QIAseq FastSelect –rRNA Yeast Kits

• QIAGEN、Illumina、NEB、KAPA RNA stranded library kit を含む様々なライブラリー試薬に対応
• 1つの試薬で酵母の細胞および胞子に対応
• 1ステップ、14分で細胞質およびミトコンドリアrRNAを高効率に除去
• わずか1回のピペッティング – 本試薬とRNAを混合し、インキュベートするのみ
• 追加のビーズ洗浄やライブラリー調製プロトコールの最適化は不要

QIAseq FastSelect –rRNA Yeast Kitsは、RNA-seqにおける不要なRNAを除去する画期的な技術です。酵母RNAサンプルに含まれる細胞質rRNA^*、ミトコンドリアrRNA^† を除去し、効率的なRNA-seqを実現します。

^*(35S [made up of 25S, 18S and 5.8S], 25S, 18S, 5.8S and 5S)

^†(21S, 15S, ACI60_gr01 [large subunit ribosomal RNA] and ACI60_gr02 [small subunit ribosomal RNA]) 

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QIAseq FastSelect –rRNA Yeast Kit は、高効率な rRNA 除去 （図  QIAseq FastSelect –rRNA Yeast Kit は rRNA を非常に効率よく除去）とロバストな性能を示します （図  QIAseq FastSelect ‒rRNA Yeast により検出遺伝子数が大幅に向上）。

QIAseq FastSelect –rRNA Yeast Kit は、一貫性のあるリードマッピングを得ることができ （図  QIAseq FastSelect –rRNA Yeast エクソン／イントロン／インタージェニック領域のマッピング、図  QIAseq FastSelect ‒rRNA YeastによるrRNAから重要な遺伝子へのリード割り当て増大、 図  QIAseq FastSelect ‒rRNA YeastによるrRNAから重要な遺伝子へのリード割り当て増大：グラフサマリ）、再現性の高い遺伝子発現解析 （図  QIAseq FastSelect ‒rRNA Yeastの再現性）を可能にします。

生物学的には重要ではない高発現の RNA 転写産物を除去すると、NGS のデータの有効活用が可能で、高感度かつハイスループットなシークエンスが可能になります。しかしながら、分解 RNA サンプルから不要な rRNA を除去することは、非常に困難です。

QIAseq FastSelect –rRNA Yeast Kit は、NGS RNA ライブラリーの調製中に、細胞質とミトコンドリアの酵母 rRNA を、トータル RNA から迅速かつ効率よく除去するようにデザインされています。QIAseq FastSelect は、お客様がご使用の stranded RNA-seq library kits を含む様々なライブラリー調製ワークフローへシームレスに統合することが可能で、わずか 14 分 1 ステップで rRNA を除去します。RNA 熱断片化（ライブラリー調製キットとサンプルの状態によって条件は異なります）の前に、QIAseq FastSelect 試薬とライブラリー調製バッファーを トータル RNA に混合します。断片化の後、反応温度を段階的に室温まで下げ、残りのライブラリー調製ステップを完了することが可能で、トータル RNA サンプルのいかなる濃縮ステップも不要です。QIAseq FastSelect –rRNA Yeast Kit は、1 ng から1 µg までの幅広い RNA 量に対して高い性能を発揮します。QIAseq FastSelect–rRNA Yeast Kit は、酵母由来のインタクトな RNA のみならず、断片化 RNA にも使用可能で、ダウンストリームアプリケーションで確実に rRNA を除去し、高い再現性が得られます。

一般的な rRNA 除去法や濃縮方法は、ライブラリー調製前に、サンプルの前処理として行います。また、その除去原理としては、不要な rRNA をハイブリッドキャプチャーしたり、酵素的に除去したりします。このような原理に基づく除去方法のワークフローには、25 ステップ以上あり、完了に 2 時間程度かかるのが一般的です。一方、当社独自の QIAseq FastSelect は、QIAGEN、Illumina、KAPA、NEB stranded RNA-seq library kits を含む様々なライブラリー調製キットに対応しており、わずか 14 分 1 ステップで rRNA を除去します （図  QIAseq FastSelect Kitのワークフロー）。

作業ステップとしては、RNA サンプルに QIAseq FastSelect 試薬（ rRNA Removal ）を添加し必要に応じて熱処理による断片化処理を行った後、14 分間で 75℃ から25 ℃ まで反応温度を段階的に下げるステップのみで、速やかに残りのライブラリー調製ステップを行うことができます。QIAseq FastSelect は RNA 断片化実施の有無にかかわらず使用可能なため、酵母サンプルからの分解された RNA、あるいは高品質 RNA でもライブラリー調製ワークフローに組み込んで使用できます。

QIAseq FastSelect–rRNA Yeast Kitは、酵母由来の高品質な RNA、あるいは分解 RNA から不要な rRNA を迅速かつ高効率に除去します。FastSelect–rRNA Yeast Kitは、お客様のアプリケーションにあわせて、様々なフォーマットとサイズをご用意しています。