RNA-seq 최적화에서 rRNA 제거의 중요성

QIAseq FastSelect는 인간 및 박테리아가 혼합된 검체에서 고품질 RNA-seq를 가능하게 합니다.

밴 앤델 연구소(Van Andel Institute)의 유전체학 핵심 책임자(Genomics Core Director) Marie Adams 박사는 QIAseq FastSelect 기술이 동일한 RNA 검체에서 인간 및 박테리아 동시 발현 연구를 위한 고품질 RNA-seq 데이터를 생성하는 문제를 극복하는 데 어떻게 도움이 되었는지 설명합니다.

QIAseq FastSelect는 더 성공적인 암 치료를 위한 길을 열어줍니다

“QIAseq FastSelect는 제 프로젝트에서 RNA 염기서열 분석에 굉장한 역할을 했습니다. RNA가 분해되어 거의 사용할 수 없었지만 QIAseq FastSelect는 이러한 분해된 검체에서 리보솜 RNA를 실제로 제거하고 염기서열 분석 라이브러리를 개선했습니다.”

Brandon Mistrella(휴스턴 대학교, 생물 및 생화학과)

휴스턴 대학교의 암 연구자들은 FFPE 검체로 작업할 때 일상적으로 RNA 분해와 관련된 문제에 직면했습니다. 수율이 낮은 RNA 검체 내에 리보솜 RNA 및 글로빈 mRNA와 같은 원치 않는 RNA 종이 존재하면 RNA 염기서열 분석이 더욱 복잡해집니다. QIAseq FastSelect가 어떻게 FFPE RNA에서 유용한 RNA-seq 데이터를 검색할 수 있도록 연구를 혁신했는지 읽어보세요.

QIAseq FastSelect를 사용하면 저품질 FFPE RNA로부터 RNA-seq 라이브러리를 구축할 수 있습니다

“이 워크플로우는 매우 간단하고 빠릅니다. 검체 품질이 좋지 않은데다가 검체 양까지 제한적이어서 우리는 결과에 대해 기대하지는 않았었습니다.”

Fabienne Desmots-Loyer 박사, Hematology researcher, CHU – Hospital Pontchaillou, Rennes, France

분해율이 높고 낮은 수율로 인해 FFPE 검체에서의 RNA 실험이 어려울 수 있습니다. 렌 병원(Hospital Rennes)의 Fabienne Desmots-Loyer 박사의 사례를 통해, RNA 분해율이 높고 낮은 수율로 인해 이미 다른 두 개의 상업 위탁 실험실에서 거부한 FFPE 암 검체로부터 QIAseq FastSelect가 어떻게 고품질의 라이브러리를 제공함으로써 이를 구했는지 알아보세요.

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획기적으로 빠르고 쉬운 rRNA 제거

대체적인 rRNA 제거 방법은 여러 시간이 걸리고 여러 단계가 필요하며 단편화되지 않은 RNA에서만 가능하거나 rRNA를 충분히 제거하지 않는 반면, FastSelect 방법을 사용하면 훨씬 더 빠르고 편리한 워크플로우란 이점과 더불어 FFPE 및 단편화된 RNA 검체에서도 탁월한 결과를 얻을 수 있습니다.

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