Verogen ForenSeq DNA Signature Prep Kit

Für alle erforderlichen Reagenzien zur Vorbereitung von Sequenzierungsbibliotheken aus forensischen DNA-Proben

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ForenSeq DNA Signature Prep Kit (96)

Cat. No. / ID:  V16000023

Enthält alle erforderlichen Reagenzien zur Vorbereitung von Sequenzierungsbibliotheken aus forensischen DNA-Proben; Teil der Verogen MiSeq FGx Genomiklösung für die Forensik
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Verogen ForenSeq DNA Signature Prep Kit ist für molekularbiologische Anwendungen in der Gerichtsmedizin, zur Personenidentifizierung und für Vaterschaftstests vorgesehen. Dieses Produkt ist nicht für die Diagnostik, Prävention oder Behandlung einer Krankheit bestimmt.

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Features

  • Abfrage von 200 genetischen Markern in einem einzigen, optimierten Arbeitsablauf
  • Zugang zu wertvollen Daten mit einem umfangreichen Satz forensisch relevanter SNPs
  • Überragende Analyse schwieriger und stark degradierter Proben
  • Multiplexing-Fähigkeit zur weiteren Steigerung der betrieblichen Effizienz
  • Zugelassen zum Hochladen in das Nationale DNA-Index-System (NDIS) für die Fallarbeit

Product Details

Mit unserem einfachen, plattenbasierten Arbeitsablauf können Sie in weniger als zwei Stunden von bis zu 96 DNA-Proben umfassende DNA-Profile erstellen. Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit nutzt die erste auf Next Generation Sequencing (NGS) basierende Short-Tandem-Repeat(STR)-Sequenzierungschemie, die für das Hochladen in das National DNA Index System (NDIS) für die Fallarbeit zugelassen ist. Durch die Kombination von über 200 Markern, darunter autosomale, X- und Y-STRs, identitätsrelevante, phänotyprelevante und biogeografische Abstammungsinformationen liefernde SNP, in einem einzigen, optimierten Arbeitsablauf werden durch das Kit multiple STR-Untersuchungen überflüssig. Durch die Vereinfachung von Schulungsprogrammen, Validierungsverfahren, Eignungsprüfungen und anderen Maßnahmen zur Qualitätssicherung/Qualitätskontrolle, die von externen Zertifizierungs- und Akkreditierungsprogrammen gefordert werden, maximiert der einfache, integrierte Arbeitsablauf die Effizienz des Labors. Die Lösung ist rückwärtskompatibel mit der aktuellen CE-Allelbestimmung.

Performance

Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit ist Teil einer Komplettlösung für die durchgehend massiv-parallele Sequenzierung, die speziell für den Einsatz in forensischen Genomanwendungen entwickelt wurde. Mit dem ForenSeq DNA Signature Prep Kit kann Ihr Labor mit einem einfachen plattenbasierten Arbeitsablauf bis zu 96 DNA-Proben für das Illumina Next Generation Sequencing (NGS) vorbereiten.

  • Keine Notwendigkeit mehr für multiple STR-Kits
  • Die breitere SNP-Palette liefert Informationen, die mit anderen Technologien nicht möglich sind.
  • Gewinnung von Daten hoher Trennschärfe aus weniger als 100 pg degradierter oder komplexer DNA
  • Gleichzeitige Vorbereitung von bis zu 96 Bibliotheken in einem einfachen plattenbasierten Format

Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit fasst alle autosomalen Short-Tandem-Repeat(STR)-Marker, die derzeit weltweit für die Fallarbeit und die kriminalistische DNA-Datenerfassung verwendet werden, in einem einzigen, optimierten Arbeitsablauf zusammen, wodurch die Notwendigkeit der Durchführung multipler STR-Untersuchungen entfällt. Zusätzlich zu autosomalen, X- und Y-STR bietet das ForenSeq DNA Signature Prep Kit Markersätze, die mit herkömmlichen Verfahren der Kapillarelektrophorese (CE) nicht standardmäßig zur Verfügung stehen. Dazu gehören eine Reihe von identitätsrelevanten Einzelnukleotid-Polymorphismen (iiSNP), die für die Zuordnung der Quelle aussagekräftig sind, phänotypischrelevante SNP (piSNPs), die Abschätzungen der Augenfarbe (blau, intermediär, braun) und Haarfarbe (braun, rot, schwarz, blond) liefern, sowie biogeografische Abstammungsinformationen liefernde SNP (aiSNP). Diese können entscheidend sein, wenn es darum geht, aus unverdächtigen Fällen, die andernfalls vielleicht nicht aufgeklärt worden wären, Ermittlungshinweise zu gewinnen.

Forensische Loci, die mit dem ForenSeq DNA Signature Prep Kit abgedeckt werden
Merkmal Anzahl der Marker Amplifikatgröße (bp) DPMA DPMB
Globale autosomale STR 27 61–467 Ja Ja
Y-STR 24 119–390 Ja Ja
X-STR 7 157–462 Ja Ja
Identitäts-SNP 94 63–261 Ja Ja
Phänotypische SNP 22 73–227 Nein Ja
Biogeografische Abstammungs-SNP 56 67–200 Nein Ja

Mit Primer Mix A (DPMA) können in einer einzigen Reaktion alle autosomalen, X- und Y-chromosomalen STR-Ziele und der gesamte Satz von iiSNP untersucht werden. Primer-Mix B (DPMB) enthält die aiSNPs und piSNPs.

Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit enthält:

  • DNA Primer Mix A: Enthält Primerpaare für 58 STR (davon 27 autosomale STR, 7 X- und 24 Y-Haplotyp-Marker) und 94 iiSNPs
  • DNA Primer Mix B: Enthält alle Marker des DNA Primer Mix A sowie Primerpaare für 56 biogeografische aiSNP und 22 piSNPs (2 aiSNPs werden auch für die Phänotypeinordnung verwendet)s

Die meisten SNPs, die Teil des ForenSeq DNA Signature Prep Kit sind, enthalten Amplifikate mit einer Größe von ≤ 125 bp, wodurch sie sich hervorragend für die Analyse degradierter DNA und sogar stark inhibierter DNA-Extrakte eignen (siehe Abbildung “Vergleich der Leistung von gDNA mit hohem Molekulargewicht und teilweise degradierter gDNA”). Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit kann auch geringfügige Nebenfaktoren in Gemischen besser erkennen, die andernfalls mit herkömmlichen STR- und CE-Analysen unerkannt bleiben würden. Diese verbesserte Leistung ist auf die große Anzahl der Marker im Kit zurückzuführen, von denen viele hoch polymorph sind, und auch auf die inhärente Sensitivität des Illumina MiSeq FGx-Geräts.

Merkmal Details
Probentypen gDNA, Wangenabstrichstäbchen, FTA-Karte
Empfohlene Eingangsmenge menschlicher gDNA je Probe 1 ng
Empfohlener Eingang für FTA-Kartenstanzen je Probe 1,2 mm
Multiplexing-Leistung je Lauf 8–96 Proben
Erkennung kurzer Amplifikate ≥ 65 bp
Fähigkeit zum Locus-Multiplexing Gleichzeitige Analyse von etwa 200 genetischen Markern
Gesamtdauer der Bibliotheksvorbereitung 7 Stunden und 15 Minuten
Dauer der praktischen Arbeit 1 Stunde und 45 Minuten
Gesamtdauer der Sequenzierung Etwa 28 Stunden mit dem MiSeq FGx Reagenzienkit; etwa 22 Stunden mit dem MiSeq FGx Reagenzien-Mikrokit

Principle

Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit ist Teil einer vollintegrierten Lösung von der Probe bis zum Ergebnis, einschließlich Bibliotheksvorbereitung, DNA-Sequenzierungsplattform und Datenanalysesoftware, die speziell für die forensische Genomik entwickelt wurde. Mit etwa 200 genetischen Markern in einem einzigen Arbeitsablauf bietet die MiSeq FGx-Lösung das umfassendste STR- und SNP-Multiplexing und den einfachsten Weg zur Personenidentifizierung.

Procedure

Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit enthält alle für die Vorbereitung von DNA-Bibliotheken zur Sequenzierung erforderlichen Reagenzien, einschließlich PCR-Reagenzien, Indexadapter sowie Aufreinigungs- und Normalisierungsperlen. Gleichzeitige Abfrage von Markern Ihrer Wahl in einer einzigen Amplifikation. Wählen Sie zwischen dem DNA Primer Set A (DPMA) und dem DNA Primer Set B (DPMB), um mehrere bestehende Kits auf Basis der Kapillarelektrophorese (CE) zu konsolidieren.

Applications

Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit ist Teil der Verogen MiSeq FGx Lösung für die forensische Genomik, einem vollständigen, umfassend validierten DNA-zu-Daten-Workflow, der speziell für Anwendungen in der forensischen Genomik entwickelt wurde.

Software

Das ForenSeq DNA Signature Prep Kit ist Teil eines integrierten Arbeitsablaufs, bei dem Bibliotheken auf dem MiSeq FGx Sequencing System sequenziert und die Daten in der Universal Analysis Software (UAS) analysiert werden. Das gesamte Portfolio wurde als leistungsstarke Komplettlösung für forensische Proben konzipiert, entwickelt und hergestellt und wird durch umfassenden technischen Support unterstützt. Darüber hinaus gewährleistet die qualitätskontrollierte Herstellung die Reproduzierbarkeit mit den praktischen Komplettkits zur Bibliotheksvorbereitung.

Services

Wir bieten hervorragende Unterstützung für den gesamten Arbeitsablauf, von der Bibliotheksvorbereitung über die Sequenzierung bis zur Analyse. Unser erfahrenes Team übernimmt umfassende Serviceleistungen für Ihre Geräte und Software, Validierungspläne und Implementierungsanleitungen, damit Sie Ihre Arbeitsabläufe schnell und problemlos in die Praxis umsetzen können.

Resources

Brochures & Guides (2)
Our improved noninvasive paternity testing workflow delivers answers with greater confidence

The benefits of next-generation sequencing for human identification


Quick-Start Protocols (1)
ForenSeq DNA Signature Prep Kit Checklist
Analysis Software (1)
ForenSeq Universal Analysis Software Guide
Labware Documents (1)
ForenSeq DNA Signature Prep Consumables and Equipment
Kit Handbooks (1)
Prepare DNA libraries to genotype database or casework reference samples in a single run
Certificates of Analysis (1)