NGSワークフロー

次世代シークエンシング（NGS）の進歩により、RNAシークエンシングはさまざまな種類のRNAを対象とする幅広い研究に不可欠なものとなっています。現在では、mRNA発現の観察にとどまらず、miRNAの配列決定や全トランスクリプトーム解析にも使用されています。近年は、rRNAの枯渇やデジタルRNAシークエンシングを用いた特定の組み合わせのトランスクリプトのターゲット化など、主な課題の解決や結果の向上につながる複数の手法が開発されています。

効果的なrRNA除去によりRNAシークエンシングを改善

RNAシークエンスライブラリー調製では、rRNAやグロビンmRNAなど科学的重要性の低いRNAの存在比が高く、貴重なシークエンシングキャパシティーを使い果たしてしまい、遺伝子発現のオンターゲットリードを得られなくなる可能性があります。不要なRNAの効果的な除去はRNAシークエンシングの前段階として重要です。
革新的なQIAseq FastSelect rRNA除去テクノロジーなら、1回のピペッティングで哺乳類、菌類、植物、および酵母のRNAサンプルから不要なRNAを除去できます。全トランスクリプトーム解析において細胞質rRNAやミトコンドリアrRNAを除去したい場合や、血液サンプルを使用した遺伝子発現研究においてグロビンmRNAを除去したい場合に、使用可能なリード数を最大化できます。

3’ シークエンシングの利点

高精度、高特異性、および高感度を実現するハイスループットソリューションに対するニーズの高まりに応えて、3’ RNAシークエンシングは細胞シグナル伝達経路の探索に活用されてきました。遺伝子発現解析において微量のRNAからハイスループット3'トランスクリプトームNGSを実現したユーザーの事例をご覧ください。