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Kat.-Nr. / ID. 250133
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Das QIAcuity High Multiplex Probe PCR Kit enthält einen 4-fach konzentrierten, gebrauchsfertigen Master-Mix, der für den mikrofluidischen Einsatz in den QIAcuity Nanoplates optimiert ist. Das Kit steigert die Spezifität und Effizienz der sondenbasierten digitalen PCR und ermöglicht eine genaue Singleplex- oder bis zu 12-plex-Analyse. Sie können 8-plex-Reaktionen ansetzen, indem Sie sechs QIAcuity-Kanäle (ein Assay/Kanal) plus zwei Long-Stokes-Shift(LSS)-Farbstoffe verwenden. Zur Analyse von bis zu 12 Zielen können Sie Amplituden-Multiplexierung durchführen, indem Sie zwei unterschiedliche Assays pro Kanal mischen.
Der QIAcuity High Multiplex Probe Master Mix wurde optimiert, um die Spezifität zu steigern und so eine genaue Quantifizierung von gDNA bzw. cDNA auf den QIAcuity dPCR-Geräten zu ermöglichen.
Das Kit wird zusammen mit dem QIAcuity Digital PCR System und den QIAcuity Nanoplates verwendet.
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Mit der digitalen QIAcuity PCR-Plattform können Sie die Herausforderungen der Hochmultiplex-PCR zum Teil dank der benutzerdefinierten Interferenzmatrix (Crosstalk) in der QIAcuity Software 3.0 lösen. Diese neue Softwarefunktion kompensiert optische Signalüberlagerungen (Crosstalk) zwischen benachbarten Kanälen. Zusammen mit der speziellen Chemie des QIAcuity High Multiplex Probe PCR Kit können Sie Ziele in bis zu acht Kanälen nachweisen: sechs optische Standardkanäle und zwei Hybridkanäle, die Hydrolyse-Sonden mit Long-Stokes-Shift(LSS)-Farbstoffen verwenden ( Abbildung 1).
Mit der QIAcuity Software 3.1 und dem QIAcuity High Multiplex Probe PCR Kit können Sie bis zu 12 Ziele in sechs Kanälen nachweisen (s Abbildung 2 und Abbildung 3).
Durch seinen neuartigen, Antikörper-vermittelten Hot-Start-Mechanismus bietet das QIAcuity High Multiplex Probe PCR Kit Single- oder Multiplex-cDNA- und -gDNA-Analysen mit höchster Spezifität. Bei niedrigen Temperaturen wird die QuantiNova DNA Polymerase durch QuantiNova Antibody und QuantiNova Guard, ein neuartiges, den Komplex stabilisierendes Additiv, in einem inaktiven Zustand gehalten. Dies verbessert die Stringenz des Hot-Starts und verhindert die Verlängerung von unspezifisch hybridisierten Primern und Primer-Dimeren. Innerhalb von 2 Minuten nach Temperaturerhöhung auf 95 °C werden der QuantiNova Antibody und das QuantiNova Guard denaturiert und die QuantiNova DNA Polymerase aktiviert, was die PCR-Amplifikation ermöglicht.
Das Prinzip der dPCR-Reaktion in den Nanoplatten finden Sie hier beschrieben.
Das QIAcuity High Multiplex Probe Kit enthält einen gebrauchsfertigen 4-fach-PCR-Master-Mix, mit dem keine Optimierung der Reaktions- und Cycling-Bedingungen mehr notwendig ist. Geben Sie einfach die Template-DNA und die Primer-Sonden-Sets zum Master-Mix und befolgen Sie das Quick-Start-Protokoll, um schnelle und zuverlässige Ergebnisse mit dem QIAcuity zu erhalten.
Das System integriert Partitionierung, Thermocycling und Bildgebung in nur einem vollautomatischen Gerät, mit dem Sie in weniger als 2 Stunden von der Probe zum Ergebnis gelangen. Mit der Software Suite können Sie Ihre Ergebnisse analysieren, die Konzentration Ihrer Zielsequenz in Kopien pro Mikroliter ermitteln und Daten zu positiven Proben bzw. NTC für die Qualitätskontrolle erhalten. Diese Auswertung kann für mehr Benutzerfreundlichkeit auch auf Remote-Computer innerhalb desselben lokalen Netzwerks (LAN) ausgedehnt werden.
In Kombination mit dem QIAcuity Digital PCR System und den QIAcuity Nanoplates ermöglicht das QIAcuity High Multiplex Probe PCR Kit die quantitative Analyse von cDNA-Zielen und gDNA für den Einsatz in Anwendungen wie:
Es wurden 8-plex-Reaktionen zusammengestellt, um die Kopienzahl von sechs Genen von Interesse (GOIs) – FLT3, VEGFA, MYCN, ERBB2, EGFR, MAPK1 – zwischen einem gesunden menschlichen Spender und der U-2-OS-Sarkom-Zelllinie zu vergleichen. Zur Normalisierung wurde die mittlere Kopienzahl der Referenzgene AGO1 und AP3B1 verwendet. Alle acht Genziele wurden zum Vergleich auch in Singleplex-Reaktionen quantifiziert. Sowohl bei Singleplex- als auch bei 8-plex-Reaktionen lag die Kopienzahl der sechs ausgewählten GOI und der beiden Referenzgene des gesunden Spenders erwartungsgemäß bei etwa 2. Im Gegensatz dazu zeigten die Ergebnisse der Singleplex- und der 8-plex-Reaktionen eine Genominstabilität in der Sarkomzelllinie, wobei die GOI-Kopienzahlen zwischen 1,25 und 3,3 variierten. Selbst die Referenzgene zeigten eine leichte Instabilität.
