Verogen ForenSeq mtDNA Control Region Kit

미토콘드리아 유전체의 조절 부위(control region) 염기서열 분석을 위한 편리한 라이브러리 준비를 위해 사용

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Verogen ForenSeq mtDNA Control Region Kit

Cat. No. / ID:  V16000085

완전한 mtDNA 대조 부위(control region) 라이브러리 준비를 위해 48회 반응에 필요한 모든 주요 시약이 포함되어 있습니다
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Verogen ForenSeq mtDNA Control Region Kit법의학, 신원 확인 및 친자 확인 검사에서 분자생물학 응용 분야에 사용하기 위한 것입니다. 이 제품은 질병의 진단, 예방 또는 치료 목적으로 사용할 수는 없습니다.

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Features

  • 최소한의 DNA 투입으로 최적의 민감도 구현
  • 최신 데이터베이스의 소형 앰플리콘을 사용하여 변이 탐지 기능 향상
  • 심하게 분해된 샘플에 대한 탁월한 해상도
  • 멀티플렉싱 기능으로 운영 효율성 향상

Product Details

ForenSeq mtDNA Control Region Kit는 최소한의 DNA 투입과 최적의 민감도로 미토콘드리아 유전체(mtGenome)의 조절 부위(control region)을 조사할 수 있는 편리하고 효율적인 라이브러리 준비를 제공합니다. 이 키트는 입증된 ForenSeq 화학을 활용하여 전체 조절 부위(control region)에서 간결한 데이터 세트를 생성하여 CODIS에 직접 업로드합니다. 멀티플렉싱 기능은 비용이나 시간을 늘리지 않고도 운영 효율성을 높여줍니다.

Performance

ForenSeq mtDNA Control Region Kit는 강력한 분석에 업계 최고의 염기서열 분석을 연계하고, 직관적인 소프트웨어와 원활하게 통합되어 최적의 연구실 효율성을 제공합니다. ForenSeq mtDNA Control Region 워크플로우는 모든 처리량 요건에 맞게 완벽하게 유연하고 확장 가능하므로, 연구실에서 최대 48개의 샘플에 대한 완전한 mtDNA 조절 부위(control region) 결과를 영업일 기준 2일 이내에 신속하게 생성할 수 있습니다. 처리량이 적은 경우 48회 반응 키트는 12개월의 보관 수명을 유지하며, 수요가 많은 연구실의 경우 유사한 라이브러리 준비 루틴을 통해 쉽게 자동화할 수 있습니다.

  • 변이 검출을 극대화하는 짧은 평균 앰플리콘 크기
  • 억제제 내성에 최적화됨
  • 유연하고 확장 가능한 처리량
  • 최적의 연구실 효율성을 위한 통합 워크플로우

mtDNA 조절 부위(control region)에 집중된 높은 돌연변이 밀도와 mtDNA 분석에 사용되는 대부분의 법의학 샘플의 분해된 특성으로 인해 최적의 프라이머 설계가 어렵습니다. ForenSeq mtDNA Control Region Kit는 매우 적은 투입량에서도 완전하고 실행 가능한 커버리지를 생성하도록 최적화되어 있습니다(그림 “ForenSeq mtDNA Control Region 시스템은 광범위한 DNA 투입량에 걸쳐 광범위한 커버리지를 제공합니다” 참조).

심하게 분해된 물질에 대한 성과를 개선하기 위해 ForenSeq mtDNA Control Region kit는 최근 선별된 mtDNA 변이 및 빈도 데이터에서 설계된 120개 이상의 프라이머를 사용하여 mtDNA 조절 부위(control region)에서 18개의 1차 앰플리콘을 생성합니다. 모든 1차 앰플리콘은 길이가 150bp 미만이며, 다수는 현재 상용 mtDNA 분석 시스템 중 가장 작은 평균 앰플리콘 크기인 100bp 미만입니다. 모든 앰플리콘은 실행 및 생물정보학적 트리밍 후 염기서열에 갭이 생기지 않도록 최소 3bp가 중첩됩니다. 강력한 증폭 환경을 조성하는 억제제에 최적화된 완충액 시스템(그림 “성능을 극대화하는 개선된 ForenSeq 완충액 시스템“ 참조).

특성 세부 정보
표적 크기 1200bp mtDNA 조절 부위(control region)
DNA 권장 투입량 샘플당 100pg gDNA 및 mtDNA
샘플 유형 뼈, 치아, 모간 등 다양한 분해된 샘플에서 추출한 DNA
권장 멀티플렉싱 용량 실행당 3~48개의 라이브러리
프라이머 개수 >120
앰플리콘 개수 18
평균 앰플리콘 크기 118bp
앰플리콘 중첩 ≥ 3bp
총 라이브러리 준비 시간 7시간 45분
수작업 시간 1시간 30분

Principle

PCR 기반 분석은 향상된 변이 검출을 위해 최신 미토콘드리아(mtDNA) 데이터베이스에서 가져온 소형 앰플리콘을 사용합니다. 바둑판식 접근 방식은 특히 분해된 샘플에서 데이터 손실로 이어질 수 있는 염기서열 갭을 방지하기 위해 앰플리콘을 겹쳐서 사용합니다. 이 바둑판식 프라이머 설계를 보완하는 향상된 완충액 시스템은 칼슘, 부식산 및 기타 관련 PCR 억제제에 대한 탁월한 내성을 발휘합니다.

Procedure

사용자 친화적이고 자동화와 호환되는 이 솔루션은 여러 애플리케이션에 걸친 다양한 연구 설계를 위한 공통 워크플로우를 제공합니다. 이 프로토콜에는 고품질 유전체 DNA(gDNA)부터 저수준 및 복잡한 샘플에 이르기까지 광범위한 투입 재료에 맞게 라이브러리 준비를 조정하는 두 가지의 정규화 방법이 포함되어 있으며, 적은 투입 요구량으로 가장 까다로운 샘플에 대한 가능성을 높여줍니다. 시약 키트의 효율적인 사용과 정확한 판독 할당을 위해 라이브러리 준비 키트에 제공되는 인덱스 어댑터를 사용하면 한 번에 최대 48개의 샘플을 풀링하고 염기서열 분석할 수 있습니다.

Applications

미토콘드리아 DNA는 핵 DNA가 손상되었거나 없을 때 강력한 대체 정보원입니다. 이는 뿌리 없는 머리카락, 치아, 뼈 및 기타 까다로운 출처에 사용되는 mtDNA는 실종자 및 재난 피해자 신원 확인을 위한 일상적인 방법이 되었습니다. 이전에는 기존 Sanger 염기서열 분석 방법과 관련된 품질 및 확장성 문제로 인해 일부 전문 센터에서 제한적인 역할만 했기 때문에 mtDNA가 제한적으로 사용되었습니다. Verogen mtDNA 워크플로우는 성능, 효율성, 사용 편의성을 독창적으로 조합하여 제공하므로 규모와 관계없이 모든 연구실에서 mtDNA 분석을 Sanger 염기서열 분석법에서 NGS로 전환하거나 다른 NGS 기술에서 얻은 결과를 개선할 수 있습니다.

Software

ForenSeq mtDNA Control Region Kit는 UAS의 ForenSeq mtDNA Analysis Module과 원활하게 페어링되어 사용이 간편하고 신속하게 mtDNA 데이터를 검토할 수 있습니다. 이 소프트웨어는 조절 부위(control region)에 대한 염기서열 분석 출력물을 분석하여 실행 완료 후 1시간 이내에 결과를 제공합니다. 연구실은 명확한 대화형 사용자 인터페이스에서 요약된 결과 또는 자세한 결과를 검토하고 최대 아홉 개의 샘플을 비교할 수 있습니다. 보고서는 여러 DNA 데이터베이스와 호환됩니다.

Services

당사는 라이브러리 준비부터 염기서열 분석, 분석에 이르기까지 전체 워크플로우에 걸쳐 탁월한 지원을 제공합니다. 당사의 숙련된 팀이 장비 및 소프트웨어에 대한 포괄적인 서비스 범위, 밸리데이션 계획 및 구현 지침을 제공하여 워크플로우를 쉽게 운영할 수 있도록 지원합니다.

Resources

Labware Documents (1)
ForenSeq mtDNA Control Region Kit Materials 
Kit Handbooks (1)
ForenSeq mtDNA Control Region Kit Reference Guide
Brochures & Guides (2)
Seek answers, not profiles with the QIAGEN-Verogen partnership

The benefits of next-generation sequencing for human identification


Quick-Start Protocols (1)
ForenSeq mtDNA Control Region Kit Checklist
Analysis Software (1)
Universal Analysis Software v2.0 and above Reference Guide
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)