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MagAttract HMW DNA Kit (48)
Cat. No. / ID: 67563
Für 48 DNA-Präparationen: MagAttract Suspension G, Buffer ATL, Buffer AL, Buffer MB, Buffer MW1, Buffer PE, Proteinase K, RNase A, Buffer AE, Nuklease-freies Wasser
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MagAttract HMW DNA Kit ist für molekularbiologische Anwendungen vorgesehen. Dieses Produkt ist nicht für die Diagnose, Prävention oder Behandlung einer Krankheit bestimmt.
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Features
- Reproduzierbare Isolierung von DNA mit hohem Molekulargewicht
- Hohe Ausbeuten und Reinheit aus einer Vielzahl an Probenmaterialien
- Schnelle und praktische Protokolle
- Vollständige Entfernung von Inhibitoren
Product Details
Das MagAttract HMW DNA Kit ermöglicht die Aufreinigung von DNA mit hohem Molekulargewicht (100–200 kb) mit einem einfachen Protokoll auf Basis von Magnetpartikeln. Bei dem Aufreinigungsverfahren werden Verunreinigungen und Inhibitoren schonend entfernt, während gleichzeitig eine sehr hohe Ausbeute und Reinheit erzielt wird. Die extrahierte genomische DNA eignet sich für zahlreiche Applikationen wie z. B. Archivierung und Next Generation Sequencing (NGS).
Performance
Das MagAttract HMW DNA Kit gewährleistet die reproduzierbare Isolierung von genomischer DNA > 150 kb. Die mit dem MagAttract HMW DNA Kit isolierte DNA wurde mit Hilfe von Pulsed-Field-Gelelektrophorese mit der mit anderen Magnetpartikel-basierten Verfahren isolierten DNA verglichen. Das MagAttract HMW DNA Kit zeigte überlegene Ergebnisse bei der Isolierung von DNA mit hohem Molekulargewicht (siehe Abbildung Erfolgreiche Isolierung von DNA mit hohem Molekulargewicht).
Konsistent hohe Ausbeute und Reinheit
Das MagAttract HMW DNA Kit nutzt ein bequemes, unkompliziertes Verfahren zur Gewinnung hoher Ausbeuten an reiner DNA mit hohem Molekulargewicht. Schonende Lysebedingungen minimieren die DNA-Fragmentierung, während Verunreinigungen und PCR-Inhibitoren effizient entfernt werden, sodass reine DNA mit hohem Molekulargewicht erhalten wird. Die optimierte Chemie und das optimierte Verfahren des MagAttract HMW DNA Kit erhöhen die DNA-Ausbeute und -Reinheit verglichen mit klassischen Spin-Säulen- oder Magnetpartikel-basierten Methoden anderer Anbieter deutlich (siehe Abbildung Höchste Ausbeute und Reinheit und Verbesserte Ausbeute aus verschiedenen Probentypen).
Effektive Entfernung von PCR-Inhibitoren
Hochsensitive Applikationen wie Real-time PCR oder NGS erfordern die Entfernung von Antikoagulanzien, Enzymen, divalenten Kationen und anderen ähnlichen Inhibitoren. Es wurde eine Real-time PCR-Amplifikation von DNA durchgeführt, die aus EDTA-, Heparin- und Citrat-stabilisierten Blutproben mit dem MagAttract HMW DNA Kit isoliert wurde. In keiner der Proben wurde eine Inhibition beobachtet; alle zeigten eine hochlineare Korrelation der CT-Werte mit dem eingesetzten Probenvolumen (siehe Abbildung Keine Inhibition in aus antikoaguliertem Blut gewonnenen Proben).
Genomische DNA gebrauchsfertig für das Next Generation Sequencing
Da Technologien zur massiven parallelen Sequenzierung (MPS) mit kurzen Read-Längen arbeiten, kann eine Sequenzierung mit intakter genomischer DNA > 10 kb durchgeführt werden. De-novo-Genom-Assemblierung sowie die Entdeckung angeborener oder erworbener Strukturvarianten stellen jedoch mit Standardprodukten zur DNA-Aufreinigung noch immer eine Herausforderung dar. Mate-Pair-Bibliotheken mit größeren Inserts können einen signifikanten Einfluss auf den Sequenzierungserfolg haben, besonders bei komplexen Genomen mit vielen Repeats. Die mit dem MagAttract HMW DNA Kit gewonnene genomische DNA mit hohem Molekulargewicht kann direkt für NGS-Experimente eingesetzt werden.
| Parameter | Spezifikation |
|---|---|
| Gesamtzahl (langer) gemappter Reads | 6521106 |
| Fehlerrate | 0,36 % |
| Indel-Rate | 0,01 % |
| Chimären | 0,14 % |
| Duplikation in Prozent | 1,15 % |
See figures
Principle
Die Isolierung genomischer DNA ist ein zentraler Schritt jeder DNA-Analysemethode. Die Schlüsselparameter sind im Allgemeinen Ausbeute, Reinheit und Integrität der isolierten DNA. Während für Standardmethoden wie PCR-, Sequenzierungs- oder Hybridisierungstechniken ein Molekulargewicht im Bereich von 10–30 kb ausreichend sein kann, erfordern einige sensitive Methoden wie die Generierung von BAC- oder Fosmid-Bibliotheken oder die Archivierung von DNA eine höhere Integrität der genomischen DNA.
Das MagAttract HMW DNA Kit ist spezifisch darauf ausgelegt, DNA mit hohem Molekulargewicht aus einem breiten Spektrum an Proben wie Human- oder Tiergewebe, Blut und Bakterien zu gewinnen. Das Kit nutzt eine effiziente Kombination aus leistungsstarken Magnetpartikeln und einer innovativen silikabasierten Chemie. Die leistungsstarken Magnetpartikel stellen sicher, dass die isolierte DNA in hoher Ausbeute und hoher Reinheit vorliegt.
Das MagAttract HMW DNA Kit ist spezifisch darauf ausgelegt, DNA mit hohem Molekulargewicht aus einem breiten Spektrum an Proben wie Human- oder Tiergewebe, Blut und Bakterien zu gewinnen. Das Kit nutzt eine effiziente Kombination aus leistungsstarken Magnetpartikeln und einer innovativen silikabasierten Chemie. Die leistungsstarken Magnetpartikel stellen sicher, dass die isolierte DNA in hoher Ausbeute und hoher Reinheit vorliegt.
Procedure
Das praktische MagAttract Protokoll ermöglicht reproduzierbare Ergebnisse in nur 70 Minuten.
Schnelles und optimiertes Protokoll
Optimierte Puffer und Enzyme lysieren Proben schonend, sodass die Fragmentierung der genomischen DNA minimiert wird. Das Verfahren besteht aus 4 einfachen Schritten: Lyse, Binden, Waschen und Eluieren. Nach der Probenlyse bindet die DNA an die Oberfläche der Magnetpartikel. Während der Waschschritte werden Verunreinigungen und PCR-Inhibitoren effektiv entfernt, und reine DNA mit hohem Molekulargewicht wird in Buffer AE eluiert (siehe Abbildung MagAttract HMW DNA Kit Verfahren).
Schnelles und optimiertes Protokoll
Optimierte Puffer und Enzyme lysieren Proben schonend, sodass die Fragmentierung der genomischen DNA minimiert wird. Das Verfahren besteht aus 4 einfachen Schritten: Lyse, Binden, Waschen und Eluieren. Nach der Probenlyse bindet die DNA an die Oberfläche der Magnetpartikel. Während der Waschschritte werden Verunreinigungen und PCR-Inhibitoren effektiv entfernt, und reine DNA mit hohem Molekulargewicht wird in Buffer AE eluiert (siehe Abbildung MagAttract HMW DNA Kit Verfahren).
See figures
Applications
Die mit dem MagAttract HMW DNA Kit gewonnene genomische DNA mit hohem Molekulargewicht kann direkt für NGS-Experimente eingesetzt werden. Sie kann zur Generierung von Bibliotheken mit sowohl kleinen als auch großen Inserts verwendet werden und eignet sich damit für alle Sequenzierungsapplikationen.
Supporting data and figures
Exemplarische Größenverteilung mit dem MagAttract HMW DNA Kit (Zellen)
Exemplarische Größenverteilung von DNA aus Zellen mit dem MagAttract HMW DNA Kit. Die Proben wurden mit dem Femto Pulse System analysiert und die Signale wurden auf den Maximalpeak normalisiert.
Specifications
| Features | Specifications |
|---|---|
| Sample amount | 200 μl Blut; bis zu 25 mg Gewebe; 2 x 10e9 Bakterienzellen |
| Process time | ~70 Minuten für 12 Proben |
| Elution volume | 100–200 µl |
Resources
Brochures & Guides (1)
Kit Handbooks (1)
Quick-Start Protocols (1)
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)
FAQ
Can I scale up reagents if I want to use more sample with the MagAttract HMW DNA Kit (cat. no. 67563)?