从土壤中成功提取高品质 RNA
从土壤中提取 RNA 是环境 分子生物学中的最困难的应用之一。不仅会不断出现与降解有关的挑战,而且 RNA 产量也往往较低。
RNA 受潜在的腐植酸和土壤所含抑制物的共同污染也是一项挑战。对 RNA 应用而言,纯度非常重要。RNA 加入到反应体系中时应具有足够高的浓度,且不能存在抑制物。
RNA 产量低,通常为 DNA 产量的 10% 至 20%,这意味着要提取出用于研究的样本,需要使用更大的 (15ml) 试管和容量更大的离心机来处理更大量的样本。鉴于寻找低拷贝基因时最好不要为逆转录步骤稀释 RNA,成功的抑制物去除是关键因素。
为了克服这些挑战,QIAGEN® 提供有 RNeasy® PowerSoil® Total RNA Kit,该试剂盒专为土壤 RNA 提取变得简单易行而开发。
该方案由经过谨慎测试的以下方法组成:抑制因子去除技术(Inhibitor Removal Technology,IRT®)以去除抑制物,苯酚-氯仿提取以实现完全的微生物裂解,阴离子交换以实现高品质纯化。最终结果是提取出所需体积的纯 RNA,从而最大化地进行 RT-PCR。
从肥沃的森林土壤到河流沉积物,每种土壤都有不同的质地、水分和微生物丰度情况。使用 RNeasy PowerSoil Total RNA Kit,可使您的提取流程适用于每种土壤样本。
10 个 RNA 提取小技巧
以下是采用 RNeasy PowerSoil Total RNA Kit 进行相关提取步骤时如何克服挑战和优化结果的 10 个小技巧
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