miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays

Pour une quantification extrêmement sensible et précise des miARN matures à l’aide de la qPCR à base de sondes renforcées par LNA

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miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assay (200)

Cat. No. / ID:  339350

Dosages prémélangés complets contenant une amorce et une sonde avant spécifiques de la cible, renforcées par LNA. Pour 200 réactions.
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182,00 $US
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Features

  • Amorce PCR avant et sonde d’hydrolyse spécifiques aux miARN, renforcées par LNA
  • Détection de vrais signaux à très faible plage de détection, jusqu’à 1 copie de miARN
  • Procédure rapide et simple en deux étapes qui dure 2 heures
  • Un niveau élevé de fiabilité et de reproductibilité pour des résultats fiables

Product Details

Les miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays sont des lots amorces-sondes PCR miARN qui permettent une quantification extrêmement sensible et spécifique des miRCURY LNA miRNA Probe PCR System. Le système, à la fois robuste et sensible, permet une détection précise des miARN à partir d’échantillons à faible teneur en ARN, notamment le sérum, le plasma et l’urine. L’amorce à amplification par PCR avant et la sonde sombre portant les indications FAM et quencher sont spécifiques aux miARN et optimisées avec la technologie LNA, ce qui augmente la performance du dosage. Les dosages de tous les miARN importants sont validés sur paillasse humide. Outre les dosages prédéfinis, qui couvrent tous les miARN de miRBase, il est possible de créer facilement des miRCURY LNA miRNA Custom Probe PCR Assays pour tout miARN d’intérêt en utilisant le même algorithme de conception.

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Performance

Détection très sensible de vrais signaux

La sensibilité exceptionnelle des miRCURY LNA miRNA Probe Assays est obtenue en combinant la transcription inverse universelle avec des amorces et des sondes spécifiques aux miARN, renforcées par LNA et normalisées par Tm. Cette combinaison permet une quantification précise et fiable des miARN individuels à partir de 1 pg d’ARN total ou jusqu’à 1 molécule sans préamplification (voir  Quantification précise même avec un faible matériel de départ et Efficacité exceptionnelle sur une large gamme dynamique). La sensibilité et la rapidité de la procédure rendent le système particulièrement adapté aux échantillons de sérum ou de plasma. Les enzymes QuantiNova permettent d’obtenir des résultats hautement reproductibles entre les réplicats techniques et biologiques dès la première tentative, ce qui permet d’enregistrer des économies de matériel et de temps.

Par rapport à d’autres systèmes PCR basés sur des sondes miARN qui reposent uniquement sur la sonde pour générer la spécificité, l’amorce et la sonde renforcées par LNA des miRCURY LNA miRNA Probe Assays sont à la fois spécifiques au miARN et suffisamment courtes pour éviter tout chevauchement lors de la liaison à la cible (voir  miRCURY LNA miRNA Probe PCR System en un coup d’œil). Les miRCURY LNA miRNA Probe Assays sont donc plus performants que les solutions alternatives en termes d’efficacité (voir  Amélioration de l’efficacité par rapport à d’autres solutions), de linéarité et de sensibilité sans préamplification (voir  Linéarité améliorée et sensibilité élevée sans préamplification). Associée à un excellent rapport signal/bruit (voir  Détection précise même en présence d’un bruit de fond ARN élevé), cette fonctionnalité unique permet de distinguer des miARN étroitement liés dont les différences de séquence ne dépassent pas un nucléotide (voir  Pouvoir discriminatoire jusqu’à une différence d’un seul nucléotide).

Validé et optimisé

La formulation des dosages (amorces et sondes) est basée sur un algorithme de formulation créé par des experts en LNA et en dosages. Cet algorithme exhaustif évalue et optimise 60 paramètres qui sont validés in silico en fonction de critères de performance très stricts afin de garantir une conception offrant la plus grande sensibilité. Les dosages obtenus permettent de détecter jusqu’à 1 copie de miARN. Les dosages de tous les miARN importants sont également entièrement validés sur paillasse humide.

Champ opérationnel

Plus de 30 000 dosages sont disponibles, couvrant l’intégralité de la miRBase 22. Plus de 1000 dosages sont entièrement validés en laboratoire humide pour ce qui est de la sensibilité, de la spécificité, de l’efficacité et du bruit de fond des tests. Les dosages restants sont validés in silico à l’aide d’un algorithme de conception complet avec des critères stricts de performance des dosages qui assure des dosages améliorés par des LNA spécifiques aux espèces et de haute qualité, avec une sensibilité et une spécificité optimales pour chaque organisme. Si vous travaillez avec de nouveaux miARN, provenant par exemple d’une expérience NGS, concevez votre propre dosage avec les miRCURY LNA miRNA Custom Probe PCR Assays.

Rapide et facile

Le protocole facile à suivre, d’une durée de 2 heures, permet d’enregistrer des gains de temps et de main-d’œuvre. L’utilisation d’une transcription universelle et de protocoles RT-PCR optimisés simplifie grandement la procédure par rapport à d’autres solutions. De plus, l’ADNc généré lors de l’étape de RT peut être utilisé dans l’ensemble du miRCURY LNA miRNA Probe PCR System, ce qui vous permet de passer en douceur des panels aux dosages en fonction de vos besoins de recherche, et d’enregistrer des échantillons et du temps. Le nombre d’étapes de pipetage est réduit au minimum, ce qui minimise également les variations techniques. La fiabilité du dosage permet une configuration à température ambiante et des cycles différés pour une plus grande flexibilité et une utilisation en automatisation (voir Stabilité de la réaction et fiabilité de la configuration.). Cette procédure simplifiée, associée à une fabrication de dosages conforme aux normes ISO (voir  Grande uniformité d’un lot à l’autre), permet d’obtenir une reproductibilité extrêmement élevée d’un jour à l’autre et d’un site à l’autre.

See figures

Principle

Le miRCURY LNA miRNA Probe PCR System permet une quantification et un profilage sensibles et spécifiques des miARN par real-time PCR. La détection est basée sur une sonde d'hydrolyse marquée par un FAM et un quencher sombre. Le système couvre toutes les étapes de la conversion des miARN en ADNc et de la détection ultérieure des miARN par qPCR. Les miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays ont été validés à l’aide du QuantiNova Probe Master Mix ; l’utilisation d’autres réactifs pour la qPCR affectera les résultats.

RNA Spike-In Kit pour RT

Le RNA Spike-In Kit permet de contrôler la qualité des étapes d’isolation de l’ARN, de synthèse de l’ADNc et d’amplification par PCR des expériences miRCURY LNA miRNA Probe PCR. Vous pouvez ainsi identifier les échantillons de mauvaise qualité dès le début du processus et gagner du temps et d’économiser des réactifs. Le kit comprend les UniSp2, UniSp4 et UniSp5 RNA Spike-in Template Mix et le cel-miR-39-3p RNA Spike-in Template.

miRCURY LNA RT Kit

Un kit universel de transcription inverse pour deux systèmes de détection. Le miRCURY LNA RT Kit est utilisé à la fois pour le miRCURY LNA miRNA PCR System, qui utilise le SYBR Green pour la détection, et pour le miRCURY LNA miRNA Probe PCR System, basé sur des sondes. Le kit comprend deux tampons de réaction spécifiques au système et tous les réactifs nécessaires pour réaliser une polyadénylation et une transcription inverse des miARN rapides et pratiques en une seule étape de réaction.

miRCURY LNA Probe PCR Kit

Optimisé et dédié au miRCURY LNA miRNA Probe PCR System, ce kit contient le QuantiNova Probe Master Mix et le miRCURY Probe Universal Reverse Primer. Associée à un miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assay ou à un miRCURY LNA miRNA Probe PCR Panel, la chimie permet la détection des miARN par real-time PCR quantitative.

miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays

Ces dosages à base d’amorces et de sondes utilisent des sondes d’hydrolyse spécifiques des miARN et des amorces directes spécifiques des miARN conçues pour détecter les miARN matures en utilisant les informations de séquence les plus récentes de la base de données miRBase 22. La miRCURY Probe Universal Reverse Primer se trouve dans le miRCURY Probe PCR Kit.

miRCURY LNA miRNA Probe PCR Panels

Plaques de panel PCR à usage unique, prêtes à l’emploi, pour établir rapidement le profil des miARN matures en se concentrant sur le miARNome, des voies spécifiques, certains types d’échantillons comme le sérum/plasma, ou dans le cadre d’un panel personnalisé conçu par l’utilisateur.

GeneGlobe Data Analysis Center

Cet outil d’analyse gratuit basé sur le Web vous guide pas à pas, via un assistant facile, dans la normalisation et l’analyse de vos données et génère des figures prêtes pour la publication.

Dosages d’ajout
Nom du produit Type de contrôle Utilisé pour contrôler Matrice ciblée
UniSp2 miRCURY LNA miRNA Probe Assay Dosage de contrôle d’ajout Efficacité de l’extraction UniSp2 – ARN matriciel synthétique, inclus dans le Modèle d’ARN, pour la RT – 339390
UniSp4 miRCURY LNA miRNA Probe Assay Dosage de contrôle d’ajout Efficacité de l’extraction UniSp4 – ARN matriciel synthétique, inclus dans le Modèle d’ARN, pour la RT – 339390
UniSp5 miRCURY LNA miRNA Probe Assay Dosage de contrôle d’ajout Efficacité de l’extraction UniSp5 – ARN matriciel synthétique, inclus dans le Modèle d’ARN, pour la RT – 339390
UniSp6 miRCURY LNA miRNA Probe Assay Dosage de contrôle de la RT Réaction de transcription inverse UniSp6 – ARN matriciel synthétique, inclus dans le miRCURY LNA RT Kit – 339340
UniSp9 miRCURY LNA miRNA Probe Assay IPC – étalonneur interplaque Réaction PCR UniSp9 – ADN matriciel synthétique. Imprégné avec dosage sur la plaque. Uniquement disponible sur les plaques (panels)
cel-miR-39-3p miRCURY LNA miRNA Probe Assay Dosage de contrôle de la RT Réaction de transcription inverse UniSp6 – ARN matriciel synthétique, inclus dans le Modèle d’ARN, pour la RT – 339390
Dosages de contrôle
Nom du produit Organisme cible Noms alternatifs Référence NCBI
Control primer set, SNORD38B (hsa) hsa U38B ; RNU38B NR_001457
Control primer set, SNORD44 (hsa) hsa U44 ; RNU44 NR_002750
Control primer set, SNORD48 (hsa) hsa U48 ; RNU48 NR_002745
Control primer set, SNORD49A (hsa) hsa U49 ; U49A ; RNU49 NR_002744
Control primer set, SNORA66 (hsa) hsa U66 ; RNU66 NR_002444
Control primer set, ARNr 5S (hsa) hsa, mmu V00589  
Control primer set, U6 snRNA (hsa, mmu) hsa, mmu, rno U6 X59362
Control primer set, RNU5G snRNA (mmu, hsa) mmu, hsa, rno Rnu5a ; U5a ; Rnu5g NR_002852
Control primer set, RNU1A1 (mmu, hsa) mmu, hsa, rno Rnu1a-1 ; Rnu1a1 NR_004411
Control primer set, SNORD65 (mmu) mmu U65 ; RNU65 NR_028541
Control primer set, SNORD68 (mmu) mmu U68 ; RNU68 NR_028128
Control primer set, SNORD110 (mmu) mmu U110 ; RNU110 NR_028547

Procedure

La première étape, la réaction de transcription inverse, est une réaction facile à réaliser, en un seul tube. L’ARN total, y compris les miARN, est utilisé comme matériel de départ et l’ADNc résultant est utilisé dans l’amplification par real-time PCR avec des amorces renforcées par LNA et une sonde d’hydrolyse pour détecter les miARN matures. Cela permet une quantification et un profilage simples des miARN, accessibles à tout laboratoire disposant d’un thermocycleur à real-time PCR.

Applications

Les miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays sont utilisés comme un élément du miRCURY LNA miRNA Probe PCR System pour :

  • La détection, le profilage et la quantification de l’expression des miARN
  • Le développement de biomarqueurs de miARN – dépistage et identification
  • La régulation des miARN et l’analyse des voies
  • Détection des miARN dans des types d’échantillons complexes et des échantillons présentant de faibles niveaux d’expression de miARN (exosomes, sérum, plasma, urine, coupes FFPE)
  • La détection des snoRNA
  • La validation du séquençage des miARN

Supporting data and figures

Resources

Quick-Start Protocols (1)
Safety Data Sheets (1)
Kit Handbooks (2)
For highly sensitive, real-time RT-PCR detection of miRNAs using hydrolysis probes
For highly sensitive, ultrafast real-time RT-PCR detection of miRNAs from exosomes, serum/plasma, and other biofluids
Certificates of Analysis (1)