Procédures de NGS

Grâce aux avancées permises par le séquençage à haut débit (NGS), le RNA-seq est devenu essentiel dans une gamme variée d’études des nombreux types d’ARN différents. Les technologies actuelles vont bien au-delà de la simple expression de l’ARNm et comprennent le séquençage de miARN et de transcriptomes entiers. Plusieurs techniques ont été développées récemment pour surmonter les principales difficultés et améliorer les résultats, par exemple par déplétion de l’ARNr et par ciblage d’ensembles spécifiques de transcrits à l’aide du RNA-seq digital.

Élimination de l’ARNr

Améliorez le RNA-seq grâce à une élimination efficace de l’ARNr

Pendant la préparation de banques de séquences ARN, les ARN très abondants de faible valeur scientifique, comme l’ARNr et/ou l’ARNm de globine, peuvent utiliser une capacité de séquençage précieuse, compromettant la possibilité d’obtenir des lectures d’expression génique sur cible. L’élimination efficace de l’ARN indésirable est une étape essentielle avant le RNA-seq.
La nouvelle technologie QIAseq FastSelect d’élimination de l’ARNr élimine les ARNr indésirables en une seule étape de pipetage dans les échantillons d’ARN provenant de mammifères, de bactéries, de plantes et même de levures. Que vous souhaitiez éliminer l’ARNr cytoplasmique et mitochondrial pour l’analyse de transcriptomes entiers, ou l’ARNm de globine pour la recherche sur l’expression génique avec des échantillons sanguins, cette nouvelle technologie peut maximiser les lectures.

Webinaire sur l’élimination de l’ARNr de nouvelle génération :

Notre équipe de R&D a décrit la façon dont nous avons développé et testé nos QIAseq FastSelect rRNA Removal Kits pour les échantillons provenant d’êtres humains, de mammifères, de bactéries, de plantes et de levures à l’aide d’ARN total de haute qualité et d’ARN fortement fragmenté.

Regarder le webinaire

Webinar] Next-generation rRNA removal: Evolution of new technologies for mammalian, bacterial, plant and yeast samples

Élimination de l’ARN ribosomique : L’étape la plus sous-estimée dans l’optimisation de RNA-seq

Lisez le témoignage du Dr Fabienne Desmots-Loyer, de l’hôpital de Rennes, et apprenez comment la gamme QIAseq FastSelect l’a sauvée en fournissant des banques de haute qualité à partir d’échantillons de cancer FFPE, que deux laboratoires commerciaux avaient refusé de traiter en raison d’un haut degré de dégradation et de trop faibles quantités d’ARN.

Lire le témoignage

Ribosomal RNA removal: The most underestimated step in RNA-seq optimization

Solutions QIAseq

Découverte de biomarqueurs

Solutions Sample to Insight pour optimiser la découverte de biomarqueurs miARN

Les solutions de séquençage QIASeq miRNA pour l’analyse d’expression des miARN, des piARN et des petits ARN, ainsi que pour la découverte de nouveaux petits ARN, permettent la préparation de banques NGS de petits ARN ainsi que le contrôle qualité de la préparation d’échantillons et des performances du NGS.

Webinaire – « La vérité sur le séquençage de l’ARN »

L’une de nos meilleures spécialistes du domaine, Barbara R. Gould, vous fera bénéficier de son expertise et des nombreuses années d’expérience acquises par les services de génomique de QIAGEN. Ce webinaire portera sur les questions de la préparation de banques, des paramètres de séquençage, du contrôle qualité, de l’analyse des données et de la validation des résultats du NGS.

NGS pour la détection des microARN

Séquençage d'ARN 3’

Avantages du séquençage 3’

L’utilisation du séquençage d'ARN 3’ a été importante dans la recherche sur les voies de signalisation cellulaire afin de répondre à la demande croissante en solutions haut débit qui garantissent également l’exactitude, la spécificité et la sensibilité. Ces témoignages d’utilisateurs expliquent comment ils ont réussi le NGS 3’ haut débit de transcriptomes à partir de quantités ultra-faibles d’ARN pour l’analyse de l’expression génique.

L’encapsulation renforce la signature des îlots de Langerhans dans les cellules souches pluripotentes induites humaines en cours de différenciation par l’intermédiaire de la signalisation des intégrines

« Pour nous, l’approche QIAseq UPX 3’ Transcriptome s’est avérée providentielle en permettant le séquençage à haut débit des quantités ultra-faibles d’ARN isolé à partir d’échantillons difficiles à traiter. Les résultats du projet pilote obtenus avec les services de génomique de QIAGEN ont dépassé nos attentes. À mon avis, c’est vraiment une approche à envisager lorsque la quantité d’ARN est inférieure au seuil minimal. » Simon Chera, maître de conférences, Université de Bergen.

Lire l’article de Nature

Encapsulation boosts islet-cell signature in differentiating human induced pluripotent stem cells via integrin signaling

Webinaire – élucider les relations

« Le service UPX 3’ Transcriptome de QIAGEN nous a permis de générer une série de données de séquençage d’ARN à grande échelle ayant facilité la découverte de modifications essentielles dans l’expression génique qui déterminent notre modèle de maladie. » Matthew Dodson, postdoctorant, Université de l’Arizona.