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MagAttract HMW DNA Kit (48)
Cat. No. / ID: 67563
DNA 제제 48개용: MagAttract 현탁액 G, Buffer ATL, Buffer AL, Buffer MB, Buffer MW1, Buffer PE, Proteinase K, RNase A, Buffer AE, Nuclease-Free Water
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MagAttract HMW DNA Kit은/는 분자생물학 분야에 사용하기 위한 것입니다. 이 제품은 질병의 진단, 예방, 또는 치료용이 아닙니다.
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Features
- 고분자량 DNA의 재현 가능한 분리
- 다양한 샘플 물질의 높은 수율 및 순도
- 빠르고 편리한 프로토콜
- 억제제 완전 제거
Product Details
MagAttract HMW DNA Kit를 사용하면 간단한 자성 비드 기반 프로토콜을 사용하여 고분자량(100–200kb) DNA를 정제할 수 있습니다. 그 정제 절차는 오염 물질과 억제제를 부드럽게 제거하는 동시에 매우 높은 수율과 순도를 제공합니다. 추출되는 유전체 DNA는 보관 및 차세대 염기서열 분석(Next-Generation Sequencing, NGS)을 포함한 다양한 응용 분야에 적합합니다.
Performance
MagAttract HMW DNA Kit를 사용하면 150kb를 초과하는 유전체 DNA를 재현 가능한 방식으로 분리할 수 있습니다. MagAttract HMW DNA Kit 및 기타 자성 비드 기반 절차를 사용하여 분리한 DNA를 펄스장 겔 전기영동법을 사용하여 비교했습니다. MagAttract HMW DNA Kit는 고분자량 DNA 분리에서 탁월한 성능을 입증했습니다(그림 성공적인 고분자량 DNA 분리 참조).
일관된 높은 수율 및 순도
MagAttract HMW DNA Kit는 편리하면서도 간단한 절차를 통해 높은 수율의 순수한 고분자량 DNA를 제공합니다. 까다롭지 않은 용해 조건은 DNA 단편화를 최소화하는 동시에 오염 물질과 PCR 억제제를 효율적으로 제거하여 순수한 고분자량 DNA를 생성합니다. MagAttract HMW DNA Kit의 최적화된 화학 작용과 절차를 통해 다른 공급업체의 기존 스핀 컬럼 또는 자성 비드 기반 방법에 비해 DNA 수율과 순도가 크게 향상되었습니다(그림 가장 높은 수율과 순도 및 다양한 샘플 유형에서 향상된 수율 참조).
효과적 PCR 억제제 제거
real-time PCR 또는 NGS와 같이 매우 민감한 응용 분야에서는 항응고제, 효소, 2가 양이온 및 기타 억제제를 제거해야 합니다. MagAttract HMW DNA Kit를 사용하여 안정화한 EDTA, 헤파린, 구연산염으로 혈액 샘플을 안정화하여 real-time PCR 증폭을 통해 DNA를 분리했습니다. 어떠한 샘플에서도 억제가 관찰되지 않았는데, 이는 CT 값과 샘플 투입량 간의 높은 선형성 상관관계를 보여줍니다(그림 항응고 혈액에서 추출한 샘플에서 억제가 관찰되지 않음 참조).
차세대 염기서열 분석을 위한 유전체 DNA
대량의 병렬 염기서열 분석(Massively Parallel Sequencing, MPS) 이후 기술은 짧은 판독 길이를 활용하므로 10kb를 초과하는 무손상 유전체 DNA를 사용하여 염기서열 분석을 수행할 수 있습니다. 그러나 새로운 유전체 조립과 유전 및 후천적 구조 변종 발견은 표준 DNA 정제 제품에 여전히 까다로운 과제로 남아 있습니다. 인서트가 더 큰 Mate-pair 라이브러리는 특히 복잡한 반복이 많은 유전체의 경우 염기서열 분석 성공에 큰 영향을 미칠 수 있습니다. MagAttract HMW DNA Kit로 얻은 고분자량 유전체 DNA는 NGS 실험에 즉시 사용할 수 있습니다
| 파라미터 | 사양 |
|---|---|
| 총(긴)매핑 판독 수 | 6521106 |
| 오류율 | 0.36% |
| Indel 비율 | 0.01% |
| 키메라 | 0.14% |
| 중복률 | 1.15% |
See figures
Principle
유전체 DNA의 분리는 모든 DNA 분석 방법에서 중요한 단계입니다. 일반적으로 주요 파라미터는 분리된 DNA의 수율, 순도 및 무결성입니다. PCR, 염기서열 분석 또는 혼성화 기술과 같은 표준 방법의 경우 10–30kb 범위의 분자량이 충분할 수 있지만, BAC 또는 포스미드 라이브러리 생성이나 DNA 보관과 같은 일부 민감한 방법에는 유전체 DNA에 더 높은 무결성이 필요합니다.
MagAttract HMW DNA Kit는 인간 또는 동물 조직, 혈액, 박테리아를 포함한 광범위한 샘플에서 고분자량 DNA를 제공하도록 특별히 설계되었습니다. 이 키트는 고성능 자성 비드와 혁신적인 실리카 기반 화학 물질의 효율적인 조합을 사용합니다. 고성능 자성 입자는 분리된 DNA의 높은 수율과 순도를 보장합니다.
MagAttract HMW DNA Kit는 인간 또는 동물 조직, 혈액, 박테리아를 포함한 광범위한 샘플에서 고분자량 DNA를 제공하도록 특별히 설계되었습니다. 이 키트는 고성능 자성 비드와 혁신적인 실리카 기반 화학 물질의 효율적인 조합을 사용합니다. 고성능 자성 입자는 분리된 DNA의 높은 수율과 순도를 보장합니다.
Procedure
편리한 MagAttract 프로토콜을 사용하면 70분 만에 재현 가능한 결과를 얻을 수 있습니다.
빠르고 최적화된 프로토콜
최적화된 완충액과 효소는 샘플을 부드럽게 용해하고 유전체 DNA의 단편화를 최소화합니다. 이 절차는 용해, 결합, 세척, 용출이라는 4개의 간단한 단계로 구성되어 있습니다. 샘플 용해 후에는 DNA가 자성 비드 표면에 결합됩니다. 세척 단계 중 오염 물질과 PCR 억제제가 효과적으로 제거되고 순수한 고분자량 DNA가 Buffer AE에서 용출됩니다(그림 MagAttract HMW DNA Kit 절차 참조).
빠르고 최적화된 프로토콜
최적화된 완충액과 효소는 샘플을 부드럽게 용해하고 유전체 DNA의 단편화를 최소화합니다. 이 절차는 용해, 결합, 세척, 용출이라는 4개의 간단한 단계로 구성되어 있습니다. 샘플 용해 후에는 DNA가 자성 비드 표면에 결합됩니다. 세척 단계 중 오염 물질과 PCR 억제제가 효과적으로 제거되고 순수한 고분자량 DNA가 Buffer AE에서 용출됩니다(그림 MagAttract HMW DNA Kit 절차 참조).
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Applications
MagAttract HMW DNA Kit로 얻은 고분자량 유전체 DNA는 NGS 실험에 즉시 사용할 수 있습니다. 이는 소형 인서트 및 대형 인서트가 모두 포함된 라이브러리 생성에 사용할 수 있으므로 모든 염기서열 분석 응용 분야에 적합합니다.
Supporting data and figures
MagAttract HMW DNA Kit(세포)를 사용한 크기 분포 예시
MagAttract HMW DNA Kit를 사용한 세포의 DNA 크기 분포 예시. 샘플은 Femto Pulse System을 사용하여 분석하고 신호는 최대 피크로 정규화했습니다.
Specifications
| Features | Specifications |
|---|---|
| Sample amount | 혈액 200μl, 조직 25mg 이하, 박테리아 세포 2 x 10e9 |
| Process time | 샘플 12개의 경우 약 70분 |
| Elution volume | 100-200µl |
Resources
Brochures & Guides (1)
Kit Handbooks (1)
Quick-Start Protocols (1)
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)
FAQ
Can I scale up reagents if I want to use more sample with the MagAttract HMW DNA Kit (cat. no. 67563)?