MagAttract HMW DNA Kit

用于分离高分子量基因组 DNA

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MagAttract HMW DNA Kit (48)

Cat. No. / ID:  67563

用于 48 次 DNA 制备:MagAttract Suspension G、Buffer ATL、Buffer AL、Buffer MB、Buffer MW1、Buffer PE、Proteinase K、RNase A、Buffer AE、Nuclease-Free Water
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MagAttract HMW DNA Kit 旨在用于分子生物学应用。该产品不能用于疾病诊断、预防和治疗。

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Features

  • 可重现的高分子量 DNA 分离
  • 从一系列样本材料中获得高产量和高纯度
  • 快速便捷的方案
  • 完全清除抑制物

Product Details

MagAttract HMW DNA Kit 可使用基于磁珠的简单方案纯化高分子量 (100–200 kb) DNA。纯化操作流程能温和地去除污染物和抑制物,同时提供很高的产量和纯度。提取的基因组 DNA 适用于多种应用,包括归档和下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)。

Performance

MagAttract HMW DNA Kit 可确保以可重现的方式分离大于 150 kb 的基因组 DNA。使用脉冲场凝胶电泳比较了使用 MagAttract HMW DNA Kit 和其他磁珠型操作流程分离的 DNA。MagAttract HMW DNA Kit 在分离高分子量 DNA 方面表现出更高性能(见图 成功分离高分子量 DNA)。


稳定的高产量和高纯度
MagAttract HMW DNA Kit 采用方便、直接的操作流程来提供高产量的高分子量纯 DNA。温和的裂解条件可尽量减少 DNA 断裂,同时高效去除污染物和 PCR 抑制物,从而获得高分子量纯 DNA。与其他供应商提供的传统离心柱或磁珠型方法相比,MagAttract HMW DNA Kit 经过优化的化学成分和操作流程显著提高了 DNA 产量和纯度(见图 最高产量和纯度 提高了各种样本类型的产量)。


有效去除 PCR 抑制物
Real-time PCR 或 NGS 等高灵敏度应用需要去除抗凝剂、酶、二价阳离子和其他此类抑制物。使用 MagAttract HMW DNA Kit 对从经过 EDTA、肝素和柠檬酸盐稳定的血样中分离出来的 DNA 进行了 real-time PCR 扩增。所有样本均未出现抑制现象,这表明 CT 值与样本量输入存在高度线性关联(见图 从抗凝血衍生的样本中无抑制)。


可随时用于下一代测序的基因组 DNA
由于大规模并行测序(Massively Parallel Sequencing,MPS)技术使用的是短序列长度,因此可以使用大于 10 kb 的完好基因组 DNA 进行测序。但对于标准 DNA 纯化产品而言,从头进行基因组组装以及遗传性和获得性结构变异的发现仍具挑战性。插入片段较大的大片段两端序列文库可能会对测序成功率产生重大影响,尤其是对于富含复杂重复序列的基因组。使用 MagAttract HMW DNA Kit 获得的高分子量基因组 DNA 可随时用于 NGS 实验

下一代测序实验(大片段两端序列)的代表性结果
参数 规格
总(长)比对序列数 6521106
错误率 0.36%
Indel 率 0.01%
嵌合体 0.14%
重复百分比 1.15%
See figures

Principle

分离基因组 DNA 是任何 DNA 分析方法的关键步骤。关键参数一般是分离的 DNA 的产量、纯度和完整性。虽然对于 PCR、测序或杂交技术等标准方法来说,10–30 kb 范围的分子量足以满足需要,但一些敏感的方法,如 BAC 或福斯质粒文库的生成或 DNA 的归档,对基因组 DNA 完整性的要求更高。
MagAttract HMW DNA Kit 专为从各种样本(包括人体或动物组织、血液和细菌)中提取高分子量 DNA 而设计。该试剂盒将高性能磁珠与创新的硅胶基质化学成分高效结合。高性能磁微粒可确保分离的 DNA 具有高产量和高纯度。

Procedure

便捷的 MagAttract 方案可在短短 70 分钟内获得可重现的结果。


快速并经过优化的方案
经过优化的缓冲液和酶可温和地裂解样本,同时确保尽量降低基因组 DNA 的断裂率。操作流程包括 4 个简单步骤:裂解、结合、清洗和洗脱。样本裂解后,DNA 与磁珠表面结合。在清洗步骤中,污染物和 PCR 抑制物得到有效去除,高分子量纯 DNA 在 Buffer AE 中洗脱(见图  MagAttract HMW DNA Kit 操作流程)。

See figures

Applications

使用 MagAttract HMW DNA Kit 获得的高分子量基因组 DNA 可随时用于 NGS 实验。它可用于生成插入片段小或大的文库,因此适用于所有测序应用。

Supporting data and figures

Specifications

FeaturesSpecifications
Sample amount200 μl 血液;最多 25 mg 组织;2 x 10e9 个细菌细胞
Process time12 个样本约 70 分钟
Elution volume100-200 µl

Resources

产品介绍与指南 (1)
Introducing QIAseq
PDF (450KB)
Accelerate your NGS performance through Sample to Insight solutions
试剂盒操作手册 (1)
For isolation of high-molecular-weight DNA from blood, tissue, and bacteria for next-generation sequencing applications
快速启动实验方案 (1)
安全数据表 (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Can I scale up reagents if I want to use more sample with the MagAttract HMW DNA Kit (cat. no. 67563)?

Technically yes, however you would need to use different containers like 15 ml tubes and suitable magnets. You cannot use 2 ml tubes as the protocol states as higher amounts of beads also require more buffer for the protocol to work.

FAQ ID - 3448