Die Bedeutung der rRNA-Entfernung bei der RNA-Seq-Optimierung

QIAseq FastSelect ermöglicht die hochwertige RNA-Sequenzierung aus gemischten menschlichen und bakteriellen Proben

Dr. Marie Adams, Genomics Core Director am Van Andel Institute, berichtet, wie die QIAseq FastSelect Technologie dabei geholfen hat, die Hürden bei der Generierung hochwertiger RNA-Seq-Daten für humane und bakterielle Koexpressionsstudien anhand einer einzigen RNA-Probe zu überwinden.

QIAseq FastSelect hilft, den Weg zu einer erfolgreicheren Krebsbehandlung zu ebnen

“QIAseq FastSelect hat bei der RNA-Sequenzierung in meinem Projekt hervorragend funktioniert. Die RNA war degradiert und nahezu unbrauchbar, aber QIAseq FastSelect schafft es wirklich, die ribosomale RNA aus diesen degradierten Proben zu entfernen, und hat so unsere Sequenzlibraries verbessert”.

Brandon Mistrella, Department of Biology and Biochemistry, University of Houston

Krebsforscher an der University of Houston hatten bei der Arbeit mit FFPE-Proben regelmäßig mit RNA-Degradierung zu kämpfen. Das Vorliegen unerwünschter RNA-Spezies wie etwa ribosomaler RNA und Globin-mRNA in RNA-Proben mit ohnehin schon geringer Ausbeute hat die RNA-Sequenzierung weiter verkompliziert. Lesen Sie, wie QIAseq FastSelect deren Forschung transformiert und die Gewinnung nützlicher RNA-Seq-Daten aus FFPE-RNA ermöglicht hat.

QIAseq FastSelect ermöglicht die Erstellung von RNA-Seq-Libraries aus FFPE-RNA von schlechter Qualität

“Der Workflow ist sehr einfach und schnell. Ich würde sagen, dass ich bei der schlechten Probenqualität und der limitierten Menge dieser Proben nicht mit den Ergebnissen gerechnet hätte, die wir erhalten haben.”

Dr. Fabienne  Desmots-Loyer, Hämatologie-Forscherin, CHU-Krankenhaus Pontchaillou, Rennes, Frankreich

Aufgrund der starken Probendegradierung und der geringen Ausbeute kann die Arbeit mit FFPE-Proben eine Herausforderung sein. Lesen Sie den Beitrag von Dr. Fabienne Desmots-Loyer, Krankenhaus Rennes, und erfahren Sie, wie QIAseq FastSelect geholfen hat, hochwertige Libraries aus FFPE-Tumorproben bereitzustellen, die zuvor aufgrund der starken RNA-Degradierung und der geringen Ausbeute von zwei kommerziellen Labors abgelehnt worden waren.

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Deutlich schnellere und einfachere rRNA-Entfernung

Während alternative Methoden zur rRNA-Entfernung mehrere Stunden dauern, etliche Schritte umfassen, ausschließlich mit unfragmentierter RNA funktionieren oder schlichtweg nicht ausreichend rRNA entfernen, bietet Ihnen die FastSelect Methode einen deutlich schnelleren und praktischeren Workflow – und außergewöhnliche Ergebnisse selbst bei FFPE- und fragmentierten RNA-Proben.

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