Circulating cell-free DNA
Biopsia líquida

ADN circulante libre

Las biopsias de tejido son la metodología más recurrente para los diagnósticos, pero solo representan un punto en el tiempo y tienen algunas desventajas, fundamentalmente en cuanto a la repetibilidad, el coste y el tiempo de espera hasta el resultado. El uso de ccfADN deja atrás estas desventajas gracias a la información mutacional en tiempo real que puede utilizarse para detectar y monitorizar biomarcadores del cáncer y otras enfermedades a través de una sencilla prueba de sangre.
Debido a que el ccfADN se suele encontrar en bajas concentraciones con mutaciones poco frecuentes o en condiciones fragmentadas, necesita herramientas fiables que le proporcionen la confianza necesaria en las señales que detecte. Independientemente de si trabaja en la investigación de biomarcadores, trasplantes o NIPT, le ofrecemos soluciones de referencia para el análisis y la preparación de las muestras de ccfADN con la garantía de la mejor calidad.

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General

¿Qué es el ccfADN?

Muchos estudios han mostrado que los niveles elevados de ccfADN, también conocidos como ctADN, se pueden encontrar en la sangre de los pacientes que sufren distintas enfermedades, sobre todo cáncer. Las ccfADN son distintas del ADN libre de células por la presencia de mutaciones somáticas, que pueden utilizarse como marcadores genéticos para determinar la respuesta terapéutica y ayudar a la toma de decisiones en cuanto a los tratamientos. El análisis de los niveles de ccfADN mutantes también pueden resultar útiles para llevar a cabo un seguimiento en pacientes con cáncer y detectar enfermedades residuales mínimas.

¿Cómo puedo superar los problemas de los procesos de aislamiento de ccfADN?

Nuestras soluciones QIAamp MinElute ccfDNA Kit y EZ1 ccfDNA Kit utilizan un método único basado en columnas y microesferas para proporcionar, de forma fiable, material de alta calidad para el suero o plasma humano para investigación. Para ello, ofrecen una recuperación eficaz del ADN fragmentado, un volumen de entrada de muestra ampliable de entre 1 y 10 ml, la extracción no orgánica o precipitación de etanol y la eliminación eficaz de contaminantes e inhibidores.

¿Puedo aislar más de un analito a partir de una única muestra?

El QIAamp ccfDNA/RNA Kit ofrece la posibilidad de aislar ccfADN y ccfARN a partir de una única muestra de plasma, con resultados y calidad excelentes para ambos analitos en el mismo eluido.
Esto le permite analizar tanto las mutaciones de ARN como las de ADN a partir de la misma muestra de biopsia líquida e impulsar la sensibilidad de detección para hallar mutaciones de tumores de baja frecuencia para la investigación.

Recogida de muestras

¿Cuál es la cantidad mínima de sangre que puede extraerse?

La mayoría de los kits del mercado requieren entre 8 y 10 ml de sangre de cada extracción para procesar el plasma y las ccfADN. Al igual que ocurre con los PAXgene Blood ccfDNA Tubes. Se requiere una extracción de sangre de 10 ml. Esta medida garantiza una proporción de 0,15 ml de aditivo de estabilización de células por ml de sangre cuando el tubo evacuado se rellena correctamente.

Cuando hablan de recogida de sangre, ¿se refiere a sangre total, suero o plasma?

En el caso de la recogida de muestras, los PAXgene Blood ccfDNA Tubes sirven para recoger sangre total humana. Por lo tanto, puede usar un protocolo con los tubos para procesar el plasma. El ccfADN puede purificarse manualmente mediante el QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit o automáticamente con el QIAsymphony PAXgene Blood ccfDNA Kit.

¿Se pueden usar agujas con aletas para extraer la sangre con los PAXgene Blood ccfDNA Tubes?

Sí, los PAXgene Blood ccfDNA Tubes pueden usarse con los equipos de recogida de sangre habituales. También puede consultar el manual de PAXgene Blood ccfDNA Tube para obtener más detalles sobre los procedimientos de recogida de muestras.

Estabilización y preparación de muestras

¿Qué tipo de estabilización de sangre debe usarse para la extracción y el análisis del ADN mediante PCR?

Es preferible evitar la modificación de ADN de los reactivos de reticulación. Los PAXgene Blood ccfDNA Tubes emplean una alternativa, una solución patentada para la estabilización que no incluye la reticulación. Esta solución le permite reducir la liberación de gADN y minimiza la hemólisis, por lo que se conserva eficazmente la integridad de sus muestras y se evita la modificación de ADN, que puede complicar la obtención de resultados de PCR.

¿Se mantienen los estados de metilación en la sangre?

Sí, el ccfADN purificado mediante la solución PAXgene Blood ccfDNA System es compatible con los ensayos específicos de metilación que requieren tratamientos con bisulfitos. En este póster, también comparamos el rendimiento de los tubos de EDTA, Streck y PAXgene Blood ccfDNA en dos puntos distintos a lo largo del tiempo con el Agilent Bioanalyzer (después de 0 días y después de 6 días). Después de 6 días, detectamos que las muestras de Streck mostraban una variación de 7-8 bp en el pico de ccfADN principal, lo que significa que ha habido una modificación del ADN por reactivos de liberación de formaldehido.

 

Para obtener más información, póngase en contacto con su representante local de QIAGEN o con nuestro departamento de servicio técnico.