digital PCR, dPCR, Nanoplate principle
디지털 PCR

PCR의 새로운 절댓값 – 디지털 PCR

알아보기 – 디지털 PCR(digital PCR, dPCR)

디지털 PCR의 힘 – 건초 더미에서 바늘 찾기

디지털 PCR(Digital PCR, dPCR)은 샘플을 여러 개의 개별 반응으로 분획하여 각 반응에 0개 또는 하나 이상의 표적 분자가 존재하도록 하는 기술입니다. 이 접근 방식을 사용하면, 건초 더미에서 바늘 찾기처럼 네거티브 백그라운드에서 하나의 포지티브를 놀라울 정도로 쉽게 찾아낼 수 있습니다. 이는 낮은 검출 한계로 인해 표준 real-time 정량 PCR(quantitative PCR, qPCR)을 실행하지 못했던 경우 한 가지 방법이 될 수 있습니다.

디지털 PCR의 가장 큰 특징은 핵산의 절대 정량화입니다. 파티셔닝 후, 각 반응은 end-point PCR 사이클링을 거치고 각 파티션에서 형광 신호의 존재(양성 반응) 또는 부재(음성 반응)를 분석합니다. 이 정보를 바탕으로 샘플에 존재하는 분자의 절대적인 수를 계산할 수 있습니다. qPCR과 달리 dPCR은 표준 곡선에 의존하지 않습니다. 덕분에 dPCR은 qPCR보다 검출 한계가 낮고 정밀도가 높습니다.

연구자들은 복제수 변이 분석, 유전자 발현 정량화, 희귀 표적 검출과 같은 민감한 응용 분야에 점점 디지털 PCR을 더 많이 사용하고 있습니다. 이 방법은 세포 및 유전자 치료 연구, 암 연구, 전염병 조사, 식품 검사 등 다양한 분야 발전에 도움을 주었습니다.

당사의 사명은 디지털 PCR 과정에서 겪는 어려움을 극복하는 데 필요한 지식과 도구를 제공하는 것입니다. 어쩌면 건초 더미에서 바늘 찾기도 말처럼 어려운 일은 아닐지 모릅니다.
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디지털 PCR 최신 정보
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웨비나, 사례 등

추천 웨비나 – 병원균 추적: 미생물 감시에 dPCR 및 염기서열 분석 사용

미생물 검출에 어떤 dPCR 플랫폼이 가장 적합한지 궁금하신가요? 그렇다면 전문가가 진행하는 웨비나에 참여하여 dPCR을 통해 미생물 검출 및 감시 작업을 개선하고 미생물을 찾는 수고를 줄이는 방법을 확인해 보세요.

아래에서 미리 들어보세요.

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qPCR vs. dPCR 선택
두 가지 방법을 비교 및 대조하여 어떤 방법이 요구 사항에 가장 적합한지 알아보고 현재의 qPCR 분석을 dPCR로 전환하는 방법을 알아보세요.
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나노플레이트 dPCR 기술

숨은 마법을 공개합니다

디지털 PCR의 샘플 분획 방법에는 미세유체(microfluidic) 칩, 마이크로어레이, 회전 미세유체 디스크, 유수 에멀젼(oil-water emulsion) 기반 미세 방울(droplet) 기술 등이 있습니다. QIAGEN은 친숙함, 사용 편의성, 향상된 해상도를 재구상하여 우수한 분획과 향상된 디지털 PCR 데이터를 얻을 수 있는 미세유체 나노플레이트를 개발했습니다.

Unveiling the magic inside
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미세 방울 없음. 결정 없음. 칩 없음.

나노플레이트에서 디지털 PCR을 수행할 때의 주요 이점은 다음과 같습니다.

  • 사용하기 편하며 친숙한 플레이트는 qPCR과 마찬가지로 피펫팅하기가 용이함
  • 고정 분획으로 크기 변화와 유착이 방지됨
  • 밀봉된 나노플레이트로 웰 간 오염이 방지됨
  • 샘플의 모든 분획물의 동시 측정으로 더욱 신속한 판독이 가능함
  • 통합 품질 관리는 개별 양성 분획 수로부터 개별 형광 신호에 대한 플레이트 이미지를 볼 수 있음을 의미함
  • 플레이트는 프런트 엔드 자동화가 가능함

미세방울 디지털 PCR(droplet digital PCR, ddPCR) 대비 장점

위에서 강조한 장점 외에도 나노플레이트 기반의 QIAcuity Digital PCR System은 미세방울 디지털 PCR 기반 시스템에 비해 상당한 이점을 제공합니다.

전체 디지털 PCR 워크플로가 하나의 시스템에 통합되어 수작업 시간이 단축되고 확장성이 향상되어 훨씬 더 빨라졌습니다.

 dpcr과 ddpcr 비교 자세히 알아보기

dPCR_workflow_comparison

디지털 PCR 응용 분야

특징
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디지털 PCR 탐구

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QIAcuity 나노플레이트 디지털 PCR 관련 FAQ

참고 문헌

Huggett JF et al. (2013). The digital MIQE guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments. Clin Chem. 59(6):892-902.

dMIQE Group, Huggett JF. (2020). The Digital MIQE Guidelines Update: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments for 2020. Clin Chem. 66(8):1012-1029.

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