Verogen MiSeq FGx Sequencing System

法医学ゲノミクスライブラリーの次世代シークエンシングのために

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Verogen MiSeq FGx Sequencing System

Cat. No. / ID:  15048975

バリデーション済みのNGSワークフロー内での広範な法医学ゲノムアプリケーション用に2つのランモードを備えたデスクトップ機器
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$184,774.00
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Verogen MiSeq FGx Sequencing System は、法医学、ヒト個人識別、父子鑑別における分子生物学的アプリケーション向けであり、疾病の診断、予防、治療を目的とはしていません。

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Features

  • 使いやすいタッチスクリーンおよびロードアンドゴーの試薬で高性能ベンチトップシークエンサー
  • 困難なDNAサンプルを加工する高度なキャパシティ
  • 単一のワークフローで数百ものマーカーを調べます
  • ヒト個人識別アプリケーション向けに最適化された柔軟性

Product Details

MiSeq FGx Sequencing Systemは、最初で唯一の次世代シークエンシング(NGS)機器で、法医学ゲノミクス向けに設計・開発・バリデーションされました。実証済みのデータ品質を使いやすさと組み合わせ、このシステムは、究極の判断基準であるNGS技術を基盤とする単一プラットフォームソリューションの鍵となります。法医学遺伝子系図(FGG)のような新しいツールを含め、成長し続けるアプリケーションのポートフォリオのために拡大するよう設計された単一ワークフローで、ライブラリーを調製・シークエンシングし、データを分析します。専用の試薬キットおよび適合する分析ソフトウェアが、すべてのヒト個人識別調査に答えられるようにします。

Performance

MiSeq FGx Systemは、法医学研究室向けに特別に設計されたバリデーション済みのワークフローに不可欠です。このシステムは、法医学研究室の要件に合わせた稼働時の適格性確認および定期的なメンテナンスで完全サポートされています。Illuminaの合成によるシークエンシング(SBS)ケミストリーのスピードと正確度を基盤とするMiSeq FGx Systemは、法医学ゲノミクスをNGSにかつてないほどに注目させる結果となり、刑事司法に協力なサポーターをもたらします。

  • 複雑なDNA混合物および分解したDNAの優れた解析
  • 一体化したシークエンシングワークフローは、ライブラリー調製、シークエンシング、分析を統合します
  • 調整可能リード長、デュアルランモード、2つのフローセルを伴う高度な能力

MiSeq FGx Systemは、1つのランで、最大96個の組み合わせたSNPおよびSTRライブラリーを調べる最初で唯一の機器です。MiSeq FGx Systemは、頑健な性能を発揮し、広範なサンプルタイプ、生物学的分子、および高品質のゲノムDNA(gDNA)から分解、混合した、および限られたサンプルまでに至る品質領域全体にわたる広範なサンプルタイプからより綿密で詳細なDNAプロファイルを作成する一方、貴重なサンプルを保存します。

2つのランモードは、法医学ゲノミクスのアプリケーションの範囲を促進する一方で、研究環境で作業の柔軟性を維持します。現在のアプリケーションまたはサンプルのバッチサイズに対してアウトプットを調整するため、2つのシークエンシングキット間で簡単に切り替えられます。業界最先端のIlluminaのSBSケミストリーを基盤とするMiSeq FGx Systemは、包括的で最終的な結果を得るための厳格な性能要件を満たします。反復配列領域またはホモポリマー内でさえ、コンテキスト特異的なエラーを実質的に取り除き、マルチプレックス能力で1つのターゲットアッセイで広範な疑問に答えます。使いやすいタッチスクリーンのインターフェイスは、機器の操作を容易にし、システムは、ランの最中に品質や性能のメトリクスを監視します。シークエンシングの後、分析は自動的に開始され、1時間足らずで完了します。

特徴 詳細
スループット 1ラン当たり、1–384サンプル、アッセイによって異なる
最大リード長 2 x 300 bp、アッセイによって異なる
アウトプット(2 x 150 bp ラン) ≥ 5 Gb
フィルターを通過するリード数 2,500万
Q30スコア(2 x 150 bpのリード長で) ≥ 80%
全体の正確度合計 ≥ 99.66%
全体の再現性合計 ≥ 99.7%
配列決定できる生体分子 gDNA、RNA、mtDNA
モード 法医学(FGx)および研究での使用専用(RUO)
電源要件 50/60Hz、10A、400 Wで100–240 V AC
RFID高周波 13.56 MHz
RFIDパワー 100 mW
寸法 68.6 cm × 56.5 cm × 52.3 cm (27 in × 22.2 in × 20.6 in
重量 54.5 kg (120 lbs)

Principle

キャピラリー電気泳動(CE)を使用したショートタンデムリピート(STR)のサイズベースの解析に比べて、NGSは、他の技術よりも短時間でDNAサンプルから遺伝子変異の全範囲を検出します。本質的に高感度であるため、Verogen NGS技術は、フラグメントサイズを超えて、内在する配列変異を同定します。包括的な結果を迅速かつ明確に生み出し、ベースごとの配列を表示するので、容易に最大限の確信のある解釈が得られます。STR能力を基盤とし、NGSは、現代の法医学ゲノミクスにさらなる利点をもたらします。たとえば、核の一塩基多型(SNP)、ミトコンドリアDNA(mtDNA)、メッセンジャーRNA(mRNA)、エピジェニックマーカーの解析などで、ヒト個人識別を必要とするケースを強化し、その一方で潜在的に情報性のあるデータに対して技術的限界を比較検討する必要性をなくします。1つのシークエンシングランで優れた結果を達成します。

MiSeq FGx Systemは、単一塩基が超並列DNA鎖内に取り込まれてた単一塩基を検出し独自の可逆的ターミネーターベースの方法を採用することにより、非常に優れたデータ品質を達成します。蛍光ターミネーター色素は、各デオキシヌクレオチド三リン酸(dNTP)が添加されてから分離され、次の塩基の取り込みを可能にするときに造影されます。4つの可逆的ターミネーター結合したdNTPすべてが各シークエンシングサイクルに存在することで、塩基間の競合がバイアスの導入を最小限に抑えます。ソフトウェアは、各導入サイクル中にシグナル強度測定から直接にベースコールを行い、他の技術に比べてraw error rateを低減します。結果は、高度に正確で、ベースごとのシークエンシングで、反復配列領域またはホモポリマー内でさえ、配列前後関係特異的エラーを最小限に抑えます。

Procedure

MiSeq FGx System上で配列決定されたライブラリーは、同じコアNGSワークフロー、すなわちライブラリー調製、シークエンシング、および分析に従います。第一段階では、ライブラリー調製キットを使用して、プライマーを、法医学サンプルから抽出されたゲノムDNA(gDNA)、mtDNAまたはmRNAに添加して、数百ものターゲット領域を同時に捕捉・増幅し、シークエンシングにすぐ使えるデュアルインデックスのライブラリーを作成します。ライブラリー調製の後、ロードアンドゴー試薬でランの設定を合理化します。単に充填済み試薬カートリッジを解凍し、ライブラリーをカートリッジに添加し、カートリッジを機器に挿入します。システムのソフトウェアは、ボタンを押すとランのパラメータを受け入れ、シークエンシングを開始します。

Applications

MiSeq FGx Systemは、生体分子や、短期範囲や長期範囲の親族分析などの増え続けるアプリケーションすべてにわたり機能を有効にします。調整可能なリード長、フローセルのオプション、およびランモードの選択により、拡大し続けるヒト個人識別の必要性の範囲にデータのアウトプットを適合させるため、かつてない柔軟性が可能になります。MiSeq FGx Systemは、分解したDNA、低量のDNA、複雑なDNAの混合物やその他の捜査を複雑にしたり阻んだりしかねない困難なサンプルを分析するため能力を向上させます。小さなアンプリコンサイズは、分解したDNAを調べるのに最適で、その一方で高度に多型なマーカーを含め、多くのマーカーが、CEでは検出されないおそれのある低量のマイナーな構成要素を見極めるためのシステム能力を向上させます。さらに、1つのシークエンシングのランで、数百という法医学的に関連する遺伝子マーカーを調べるため、フラグメントの長さをベースとしたSTRキットの選択を不要にし、また困難なサンプルを受け入れるための交換をする必要もありません。

Software

MiSeq FGx Systemは、消耗品の装填からランの構成設定およびモニタリングに至るまで、シークエンシングの各ランを通して段階的なガイダンスを提供する、使いやすいタッチスクリーンのインターフェイスを特徴としています。オンボードのクラスター生成および自動解析開始により、ハンズオン操作時間を最小限に短縮します。オンボードソフトウェアを補って、システムは、混合サンプルの自動検出、人口統計の作成、データベース適合レポートなどを含め、法医学用に調整された能力の強力な一式をもたらす完全に最適化された解析プラットフォームであるUniversal Analysis Software(UAS)と一体化しています。機器にから独立して、補助ハードウェアやコンピューティングリソースが不要な、専用サーバーにプリインストールされたUASは、機器の設置面積はわずか0.4平方メートルの最小面積を維持します。

Services

当社は、ライブラリー調製からシークエンシング、分析まで全ワークフローにわたって優れたサポートを提供します。当社の経験豊富なチームは、お使いの装置、ソフトウェア、バリデーションプラン、および実践のガイダンスのために包括的なサービスを提供し、ワークフローを容易に操作可能にします。

Specifications

FeaturesSpecifications
重量54.5 kg (120 lb)、木箱梱包重量 90.9 kg (200 lb)
FeaturesNRTL certified IEC 61010-1 CE marked FCC/IC approved
Altitude最大2000 m (6500 ft)
Pollution degree2

Resources

パンフレット (3)
Our improved noninvasive paternity testing workflow delivers answers with greater confidence
Seek answers, not profiles with the QIAGEN-Verogen partnership

The benefits of next-generation sequencing for human identification


解析用ソフトウェア (2)
ForenSeq Universal Analysis Software Guide
Universal Analysis Software v2.0 and above Reference Guide
テクニカルインフォメーション (2)

Combine HT targeted SNP sequencing with a local kinship database to identify human remains


An introduction for crime laboratories


機器ユーザーマニュアル (1)
MiSeq FGx Sequencing System Reference Guide
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)
Brochures & Guides (3)

The benefits of next-generation sequencing for human identification


Our improved noninvasive paternity testing workflow delivers answers with greater confidence
Seek answers, not profiles with the QIAGEN-Verogen partnership
Technical Information (2)

An introduction for crime laboratories


Combine HT targeted SNP sequencing with a local kinship database to identify human remains


Analysis Software (2)
ForenSeq Universal Analysis Software Guide
Universal Analysis Software v2.0 and above Reference Guide
Instrument User Manuals (1)
MiSeq FGx Sequencing System Reference Guide