QIAxcel DNA Kits

Zur automatisierten Analyse von DNA-Fragmenten mit QIAxcel Geräten

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QIAxcel DNA High Resolution Kit (1200)

Cat. No. / ID:  929002

QIAxcel DNA High Resolution Gel Cartridge, Puffer, Mineralöl, QX Intensity Calibration Marker, 12-Röhrchen-Streifen
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1.116,00 €
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Cartridge type
High Resolution
Screening
Fast Analysis
High Sensitivity

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Features

  • Sicherheit und Komfort durch gebrauchsfertige Gelkartuschen
  • Optimierter Workflow minimiert die Analysedauer
  • Robuste Ergebnisse für Nukleinsäurekonzentrationen schon ab 5 pg/µl
  • Präzise Analyse mit bis zu 3–5 bp Auflösung
  • Standardisierte Verarbeitung mit digitaler Datenerfassung

Product Details

QIAxcel Geräte ermöglichen in Verbindung mit QIAxcel DNA Kits eine vollautomatisierte Größenauftrennung und Quantifizierung von DNA-Fragmenten in bis zu 96 Proben je Lauf. Die QIAxcel Technologie basiert auf Kapillarelektrophorese mit Gelkartuschen und bietet unerreichte Auflösung, Geschwindigkeit und Durchsatz. Die QIAxcel Gelkartuschen sind wiederverwendbar und ermöglichen die Durchführung von bis zu 250 Läufe zu je 12 Proben. Für die meisten Applikationen geeignete Methoden sind vorinstalliert verfügbar. QIAGEN kann auch kundenspezifische Methoden für Anwenderinnen und Anwender erstellen.

Das QIAxcel DNA High Sensitivity Kit kann nur zusammen mit dem QIAxcel Connect verwendet werden. Alle anderen QIAxcel DNA Kits können entweder mit dem QIAxcel Connect oder QIAxcel Advanced Geräten verwendet werden. Die QIAxcel DNA Accessories sind mit allen QIAxcel DNA Kits kompatibel.

Performance

Einfache hochauflösende Analyse

Genotypisierung von Organismen, PCR-basiertes cDNA-Bibliotheksscreening und viele andere Applikationen in der biomedizinischen Forschung und Molekularbiologie erfordern die Differenzierung von PCR-Fragmenten, die sich in der Größe nur um wenige Basenpaare unterscheiden. Das QIAxcel High Resolution Kit erlaubt in Kombination mit QIAxcel Geräten die Analyse von DNA-Fragmenten mit einer Größe zwischen 15 bp und 5 kb. Fragmente, die kleiner als 500 bp sind, können mit einer Auflösung von 3–5 bp aufgetrennt werden. Dies ermöglicht eine zuverlässigere Dateninterpretation als mit der herkömmlichen hochauflösenden Agarose-Gelelektrophorese (siehe  Sensitiver Nachweis eines mutierten krebsassoziierten Gens). Bei einer Nachweissensitivität von 0,1 ng/µl DNA in unverdünnten Amplifikationsreaktionen bieten QIAxcel Geräte robustere Ergebnisse bei kleineren Mengen an eingesetztem Probenmaterial.

Das QIAxcel DNA Screening Kit eignet sich optimal für die routinemäßige Evaluierung von Fragmenten für den Verdau mit Restriktionsendonukleasen, qualitative Singleplex- oder Multiplex-PCR und andere DNA-Applikationen (siehe  Hochauflösende Analyse von Multiplex-PCR-Proben). Die Verwendung von Kartuschen für das DNA-Screening optimiert den Labor-Workflow durch Minimierung der Analysezeit für Fragmente von 15 bp bis 5 kb Größe – 96 Proben werden in etwa 1 Stunde bearbeitet. Für Fragmente unter 1 kb kann eine Auflösung von 20–50 bp erreicht werden. Der Probenverbrauch liegt bei weniger als 0,1 µl, sodass nahezu Ihre gesamte wertvolle Probe für nachgelagerte Applikationen erhalten bleibt.

Das QIAxcel DNA Fast Analysis Kit eignet sich optimal für die routinemäßige Beurteilung von DNA-Fragmenten in qualitativen Single- oder Multiplex-PCR-Applikationen. Die Verwendung von Gelkartuschen für das DNA-Screening optimiert den Labor-Workflow durch Minimierung der Analysezeit für Fragmente von 15 bp bis 3 kb Größe – 12 Proben werden in nur 3 Minuten und 96 Proben in etwa 25 Minuten bearbeitet (siehe  Screenshot mit Daten aus PCR-Fragmentanalyse). Mit der QIAxcel DNA Fast Analysis Gelkartusche kann eine Auflösung von bis zu 50 bp erzielt werden, wobei der Probenverbrauch bei weniger als 0,1 μl liegt.

Mit dem QIAxcel DNA High Sensitivity Kit können Sie DNA in Konzentrationen schon ab 5 pg/μl analysieren. Die Analysezeit für Fragmente von 15 bp–3 kb Größe beträgt für 12 Proben etwa 9 Minuten. Mit der QIAxcel DNA High Sensitivity Gelkartusche kann eine Auflösung von 20–50 bp erzielt werden.

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Principle

QIAxcel Geräte nutzen Kapillargelelektrophorese, um eine schnelle, größenbasierte Auftrennung von Nukleinsäuren zu ermöglichen (siehe  Prozess der Probenauftrennung). Anders als bei der traditionellen Agarose-Gelelektrophorese wird die Auftrennung in einer Kapillare einer gebrauchsfertigen Gelkartusche durchgeführt. Die Proben werden automatisch in eine einzelne Kapillare geladen und dann eine Spannung angelegt. Die negativ geladenen Nukleinsäuremoleküle wandern durch die Kapillare zum positiv geladenen Ende. Wie bei der Agarose-Gelelektrophorese wandern Moleküle mit niedrigem Molekulargewicht schneller als Moleküle mit hohem Molekulargewicht. Während die Moleküle durch die Kapillare wandern, passieren sie einen Detektor, der das Fluoreszenzsignal erfasst und misst. Ein Photomultiplier konvertiert das Fluoreszenzsignal in elektronische Daten, die dann zur weiteren Verarbeitung mit der QIAxcel ScreenGel Software auf den Computer übertragen werden. Nach der Verarbeitung werden die Daten als Elektropherogramm oder Gel-Bild dargestellt.

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Procedure

QIAxcel DNA Kits erleichtern die Auftrennung und Analyse von DNA-Fragmenten und sorgen für eine höhere Anwendersicherheit. Es sind nur wenige einfache Schritte erforderlich: Laden der Gelkartusche, Füllen und Laden des Pufferreservoirs, Laden der Proben in 96-Well-Platten oder PCR-Röhrchen oder -Streifen, Auswählen des gewünschten Prozessprofils und Starten. Aufwändige Gelvorbereitung und umfassende Anwenderschulung werden überflüssig, wodurch der Workflow optimiert und die Integration des Systems in die tägliche Laborroutine erleichtert wird. Schon Minuten nach Beginn des Laufs werden die ersten Ergebnisse in Echtzeit auf dem Computerbildschirm angezeigt (siehe  Reduzierte Laufzeiten).

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Applications

Vorprogrammierte Methoden erlauben in Kombination mit den entsprechenden Gelkartuschen die Auftrennung und Analyse einer Vielzahl von Nukleinsäuren, einschließlich einzelner oder mehrerer PCR-Fragmente, mit Restriktionsendonukleasen verdauter DNA und synthetisierter Oligonukleotide.

  QIAxcel DNA High Resolution Kit QIAxcel DNA High Sensitivity Kit§ QIAxcel DNA Screening Kit QIAxcel DNA Fast Analysis Kit
Größenbereich 15 bp–20 kb; Anzeige von bis zu 50 kb 15 bp–3 kb 15 bp–5 kb 15 bp–3 kb
Auflösung* 3–5 bp 20–50 bp 20–50 bp 50 bp
Nachweisgrenze 0,1 ng/μl 5 pg/μl 0,1 ng/μl 0,1 ng/μl
Proben je Kartusche 1200 Proben 1200 Proben 2400 Proben 3000 Proben
Laufzeit 9–25 min ~9 min ~7 min ~3 min
Anwendungsbereich
  • Hochauflösende Genotypisierung
  • VNTR, STRs usw.
  • gDNA-Integritätsprüfung
  • NGS-Bibliotheksprüfung
  • Qualitätskontrolle von Flüssigbiopsieextrakten
  • NGS-Bibliotheksprüfung
  • Schnelles PCR-Screening (Single- und Multiplex)
  • Restriktionsverdau, Plasmid
  • gDNA-Integritätsprüfung
  • NGS-Bibliotheksprüfung
  • Schnelle Analyse einzelner Amplifikate, z. B. HLA-Typisierung

Supporting data and figures

Resources

Brochures & Guides (5)

For analysis and typing of PCR products from different HLA loci using the QIAxcel Advanced and the Helmberg-SCORE software

A protocol for evaluation of samples for next-generation sequencing on the QIAGEN GeneReader platform using the QIAxcel Advanced Instrument and ScreenGel software version 1.5 of higher
Kit Handbooks (2)
For automated analysis of DNA fragments using the QIAxcel and QIAxcel Advanced instruments
For automated electrophoretic analysis of DNA using the QIAxcel Connect instrument

June 2022
Application Notes (20)
The QIAxcel System was successfully used to detect DNA derived from genetically modified organisms (GMOs) at a level suitable for GMO testing according to EU standards.
Operating Software (2)
This release includes the first version of QIAxcel ScreenGel NGS Profiles. These profiles are intended to be used to run and analyze reactions of GeneRead QIAact AIT and BRCA 1/2 panels using the QIAxcel instrument and QIAxcel ScreenGel 1.5 Software. These profiles are composed of an Process Profile, Analysis Profile, Distribution Profile, and Report/Export Profile.
Quick-Start Protocols (1)
For electrophoretic analysis of DNA samples using the QIAxcel Connect system

June 2022
Instrument User Manuals (2)
For use with QIAxcel ScreenGel software v2.0
For use with QIAxcel Advanced instruments and QIAxcel ScreenGel Software version 1.6
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Why does an intensity calibration of the gel cartridge for the QIAxcel System and QIAxcel Advanced need to be performed?

The intensity calibration procedure on the QIAxcel System and QIAxcel Advanced is performed to normalize the signal intensities across all 12 channels of the gel cartridge. This corrects for natural intensity reading variations between each capillary in the cartridge. A correction factor is determined and applied for every subsequent run performed with the cartridge.

FAQ ID -1824
Can a QIAxcel DNA Fast Analysis Cartridge be run on a QIAxcel System?

The QIAxcel DNA Fast Analysis Cartridge can only be run on the QIAxcel Fast Analysis System with the BioCalculator Fast Analysis software and the grey software key.

All other QIAxcel Cartridges can only be run on the QIAxcel System with the BioCalculator software and the blue software key.

FAQ ID -1828
Can customers use their own DNA size marker with the QIAxcel System and if yes, what concentration should be used?

The concentration of the DNA marker, pUC18/HaeIII, provided in the QIAxcel DNA Kits is 5ug/ml in 1XTE buffer solution. Customers can run their own DNA size marker sample with different concentration levels using the provided Methods (i.e. M500, H500, L500 and so on).

The recommended method for all basic applications with the QIAxcel System is the M500 method. The BioCalculator software also allows customers to choose their own Sample Injection Time in the Sequence table. The M500 method provides 5KV for 20 seconds for the electro-kinetic injection of lower concentrated DNA samples. If the Injection Time is doubled or tripled (40 or 60 sec), you can expect double or triple intensities (also peak heights).

FAQ ID -1841
Where are the QIAxcel data stored?

For the BioCalculator software, the default data folder is:

C:\Program Files\QIAGEN\QIAxcel BioCalculator\Data.

For the ScreenGel software, the default data folders are:

C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Experiment (for a computer with Windows XP operation system) or C:\ProgramData\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Experiment\ (for a computer with Windows 7 operating system).

Alternatively, you can more conveniently access the ScreenGel experiment data folder using the menu options File\Open data directory\Experiment within the ScreenGel software.

FAQ -9008
If a different DNA size and/or alignment marker is to be used with the QIAxcel System or QIAxcel Advanced, does the Gel Cartridge need to be recalibrated?

The Gel Cartridge does not need to be recalibrated when using a new alignment marker and/or DNA size marker with the QIAxcel System or QIAxcel Advanced. Calibration is required only once, i.e. when the first cartridge is run or when the cartridge is used on a different QIAxcel system than the one it has been calibrated on, or when using a different PC than the one used to calibrate initially.

FAQ ID -1858
How can drying out of the gel cartridge tips used on the QIAxcel System and QIAxcel Advanced be prevented?

If the gel cartridge tips for the QIAxcel System and QIAxcel Advanced are in contact with air, the tips will dry out. There are 3 ways of preventing the tips from drying.

  1. Store the cartridge in the instrument with the instrument in the “Park” position. The washing solution (8 ml) covered with mineral oil must be in the “Park” position of the Solution Tray. 
  2. Store the cartridge in the Cartridge Stand with enough mineral oil in the well of the Cartridge Stand to cover the capillary tips. The Cartridge Stand should only be used for short term storage, i.e. when changing cartridges during one working day. 
  3. Place the cartridge back into its packaging with the capillary tips gently inserted into the soft gel in the box.
FAQ ID -1823
Why does the ScreenGel software version 1.2 crash when I try to use an old reference size marker table?

The reference size marker table created by ScreenGel version 1.1 or earlier is incompatible with ScreenGel version 1.2. Re-analyze the size marker run in ScreenGel version 1.2 and create a new reference size marker table for future use.

FAQ -9009
Why is the cartridge not recognized?

When using the BioCalculator software, ensure the color of the software key matches the type of cartridge used. For example, the QIAxcel Fast Analysis cartridge requires the red software key, while the QIAxcel High Resolution cartridge requires the blue software key.

In addition, check that the communication between the computer and the instrument is established. Further, check that the smart key is inserted securely.

If the issue persists, contact QIAGEN Technical Services and provide the cartridge ID and lot number, which is printed on the packaging of QIAxcel cartridges.

FAQ -9004
How do I perform the filter test?

When using the BioCalculator software, select Settings under File in the Instrument control panel window. In the new windows, click Check Filter in the new window and follow the on-screen prompts.

When using the ScreenGel software, log in to the ScreenGel software with an account with basic or advanced privilege.  Select System Check under the Service environment. Select Filter Check and click Start.

Please send the filter test result to QIAGEN Technical Services for further assistance.

FAQ -9006
Why is the signal of the QX alignment marker weak?

Incorrect storage can lead to QX alignment marker degradation. The QX alignment markers can be used for 50 runs or 3 days, whichever comes first. Opened QX alignment marker should be store at –20°C between uses.

FAQ -9003
What causes the calibration to fail?

Clogged capillaries and/or re-using the calibration marker are the most common causes of failed calibration. Perform “Removing gel from blocked capillaries”, as outlined in Appendix D in the QIAxcel DNA handbook. Use a new set of calibration marker for each new calibration procedure.

FAQ -9001
I have upgraded the ScreenGel software to version 1.2. How can I stop the software crash when I try to select a cartridge?

Please delete the 6 obsolete method files as outlines in the Important Note QIAxcel ScreenGel Software

FAQ -9010
How do I perform the detector test?

When using the BioCalculator software, select Detector test under File in the Instrument control panel window. Perform the Detector test with and without a cartridge latched inside the QIAxcel. Feedback is not shown on the screen when you select the Detect test. Instead, the file named detector.asc is saved at C:\Program Files\QIAGEN\QIAxcel BioCalculator. Change the file name before performing another detector test.

Note: Older versions of BioCalculator software save the detector.asc at C:\Program Files\QIAxcel BioCalculator.

When using the ScreenGel software, log in to the ScreenGel with an account with basic or advanced privilege.  Select System Check under the Service environment. Select Detector Test and click Start. The file is saved at C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting\Troubleshooting_xxxxxxxx (current date in the format of YYYYMMDD) for a computer with Windows XP operating system or C:\ProgramData\QIAGEN\QIAxcel\ScreenGel\Data\Troubleshooting for a computer with Windows 7 operating system. Alternatively, you can perform a screen capture for the Detector test result.

Please send the Detector test results to QIAGEN Technical Services for further assistance.

FAQ -9006