Verogen ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit

用于进行方便的文库制备,以对整个线粒体基因组进行测序

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Verogen ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit

Cat. No. / ID:  V16000086

包括用于制备完整的 mtDNA 全基因组文库的 48 次反应所需的全部主要试剂
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Verogen ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit 旨在用于法医鉴定、人类身份识别、亲子鉴定等领域的分子生物学应用场景。该产品不能用于疾病诊断、预防和治疗。

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Features

  • 以极小的 DNA 输入量实现出色的数据恢复
  • 扩展组合可促进群体研究
  • 增强对严重降解样本的分辨力
  • 多重能力进一步提高了工作效率

Product Details

ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit 提供方便的高性价比文库制备,可对整个线粒体基因组 (mtGenome) 进行测序,DNA 输入量极小,数据恢复能力出色。该试剂盒利用成熟可靠的 ForenSeq 化学试剂,产生的扩展数据集可促进群体研究或增强对严重降解样本的分辨力。此外,在所有商用的全基因组检测中,该解决方案的标价最低。在不增加成本或时间的情况下,多重能力进一步提高了工作效率。

Performance

ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit 具有 Verogen 文库制备产品组合中最高的 mtGenome 测序分辨力。平铺扩增子、适用的缓冲液和精心设计的方案可支持较低端的 DNA 输入量、各种类型的样本以及种类多样的法医和数据库应用,包括失踪人口、灾难受害者鉴定(Disaster Victim Identification,DVI)和人口研究。

  • 对各种 gDNA 输入都具有高灵敏度
  • 提高低输入样本的回收率
  • 对常见抑制剂具有强大抗性

该方案包括可选的二次纯化,可进一步提高低水平和复杂样本的性能。图“在各种 DNA 输入量范围下的高覆盖率”显示了经过和未经过二次纯化的文库的覆盖率比较结果。与单次纯化相比,两次纯化的覆盖率逐步提高,最终在 2 pg 下提高了 90%(见图“二次纯化后的读数提高”)。法医样本分析的另一个挑战是 PCR 抑制剂的频繁出现会影响文库制备。将法医 mtDNA 样本中常见的三种不同量的抑制剂加入 100 pg 的对照 DNA HL60 中时,图“对相关 PCR 抑制剂具有高抗性的缓冲液”在所有输入量下都表现出了高抗性和一致的覆盖率。

特点 详细信息
推荐的 DNA 输入量 每个样本 100 pg gDNA
试剂盒配置 48 次反应
多重能力 每次测序运行处理 16 个文库
引物数量 >500
扩增子数量 245
平均扩增子大小 131 bp
扩增子重叠 ≥3 bp
文库制备总时间 7 小时 45 分钟
手动操作时间 1 小时 45 分钟

Principle

这种基于 PCR 的靶向检测利用来自最新 mtDNA 数据库的小扩增子来加强变体检测。平铺引物方法将扩增子重叠在一起,以防止序列间隙导致数据丢失,尤其是在已降解样本中。作为对这种平铺引物设计的补充,增强型缓冲液系统对钙、腐植酸和其他相关 PCR 抑制剂具有出色的抗性。

Procedure

这种易用、兼容自动化的解决方案为跨越多个应用领域的各种研究设计提供了通用的工作流程。该方案包括两种归一化方法,可针对从高品质基因组 DNA (gDNA) 直至低水平和复杂样本的多种输入材料进行定制的文库制备。低输入量需求扩充了最具挑战性样本的可行解决方案。为了高效使用试剂盒和准确分配读数,文库制备试剂盒中提供的index接头允许在一次运行中对多达 16 个样本进行汇集和测序。全基因组试剂盒的平铺扩增子设计适合分析整个 16,569 bp 人类 mtGenome。该检测包括用于扩增约 500 个小扩增子的试剂,可通过两次 PCR 反应覆盖整个基因组。

Applications

当核 DNA 受损或缺失时,线粒体 DNA 是一种强大的替代信息来源。mtDNA 用于无根毛发、牙齿、骨骼和其他具有挑战性的来源,已成为失踪人员和灾难受害者身份鉴定工作的常规手段。以前,由于传统 Sanger 测序方法存在的质量和规模问题,mtDNA 只能在少数专业中心发挥有限的作用。Verogen mtDNA 工作流程提供了性能、效率和易用性的独特组合,因此任何规模的实验室都能将 mtDNA 分析从 Sanger 测序过渡到 NGS,或改进从其他 NGS 技术获得的结果。

Software

为了快速审查 mtDNA 数据,ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit 与 Universal Analysis Software (UAS) 中的 ForenSeq mtDNA 分析模块无缝配对。UAS 为分析和管理鉴证基因组数据提供了一个 NGS 平台,简化了复杂的生物信息学。该软件可分析整个线粒体基因组的测序输出,并在运行完成后不到一小时内提供结果。实验室可在清晰的交互式用户界面上回顾汇总或详细结果,并对多达九个样本进行比较。报告与多个 DNA 数据库兼容。

Services

我们为从文库制备到测序再到分析的整个工作流程提供卓越支持。我们经验丰富的团队为您的设备和软件提供全面的服务覆盖、验证计划和实施指导,使您能快速轻松地将工作流程投入运行。

Resources

产品介绍与指南 (2)
Seek answers, not profiles with the QIAGEN-Verogen partnership

The benefits of next-generation sequencing for human identification


耗材文档 (1)
ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit Materials 
快速启动实验方案 (1)
ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit Checklist
分析软件 (1)
Universal Analysis Software v2.0 and above Reference Guide
试剂盒操作手册 (1)
ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit Reference Guide
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)