Verogen MiSeq FGx Sequencing System

법의학 유전체학 라이브러리의 차세대 염기서열 분석을 위해 사용

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Verogen MiSeq FGx Sequencing System

Cat. No. / ID:  15048975

검증된 NGS 워크플로우 내에서 다양한 법의학 유전체학 애플리케이션을 위한 두 가지 실행 모드를 갖춘 탁상 기기
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Verogen MiSeq FGx Sequencing System법의학, 신원 확인 및 친자 확인 검사에서 분자생물학 응용 분야에 사용하기 위한 것입니다. 이 제품은 질병의 진단, 예방 또는 치료 목적으로 사용할 수는 없습니다.

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Features

  • 직관적인 터치스크린과 로드 앤 고(load-and-go) 시약을 갖춘 고성능 실험대 염기서열 분석기
  • 까다로운 DNA 샘플을 처리할 수 있는 고급 기능.
  • 단일 워크플로우에서 수백 개의 표지자를 조사합니다
  • 신원 확인 애플리케이션을 위한 최적화된 유연성

Product Details

MiSeq FGx Sequencing System은 법의학 유전체학을 위해 설계, 개발, 검증된 최초이자 유일한 차세대 염기서열 분석(Next-Generation Sequencing, NGS) 기기입니다. 입증된 데이터 품질과 사용 편의성을 결합한 이 시스템은 최적 표준 NGS 기술을 기반으로 구축된 고유한 단일 플랫폼 솔루션의 핵심입니다. 법의학 유전 계보학(Forensic Genetic Genealogy, FGG)과 같은 새로운 도구를 포함하여 늘어나는 애플리케이션 제품군에 맞게 확장할 수 있도록 설계된 단일 워크플로우에서 라이브러리를 준비 및 염기서열 분석하고 데이터를 분석합니다. 전용 시약 키트와 일치하는 분석 소프트웨어로 모든 신원 확인 수사에 대한 답을 얻을 수 있습니다.

Performance

MiSeq FGx System은 법의학 연구실을 위해 특별히 설계된 검증된 워크플로우에 필수적인 요소입니다. 이 시스템은 법의학 연구실의 요구 사항에 부합하는 성능 인증 및 정기 유지관리를 완벽하게 지원합니다. Illumina sequencing-by-synthesis(SBS) 화학 기술의 속도와 정확성을 기반으로 구축된 MiSeq FGx System은 법의학 유전체학의 전례 없는 초점을 NGS에 가져왔으며, 형사 사법제도의 강력한 지원군이 되어줍니다.

  • 복잡한 DNA 혼합물 및 분해된 DNA에 대한 탁월한 분석 능력
  • 라이브러리 준비, 염기서열 분석, 분석을 통합하는 통합 염기서열 분석 워크플로우
  • 판독 길이 조절 가능, 이중 실행 모드, 2개의 플로우 셀을 갖춘 고급 기능

MiSeq FGx System은 한 번의 실행으로 최대 96개의 결합된 SNP 및 STR 라이브러리를 조사할 수 있는 최초이자 유일한 기기입니다. MiSeq FGx System은 귀중한 샘플을 보존하는 동시에 강력한 성능을 발휘하여 광범위한 샘플 유형, 생물학적 분자, 고품질 유전체 DNA(genomic DNA, gDNA)부터 분해, 혼합, 제한된 샘플까지 다양한 품질 스펙트럼에 걸쳐 보다 철저하고 상세한 DNA 프로필을 제공합니다.

두 개의 실행 모드는 연구 환경에서 작업할 수 있는 유연성을 유지하면서 다양한 법의학 유전체학 애플리케이션을 지원합니다. 두 염기서열 분석 키트 간에 쉽게 전환 가능하여 현재 애플리케이션 또는 샘플 배치 크기에 맞게 출력물을 조정할 수 있습니다. 업계를 선도하는 Illumina SBS 화학 기술을 기반으로 구축된 MiSeq FGx System은 포괄적이고 확실한 결과를 위한 엄격한 성능 요구 사항을 충족합니다. 반복적인 염기서열 영역이나 동종중합체 내에서도 상황별 오류를 사실상 제거하고 멀티플렉싱 기능을 통해 하나의 표적 분석에서 더 광범위한 질문에 답할 수 있습니다. 직관적인 터치스크린 인터페이스는 기기 작동을 간소화하고 시스템은 실행 중에 품질 및 성능 기준을 모니터링합니다. 염기서열 분석 후 분석이 자동으로 시작되어 1시간 이내에 완료됩니다.

특성 세부 정보
처리량 분석에 따라 실행당 1~384개의 샘플
최대 판독 길이 분석에 따라 2 x 300bp
출력물(2 x 150bp 실행) ≥ 5Gb
필터 통과 판독 2,500만
Q30 점수(판독 길이 2 x 150bp 기준) ≥ 80%
총 전체 정확도 ≥ 99.66%
총 전체 재현성 ≥ 99.7%
염기서열 분석이 가능한 생체 분자 gDNA, RNA, mtDNA
모드 법의학(FGx) 및 연구 전용(Research Use Only, RUO)
전원 요건 50/60Hz에서 100~240V AC, 10A, 400W
RFID 무선 주파수 13.56MHz
RFID 전원 100mW
치수 68.6cm × 56.5cm × 52.3cm
중량 54.5kg

Principle

모세관 전기영동(Capillary Electrophoresis, CE)을 사용한 짧은 연쇄 반복(Short Tandem Repeat, STR)의 크기 기반 분석과 비교했을 때, NGS는 다른 기술보다 빨리 DNA 샘플의 전체 유전자 변이 스펙트럼을 감지합니다. 본질적으로 민감한 Verogen NGS 기술은 단편 크기를 넘어 근본적인 염기서열 변이를 식별합니다. 포괄적인 결과가 빠르고 명확하게 전달되며, 가장 확실하고 쉽게 해석할 수 있도록 염기서열을 염기별로 표시합니다. STR 기능을 기반으로 하는 NGS는 핵 단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP), 미토콘드리아 DNA(mitochondrial DNA, mtDNA), 메신저 RNA(messenger RNA, mRNA), 후성적 표지자 분석 등 현대 법의학 유전체학에 다른 이점을 제공하며, 신원 확인이 필요한 사건을 지원합니다. 이 과정에서 정보를 제공할 가능성이 있는 데이터와 기술적 제한을 저울질할 필요가 없습니다. 한 번의 염기서열 분석 실행으로 탁월한 결과를 얻을 수 있습니다.

MiSeq FGx System은 단일 염기가 대규모 병렬 DNA 가닥에 결합될 때 이를 감지하는 독점적인 가역적 종결 부위 기반 방법을 채택하여 탁월한 데이터 품질을 달성합니다. 형광 종결 부위 염료는 각 디옥시뉴클레오티드 트리포스페이트(deoxynucleotide triphosphate, dNTP)가 첨가된 후 다음 염기가 결합할 수 있도록 절단되면서 이미지화됩니다. 각 염기서열 사이클마다 가역적인 종결 부위 결합 dNTP 네 개가 모두 존재하기 때문에 염기 간의 자연스러운 경쟁이 염기서열 편향을 최소화합니다. 이 소프트웨어는 각 통합 사이클 동안 신호 강도 측정으로부터 직접 base call을 수행하여 다른 기술에 비해 원시 오류율을 줄입니다. 그 결과 반복적인 염기서열 영역이나 동종중합체 내에서도 염기서열 상황별 오류를 최소화하는 매우 정확한 염기별 염기서열 분석이 가능합니다.

Procedure

MiSeq FGx System에서 염기서열 분석된 라이브러리는 라이브러리 준비, 염기서열 분석, 분석이라는 동일한 핵심 NGS 워크플로우를 따릅니다. 첫 번째 단계에서는 라이브러리 준비 키트를 사용하여 법의학 샘플에서 추출한 유전체 DNA(genomic DNA, gDNA), mtDNA 또는 mRNA에 프라이머를 추가하여 수백 개의 표적 영역을 동시에 캡처하고 증폭하여 염기서열 분석할 준비가 된 이중 색인 라이브러리를 생성합니다. 라이브러리 준비 후 로드 앤 고(load-and-go) 시약으로 실행 설정을 간소화할 수 있습니다. 미리 채워진 시약 카트리지를 해동하고 카트리지에 라이브러리를 추가한 후 기기에 카트리지를 삽입하기만 하면 됩니다. 버튼 하나만 누르면 시스템 소프트웨어가 실행 매개변수를 수락하고 염기서열 분석을 시작합니다.

Applications

MiSeq FGx System은 모든 생물학적 분자와 근거리(short-range) 및 원거리(long-range) 친족 관계 분석을 포함한 점점 더 많은 애플리케이션에 걸쳐 기능을 지원합니다. 판독 길이, 플로우 셀 옵션 및 실행 모드 선택이 가능하여 데이터 출력을 점점 더 다양해지는 신원 확인 요구에 맞출 수 있는 전례 없는 유연성을 제공합니다. MiSeq FGx System은 분해된 DNA, 소량의 DNA, 복잡한 DNA 혼합물 및 조사를 복잡하게 만들거나 방해할 수 있는 기타 까다로운 샘플을 분석할 수 있는 향상된 기능을 제공합니다. 소형 앰플리콘 크기는 분해된 DNA를 조사하는 데 적합하며, 다형성이 높은 표지자를 포함하여 많은 수의 표지자는 CE가 검출하지 못할 수 있는 낮은 수준의 소수 성분을 식별하는 시스템 능력을 향상시킵니다. 또한 한 번의 염기서열 분석 실행으로 수백 개의 법의학 관련 유전자 표지자를 조사할 수 있으므로 단편 길이 기반 STR 키트 중에서 선택하거나 까다로운 샘플을 수용하기 위해 다른 절충안을 만들 필요가 없습니다.

Software

MiSeq FGx System은 소모품 로딩부터 실행 구성 및 모니터링에 이르기까지 염기서열 분석 실행의 각 단계를 단계별로 안내하는 직관적인 터치스크린 인터페이스를 갖추고 있습니다. 온보드 클러스터 생성 및 자동화된 분석 초기화로 수작업 시간을 최소화합니다. 온보드 소프트웨어를 보완하는 이 시스템은 혼합 샘플 자동 감지, 모집단 통계 생성, 데이터베이스 호환 보고서 등 법의학에 맞게 조정된 강력한 기능의 제품군을 제공하는 완전히 최적화된 분석 플랫폼인 Universal Analysis Software(UAS)와 통합됩니다. UAS는 기기에서 독립된 전용 서버에 사전 설치되어 배송되므로 보조 하드웨어 및 컴퓨팅 리소스가 필요하지 않으며 기기 설치 공간도 0.4제곱미터에 불과합니다.

Services

당사는 라이브러리 준비부터 염기서열 분석, 분석에 이르기까지 전체 워크플로우에 걸쳐 탁월한 지원을 제공합니다. 당사의 숙련된 팀이 장비 및 소프트웨어에 대한 포괄적인 서비스 범위, 밸리데이션 계획 및 구현 지침을 제공하여 워크플로우를 쉽게 운영할 수 있도록 지원합니다.

Specifications

FeaturesSpecifications
Weight54.5kg, 상자 중량 90.9kg
FeaturesNRTL certified IEC 61010-1 CE marked FCC/IC approved
Altitude최대 2000m
Pollution degree2

Resources

Brochures & Guides (3)

The benefits of next-generation sequencing for human identification


Our improved noninvasive paternity testing workflow delivers answers with greater confidence
Seek answers, not profiles with the QIAGEN-Verogen partnership
Analysis Software (2)
ForenSeq Universal Analysis Software Guide
Universal Analysis Software v2.0 and above Reference Guide
Technical Information (2)

An introduction for crime laboratories


Combine HT targeted SNP sequencing with a local kinship database to identify human remains


Instrument User Manuals (1)
MiSeq FGx Sequencing System Reference Guide
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)