dPCR CNV Probe Assay

用于通过单重或多重dPCR检测 进行基因座特异性拷贝数变异及改变分析

S_1219_8_LS_dPCR_CNV_Probe_Assay
Configure at GeneGlobe
Find or custom design the right target-specific assays and panels to research your biological targets of interest.
dPCR CNV Probe Reference Assay

Cat. No. / ID:  250213

单管装即用型 20x 浓缩参比检测方案;可用于 300/500/1000 次 12 µl的 dPCR 反应
Copy order details
Configure at GeneGlobe To see pricing
Product
dPCR CNV Probe Reference Assay
dPCR CNV Probe Assay
dPCR CNV Probe Centromeric Reference Assay
dPCR CNV Probe Assay 旨在用于分子生物学应用。这些产品不能用于疾病诊断、预防和治疗。
Configure at GeneGlobe
Find or custom design the right target-specific assays and panels to research your biological targets of interest.

Features

  • 200 多个靶标基因检测方案已进行过湿实验验证,从而确保卓越的性能
  • 染料可配置性支持在每个反应中对最多 5 个靶标进行多重检测
  • 可提供目标基因检测、参比基因检测和着丝粒参比基因检测
  • 已针对一系列样本(例如 FFPE、细胞系和 gDNA)进行了即用型检测验证
  • 在 QIAcuity 仪器上实现简单快速的 dPCR 工作流程
  • 可方便地使用 QIAcuity Software Suite 进行拷贝数数据分析

Product Details

dPCR CNV Probe Assay可让您针对个体基因或目标区域进行特异、准确、可重复且易于解读的拷贝数改变分析。200 多个靶标基因检测方案经过 dPCR 湿实验验证,并在特定检测方案说明中进行了标记。


dPCR CNV Probe Assay以管装形式提供,是即用型 20x 浓缩检测方案管内包含引物对和水解探针,可与 QIAcuity Probe PCR Kit (DNA 靶标)、QIAcuity Digital PCR SystemQIAcuity Nanoplate 配套使用。


每种检测方案都有五种不同水解探针(荧光基团)供选择:FAM、HEX、ROX、Atto 550 和 Cy5。这种灵活性允许对不同的检测方案进行混合和匹配,以便在单个 dPCR 反应中对最多五个靶标基因进行多重分析。


您想要进一步了解该产品并让我们的 dPCR 专家联系您吗?请在这里登记 ,我们将很快与您联系。

 

Performance

出色的检测性能


在使用两种不同 gDNA 模板浓度进行的双重分析中,dPCR CNV Probe Assay显示出良好的产物扩增以及阴性和阳性反应簇之间的分离(参见 KRAS 和 TERT 检测双重反应的一维和二维散点图)。结果表明,即使在 gDNA 输入浓度很低时,也能够对 CNV 进行准确分析。有关Nanoplate 8.5k的最小和最大装载量,请查看 QIAcuity 用户手册扩展版。


使用数字 PCR 进行精确和可重复的拷贝数分析


高度可重复的 QIAcuity dPCR 系统和 dPCR CNV Probe Assay 允许在无需重复测试的情况下进行 CNV 分析,以经济高效的方式增加了样本通量。对 gDNA 样本进行的双重分析时,在所有复本中都得到了每个基因组的预期拷贝数(参见“在双重反应中进行准确和可重复的拷贝数分析”)。在分析 gDNA 系列稀释的精密度测试中,该检测方案显示出良好的线性分布和簇分离(参见“系列稀释精密度测试中的线性分布”)。


通过 dPCR 进行多重拷贝数分析


使用 dPCR CNV Probe Assay 进行多重分析可提高通量,并显著降低每个靶标的分析成本。通过订购使用不同染料标记(FAM、HEX、ROX、Atto 550 和 Cy5)的检测方案,可以在单个反应中同时对最多 5 个靶标基因进行灵活的实验设计和多重分析。dPCR CNV Probe Assay在单个反应中进行 5 重检测显示出极好的扩增性能以及阳性和阴性簇的分离(参见“在 5 重反应中进行 CNV 检测”)。

 

Principle

所有 dPCR CNV Probe Assay均针对人类基因组的独特区域而设计。dPCR CNV Probe Gene of Interest Assay 靶向广泛研究的癌症及癌症相关基因。dPCR CNV Probe Reference Assay和 dPCR CNV Probe Centromeric Reference Assay 包括每个基因组具有不同拷贝数的各种参比基因,从而可让您针对各项分析选择最佳的归一化参考基因。根据实验条件,在反应中可以包括多种 GOI 和参比检测,以准确计算目标基因或靶标的拷贝数。


dPCR Copy Number Probe Assay为即用型:只需将单项检测混合物添加到 QIAcuity Probe PCR Kit 的 DNA 样本和预混液中,加载入 QIAcuity Nanoplate中,然后即可在 QIAcuity 仪器上开始运行。每种检测方案都是基于人类基因组中特定基因区域的终点 PCR 扩增。使用靶标特异性荧光水解探针检测扩增产物,这有助于确保检测的高度特异性。


有关纳米微孔板中 dPCR 反应的原理说明,请参见这里

 

Procedure

实验设置步骤简单明了,可以在任何有着 QIAcuity dPCR 仪器的实验室中进行。为了进行更精确的拷贝数分析,我们建议采用限制性酶消化法从样本中分离基因组 DNA。高度片段化的 DNA(例如 FFPE DNA 或循环 DNA)或 cDNA 不需要限性消化。要直接在反应混合物中进行限性消化,请在反应体系构建期间加入推荐的限制性酶。关键是要避免使用在目标扩增子区域内切割的限制性酶。


然后将片段化的模板与即用型 QIAcuity Probe PCR Kit 预混液和 dPCR CNV Probe Assay 混合,并将此混合物分装至 dPCR 预孔板的每个孔中。然后通过移液管吹打将反应混合物充分混匀,并转移到 QIAcuity Nanoplate的孔中。通过与不同的荧光基团结合,可以实现单孔中多重反应,对每个目标基因或靶标以及每个参比检测进行分析。


加载并密封纳米微孔板后,在 QIAcuity 仪器上运行推荐的循环程序。获得的每微升拷贝数结果显示在 QIAcuity Software Suite 的绝对定量分析类型中。要计算每个基因组的拷贝数,在 QIAcuity Software Suite 中选择拷贝数数据分析类型,并定义纳米微孔板孔中为基因/目标区域或归一化参比基因。根据扩增方案,dPCR 运行的结果可以在大约 2 小时后使用 QIAcuity Software Suite 进行分析。

 

Applications

dPCR CNV Probe Assay 非常适合用于使用来自新鲜、冰冻或固定样本的 DNA来 检测单个基因座的拷贝数改变或变异。

Resources

产品介绍与指南 (1)
For locus-specific copy number variation (CNV) analysis using the QIAcuity Digital PCR System
应用说明 (1)
Here, we present a workflow that combines two technologies, cellenONE and QIAcuity Digital PCR, which accelerate and streamline high-throughput analyses of target copy numbers in cultured cells. The workflow starts with detecting and sorting defined populations of cells as well as individual cells using cellenONE, followed by multiplexing dPCR on the QIAcuity platform. Copy number variations of target regions are then analyzed using the QIAcuity Software Suite, providing an intuitive and fast interpretation of results.
快速启动实验方案 (1)
dPCR CNV Probe Assays
PDF (970KB)
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)
Quick-Start Protocols (1)
dPCR CNV Probe Assays
PDF (970KB)
Brochures & Guides (1)
For locus-specific copy number variation (CNV) analysis using the QIAcuity Digital PCR System
Application Notes (1)
Here, we present a workflow that combines two technologies, cellenONE and QIAcuity Digital PCR, which accelerate and streamline high-throughput analyses of target copy numbers in cultured cells. The workflow starts with detecting and sorting defined populations of cells as well as individual cells using cellenONE, followed by multiplexing dPCR on the QIAcuity platform. Copy number variations of target regions are then analyzed using the QIAcuity Software Suite, providing an intuitive and fast interpretation of results.