Verogen ForenSeq DNA Signature Prep Kit

法医学のDNAサンプルからシークエンシングライブラリーを調製するために必要な試薬すべてのために

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ForenSeq DNA Signature Prep Kit(96)

Cat. No. / ID:  V16000023

法医学DNAサンプルからシークエンシングライブラリーを調製するために必要な試薬すべて、Verogen MiSeq FGx Forensic Genomics Solutionの一部を含みます
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Verogen ForenSeq DNA Signature Prep Kit は、法医学、ヒト個人識別、父子鑑別における分子生物学的アプリケーション向けであり、疾病の診断、予防、治療を目的とはしていません。

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Features

  • 単一の合理化されたワークフローを使用して、200個の遺伝子マーカーを調べます
  • 法医学的に関連するSNPの高密度なセットの価値あるデータにアクセスします
  • 困難なサンプルおよび重度に分解したサンプルの優れた解析
  • マルチプレックス能力により、操作効率をさらに向上
  • ケースワークのためにNational DNA Index System(NDIS)へのアップロードが承認されています

Product Details

当社のシンプルなプレートベースのワークフローを使用して、ハンズオン操作時間が2時間足らずで最大96個のDNAサンプルについて、より包括的なDNAプロファイルを作成します。ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ケースワークのためのNational DNA Index System(NDIS)へのアップロードが承認された、最初の次世代シークエンシング(NGS)ベースのショートタンデムリピート(STR)シークエンシングケミストリーです。常染色体STR、X-STRおよびY-STR、身元情報性のあるSNP、表現型情報性のあるSNP、そして生物地理学的先祖情報性のあるSNPを含め、200個を超えるマーカーを単一の合理化されたワークフローに組み合わせることにより、キットは複数のSTR検査実行を不要とします。容易で一体化されたワークフローは、トレーニングプログラム、バリデーションの手順、技能検査、およびその他の、外部認証や認定プログラムに要求される品質保証/品質管理対策を簡易化することにより、研究室の効率を最大限に高めます。ソリューションは、現行のCEアレルコーリングに対して後方互換性があります。

Performance

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、法医学ゲノミクスアプリケーションでの使用向けに特別に設計された、完全なエンド・ツー・エンドの超並列シーケンスソリューションの一部です。ForenSeq DNA Signature Prep Kitにより、シンプルなプレートベースのワークフローでIlluminaの次世代シークエンシング(NGS)用に最大96個のDNAサンプルまで調製できます。

  • 複数のSTRキットの必要性を取り除きます
  • より広範なSNPが、他の技術では入手できない情報を提供します
  • 100 pg未満の分解したDNAまたは複雑なDNAから識別性の高いデータが得られます
  • シンプルなプレートベースのフォーマットを使用して、最大96個のライブラリーを調製します

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ケースワークおよび犯罪DNAデータベーシング用に世界中で現在使用されているすべての常染色体ショートタンデムリピート(STR)マーカーを、単一の合理化されたワークフロー内に統合し、複数のSTR検査を実行する必要性を取り除きます。常染色体STR、X-STRおよびY-STRに加えて、ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、従来のキャピラリー電気泳動(CE)法では通常入手できないマーカーセットを提供します。これらには、出生源についての有益な情報を与える一塩基多型(iiSNP)、目の色(青色、中間色、茶色)および毛髪の色(茶色、赤色、黒色、ブロンド)を推定する表現型情報性のSNP(piSNP)、生物地理学的先祖について情報性のあるSNP(aiSNP)の高密度のセットが含まれます。これらは、“容疑者がおらず”、そのままではコールドケースになりかねないケースから捜査の手がかりを見いだすのに重要なものとなり得ます。

ForenSeq DNA Signature Prep Kitで網羅される法医学的遺伝子座
特徴 マーカー数 アンプリコンサイズ(bp) DPMA DPMB
包括的な常染色体STR 27 61–467 はい はい
Y-STR 24 119–390 はい はい
X-STR 7 157–462 はい はい
SNPの同定 94 63–261 はい はい
表現型SNP 22 73–227 いいえ はい
生物地理学的アンセストリーSNP 56 67–200 いいえ はい

1つの反応で、プライマーミックスA(DPMA)は、すべての常染色体STR、X染色体STR、およびY染色体STRターゲットおよび完全なセットのiiSNPすべての検査を可能にします。プライマーミックスB(DPMB)には、aiSNPおよびpiSNPが含まれます。

ForenSeq DNA Signature Prep Kitには、次のものが含まれます。

  • DNA プライマーミックスA:58個のSTR(27個の常染色体STR、7個のXハプロタイプマーカーおよび24個のYハプロタイプマーカーを含む)および94個のiiSNPのためのプライマーペアを含みます。
  • DNA プライマーミックスB:DNA プライマーミックスA内のすべてのマーカー、さらに56個の生物地理学的aiSNPおよび22個のpiSNP(2個のaiSNPも表現型推定に使用されます)のためのプライマーペアを含みます。

ForenSeq DNA Signature Prep Kitに含まれる大部分のSNPは、アンプリコンサイズ≤ 125 bpを含み、分解したDNA抽出物の分析またはかなり阻害されているDNA抽出物の分析にさえも極めて適しています(図 “高分子量のgDNAと部分的に分解したgDNAの性能の比較”を参照)。また、ForenSeq DNA Signature Prep Kitでは、混合物内の、従来のSTRおよびCE分析では検出されないおそれのある低濃度のマイナーな構成要素を検出する能力が向上します。この向上した力は、キットに含まれる多数のマーカーによるもので、それらの多くは、高度に多型であり、Illumina MiSeq FGx機器の本来の感度と相まっています。

特徴 詳細
サンプルのタイプ gDNA、口腔スワブ、FTAカード
1サンプル当たりのヒトgDNAの推奨インプット 1 ng
1サンプル当たりのFTAカードパンチ用の推奨インプット 1.2 mm
1ラン当たりのマルチプレックスキャパシティ 8–96サンプル
短いアンプリコンの検出 ≥ 65 bp
遺伝子座のマルチプレックスキャパシティ およそ200個の遺伝子マーカーの同時解析
ライブラリー調製時間合計 7時間15分
ハンズオン操作時間 1時間45分
シークエンシング時間合計 MiSeq FGx Reagent Kitでおよそ28時間、MiSeq FGx Reagent Micro Kitでおよそ22時間

Principle

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ライブラリー調製、DNAシークエンシングプラットフォーム、法医学ゲノミクス向けに特別に設計されたデータ解析ソフトウェアを含む、完全一体型のサンプルから答えへのソリューションの一部です。単一のワークフローでおよそ200個の遺伝子マーカーを使用して、MiSeq FGx Solutionは、STRおよびSNPの最も包括的なマルチプレックスおよび、ヒト個人識別への最もわかりやすい経路を提供します。

Procedure

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、PCR試薬、インデックスアダプター、精製およびノーマライゼーション用ビーズなど、シークエンシング用のDNAライブラリーを調製するために必要なすべての試薬を含みます。1つの増幅で選択したマーカーを同時に調べます。複数の既存のキャピラリー電気泳動(CE)ベースのキットを統合するため、DNAプライマーSet A(DPMA)またはDNAプライマーSet B(DPMB)のいずれかから選択します。

Applications

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、Verogen MiSeq FGx Forensic Genomics Solution、法医学ゲノミクスのアプリケーション向けに特別に設計された完全にバリデーション済みのDNAからデータまでのワークフローの一部です。

Software

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、MiSeq FGx Sequencing System上でライブラリーの配列決定をし、Universal Analysis Software(UAS)でデータを分析する一体化型ワークフローの一部です。高性能でエンド・ツー・エンドのソリューションとして設計、開発、製造され、ポートフォリオ全体が充実した技術的サポートによりバックアップされています。さらに、品質管理された製造により、オールインワンライブラリー調製キットの利便性と共に再現性が保証されます。

Services

当社は、ライブラリー調製からシークエンシング、分析まで全ワークフローにわたって優れたサポートを提供します。当社の経験豊富なチームは、お使いの装置、ソフトウェア、バリデーションプラン、および実践のガイダンスのために包括的なサービスを提供し、ワークフローを容易に操作可能にします。

Resources

パンフレット (2)
Our improved noninvasive paternity testing workflow delivers answers with greater confidence

The benefits of next-generation sequencing for human identification


クイックスタートプロトコール (1)
ForenSeq DNA Signature Prep Kit Checklist
解析用ソフトウェア (1)
ForenSeq Universal Analysis Software Guide
実験器具関連資料 (1)
ForenSeq DNA Signature Prep Consumables and Equipment
キットハンドブック (1)
Prepare DNA libraries to genotype database or casework reference samples in a single run
Certificates of Analysis (1)
Brochures & Guides (2)

The benefits of next-generation sequencing for human identification


Our improved noninvasive paternity testing workflow delivers answers with greater confidence
Labware Documents (1)
ForenSeq DNA Signature Prep Consumables and Equipment
Quick-Start Protocols (1)
ForenSeq DNA Signature Prep Kit Checklist
Kit Handbooks (1)
Prepare DNA libraries to genotype database or casework reference samples in a single run
Analysis Software (1)
ForenSeq Universal Analysis Software Guide