QIAamp DNA FFPE Tissue Kit

Zur Aufreinigung von genomischer DNA aus mit Formalin fixierten, in Paraffin eingebetteten Geweben

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QIAamp DNA FFPE Tissue Kit (50)

Cat. No. / ID:  56404

Für 50 DNA-Präparationen: 50 QIAamp MinElute Columns, Proteinase K, Puffer, Collection Tubes (2 ml) Verwenden Sie unsere QIAamp DNA FFPE Advanced Kits der nächsten Generation für bessere Ergebnisse.
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QIAamp DNA FFPE Tissue Kit ist für molekularbiologische Anwendungen vorgesehen. Dieses Produkt ist nicht für die Diagnose, Prävention oder Behandlung einer Krankheit bestimmt.

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Features

  • Schnelle Aufreinigung von hochwertiger gebrauchsfertiger DNA
  • Konsistent hohe Ausbeute
  • Vollständige Entfernung von Verunreinigungen und Inhibitoren

Product Details

Das QIAamp DNA FFPE Tissue Kit ist speziell für die Aufreinigung von DNA aus formalinfixierten, in Paraffin eingebetteten Gewebeschnitten vorgesehen. Das Kit arbeitet mit speziellen Lysebedingungen, um die DNA aus den Gewebeschnitten freizusetzen und die durch Formalin-Quervernetzung verursachten inhibitorischen Effekte zu verhindern. Das Kit nutzt QIAamp MinElute Spin Columns für die Aufreinigung von hochwertiger DNA in kleinen Volumen. Die Aufreinigung von DNA mit dem QIAamp DNA FFPE Tissue Kit kann auf dem QIAcube Connect automatisiert werden.

Testen Sie die QIAamp DNA FFPE Advanced Kits der nächsten Generation für eine effiziente Wiedergewinnung von DNA und die optionale Entfernung von Artefakten.

Performance

Mit dem QIAamp DNA FFPE Tissue Kit wird DNA aufgereinigt, die in einer Vielzahl nachgelagerter Applikationen eingesetzt werden kann, wie Einzelnukleotid-Polymorphismus-Genotypisierung (SNP) und Short Tandem Repeats-Genotypisierung (STRs) und die pharmakogenetische Forschung. Die mit dem QIAamp DNA FFPE Tissue Kit aufgereinigte DNA kann auch in der PCR eingesetzt werden (siehe Abbildung „ PCR-Analyse von aus FFPE-Gewebeproben aufgereinigter DNA“).
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Principle

Das QIAamp DNA FFPE Tissue Kit nutzt die bewährte QIAamp MinElute Technologie zur Aufreinigung von genomischer und mitochondrialer DNA aus kleinen Probenvolumen oder -größen. Das Kit kombiniert die selektiven Bindungseigenschaften einer silikabasierten Membran mit flexiblen Elutionsvolumen zwischen 20 und 100 μl.

Speziell optimierte Lysebedingungen ermöglichen die effiziente Aufreinigung genomischer DNA aus FFPE-Gewebeschnitten ohne Inkubation über Nacht. Durch die Inkubation bei erhöhter Temperatur nach dem Proteinase K-Verdau werden die Formalin-Quervernetzungen in der freigesetzten DNA teilweise entfernt, was die Ausbeute und Leistung der DNA in nachgelagerten Assays verbessert. Beachten Sie, dass die aus FFPE-Proben isolierte DNA in der Regel ein niedrigeres Molekulargewicht hat als die DNA aus frischen oder gefrorenen Proben. Der Grad der Fragmentierung hängt von der Art und vom Alter der Probe und der Fixierungsbedingungen ab.

Procedure

Das QIAamp DNA FFPE Tissue Verfahren besteht aus 6 Schritten: Entfernen von Paraffin, Lyse, Erhitzen, Binden, Waschen und Eluieren (siehe Flussdiagramm „ Verfahren“). Nach der Probenlyse liefert das unkomplizierte QIAamp DNA FFPE Tissue Verfahren, das sich hervorragend für die gleichzeitige Verarbeitung mehrerer Proben eignet, reine DNA in weniger als 30 Minuten.

 

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Applications

Das QIAamp DNA FFPE Tissue Kit ist speziell für die Aufreinigung von DNA aus formalinfixiertem, in Paraffin eingebettetem Gewebe vorgesehen.

Supporting data and figures

Specifications

FeaturesSpecifications
ApplicationsReal-time PCR, STR-Analyse, LMD‑PCR
ProcessingManuell
Purification of total RNA, miRNA, poly A+ mRNA, DNA or proteinGenomische DNA, mitochondriale DNA
Elution volume20–100 µl
FormatSpin-Säule
TechnologySilika-Technologie
Main sample typeFormalinfixierte, in Paraffin eingebettete Gewebeproben
Sample amountBis zu 8 Schnitte, jeweils mit einer Dicke von bis zu 10 µm und einer Oberfläche von bis zu 250 mm2

Resources

Brochures & Guides (5)
High-quality, nucleic acid purification for successful PCR and NGS experiments.
Second edition — innovative tools
Sample to Insight solutions for successful molecular analysis
Critical factors for molecular analysis of FFPE samples
Kit Handbooks (1)
Safety Data Sheets (1)
Additional Resources (1)
Certificates of Analysis (1)

Publications

Gender-related survival differences associated with EGFR polymorphisms in metastatic colon cancer.
Press OA; Zhang W; Gordon MA; Yang D; Lurje G; Iqbal S; El-Khoueiry A; Lenz HJ;
Cancer Res; 2008; 68 (8):3037-42 2008 Apr 15 PMID:18413774
Discrepancy between CYP2D6 phenotype and genotype derived from post-mortem dextromethorphan blood level.
Bailey B; Daneman R; Daneman N; Mayer JM; Koren G;
Forensic Sci Int; 2000; 110 (1):61-70 2000 May 8 PMID:10802201

FAQ

I received a kit containing the MinElute columns; however, they were left out for a while and not stored at 2–8°C upon receipt. Can I still use them?

The MinElute spin columns included in the following kits should be stored at 2–8°C upon arrival: AllPrep DNA/RNA Micro, EpiTect Fast DNA Bisulfite, EpiTect Fast FFPE Bisulfite, EpiTect Fast LyseAll Bisulfite, EpiTect Plus DNA Bisulfite, EpiTect Plus FFPE Bisulfite, EpiTect Plus LyseAll Bisulfite, exoRNeasy Serum/plasma Maxi, exoRNeasy Serum/Plasma Midi, GeneRead DNA FFPE, GeneRead rRNA Depletion, GeneRead Size Selection, MinElute Gel Extraction, MinElute PCR Purification, MinElute Reaction Cleanup, miRNeasy FFPE, miRNeasy Micro, miRNeasy Serum/Plasma, QIAamp DNA FFPE, QIAamp DNA Investigator, QIAamp DNA Micro, QIAamp MinElute Media, QIAamp MinElute Virus Spin, QIAamp MinElute Virus Vacuum, RNeasy FFPE, RNeasy Micro, RNeasy Plus Micro.

Short-term storage (up to 4 weeks) at room temperature (15–25°C) does not affect the performance. However, for optimal performance and quality, storage temperature should not exceed 25°C.

FAQ ID - 3560
What is the composition of elution buffer ATE in the QIAamp DNA Investigator kit, QIAamp DNA FFPE Tissue kit and the QIAamp Fast DNA Stool Mini kit?

The composition of Buffer ATE is:

- 10 mM Tris-Cl pH 8.3

- 0.1 mM EDTA

- 0.04% NaN3 (sodium-azide)

FAQ ID -3122
What can be used as an alternative to the A260 measurement for quantification of small amounts of RNA and DNA?

Small amounts of RNA and DNA may be difficult to measure spectrophotometrically. Fluorometric measurements, or quantitative RT-PCR and PCR are more sensitive and accurate methods to quantify low amounts of RNA or DNA.

Fluorometric measurements are carried out using nucleic acid binding dyes, such as RiboGreen® RNA Quantitation Reagent for RNA, and PicoGreen® DNA Quantitation Reagent for DNA (Molecular Probes, Inc.).

FAQ ID -728