Session d’informations sur le cancer

Études multianalytes de biopsies liquides

Vous travaillez avec de l’ADN libre, des vésicules extracellulaires ou des cellules tumorales circulantes (CTC) ? Vous êtes-vous déjà posé la question suivante : Est-ce que l’on manque, voire gâche, des informations génomiques et transcriptomiques en ne s’intéressant qu’à un seul analyte ? Quels changements apporterait la possibilité d’étudier tous ces analytes à partir d’un même échantillon ?

Dans l’étude ELIMA (Evaluation of multiple Liquid biopsy analytes In Metastatic breast cancer patients All from one blood sample), Sabine Kasimir-Bauer et Corinna Keup (Hôpital universitaire d’Essen, Allemagne) se sont attelées au problème et ont développé des procédures puis comparé et analysé les profils d’ARN de cellules tumorales circulantes et de vésicules extracellulaires, elles ont ensuite effectué une analyse mutationnelle de l’ADN libre (ADNlc) à partir de plasma vierge ou appauvri en CTC, et plus encore.

Cette session d’informations sur le cancer inclut des présentations scientifiques de Sabine Kasimir-Bauer, Corinna Keup et une table ronde d’experts avec des scientifiques de QIAGEN. Vous pouvez télécharger votre poster qui vous guidera dans l’utilisation des biopsies liquides multianalytes et accéder à d’autres publications pour approfondir le sujet.

Écoutez la présentation scientifique avec Sabine Kasimir-Bauer, de l’Hôpital universitaire d’Essen, et la participation de Siegfried Hauch, Constanze Kindler et Markus Sprenger-Haussels

Analyse moléculaire des cellules tumorales circulantes, vésicules extracellulaires et acides nucléiques dans les biopsies liquides

L’utilisation de liquides biologiques tels que le sang comme source non invasive de biomarqueurs cellulaires et d’acides nucléiques biomarqueurs serait un « tissu de substitution » idéal pour identifier et suivre les facteurs pronostiques et prédictifs qui faciliteront la sélection de la stratégie thérapeutique optimale pour chaque patient. Sabine Kasimir-Bauer et son équipe se sont attelées au problème et ont comparé et analysé, dans un seul échantillon de sang, les profils d’ARN contenus dans les cellules tumorales circulantes ou les vésicules extracellulaires et effectué une analyse mutationnelle de l’ADN libre (ADNlc) dans des échantillons de plasma (séquençage à haut débit) dans le cadre du suivi de la maladie, afin d’en appréhender l’utilité pour la stratification thérapeutique et de prédire les options thérapeutiques.

Profilage des ARNm de CTC par rapport aux VE : un exemple de synergie

L’analyse des ARN contenus dans les cellules tumorales circulantes (CTC) ou les vésicules extracellulaires (VE) est peut-être suffisamment sensible pour détecter la progression de la maladie plus tôt que les méthodes de stadification visuelles actuelles. Corinna Keup décrit son étude de recherche, comparant les profils d’ARN des CTC et des vésicules extracellulaires (VE) chez les patientes avec cancer du sein métastatique (SCM) afin d’en appréhender l’utilité dans la stratification thérapeutique.

Corinna Keup, Hôpital universitaire d’Essen, avec la participation de Siegfried Hauch, Constanze Kindler et Martin Schlumpberger

Présentée par Corinna Keup, avec la participation de Siegfried Hauch et Markus Storbeck

Séquençage profond ciblé de l’ADNlc : une meilleure appréhension de la pertinence clinique des biopsies liquides

L’ADN libre (ADNlc) est considéré comme le reflet de l’hétérogénéité intratumorale et fournit des indications sur l’évolution clonale améliorant les décisions thérapeutiques. Corinna Keup décrit le séquençage profond ciblé de l’ADNlc d’une cohorte de cancer du sein métastatique (SCM) à récepteurs hormonaux positifs, HER2 négatif afin d’examiner la prévalence et la pertinence des variants et de la dynamique dans le cadre du traitement. Des identifiants moléculaires uniques permettent l’identification des mutations vraies positives dans l’ADNlc.

Profils de variants d’ADNccf et d’ARNm de CTC correspondants : peut-on les obtenir à partir d’un seul tube de sang ?

Les analytes de biopsie liquide tels que l’ADNlc et les CTC sont considérés comme une source d’informations additives, et les échantillons sanguins sont limités. Il est souhaitable de pouvoir isoler l’ADNlc et les CTC dans un format de tube « tout-en-un ». Corinna Keup a cherché à savoir si le séquençage de variants d’ADNlc à partir de sang appauvri en CTC a un impact sur les résultats par rapport au séquençage de variants d’ADNlc de sang total correspondant, et s’il constitue une procédure applicable pour l’évaluation des CTC et de l’ADNtc dans l’analyse d’expression et de mutation à partir d’un même échantillon sanguin.

Présentée par Corinna Keup, avec la participation de Siegfried Hauch, Sabine Kasimir-Bauer, Markus Storbeck et Constanze Kindler

Siegfried Hauch (président de séance), avec la participation d’Ioanna Andreou, Anna Babayan, Eric Lader, Jonathan Shaffer et Markus Storbeck

Présentation en ligne par des experts de QIAGEN

Intérêt des approches multianalytes dans l’analyse de biopsie liquide

Des scientifiques de QIAGEN examinent chacune des étapes de la procédure d’analyse de vésicules extracellulaires, des cellules tumorales circulantes et de l’ADNlc en parallèle, ainsi que les outils que nous pouvons utiliser pour une analyse plus approfondie des données. Cela comprend le séquençage d’ADN ciblé à l’aide d’UMI, les solutions de bio-informatique, le séquençage d’ADN méthylé ciblé, le séquençage de miARN et le profilage simultané de l’ADN et de l’ARN par NGS.

Nos intervenants

Sabine Kasimir-Bauer

Le Dr Sabine Kasimir-Bauer est maître de conférences à l’Hôpital universitaire d’Essen, en Allemagne, où elle a occupé plusieurs postes depuis son arrivée en 1993. Elle a obtenu un doctorat en 1993 de l’Institut de microbiologie et d’immunologie médicales à l’Université de Bochum, en Allemagne. Les études actuelles du Dr Kasimir-Bauer portent notamment sur le profilage d’expression des CTC, dont l’analyse de cellules individuelles, par rapport à l’expression de la tumeur primaire, ainsi que sur les métastases pour évaluer les patients en vue de thérapies ciblées. Outre l’analyse des CTC dans le sang, son équipe s’intéresse aux vésicules extracellulaires circulantes et à l’ADN libre circulant, en recourant aux identifiants moléculaires uniques et au séquençage à haut débit.
Siegfried Hauch

Le Dr Siegfried Hauch a intégré QIAGEN en 2001 et occupé plusieurs postes dans le marketing et la R&D pour la gamme de produits AdnaTest. Il a étudié la biologie à l’Université d’Ulm et a reçu son doctorat en physiologie végétale et en biologie moléculaire à l’Université Eberhard Karl de Tübingen en 1997. Siegfried est directeur de CTC Research and Development chez QIAGEN à Hilden, en Allemagne.
Constanze Kindler

Le Dr Constanze Kindler a intégré QIAGEN à Hilden, en Allemagne, en 1993, où elle a occupé différents postes au service Ventes et marketing mondial. Elle a obtenu son doctorat en biologie moléculaire à l’Université de Münster en 1993. Constanze est actuellement Associate Director, de Global Product Management, Sample Technologies, et se consacre plus particulièrement aux applications de biopsie liquide.
Corinna Keup

Le Dr Corinna Keup est chercheuse à l’Hôpital universitaire d’Essen, en Allemagne, où elle a consacré sa thèse de doctorat à la caractérisation moléculaire complète des cellules tumorales circulantes, des vésicules extracellulaires et de l’ADN libre grâce à la biopsie liquide multiparamétrique pour la gestion des thérapies chez les patientes avec cancer du sein métastatique. Elle a étudié la biochimie à l’Université Heinrich-Heinn à Düsseldorf, en Allemagne.
Markus Sprenger-Haussels

Le Dr Markus Sprenger-Haussels a intégré QIAGEN en tant que directeur de laboratoire en 1999. Depuis lors, il a occupé divers postes au sein de l’organisation R&D dans la division des Diagnostics moléculaires et sciences de la vie, assumant de nouvelles responsabilités en se concentrant sur le développement d’applications de biopsie liquide. Il est aujourd’hui responsable de la planification et de l’exécution de la stratégie de Technologie d’échantillons au sein de la division des Sciences de la vie de QIAGEN et dirige le département de développement de de produits. Il a étudié la biologie à l’Université de Cologne, obtenu un doctorat en génétique et effectué plusieurs postdoctorats à l’Institut Max-Planck de Cologne et Dortmund.
Martin Schlumpberger

Martin Schlumpberger est Director, Product Development chez QIAGEN et se consacre plus particulièrement à l’isolement des exosomes et des acides nucléiques libres circulants. Avant d’occuper cette fonction, il a dirigé avec succès le développement de différents produits d’isolement de l’ARN chez QIAGEN, dont les produits suivants : RNeasy FFIP Kit, RNeasy Plus Kit, AllPrep DNA/RNA Kit, miRNeasy Kit et QIAsymphony RNA Kit. Avant d’intégrer QIAGEN, Martin a travaillé comme postdoctorant à l’Institut pour les maladies neurodégénératives d’UCSF, aux États-Unis. Il est titulaire d’un doctorat en chimie de l’Université de Stuttgart, en Allemagne, qui était principalement axé sur la biologie moléculaire et la génétique des levures.
Markus Storbeck

Le Dr Markus Storbeck a intégré QIAGEN à Hilden, en Allemagne en 2017. Dans son rôle actuel de chercheur en développement de technologies NGS, il travaille au développement de procédures de préparation de banques NGS pour les plates-formes de séquençage Illumina et Ion Torrent, ainsi que sur des technologies d’enrichissement ciblé. Avant d’intégrer QIAGEN, Markus a travaillé comme postdoctorant à l’Institut de génétique humaine de l’Hôpital universitaire de Cologne sur la découverte de variants causant des maladies héréditaires rares. En 2014, il a obtenu son doctorat sur les facteurs d’épissage de l’ARNm dans les maladies neuromusculaires et neurodégénératives.

Sabine Kasimir-Bauer
Siegfried Hauch
Constanze Kindler
Corinna Keup
Markus Sprenger-Haussels
Martin Schlumpberger
Markus Storbeck

S’informer sur les études ELIMA

Keup C. et al. (2018) RNA profiles of circulating tumor cells and extracellular vesicles for therapy stratification of metastatic breast cancer patients. Clinical Chemistry
Keup C. et al. (2019) Targeted deep sequencing revealed variants in cell-free DNA of hormone receptor-positive metastatic breast cancer patients. Cellular and Molecular Life Sciences
Keup C. et al. (2019) Cell-free DNA variant sequencing using CTC-depleted blood for comprehensive liquid biopsy testing in metastatic breast cancer Cancers
Keup C. et al. (2020) Multimodal Targeted Deep Sequencing of Circulating Tumor Cells and Matched Cell-Free DNA Provides a More Comprehensive Tool to Identify Therapeutic Targets in Metastatic Breast Cancer Patients. Cancers

Procédure synthétisée pour la recherche sur les biopsies liquides multianalytes

Téléchargez notre nouveau poster pour l’accrocher au mur de votre laboratoire ou à la porte de votre réfrigérateur : Procédure synthétisée pour la recherche sur les biopsies liquides multianalytes

Télécharger

Vous avez des questions sur les biopsies liquides multianalytes ?

Envoyez-nous vos questions et nous y répondrons au mieux.

Demandez-nous