QIAxcel DNA Kits

Pour l’analyse automatisée de fragments d’ADN avec les instruments QIAxcel

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QIAxcel DNA High Resolution Kit (1200)

Cat. No. / ID:  929002

Cartouche de gel QIAxcel DNA High Resolution, tampons, huile minérale, marqueur d’étalonnage d’intensité QX, 12 barrettes de tubes
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1 474,00 $US
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Cartridge type
High Resolution
Screening
Fast Analysis
High Sensitivity
Les QIAxcel DNA Kits sont destinés aux applications de biologie moléculaire. Ces produits ne sont pas conçus pour le diagnostic, la prévention ou le traitement des maladies.

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Features

  • Sécurité et maniabilité des cartouches de gel prêtes à l’emploi
  • Procédure simplifiée qui limite le temps d’analyse
  • Des résultats fiables pour des concentrations d’acides nucléiques de l’ordre de 5 pg/µl
  • Des analyses de précision avec une résolution de 3–5 pb
  • Un traitement standardisé avec la collecte de données numérique

Product Details

Les instruments QIAxcel, utilisés avec les QIAxcel DNA Kits, permettent la séparation par taille et la quantification entièrement automatisées de fragments d’ADN dans 96 échantillons maximum par cycle. La technologie QIAxcel, basée sur l’électrophorèse capillaire avec cartouches de gel, offre une résolution, une vitesse et un débit incomparables. Les cartouches de gel QIAxcel sont réutilisables, elles permettent de réaliser jusqu’à 250 cycles d’analyse de 12 échantillons. Les méthodes adaptées à la plupart des applications sont préinstallées. QIAGEN peut aussi créer des méthodes sur mesure pour les utilisateurs.

Le QIAxcel DNA High Sensitivity Kit fonctionne uniquement avec le QIAxcel Connect. Tous les autres QIAxcel DNA Kits fonctionnent avec le QIAxcel Connect ou avec les instruments QIAxcel Advanced. Les accessoires pour ADN QIAxcel sont compatibles avec tous les QIAxcel DNA Kits.

Performance

Analyse haute résolution simplifiée

Le génotypage d’organismes, le criblage de banques d’ADNc par PCR et bien d’autres applications de recherche biomédicale et de biologie moléculaire nécessitent la discrimination des fragments d’ADN dont la taille varie d’un petit nombre de paires de bases. Le QIAxcel High Resolution Kit, associé aux instruments QIAxcel, permet d’analyser des fragments d’ADN dont la taille varie entre 15 pb et 5 kb. Les fragments inférieurs à 500 pb peuvent être séparés avec une résolution de 3–5 pb, cela facilite nettement l’interprétation des données par rapport à l’électrophorèse sur gel d’agarose haute résolution classique (voir  Détection sensible d’un oncogène muté). Avec une sensibilité de détection de 0,1 ng/µl d’ADN dans des réactions d’amplification non diluées, les instruments QIAxcel donnent des résultats plus fiables avec un échantillon de départ moins important.

Le QIAxcel DNA Screening Kit est tout à fait adapté à l’évaluation courante de fragments pour la digestion par des endonucléases de restriction, la PCR qualitative simplexe ou multiplexe et d’autres applications relatives à l’ADN (voir  Analyse haute résolution d’échantillons par PCR multiplexe). L’utilisation de cartouches de gel pour le dépistage d’ADN simplifie la procédure du laboratoire en limitant le temps d’analyse pour les fragments de 15 pb à 5 kb - 96 échantillons sont traités en 1 heure environ. Vous pouvez obtenir une résolution de 20–50 pb pour les fragments inférieurs à 1 kb. La consommation d’échantillons est inférieure à 0,1 µl, vous réservez ainsi vos échantillons précieux pour un autre usage ultérieur.

Le QIAxcel DNA Fast Analysis Kit est tout à fait adapté à l’évaluation courante de fragments d’ADN dans des applications de PCR qualitative simplexe ou multiplexe. L’utilisation de cartouches de gel pour le dépistage d’ADN simplifie la procédure du laboratoire en limitant le temps d’analyse pour les fragments de 15 pb à 3 kb — 12 échantillons sont traités en seulement 3 minutes et 96 échantillons en 25 minutes environ (voir  Capture d’écran de données d’analyse de fragments par PCR). Vous pouvez obtenir une résolution de 50 pb avec la cartouche de gel QIAxcel DNA Fast Analysis et la consommation d’échantillons est inférieure à 0,1 μl.

Le QIAxcel DNA High Sensitivity Kit vous permet d’analyser l’ADN à des concentrations de l’ordre de 5 pg/μl. Le temps d’analyse de fragments de 15 pb–3 kb est d’environ 9 minutes pour 12 échantillons. Vous pouvez obtenir une résolution de 20–50 pb avec la cartouche de gel QIAxcel DNA High Sensitivity.

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Principle

Les instruments QIAxcel utilisent l’électrophorèse capillaire sur gel qui permet une séparation rapide basée sur la taille des acides nucléiques (voir  Processus de séparation des échantillons). Contrairement à l’électrophorèse sur gel d’agarose classique, la séparation s’effectue dans un capillaire d’une cartouche de gel prête à l’emploi. Les échantillons sont chargés automatiquement dans un capillaire individuel puis une tension est appliquée. Les molécules d’acides nucléiques chargées négativement migrent à travers le capillaire jusqu’au terminus chargé positivement. Comme pour l’électrophorèse sur gel d’agarose, les molécules de faible poids moléculaire migrent plus vite que les molécules de poids moléculaire élevé. Lorsque les molécules migrent à travers le capillaire, elles passent devant un détecteur qui détecte et mesure le signal de fluorescence. Un photomultiplicateur convertit le signal de fluorescence en données électroniques, qui sont ensuite transférées à l’ordinateur pour être traitées avec le logiciel QIAxcel ScreenGel. Au terme du traitement, les données s’affichent sous forme d’électrophérogramme ou d’image de gel.

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Procedure

Les QIAxcel DNA Kits simplifient la séparation et l’analyse des fragments d’ADN et offrent à l’utilisateur une sécurité accrue. Il suffit de quelques étapes simples : chargez la cartouche de gel, remplissez et chargez le plateau de tampons, chargez les échantillons dans des plaques de 96 puits ou des tubes ou barrettes pour PCR, sélectionnez le profil de traitement et c’est tout. Oubliez la préparation de gel fastidieuse et la formation approfondie de l’utilisateur, la procédure est simplifiée et le système s’intègre facilement à l’activité quotidienne du laboratoire. Quelques minutes après le lancement d’un cycle, les premiers résultats apparaissent en temps réel sur l’écran de l’ordinateur (voir  Temps de fonctionnement réduits).

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Applications

Des méthodes préprogrammées, associées aux cartouches de gel correspondantes, permettent la séparation et l’analyse de nombreux acides nucléiques, notamment les fragments par PCR simplexe ou multiplexe, l’ADN digéré par des endonucléases de restriction et des oligonucléotides synthétisés.

  QIAxcel DNA High Resolution Kit QIAxcel DNA High Sensitivity Kit§ QIAxcel DNA Screening Kit QIAxcel DNA Fast Analysis Kit
Plage de taille 15 pb–20 kb ; affichant jusqu’à 50 kb 15 pb–3 kb 15 pb–5 kb 15 pb–3 kb
Résolution* 3–5 pb 20–50 pb 20–50 pb 50 pb
Limite de détection 0,1 ng/μl 5 pg/μl 0,1 ng/μl 0,1 ng/μl
Échantillons par cartouche 1 200 échantillons 1 200 échantillons 2 400 échantillons 3 000 échantillons
Temps de fonctionnement 9–25 min ~ 9 min ~ 7 min ~ 3 min
Domaine d’application
  • Génotypage haute résolution
  • VNTR, STR, etc.
  • Vérification de l’intégrité de l’ADNg
  • Consultation de banques de NGS
  • Contrôle qualité d’extraits de biopsie liquide
  • Consultation de banques de NGS
  • Dépistage rapide par PCR (simplexe et multiplexe)
  • Digestion par enzymes de restriction, plasmide
  • Vérification de l’intégrité de l’ADNg
  • Consultation de banques de NGS
  • Analyse rapide d’un seul amplicon, p. ex. typage HLA

Supporting data and figures

Resources

Brochures & Guides (5)
A protocol for evaluation of samples for next-generation sequencing on the QIAGEN GeneReader platform using the QIAxcel Advanced Instrument and ScreenGel software version 1.5 of higher

For analysis and typing of PCR products from different HLA loci using the QIAxcel Advanced and the Helmberg-SCORE software

Kit Handbooks (2)
For automated electrophoretic analysis of DNA using the QIAxcel Connect instrument

June 2022
For automated analysis of DNA fragments using the QIAxcel and QIAxcel Advanced instruments
Application Notes (17)
The QIAxcel System was successfully used to detect DNA derived from genetically modified organisms (GMOs) at a level suitable for GMO testing according to EU standards.
Operating Software (2)
This release includes the first version of QIAxcel ScreenGel NGS Profiles. These profiles are intended to be used to run and analyze reactions of GeneRead QIAact AIT and BRCA 1/2 panels using the QIAxcel instrument and QIAxcel ScreenGel 1.5 Software. These profiles are composed of an Process Profile, Analysis Profile, Distribution Profile, and Report/Export Profile.
Quick-Start Protocols (1)
For electrophoretic analysis of DNA samples using the QIAxcel Connect system

June 2022
Instrument User Manuals (2)
For use with QIAxcel ScreenGel software v2.0
For use with QIAxcel Advanced instruments and QIAxcel ScreenGel Software version 1.6
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Why does an intensity calibration of the gel cartridge for the QIAxcel System and QIAxcel Advanced need to be performed?

The intensity calibration procedure on the QIAxcel System and QIAxcel Advanced is performed to normalize the signal intensities across all 12 channels of the gel cartridge. This corrects for natural intensity reading variations between each capillary in the cartridge. A correction factor is determined and applied for every subsequent run performed with the cartridge.

FAQ ID -1824
Can a QIAxcel DNA Fast Analysis Cartridge be run on a QIAxcel System?

The QIAxcel DNA Fast Analysis Cartridge can only be run on the QIAxcel Fast Analysis System with the BioCalculator Fast Analysis software and the grey software key.

All other QIAxcel Cartridges can only be run on the QIAxcel System with the BioCalculator software and the blue software key.

FAQ ID -1828
Can customers use their own DNA size marker with the QIAxcel System and if yes, what concentration should be used?

The concentration of the DNA marker, pUC18/HaeIII, provided in the QIAxcel DNA Kits is 5ug/ml in 1XTE buffer solution. Customers can run their own DNA size marker sample with different concentration levels using the provided Methods (i.e. M500, H500, L500 and so on).

The recommended method for all basic applications with the QIAxcel System is the M500 method. The BioCalculator software also allows customers to choose their own Sample Injection Time in the Sequence table. The M500 method provides 5KV for 20 seconds for the electro-kinetic injection of lower concentrated DNA samples. If the Injection Time is doubled or tripled (40 or 60 sec), you can expect double or triple intensities (also peak heights).

FAQ ID -1841
Where are the QIAxcel data stored?

For the BioCalculator software, the default data folder is:

C:\Program Files\QIAGEN\QIAxcel BioCalculator\Data.

For the ScreenGel software, the default data folders are:

C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Experiment (for a computer with Windows XP operation system) or C:\ProgramData\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Experiment\ (for a computer with Windows 7 operating system).

Alternatively, you can more conveniently access the ScreenGel experiment data folder using the menu options File\Open data directory\Experiment within the ScreenGel software.

FAQ -9008
If a different DNA size and/or alignment marker is to be used with the QIAxcel System or QIAxcel Advanced, does the Gel Cartridge need to be recalibrated?

The Gel Cartridge does not need to be recalibrated when using a new alignment marker and/or DNA size marker with the QIAxcel System or QIAxcel Advanced. Calibration is required only once, i.e. when the first cartridge is run or when the cartridge is used on a different QIAxcel system than the one it has been calibrated on, or when using a different PC than the one used to calibrate initially.

FAQ ID -1858
How can drying out of the gel cartridge tips used on the QIAxcel System and QIAxcel Advanced be prevented?

If the gel cartridge tips for the QIAxcel System and QIAxcel Advanced are in contact with air, the tips will dry out. There are 3 ways of preventing the tips from drying.

  1. Store the cartridge in the instrument with the instrument in the “Park” position. The washing solution (8 ml) covered with mineral oil must be in the “Park” position of the Solution Tray. 
  2. Store the cartridge in the Cartridge Stand with enough mineral oil in the well of the Cartridge Stand to cover the capillary tips. The Cartridge Stand should only be used for short term storage, i.e. when changing cartridges during one working day. 
  3. Place the cartridge back into its packaging with the capillary tips gently inserted into the soft gel in the box.
FAQ ID -1823
Why does the ScreenGel software version 1.2 crash when I try to use an old reference size marker table?

The reference size marker table created by ScreenGel version 1.1 or earlier is incompatible with ScreenGel version 1.2. Re-analyze the size marker run in ScreenGel version 1.2 and create a new reference size marker table for future use.

FAQ -9009
Why is the cartridge not recognized?

When using the BioCalculator software, ensure the color of the software key matches the type of cartridge used. For example, the QIAxcel Fast Analysis cartridge requires the red software key, while the QIAxcel High Resolution cartridge requires the blue software key.

In addition, check that the communication between the computer and the instrument is established. Further, check that the smart key is inserted securely.

If the issue persists, contact QIAGEN Technical Services and provide the cartridge ID and lot number, which is printed on the packaging of QIAxcel cartridges.

FAQ -9004
How do I perform the filter test?

When using the BioCalculator software, select Settings under File in the Instrument control panel window. In the new windows, click Check Filter in the new window and follow the on-screen prompts.

When using the ScreenGel software, log in to the ScreenGel software with an account with basic or advanced privilege.  Select System Check under the Service environment. Select Filter Check and click Start.

Please send the filter test result to QIAGEN Technical Services for further assistance.

FAQ -9006
Why is the signal of the QX alignment marker weak?

Incorrect storage can lead to QX alignment marker degradation. The QX alignment markers can be used for 50 runs or 3 days, whichever comes first. Opened QX alignment marker should be store at –20°C between uses.

FAQ -9003
What causes the calibration to fail?

Clogged capillaries and/or re-using the calibration marker are the most common causes of failed calibration. Perform “Removing gel from blocked capillaries”, as outlined in Appendix D in the QIAxcel DNA handbook. Use a new set of calibration marker for each new calibration procedure.

FAQ -9001
I have upgraded the ScreenGel software to version 1.2. How can I stop the software crash when I try to select a cartridge?

Please delete the 6 obsolete method files as outlines in the Important Note QIAxcel ScreenGel Software

FAQ -9010
How do I perform the detector test?

When using the BioCalculator software, select Detector test under File in the Instrument control panel window. Perform the Detector test with and without a cartridge latched inside the QIAxcel. Feedback is not shown on the screen when you select the Detect test. Instead, the file named detector.asc is saved at C:\Program Files\QIAGEN\QIAxcel BioCalculator. Change the file name before performing another detector test.

Note: Older versions of BioCalculator software save the detector.asc at C:\Program Files\QIAxcel BioCalculator.

When using the ScreenGel software, log in to the ScreenGel with an account with basic or advanced privilege.  Select System Check under the Service environment. Select Detector Test and click Start. The file is saved at C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting\Troubleshooting_xxxxxxxx (current date in the format of YYYYMMDD) for a computer with Windows XP operating system or C:\ProgramData\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting for a computer with Windows 7 operating system. Alternatively, you can perform a screen capture for the Detector test result.

Please send the Detector test results to QIAGEN Technical Services for further assistance.

FAQ -9006