miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays

LNA 강화 프로브 기반 qPCR을 사용하여 매우 민감하고 정확한 mature miRNA 정량화

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miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assay (200)

Cat. No. / ID:  339350

LNA 강화 표적 특이적 정방향 프라이머 및 프로브가 포함된 완전 사전 혼합 분석으로, 200 reaction용.
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₩232,000.00
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Features

  • LNA 강화 및 miRNA 특이적인 정방향 PCR 프라이머 및 가수분해 프로브
  • miRNA 복사본 1개까지 매우 낮은 검출 범위에서 실제 신호 검출
  • 2시간의 빠르고 간단한 2단계 워크플로우
  • 신뢰할 수 있는 결과를 위한 높은 수준의 강건성과 재현성

Product Details

miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays는 miRNA PCR 프라이머-프로브 세트로 miRCURY LNA miRNA Probe PCR System을 사용하여 매우 민감하고 특이적인 miRNA 정량화를 가능하게 합니다. 이 시스템은 강력하고 민감하여 혈청, 혈장, 소변 등 RNA 함량이 낮은 샘플에서 miRNA를 정확하게 검출할 수 있습니다. 정방향 PCR 증폭 프라이머와 FAM 및 어두운 소광제 라벨이 있는 프로브 모두 miRNA 특이적이며 LNA 기술로 최적화되어 분석 성능을 향상시킵니다. 모든 중요 miRNA에 대한 분석은 웨트 벤치(wet-bench)로 검증되었습니다. miRBase의 모든 miRNA를 다루는 사전 설계된 분석과 유사하게 동일한 설계 알고리즘을 사용하여 관심 있는 모든 miRNA에 대해 miRCURY LNA miRNA Custom Probe PCR Assay를 손쉽게 생성할 수 있습니다.

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Performance

실제 신호에 대한 고감도 검출

miRCURY LNA miRNA Probe Assays의 탁월한 민감도는 범용 역전사를 LNA 강화, Tm 정규화, miRNA 특이적 프라이머 및 프로브와 결합함으로써 얻은 것입니다. 이 조합을 사용하면 사전 증폭 없이 최소 1pg의 총RNA 또는 최소 1개의 분자에서 개별 miRNA를 정확하고 안정적으로 정량화할 수 있습니다( 소량의 시재료로도 정확한 정량화 가능 및 광범위한 동적 범위에서 뛰어난 효율성 제공 참조). 이 시스템은 민감도와 신속한 워크플로우로 인해 특히 혈청 또는 혈장 샘플에 적합합니다. QuantiNova 효소는 첫 번째 시도에서 기술적 복제와 생물학적 복제 간에 고도로 재현 가능한 결과를 보장하여 샘플 물질과 시간을 절약할 수 있습니다.

miRCURY LNA miRNA Probe Assays의 LNA 강화 프라이머 및 프로브 모두 특이성을 생성하기 위해 프로브에만 의존하는 기타 miRNA 프로브 기반 PCR 시스템과 비교하여 miRNA 특이적이며 표적에 결합할 때 중첩되지 않을 만큼 충분히 짧습니다( miRCURY LNA miRNA Probe PCR System 개요 참조). 결과적으로 miRCURY LNA miRNA Probe Assays는 효율성( 대체 솔루션에 비해 향상된 효율성 참조), 선형성 사전 증폭 없는 민감도( 향상된 선형성 및 사전 증폭 없이 높은 민감도 참조) 측면에서 대체 솔루션보다 성능이 뛰어납니다. 이 고유한 기능을 뛰어난 신호 대 잡음비( 높은 RNA 배경에서도 정확한 검출 참조)와 결합하여 사용하면 밀접하게 관련된 miRNA를 뉴클레오티드 1개 정도의 미세한 서열 차이로 구별할 수 있습니다( 단일 뉴클레오티드 차이까지의 변별력 참조).

검증 및 최적화 완료

분석 설계(프라이머 및 프로브)는 LNA 및 분석 전문가가 만든 설계 알고리즘을 기반으로 합니다. 이 포괄적인 알고리즘은 매우 엄격한 성능 기준에 따라 인실리코(in silico) 검증을 거친 매개변수 60개를 평가하고 최적화하여 설계에서 최고 수준의 민감도를 제공하도록 보장합니다. 그 결과 분석에서 1개의 miRNA 복사본까지 검출할 수 있습니다. 모든 중요 miRNA에 대한 분석도 웨트 벤치(wet-bench)로 검증되었습니다.

적용 범위

모든 miRBase 22에 대해 30,000개 이상의 분석을 사용할 수 있습니다. 1,000개 이상의 분석이 민감도, 특이성, 효율성과 배경 테스트를 위한 완전 웨트 랩(wet-lab) 검증을 거쳤습니다. 나머지 분석은 엄격한 분석 성능 기준을 갖춘 포괄적인 설계 알고리즘을 사용하여 인실리코(in silico) 검증을 거쳤습니다. 이는 각 유기체에 대한 최적의 민감도와 특이성으로 고품질의 종 특이적 LNA 강화 분석을 보장합니다. NGS 실험과 같이 새 miRNA를 사용하면 miRCURY LNA miRNA Custom Probe PCR Assays를 사용하여 고유한 분석을 설계할 수 있습니다.

신속성 및 용이성

쉽게 따라할 수 있는 2시간 프로토콜을 통해 시간과 노력을 절약할 수 있습니다. 범용 전사 및 최적화된 RT-PCR 프로토콜을 사용하면 다른 솔루션에 비해 절차가 크게 간소화됩니다. 또한 RT 단계에서 생성된 cDNA를 miRCURY LNA miRNA Probe PCR System 전체에서 사용할 수 있어 연구 요구 사항에 따라 패널에서 분석으로 원활하게 전환하고 샘플 물질과 시간을 절약할 수 있습니다. 피펫팅 단계의 수가 최소한으로 줄어들어 기술적 변동도 최소화됩니다. 분석 강건성으로 인해 실온 설정 및 실행 지연이 가능하여 유연성이 향상되고 자동화에 사용할 수 있습니다(반응 안정성 및 설정 강건성 참조). 또한 이처럼 간소화된 워크플로우가 ISO 준수 분석 제조 기술( 로트 간 높은 일관성 참조)과 결합되어 매우 높은 수준의 일별 및 현장 간 재현성을 달성할 수 있습니다.

See figures

Principle

miRCURY LNA miRNA Probe PCR System을 사용하면 real-time PCR을 통해 miRNA를 민감하고 특이적으로 정량화하고 프로파일링할 수 있습니다. 검출은 FAM 및 어두운 소광제 라벨이 있는 프로브 및 소광제 라벨이 있는 가수분해 프로브를 기반으로 합니다. 이 시스템은 miRNA를 cDNA로 변환하고 miRNA의 후속 qPCR 검출과 관련된 모든 단계를 다룹니다. miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays는 QuantiNova Probe Master Mix를 사용하여 검증되었습니다. qPCR에 다른 시약을 사용하면 결과가 영향을 받습니다.

RNA Spike-In Kit for RT

RNA Spike-In Kit를 사용하면 miRCURY LNA miRNA Probe PCR 실험의 RNA 분리, cDNA 합성 및 PCR 증폭 단계를 정도 관리할 수 있어 프로세스 초기에 품질이 좋지 않은 샘플을 식별하고 시간과 시약을 절약할 수 있습니다. 이 키트에는 UniSp2, UniSp4, UniSp5 RNA 스파이크인 템플릿 혼합물과 cel-miR-39-3p RNA 스파이크인 템플릿이 포함되어 있습니다.

miRCURY LNA RT Kit

두 가지 검출 시스템을 위한 하나의 범용 역전사 키트입니다. miRCURY LNA RT Kit는 검출에 SYBR Green을 이용하는 miRCURY LNA miRNA PCR System과 프로브 기반의 miRCURY LNA miRNA Probe PCR System 모두에 사용됩니다. 이 키트에는 시스템별 반응 완충액 두 개와 단일 반응 단계에서 빠르고 편리한 miRNA 아데닐중합체형성 및 역전사를 수행하는 데 필요한 모든 시약이 포함되어 있습니다.

miRCURY LNA Probe PCR Kit

이 키트는 miRCURY LNA miRNA Probe PCR System을 위해 최적화되었고 이 시스템 전용으로 설계되었으며, 고성능 QuantiNova Probe Master Mix 및 miRCURY Probe Universal Reverse Primer가 포함되어 있습니다. miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assay 또는 miRCURY LNA miRNA Probe PCR Panel과 결합된 이 화학 기술을 사용하면 정량적 real-time PCR을 통해 miRNA를 검출할 수 있습니다.

miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays

이러한 프라이머 및 프로브 분석은 miRBase 22의 최신 서열 정보를 사용하여 mature miRNA를 검출하도록 설계된 miRNA 특이적인 가수분해 프로브와 miRNA 특이적인 정방향 프라이머를 사용합니다. miRCURY Probe Universal Reverse Primer는 miRCURY Probe PCR Kit에 포함되어 있습니다.

miRCURY LNA miRNA Probe PCR Panels

사전 설계되어 즉시 사용 가능한 일회용 PCR 패널 플레이트는 miRNome, 특정 경로, 혈청/혈장과 같은 특정 샘플 유형 또는 사용자가 설계한 맞춤형 패널에 중점을 두고 mature miRNA를 신속하게 프로파일링합니다.

GeneGlobe 데이터 분석 센터

무료로 이용 가능한 웹 기반 분석 도구로, 사용하기 쉬운 마법사를 통해 데이터의 정규화 및 분석을 단계별로 안내하고 발표할 수 있는 수치를 생성합니다.

스파이크인 분석
제품명 대조 유형 대조에 사용됨 표적 템플릿
UniSp2 miRCURY LNA miRNA Probe Assay 스파이크인 대조 분석 추출 효율성 UniSp2 – 합성 RNA 템플릿, RNA Spike-In Kit에 포함, RT용 – 339390
UniSp4 miRCURY LNA miRNA Probe Assay 스파이크인 대조 분석 추출 효율성 UniSp4 – 합성 RNA 템플릿, RNA Spike-In Kit에 포함, RT용 – 339390
UniSp5 miRCURY LNA miRNA Probe Assay 스파이크인 대조 분석 추출 효율성 UniSp5 – 합성 RNA 템플릿, RNA Spike-In Kit에 포함, RT용 – 339390
UniSp6 miRCURY LNA miRNA Probe Assay RT 대조 분석 역전사 반응 UniSp6 – 합성 RNA 템플릿으로 miRCURY LNA RT Kit에 포함 – 339340
UniSp9 miRCURY LNA miRNA Probe Assay IPC – 플레이트 간 캘리브레이터 PCR 반응 UniSp9 – 합성 DNA 템플릿. 플레이트에서 분석물이 발견됨. 플레이트(패널)에만 사용 가능
cel-miR-39-3p miRCURY LNA miRNA Probe Assay RT 대조 분석 역전사 반응 UniSp6 – 합성 RNA 템플릿, RNA Spike-In Kit에 포함, RT용 – 339390
대조 분석
제품명 표적 유기체 대체 이름 NCBI 참조
Control primer set, SNORD38B(hsa) hsa U38B, RNU38B NR_001457
Control primer set, SNORD44(hsa) hsa U44, RNU44 NR_002750
Control primer set, SNORD48(hsa) hsa U48, RNU48 NR_002745
Control primer set, SNORD49A(hsa) hsa U49, U49A, RNU49 NR_002744
Control primer set, SNORA66(hsa) hsa U66, RNU66 NR_002444
Control primer set, 5S rRNA(hsa) hsa, mmu V00589  
Control primer set, U6 snRNA (hsa, mmu) hsa, mmu, rno U6 X59362
Control primer set, RNU5G snRNA (mmu, hsa) mmu, hsa, rno Rnu5a, U5a, Rnu5g NR_002852
Control primer set, RNU1A1 (mmu, hsa) mmu, hsa, rno Rnu1a-1, Rnu1a1 NR_004411
Control primer set, SNORD65(mmu) mmu U65, RNU65 NR_028541
Control primer set, SNORD68(mmu) mmu U68, RNU68 NR_028128
Control primer set, SNORD110(mmu) mmu U110, RNU110 NR_028547

Procedure

첫 번째 단계인 역전사 반응은 수행하기 쉬운 단일 튜브 반응입니다. mature miRNA 검출을 위해 miRNA가 포함된 총RNA가 시재료로 사용되고, 생성된 cDNA는 LNA 강화 프라이머 및 가수분해 프로브와 함께 real-time PCR 증폭에 사용됩니다. 이를 통해 miRNA 정량화 및 프로파일링을 간단하게 수행할 수 있으며 real-time PCR 사이클러를 갖춘 모든 실험실에서 액세스할 수 있습니다.

Applications

miRCURY LNA miRNA Probe PCR Assays는 miRCURY LNA miRNA Probe PCR System의 일부로 다음 용도에 사용됩니다.

  • miRNA 발현 검출, 프로파일링, 정량화
  • miRNA 바이오마커 개발 – 스크리닝 및 식별
  • miRNA 조절 및 경로 분석
  • 복잡한 샘플 유형 및 miRNA 발현 수준이 낮은 샘플(예: 엑소솜, 혈청, 혈장, 소변, FFPE 절편)에서 miRNA 검출
  • snoRNA 감지
  • miRNA 염기서열 분석 검증

Supporting data and figures

Resources

Quick-Start Protocols (1)
Safety Data Sheets (1)
Kit Handbooks (2)
For highly sensitive, real-time RT-PCR detection of miRNAs using hydrolysis probes
For highly sensitive, ultrafast real-time RT-PCR detection of miRNAs from exosomes, serum/plasma, and other biofluids
Certificates of Analysis (1)