NGS-seq
次世代シークエンシング

DNA-seqソリューションでゲノムの複雑さを解明

概要

DNA変異の検出、あるいは既知および新規RNA融合の同定に関心がある場合、複雑なワークフロー、長いターンアラウンドタイム、限られたサンプル数などが進捗を妨げ、コストを増加させ、実用的なデータを遅らせる可能性があります。当社の高性能DNAシークエンシング（DNA-seq）技術は、こうした課題を克服するように最適化されているため、GCリッチ領域を確実にシークエンシングし、低頻度の変異株を正確に同定し、低品質の、または限られた入力サンプルを最大限に活用できます。カスタムパネルが必要な場合は、当社の専門家がインテリジェントなパネル設計をお手伝いします。

アンプリコンシークエンシング

QIAseq Tumor Mutational Burden Panels
アンプリコンシークエンシングの再定義：ターゲットDNA-seqで重要な変異を見つける

PCRの重複、偽陽性、ライブラリーバイアスは、ターゲットシークエンシングデータの品質を損なう可能性があります。デジタルDNAシークエンシング法を採用することで、ワークフローに精度と信頼性を導入することができます。

プラットフォームにとらわれず、専門的に精選された当社のターゲットDNAシークエンシングパネルは、独自の分子インデックスを利用して、以下の優れたカバレッジを保証します。

  • GCリッチゲノム領域
  • 遺伝子のエキソン領域
  • ホットスポット
  • SNP
  • イントロン領域とプロモーター領域
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エラーまたは低頻度突然変異？

パネルを使用するターゲットDNAシークエンシングは、低頻度変異を検出する強力な方法です。しかし、すべてのDNA断片がまったく同じに見えるため、シークエンシングエラーとユニークなDNA分子の区別がほとんど不可能になるという大きな欠点があります。これにより、低頻度のDNA変異を確実に検出する能力が制限されます。QIAseqではこのようなことはありません。すべてのカタログとカスタムパネルに独自の分子インデックスが含まれており、オリジナルDNA分子にタグを付け、PCR、ポリメラーゼ、および機械読み取りエラーによる誤った読み取りを排除します。

Next-generation sequencing
Next-generation sequencing
ゲノムの最も困難な領域にアクセス

QIAseq製品には、最適化されたアンプリコンシークエンシングバッファーと酵素が含まれており、ゲノムの最も困難な領域にアクセスできます。QIAseq Targeted DNAパネルとワークフローで使用されているケミストリーは、通常のゲノム領域とGCリッチなゲノム領域の両方に対応しています。タイリングメソッドを使用して、CEBPAやCCND1などのGC含量が豊富な遺伝子を100%カバーします。

優れたシークエンシング指標

均一性：標準パネルは通常、平均カバレッジ0.2倍で99.5%、平均カバレッジ0.5倍で96%の均一性を達成します。

感度：低頻度のDNA変異判定の信頼性が高まります。標準パネルでは、1% NA12878 SNPと典型的なコード領域のインデルに対して90%以上の感度を示し、偽陽性はメガベース領域あたり15%未満です。

より多くのマルチプレックス化：他のサプライヤーの製品は、96サンプルのマルチプレックス化が可能です。QIAseqはそれ以上です。QIAseq特異的インデックスを使用して、384サンプルをマルチプレックス化できます。

注目のサクセスストーリー

Kings College Hospital NHS Foundation Trust（キングスカレッジ病院NHSトラスト）のLaboratory Lead for Precision Medicine（精密医療研究室長）であるDr. Barnaby Clarkが、ターゲットシークエンシングに関する経験と、最終的には自身のプロジェクト用NGSパネルの選択について語ります。
Dr. Fergus J Couch
「QIAseqパネルは、シングルプライマー伸長設計戦略を利用するため、ゲノムの困難な領域に入ることができます。同時に最大1500サンプルをシークエンシングできます。」

Dr. Fergus Couch、Mayo Clinic

 

QIAseqによるゲノムの洞察

QIAseqソリューションは、以下のイノベーションに基づいて、バイアスを最小限に抑え、ゲノムのカバレッジ、均一性、精度を最大化します。

QIAseq, NGS

サンプルの混同を削減し、スループットを最大化

QIAseq Multimodal Panels
Unique Dual Indices（UDI）は、「インデックスホッピング」とリードのミスアサインメントを軽減することにより、最高レベルのプロセス安全性とシークエンシングデータの信頼性を提供します。UDIにより、サンプルあたりのシークエンシングコストを削減し、シークエンシングスループットを最大化することができます。UMIとUDI両方を組み合わせることにより、QIAseq Targeted Panelsはこれまでにないレベルの精度を提供いたします。

全エクソームシークエンシング

記録的な速さでサンプルから病気を洞察

1つの最適化したエクソームシークエンシングパイプラインにより、サンプルから標準化した変異株の分類と解釈まで、ターンアラウンドタイムを短縮できます。

NGS
1日ワークフローによる自動化可能でスケーラブルなエクソームシークエンシング

エクソームを調査して病気の原因となる変異を特定しますが、GC組成に起因するカバレッジの均一性が心配ですか?

自動化に対応したスケーラブルな1日ワークフローを使用して、病原性変異を確実に、簡単かつ効率的に検出します。hybrid capture技術に基づくQIAseq Human Exome Kitは、以下を保証します。

  • 500を超える遺伝子ターゲットの高感度変異判定
  • サンプルあたりのシークエンシング費用を50%削減
  • サンプルからデータまでの全体的なターンアラウンドタイムを40%短縮

QIAGEN CLC Genomics Workbenchとのシームレスな統合により、迅速な変異判定が可能になり、QCI Translationalにより、手動キュレーションの負担なしに、正確な変異の解釈と疾患特異的洞察が保証されます。

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全ゲノム シークエンシング

ゲノムの包括的なビューをキャプチャー

全ゲノムおよびhybrid captureシークエンシングは、ゲノム全体の全体像と比類のない洞察を提供しますが、時間とコストのかかる方法となる可能性があります。QIAseqソリューションは、サンプルごとのデータの品質を最大化することで、この方法をより利用しやすくします。

次のような利点があります：

  • 高度なケミストリー ピコグラムのサンプル入力と 高速で自動化可能なプロトコールに対応
  • 酵素DNA断片化 – 高価な機械的せん断装置が不要
  • ライゲーション効率の改善 高い変換率と収量 – アダプター-ダイマーなし
  • 均一なG/C表示 あらゆる微生物に対応
  • 便利なキット形式 デュアルバーコードアダプター同梱
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QIAseq FX Library
注目のサクセスストーリー

ハイデルベルクのEndocrinology and Nuclear Medicine Community PracticeのDr. Egbert Schulzeが、全酵素的QIAseq FXワークフローが、いかにして均一なカバレッジを可能にし、研究で信頼性の高いシークエンシング結果を得るのに役立ったのか説明します。

ライブラリー調製の自動化および加速化
NGSライブラリー調製の自動化は、いかにしてラボに貢献しますか？
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cfDNAシークエンシング

cfDNAからの超希少変異検出に究極の信頼性
cfDNAから、非常に重要だが超希少な変異をお探しですか？ 当社のQIAseq Targeted cfDNA Ultra Panelsなら、金鉱を掘り当てたようなものです。当社のパネルでは、合理化された8時間のワークフローをに沿って、cfDNAから変異アレル頻度（VAF）0.1％までのレアバリアントを検出できます。
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QIAseq cfDNA Ultra visual illustration

シングルセルDNA-seq

single cell teaser image
包括的カバレッジと高いシークエンス忠実度を備えたPCRフリーのシングルセル全ゲノムライブラリー調製
シングルセルや限られたゲノムDNA量が、ゲノムのより深い理解を妨げていませんか? 当社のシングルセルDNAライブラリー調製キットを使用すると、シングルセルから全ゲノムライブラリーを4時間未満で調製できます。PCRフリープロトコールではバイアスが排除されるため、希少サンプル由来のシングルセルの異数性、コピー数、シークエンス変異を確実に分析できます。
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メタゲノミクス

微生物の多様性を解読

メタゲノムデータは、自然または健康な微生物嚢に存在する種の調査、病原性または抗生物質耐性遺伝子の存在量の定量、あるいはさまざまな疾患の原因、影響、および将来の治療法の解明に利用されます。PCRアンプリコンシークエンシングが必要な場合であれ、DNAサンプルの全メタゲノム解析または16S解析が必要な場合であれ、QIAseq NGSソリューションはサンプルのゲノムの複雑さを解明するように設計されています。

適切なツールを見つける
Water Microbiome

正規化

より迅速に – 定量せずにライブラリーを正規化
時間を節約し、時間のかかる従来のライブラリー定量法を手放しましょう。当社のQIAseq Normalizer Kitを使用すれば、ライブラリーの定量を行うことなく簡単にライブラリーをプールでき、しかもqPCRレベルの精度が得られます。所要時間はわずか30分です。
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Normalizer illustration main header

ウェビナーのハイライト

Enterprise Genomics Solutions
比類のない専門知識とサポートを当社の高性能QIAseq技術と組み合わせます。パネル設計から解析、さらには–当社のEnterprise Genomics Solutionsが、バイオマーカーの発見を簡素化し、研究を前進させます。
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写真はすべてCOVID-19が流行する前に撮影されたものです