QIAxcel DNA Kits

Para el análisis automatizado de fragmentos de ADN con instrumentos de QIAxcel

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QIAxcel DNA High Resolution Kit (1200)

Cat. No. / ID:  929002

Cartucho de gel de alta resolución para ADN QIAxcel, tampones, aceite mineral, marcador de calibración de intensidad QX, tiras de 12 tubos
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Cartridge type
High Resolution
Screening
Fast Analysis
High Sensitivity
QIAxcel DNA Kits están concebidos para su uso en aplicaciones de biología molecular. Estos productos no están concebidos para el diagnóstico, la prevención ni el tratamiento de enfermedades.

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Features

  • Seguridad y practicidad con cartuchos de gel listos para usar
  • El flujo de trabajo optimizado reduce el tiempo de análisis
  • Resultados fiables para las concentraciones de ácido nucleico de tan solo 5 pg/µl
  • Análisis exactos con resolución de tan solo 3–5 pb
  • Procesamiento estandarizado con recopilación de datos digitales

Product Details

Los instrumentos QIAxcel, cuando se utilizan junto con los QIAxcel DNA Kits, proporcionan separación por tamaño y cuantificación completamente automatizadas de fragmentos de ADN en hasta 96 muestras por serie. La tecnología QIAxcel, que se basa en la electroforesis capilar con cartuchos de gel, proporciona resolución, velocidad y rendimiento incomparables. Los cartuchos de gel QIAxcel son reutilizables, lo que permite realizar hasta 250 series de 12 muestras. Se proporcionan métodos preinstalados para la mayoría de las aplicaciones. QIAGEN también puede crear métodos personalizados para los usuarios.

El QIAxcel DNA High Sensitivity Kit solo funciona con el instrumento QIAxcel Connect. Todos los otros QIAxcel DNA Kits funcionan con el instrumento QIAxcel Connect o con instrumentos QIAxcel Advanced. Los QIAxcel DNA Accessories son compatibles con todos los QIAxcel DNA Kits.

Performance

Análisis sencillo de alta resolución

El genotipado de microrganismos, el cribado de bibliotecas de ADNc basado en PCR y muchas otras aplicaciones de biología molecular e investigación biomédica requieren la discriminación de fragmentos de PCR cuyo tamaño varía en un pequeño número de pares de bases. El QIAxcel High Resolution Kit, junto con los instrumentos QIAxcel, permite analizar fragmentos de ADN con un tamaño de entre 15 pb y 5 kb. Los fragmentos de menos de 500 pb pueden separarse con una resolución de 3–5 pb, lo que proporciona una confianza en la interpretación de los datos superior a la que se puede obtener con la electroforesis en gel de agarosa de alta resolución convencional (consulte  Detección sensible de un gen mutado relacionado con el cáncer). Con una sensibilidad de detección de 0,1 ng/µl de ADN en reacciones de amplificación sin diluir, los instrumentos QIAxcel ofrecen resultados más sólidos con menos material de entrada de muestra.

El QIAxcel DNA Screening Kit es ideal para la evaluación de rutina de fragmentos en digestión de endonucleasas de restricción, PCR cualitativa simple o múltiple y otras aplicaciones de ADN (consulte  Análisis de alta resolución de muestras de PCR múltiple). El uso de cartuchos de gel para el cribado de ADN optimiza el flujo de trabajo del laboratorio al reducir al mínimo el tiempo de análisis de fragmentos de 15 pb a 5 kb de tamaño, se procesan 96 muestras en 1 hora aproximadamente. Se puede obtener una resolución de 20–50 pb para fragmentos de menos de 1 kb. El consumo de la muestra es inferior a 0,1 µl, lo que deja prácticamente toda la valiosa muestra para su uso posterior.

El QIAxcel DNA Fast Analysis Kit resulta ideal para la evaluación de rutina de fragmentos de ADN en aplicaciones de PCR cualitativa simple o múltiple. El uso de cartuchos de gel para el cribado de ADN optimiza el flujo de trabajo del laboratorio al reducir al mínimo el tiempo de análisis de fragmentos de 15 pb a 3 kb de tamaño; se procesan 12 muestras en tan solo 3 minutos y 96 muestras en aproximadamente 25 minutos (consulte  Captura de pantalla que muestra datos del análisis de fragmentos de la PCR). Se puede obtener una resolución de hasta 50 pb con el cartucho de gel QIAxcel DNA Fast Analysis, mientras que el consumo de la muestra es inferior a 0,1 μl.

El QIAxcel DNA High Sensitivity Kit le permite analizar ADN en concentraciones de tan solo 5 pg/μl. El tiempo de análisis para los fragmentos con un tamaño de 15 pb a 3 kb es de aproximadamente 9 minutos para 12 muestras. Se puede alcanzar una resolución de 20 a 50 pb con el cartucho de gel DNA High Sensitivity.

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Principle

Los instrumentos QIAxcel usan electroforesis capilar en gel para permitir la separación rápida basada en el tamaño de los ácidos nucleicos (consulte  Proceso de separación de muestras). A diferencia de la electroforesis tradicional en gel de agarosa, la separación se produce en un capilar de un cartucho de gel listo para usar. Las muestras se cargan automáticamente en un capilar individual y se aplica voltaje. Las moléculas de ácido nucleico con carga negativa migran a través del capilar al extremo con carga positiva. De la misma manera que en la electroforesis en gel de agarosa, las moléculas con masa molecular baja migran a mayor velocidad que las moléculas con alta masa molecular. A medida que las moléculas migran a través del capilar, pasan por un detector que detecta y mide la señal fluorescente. Un fotomultiplicador convierte la señal fluorescente en datos electrónicos, que luego se transfieren al equipo para su posterior procesamiento con el software QIAxcel ScreenGel. Después del procesamiento, los datos se muestran como un electroferograma o como una imagen del gel.

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Procedure

Los QIAxcel DNA Kits simplifican la separación y el análisis de fragmentos de ADN y proporcionan mayor seguridad al usuario. Solo se requieren unos simples pasos: cargue el cartucho de gel, llene y cargue la bandeja de tampón, cargue las muestras en placas de 96 pocillos o en tubos o tiras reactivas para PCR, seleccione el perfil de proceso que desea usar y listo. Se eliminan la tediosa preparación del gel y la extensa formación del usuario, lo que agiliza el flujo de trabajo y facilita la integración del sistema en la rutina diaria del laboratorio. A pocos minutos de iniciar una serie, los primeros resultados aparecen en tiempo real en la pantalla del ordenador (consulte  Tiempos de serie reducidos).

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Applications

Los métodos preprogramados, junto con los cartuchos de gel correspondientes, permiten la separación y el análisis de una variedad de ácidos nucleicos, incluidos los fragmentos de PCR simple o múltiple, el ADN digerido con endonucleasas de restricción y los oligonucleótidos sintetizados.

  QIAxcel DNA High Resolution Kit QIAxcel DNA High Sensitivity Kit§ QIAxcel DNA Screening Kit QIAxcel DNA Fast Analysis Kit
Intervalo de tamaño 15 pb-20 kb; se muestran hasta 50 kb 15 pb-3 kb 15 pb-5 kb 15 pb-3 kb
Resolución* 3-5 pb 20-50 pb 20-50 pb 50 pb
Límite de detección 0,1 ng/μl 5 pg/μl 0,1 ng/μl 0,1 ng/μl
Muestras por cartucho 1200 muestras 1200 muestras 2400 muestras 3000 muestras
Tiempo de la serie 9-25 min ~9 min ~7 min ~3 min
Área de aplicación
  • Genotipado de alta resolución
  • VNTR, STRs, etc.
  • Comprobación de integridad de ADNg
  • Comprobación de la biblioteca de NGS
  • Control de calidad de extractos de biopsia líquida
  • Comprobación de la biblioteca de NGS
  • Cribado rápido de PCR (simple y múltiple)
  • Digestión de restricción, plásmidos
  • Comprobación de integridad de ADNg
  • Comprobación de la biblioteca de NGS
  • Análisis rápido de un solo amplicón, por ejemplo, tipificación de HLA

Supporting data and figures

Resources

Brochures & Guides (5)

For analysis and typing of PCR products from different HLA loci using the QIAxcel Advanced and the Helmberg-SCORE software

A protocol for evaluation of samples for next-generation sequencing on the QIAGEN GeneReader platform using the QIAxcel Advanced Instrument and ScreenGel software version 1.5 of higher
Kit Handbooks (2)
For automated analysis of DNA fragments using the QIAxcel and QIAxcel Advanced instruments
For automated electrophoretic analysis of DNA using the QIAxcel Connect instrument

June 2022
Application Notes (20)
The QIAxcel System was successfully used to detect DNA derived from genetically modified organisms (GMOs) at a level suitable for GMO testing according to EU standards.
Operating Software (2)
This release includes the first version of QIAxcel ScreenGel NGS Profiles. These profiles are intended to be used to run and analyze reactions of GeneRead QIAact AIT and BRCA 1/2 panels using the QIAxcel instrument and QIAxcel ScreenGel 1.5 Software. These profiles are composed of an Process Profile, Analysis Profile, Distribution Profile, and Report/Export Profile.
Quick-Start Protocols (1)
For electrophoretic analysis of DNA samples using the QIAxcel Connect system

June 2022
Instrument User Manuals (2)
For use with QIAxcel ScreenGel software v2.0
For use with QIAxcel Advanced instruments and QIAxcel ScreenGel Software version 1.6
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Why does an intensity calibration of the gel cartridge for the QIAxcel System and QIAxcel Advanced need to be performed?

The intensity calibration procedure on the QIAxcel System and QIAxcel Advanced is performed to normalize the signal intensities across all 12 channels of the gel cartridge. This corrects for natural intensity reading variations between each capillary in the cartridge. A correction factor is determined and applied for every subsequent run performed with the cartridge.

FAQ ID -1824
Can a QIAxcel DNA Fast Analysis Cartridge be run on a QIAxcel System?

The QIAxcel DNA Fast Analysis Cartridge can only be run on the QIAxcel Fast Analysis System with the BioCalculator Fast Analysis software and the grey software key.

All other QIAxcel Cartridges can only be run on the QIAxcel System with the BioCalculator software and the blue software key.

FAQ ID -1828
Can customers use their own DNA size marker with the QIAxcel System and if yes, what concentration should be used?

The concentration of the DNA marker, pUC18/HaeIII, provided in the QIAxcel DNA Kits is 5ug/ml in 1XTE buffer solution. Customers can run their own DNA size marker sample with different concentration levels using the provided Methods (i.e. M500, H500, L500 and so on).

The recommended method for all basic applications with the QIAxcel System is the M500 method. The BioCalculator software also allows customers to choose their own Sample Injection Time in the Sequence table. The M500 method provides 5KV for 20 seconds for the electro-kinetic injection of lower concentrated DNA samples. If the Injection Time is doubled or tripled (40 or 60 sec), you can expect double or triple intensities (also peak heights).

FAQ ID -1841
Where are the QIAxcel data stored?

For the BioCalculator software, the default data folder is:

C:\Program Files\QIAGEN\QIAxcel BioCalculator\Data.

For the ScreenGel software, the default data folders are:

C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Experiment (for a computer with Windows XP operation system) or C:\ProgramData\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Experiment\ (for a computer with Windows 7 operating system).

Alternatively, you can more conveniently access the ScreenGel experiment data folder using the menu options File\Open data directory\Experiment within the ScreenGel software.

FAQ -9008
If a different DNA size and/or alignment marker is to be used with the QIAxcel System or QIAxcel Advanced, does the Gel Cartridge need to be recalibrated?

The Gel Cartridge does not need to be recalibrated when using a new alignment marker and/or DNA size marker with the QIAxcel System or QIAxcel Advanced. Calibration is required only once, i.e. when the first cartridge is run or when the cartridge is used on a different QIAxcel system than the one it has been calibrated on, or when using a different PC than the one used to calibrate initially.

FAQ ID -1858
How can drying out of the gel cartridge tips used on the QIAxcel System and QIAxcel Advanced be prevented?

If the gel cartridge tips for the QIAxcel System and QIAxcel Advanced are in contact with air, the tips will dry out. There are 3 ways of preventing the tips from drying.

  1. Store the cartridge in the instrument with the instrument in the “Park” position. The washing solution (8 ml) covered with mineral oil must be in the “Park” position of the Solution Tray. 
  2. Store the cartridge in the Cartridge Stand with enough mineral oil in the well of the Cartridge Stand to cover the capillary tips. The Cartridge Stand should only be used for short term storage, i.e. when changing cartridges during one working day. 
  3. Place the cartridge back into its packaging with the capillary tips gently inserted into the soft gel in the box.
FAQ ID -1823
Why does the ScreenGel software version 1.2 crash when I try to use an old reference size marker table?

The reference size marker table created by ScreenGel version 1.1 or earlier is incompatible with ScreenGel version 1.2. Re-analyze the size marker run in ScreenGel version 1.2 and create a new reference size marker table for future use.

FAQ -9009
Why is the cartridge not recognized?

When using the BioCalculator software, ensure the color of the software key matches the type of cartridge used. For example, the QIAxcel Fast Analysis cartridge requires the red software key, while the QIAxcel High Resolution cartridge requires the blue software key.

In addition, check that the communication between the computer and the instrument is established. Further, check that the smart key is inserted securely.

If the issue persists, contact QIAGEN Technical Services and provide the cartridge ID and lot number, which is printed on the packaging of QIAxcel cartridges.

FAQ -9004
How do I perform the filter test?

When using the BioCalculator software, select Settings under File in the Instrument control panel window. In the new windows, click Check Filter in the new window and follow the on-screen prompts.

When using the ScreenGel software, log in to the ScreenGel software with an account with basic or advanced privilege.  Select System Check under the Service environment. Select Filter Check and click Start.

Please send the filter test result to QIAGEN Technical Services for further assistance.

FAQ -9006
Why is the signal of the QX alignment marker weak?

Incorrect storage can lead to QX alignment marker degradation. The QX alignment markers can be used for 50 runs or 3 days, whichever comes first. Opened QX alignment marker should be store at –20°C between uses.

FAQ -9003
What causes the calibration to fail?

Clogged capillaries and/or re-using the calibration marker are the most common causes of failed calibration. Perform “Removing gel from blocked capillaries”, as outlined in Appendix D in the QIAxcel DNA handbook. Use a new set of calibration marker for each new calibration procedure.

FAQ -9001
I have upgraded the ScreenGel software to version 1.2. How can I stop the software crash when I try to select a cartridge?

Please delete the 6 obsolete method files as outlines in the Important Note QIAxcel ScreenGel Software

FAQ -9010
How do I perform the detector test?

When using the BioCalculator software, select Detector test under File in the Instrument control panel window. Perform the Detector test with and without a cartridge latched inside the QIAxcel. Feedback is not shown on the screen when you select the Detect test. Instead, the file named detector.asc is saved at C:\Program Files\QIAGEN\QIAxcel BioCalculator. Change the file name before performing another detector test.

Note: Older versions of BioCalculator software save the detector.asc at C:\Program Files\QIAxcel BioCalculator.

When using the ScreenGel software, log in to the ScreenGel with an account with basic or advanced privilege.  Select System Check under the Service environment. Select Detector Test and click Start. The file is saved at C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting\Troubleshooting_xxxxxxxx (current date in the format of YYYYMMDD) for a computer with Windows XP operating system or C:\ProgramData\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting for a computer with Windows 7 operating system. Alternatively, you can perform a screen capture for the Detector test result.

Please send the Detector test results to QIAGEN Technical Services for further assistance.

FAQ -9006