QIAamp Fast DNA Tissue Kit

PCR이나 차세대 염기서열 분석(Next-Generation Sequencing, NGS)을 이용한 유전형 분석 및 기타 DNA 분석에는 적절한 양의 고품질 유전체 DNA가 시재료로 필요합니다. 고품질 DNA를 얻는 데 병목 현상이 가장 많이 일어나는 단계는 조직 용해 단계입니다. 섬유질 조직이나 기타 용해가 잘 되지 않는 조직은 길고 지루한 프로토콜이 필요하며, 이로 인해 저품질의 DNA을 저수율로 얻는 경우가 많습니다. 검증된 QIAGEN 기술이 기반이 된 QIAamp Fast DNA Tissue Kit는 수율을 크게 개선하고 결과를 얻기까지의 시간을 단축하는 혁신적인 파쇄 튜브를 사용하여 이러한 병목 현상을 극복합니다. 해당 절차는 QIAcube Connect에서 전면 자동화할 수 있습니다.

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QIAamp Fast DNA Tissue Kit는 기계적, 화학적 및 효소적 용해의 새로운 조합을 사용합니다. 각 키트에는 다른 방법보다 더 철저하게 조직을 파괴하기에 유용한 독특한 모양의 특수 스테인리스 스틸 비드가 들어있는 파쇄 튜브가 제공됩니다. 먼저, 조직 샘플과 시약 혼합물을 튜브에 넣고, 일반 실험용 벤치탑 보텍서(적절한 어댑터 사용) 또는 TissueLyser II 또는 LT와 같은 비드 밀에서 균질화한 후, 동일한 튜브에서 짧은 용해 과정을 진행합니다. 그런 다음 검증된 QIAamp 기술을 사용하여 용해물에서 DNA를 추출합니다. 전처리는 총DNA 추출 시간을 수시간에서 단 30분으로 단축합니다.
DNA 추출에 걸리는 총시간을 단축할 뿐 아니라, 기계적 파쇄 단계와 철저한 용해 프로토콜이 DNA 수율을 높입니다. QIAxpert와 형광 측정법을 사용하여 다양한 유형의 조직에서 수율 개선을 평가했습니다. 실험 결과에 따르면 QIAamp Fast DNA Tissue Kit는 표준 방법보다 최대 10배 더 많은 DNA를 추출할 수 있으면서도 가장 빠른 프로토콜 중 하나를 제공합니다.
대부분의 NGS 응용 분야에서는 더 큰 범위의 DNA의 서열을 분석하고 생물정보학 도구를 사용하여 어셈블해야 하므로 고분자량 DNA(>10kb)가 필요합니다. 일부 파쇄 방법은 전단으로 인해 DNA가 단편화될 수 있으며, 이는 다운스트림 분석에 영향을 미칠 수 있습니다. 몇 kb 수준까지로 단편화가 심하게 나타나는 다른 키트에 비해 QIAamp Fast DNA Tissue Kit는 25~50kb 사이의 DNA를 얻을 수 있으므로 어떤 PCR이나 NGS 응용 분야에도 매우 적합합니다.

PCR과 NGS와 같은 분자 기술로 복잡한 실험 샘플에서 이전에는 알려지지 않았던 세부 정보가 밝혀지고 있습니다. 이러한 기술을 사용하여 신뢰할 수 있는 결과를 얻으려면 충분한 양의 고품질 DNA를 확보하는 것이 필수적입니다. 섬유질이나 단단한 조직을 다뤄야 할 경우 이런 샘플은 분해하기 어려워서 방출되는 DNA 양에 직접적인 영향을 미치므로 문제가 될 수 있습니다. 이 문제를 해결하기 위해, 새로운 QIAamp Fast DNA Tissue Kit는 기계적, 화학적, 효소적 용해 방식을 통합하여 조직을 처리하며, 기존 표준 방법 대비 DNA 수율을 5~10배까지 증가시킵니다. 전처리를 통해 전체 DNA 추출 시간이 몇 시간에서 단 30분으로 단축되므로 PCR 및 NGS 응용 분야에 적합한 높은 무결성 DNA를 얻을 수 있을뿐 아니라 상당한 시간을 절약할 수 있습니다.

QIAamp Fast DNA Tissue Kit는 기계적, 화학적, 효소적 용해를 결합하여 샘플을 균질화합니다. 포함된 조직 파쇄 튜브에는 교반 시 조직을 효과적으로 파쇄하는 특수한 모양의 비드가 들어 있습니다. 탁상용 보텍스에서는 5분, 고출력 비드 밀에서는 30초면 조직을 균질화하는 데 충분합니다. 최적화된 화학 작용으로 조직을 균질화할 수 있으며, 이와 동시에 손상된 조직에서 방출된 DNA가 안정화됩니다. 분해 완충액 혼합물에는 Proteinase K가 포함되어 있어, 짧은 인큐베이션만으로 시료를 완전히 용해할 수 있으며, 기계적 균질화에 의해 효능이 저해되지 않습니다. 그런 후 유전체 DNA는 검증된 QIAamp 기술을 사용하여 정제되어 PCR이나 염기서열 분석과 같은 다운스트림 응용 분야에 사용할 수 있는 순수 DNA를 제공합니다. 아울러, QIAamp Fast DNA Tissue Kit은 QIAcube와 함께 편리하게 사용하여 자동화된 샘플 준비를 수행할 수 있습니다.

QIAamp Fast DNA Tissue Kit는 모든 유형의 조직에서 높은 수율의 순수 DNA를 제공하며 PCR 및 NGS 응용 분야에 적합합니다.