Verogen ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit

• 최소한의 DNA 투입량으로 탁월한 데이터 회수
• 확장된 패널로 인구 집단 연구 지원
• 심하게 분해된 샘플에 대한 추가적인 분석 해상도 제공
• 멀티플렉싱 기능으로 운영 효율성 향상

ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit는 최소한의 DNA 투입량과 탁월한 데이터 회수로 전장 미토콘드리아 유전체(mtGenome)의 염기서열 분석을 위한 편리하고 비용 효율적인 라이브러리 준비 과정을 제공합니다. 이 키트는 입증된 ForenSeq 화학을 활용하여 인구 집단 연구를 지원하거나 심하게 분해된 샘플에 대한 추가적인 분석 해상도를 제공하는 확장된 데이터 세트를 생성합니다. 또한 이 솔루션은 상용 전장 유전체 분석 솔루션 중 가장 낮은 권장 소비자 가격으로 제공됩니다. 멀티플렉싱 기능은 비용이나 시간을 늘리지 않고도 운영 효율성을 더욱 높여줍니다.

ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit는 Verogen 라이브러리 준비 제품군에서 가장 높은 해상도의 mtGenome 염기서열 분석을 제공합니다. 바둑판식 앰플리콘, 목적에 맞는 완충액, 세심하게 설계된 프로토콜을 통해 최소한의 DNA 투입량으로 다양한 샘플 유형의 실종자, 재난 피해자 신원 확인(Disaster Victim Identification, DVI), 인구 집단 연구를 포함한 광범위한 법의학 및 데이터베이스 애플리케이션을 지원할 수 있습니다.

• 다양한 gDNA 투입량에 걸쳐 높은 민감도 유지
• 적은 투입량 샘플의 개선된 회수율
• 일반적인 억제제에 대한 강력한 내성

이 프로토콜에는 저수준 및 복잡한 샘플에서 성과를 더욱 개선하기 위한 2차 정제 옵션이 포함되어 있습니다. “다양한 투입 DNA 양에 걸친 높은 커버리지” 그림은 2차 정제를 한 라이브러리와 하지 않은 라이브러리의 커버리지 결과를 비교한 것입니다. 단일 정제와 비교했을 때, 두 번의 정제는 점진적인 커버리지 향상을 보여주며, 2pg에서 90% 개선으로 정점을 찍습니다(그림 “2차 정제의 판독 횟수 개선” 참조). 법의학 샘플 분석의 또 다른 과제는 라이브러리 준비를 저해할 수 있는 PCR 억제제가 빈번하게 존재한다는 점입니다. 법의학 mtDNA 샘플에서 흔히 볼 수 있는 세 가지 억제제 양을 대조물질 DNA HL60 100pg에 첨가한 결과, “관련 PCR 억제제에 대한 내성이 높은 완충액” 그림에 표시된 것처럼 모든 투입량에 걸쳐 일관된 커버리지로 높은 내성을 보여주었습니다.

표적 PCR 기반 분석은 향상된 변이 검출을 위해 최신 mtDNA 데이터베이스에서 가져온 소형 앰플리콘을 사용합니다. 바둑판식 프라이머 접근 방식은 특히 분해된 샘플에서 데이터 손실로 이어질 수 있는 염기서열 갭을 방지하기 위해 앰플리콘을 겹쳐서 사용합니다. 이 바둑판식 프라이머 설계를 보완하는 향상된 완충액 시스템은 칼슘, 부식산 및 기타 관련 PCR 억제제에 대한 탁월한 내성을 발휘합니다.

사용자 친화적이고 자동화와 호환되는 이 솔루션은 여러 애플리케이션에 걸친 다양한 연구 설계를 위한 공통 워크플로우를 제공합니다. 이 프로토콜에는 고품질 유전체 DNA(gDNA)부터 저수준 및 복잡한 샘플에 이르기까지 광범위한 투입 재료에 맞게 라이브러리 준비를 조정하는 두 가지의 정규화 방법이 포함되어 있습니다. 필요한 투입량이 적어 가장 까다로운 샘플에 대해서도 가능성을 높일 수 있습니다. 시약 키트의 효율적인 사용과 정확한 판독 할당을 위해 라이브러리 준비 키트에 제공되는 인덱스 어댑터를 사용하면 한 번에 최대 16개의 샘플을 풀링하고 염기서열 분석할 수 있습니다. 전장 유전체 키트의 바둑판식 앰플리콘 디자인은 전체 16,569bp인 인간 mtGenome을 분석하는 데 적합합니다. 이 분석에는 약 500개의 소형 앰플리콘을 증폭하고 두 번의 PCR 반응으로 전체 유전체를 커버하는 시약이 포함되어 있습니다.

미토콘드리아 DNA는 핵 DNA가 손상되었거나 없을 때 강력한 대체 정보원입니다. 이는 뿌리 없는 머리카락, 치아, 뼈 및 기타 까다로운 출처에 사용되는 mtDNA는 실종자 및 재난 피해자 신원 확인을 위한 일상적인 방법이 되었습니다. 이전에는 기존 Sanger 염기서열 분석 방법과 관련된 품질 및 확장성 문제로 인해 일부 전문 센터에서 제한적인 역할만 했기 때문에 mtDNA가 제한적으로 사용되었습니다. Verogen mtDNA 워크플로우는 성능, 효율성, 사용 편의성을 독창적으로 조합하여 제공하므로 규모와 관계없이 모든 연구실에서 mtDNA 분석을 Sanger 염기서열 분석법에서 NGS로 전환하거나 다른 NGS 기술에서 얻은 결과를 개선할 수 있습니다.

mtDNA 데이터를 빠르게 검토할 수 있도록, ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit는 Universal Analysis Software(UAS)의 ForenSeq mtDNA Analysis Module과 원활하게 페어링됩니다. UAS는 법의학 유전체 데이터를 분석하고 관리할 수 있는 NGS 플랫폼을 제공하여 복잡한 생물 정보학을 간소화합니다. 이 소프트웨어는 전체 미토콘드리아 유전체에 대한 염기서열 분석 출력물을 분석하여 실행 완료 후 1시간 이내에 결과를 제공합니다. 연구실은 명확한 대화형 사용자 인터페이스에서 요약된 결과 또는 자세한 결과를 검토하고 최대 아홉 개의 샘플을 비교할 수 있습니다. 보고서는 여러 DNA 데이터베이스와 호환됩니다.

당사는 라이브러리 준비부터 염기서열 분석, 분석에 이르기까지 전체 워크플로우에 걸쳐 탁월한 지원을 제공합니다. 당사의 숙련된 팀이 장비 및 소프트웨어에 대한 포괄적인 서비스 범위, 밸리데이션 계획 및 구현 지침을 제공하여 워크플로우를 쉽게 운영할 수 있도록 지원합니다.