digital PCR, dPCR, Nanoplate principle
デジタルPCR

PCRにおける新たな絶対定量可能な–デジタルPCR

発見 –  デジタルPCR（dPCR）

デジタルPCRの威力– 干し草の山から1本の針を見つける

デジタルPCR（dPCR）はサンプルを多数の個別の反応に分割し、各反応に0個または1個以上のターゲット分子が存在するようにするテクノロジーです。このアプローチにより、典型的な「干し草の山の中の針」問題である強力な陰性のバックグラウンドに対してひとつの陽性を検出することが驚くほど容易になります。このような場合、検出限界が低いため、標準的なリアルタイム定量PCR（qPCR）は実行可能な方法としては選択されません。

デジタルPCRの決定的な特徴は、核酸の絶対定量です。パーティショニングの後、反応はエンドポイントPCRサイクルを受け、蛍光シグナルが存在するか（陽性反応）、存在しないか（陰性反応）、パーティションを分析します。この情報に基づいて、サンプル中に存在する分子の絶対数を計算できます。qPCRとは異なり、dPCRは標準曲線に依存しません。そのため、dPCRはqPCRよりも検出限界が低く、精度が高くなります。

高感度アプリケーションにデジタルPCRシステムを使用する研究者が増えています。この方法は、細胞および遺伝子治療研究、がん研究、感染症のモニタリング、食品検査などの進歩に貢献してきました。

弊社の使命は、デジタルPCRの旅路で課題を克服する際に必要な知識とツールを提供することです。結果的に、干し草の山から1本の針を見つける作業は思ったほど難しいことではないかもしれません。
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デジタルPCRの最新情報
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ウェビナー、ストーリーなど

特別ウェビナー – 病原体の追跡：微生物をモニタリングするためのdPCRとシークエンシングの使用

微生物検出に最適なdPCRプラットフォームはどれかお悩みですか？当社の専門家が出演するウェビナーに参加し、微生物検出とモニタリングをdPCRを用いて改良する方法の説明をご視聴ください。微生物との駆け引きに終止符を打ちましょう。

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ナノプレートdPCRテクノロジー

中に閉じ込めた魔法を明らかにする

デジタルPCRにおけるサンプル分割法には、マイクロ流体チップ、マイクロアレイ、マイクロ流体ディスク回転、油水エマルジョンを用いたドロップレットテクノロジーがあります。慣れ親しめること、使いやすいこと、精細な分解能が得られることを念頭に、分割の向上とデジタルPCRデータの強化を実現するマイクロ流体ナノプレートを開発しました。

Unveiling the magic inside
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ドロップレット、クリスタル、チップスは必要ありません

ナノプレートでデジタルPCRを実行する主な利点：

  • 慣れ親しんだユーザーフレンドリーなプレートで、qPCRと同じように簡単なピペット操作
  • パーティションが固定されているので、サイズが一定でサンプルが混合しない
  • ナノプレートが密封されているので、ウェル間の汚染がない
  • サンプルのパーティションをすべて同時に読み取るため、迅速な読み取りが可能
  • 品質を統合的に管理するので、プレート画像を見て、個々の陽性パーティションのカウントから蛍光ごとのシグナルを確認できる
  • プレートが調製工程の自動化に適している

ドロップレットデジタルPCR（ddPCR）より優れている点

上述で強調した利点の他に、ナノプレートを用いるQIAcuityデジタルPCRシステムには、ドロップレットデジタルPCR（ddPCR）ベースのシステムに勝る大きな利点があります。

デジタルPCRのワークフロー全体が1つのシステムに統合され、処理速度が大幅に上がり手作業の時間が短縮し拡張性も増します。

 dpcrとddpcrを比較した内容を詳しく読む

dPCR_workflow_comparison

デジタルPCRアプリケーション

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QIAcuityナノプレートデジタルPCRに関するFAQ

参考文献

Huggett JF et al. (2013). The digital MIQE guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments. Clin Chem. 59(6):892-902.

dMIQE Group, Huggett JF. (2020). The Digital MIQE Guidelines Update: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments for 2020. Clin Chem. 66(8):1012-1029.

関連項目