MagAttract HMW DNA Kit

Pour l’isolement d’ADN génomique de poids moléculaire élevé

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MagAttract HMW DNA Kit (48)

Cat. No. / ID:  67563

Pour 48 préparations d’ADN : MagAttract Suspension G, Buffer ATL, Buffer AL, Buffer MB, Buffer MW1, Buffer PE, protéinase K, RNase A, Buffer AE, eau sans nucléase
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457,00 $US
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Le MagAttract HMW DNA Kit est destiné aux applications de biologie moléculaire. Ce produit n’est pas conçu pour le diagnostic, la prévention ou le traitement des maladies.

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Features

  • Isolement reproductible d’ADN de poids moléculaire élevé
  • Rendements élevés et pureté importante à partir de divers matériels d’échantillons
  • Protocoles rapides et pratiques
  • Extraction complète des inhibiteurs

Product Details

Le MagAttract HMW DNA Kit permet de purifier un ADN de poids moléculaire élevé (100–200 kb) suivant un protocole simple, avec billes magnétiques. La procédure de purification élimine délicatement les contaminants et les inhibiteurs, tout en offrant des rendements et une pureté très importants. L’ADN génomique extrait est adapté à de nombreuses applications, notamment l’archivage et le séquençage à haut débit (Next-generation sequencing, NGS).

Performance

Le MagAttract HMW DNA Kit permet l’isolement reproductible d’un ADN génomique > 150 kb. L’ADN isolé avec le MagAttract HMW DNA Kit et d’autres procédures avec billes magnétiques a été comparé à l’aide de l’électrophorèse sur gel en champs pulsés. Le MagAttract HMW DNA Kit a démontré des performances supérieures pour l’isolement d’ADN de poids moléculaire élevé (voir l’illustration  Isolement réussi d’ADN de poids moléculaire élevé)..


Rendements et pureté importants et homogènes
Le MagAttract HMW DNA Kit applique une procédure simple et pratique qui permet d’obtenir des rendements élevés d’ADN génomique pur de poids moléculaire élevé. Les conditions de lyse favorables limitent la fragmentation de l’ADN, tandis que les contaminants et les inhibiteurs de PCR sont efficacement éliminés, vous obtenez alors un ADN pur de poids moléculaire élevé. La chimie et la procédure optimisées du MagAttract HMW DNA Kit améliorent nettement le rendement et la pureté de l’ADN, comparé aux méthodes classiques à colonnes de centrifugation ou billes magnétiques d’autres fournisseurs (voir les illustrations  Rendements et pureté optimaux et  Rendements améliorés à partir de divers types d’échantillons).


Élimination efficace des inhibiteurs de PCR
Des applications particulièrement sensibles, comme la PCR en temps réel ou le NGS, nécessitent l’élimination des anticoagulants, des enzymes, des cations divalents et autres inhibiteurs de ce type. On procède à une amplification par PCR en temps réel de l’ADN isolé à partir d’échantillons de sang stabilisés à l’EDTA, à l’héparine et au citrate, à l’aide du MagAttract HMW DNA Kit. Aucune inhibition n’est observée dans les échantillons, prouvant ainsi une forte corrélation linéaire des valeurs de CT avec le volume d’échantillon initial (voir l’illustration  Aucune inhibition dans les échantillons issus de sang avec anticoagulant).


ADN génomique prêt pour le séquençage à haut débit
Dans la mesure où les technologies de séquençage massivement parallèle (Massively parallel sequencing, MPS) utilisent de courtes longueurs de lecture, le séquençage peut être réalisé avec un ADN génomique intact > 10 kb. Néanmoins, l’assemblage de novo du génome et la découverte de variants structurels innés et acquis demeurent difficiles avec les produits de purification d’ADN standard. Les banques de paires conjuguées contenant des inserts plus importants peuvent avoir une incidence significative sur la réussite du séquençage, tout particulièrement pour les génomes complexes à multiples répétitions. L’ADN génomique de poids moléculaire élevé obtenu avec le MagAttract HMW DNA Kit est prêt à être utilisé dans des expériences de NGS.

Résultats représentatifs d’une expérience de séquençage à haut débit (paires conjuguées)
Paramètre Caractéristique
Nombre total de lectures cartographiées (longues) 6521106
Taux d’erreur 0,36 %
Taux d’indel 0,01 %
Chimères 0,14 %
Pourcentage de duplication 1,15 %
See figures

Principle

L’isolement d’ADN génomique est une étape incontournable dans la méthode d’analyse de l’ADN. En général, les principaux paramètres sont le rendement, la pureté et l’intégrité de l’ADN isolé. Pour les méthodes standard de type PCR, séquençage ou hybridation, un poids moléculaire de 10–30 kb peut être suffisant, mais certaines méthodes sensibles de type génération de banques de BAC ou de fosmides ou archivage d’ADN requièrent une intégrité supérieure de l’ADN génomique.
Le MagAttract HMW DNA Kit est spécifiquement conçu pour extraire un ADN de poids moléculaire élevé à partir d’échantillons très divers, y compris des tissus d’origine humaine ou animale, du sang et des bactéries. Ce kit utilise une combinaison performante de billes magnétiques haute performance et de chimie innovante à base de silice. Les particules magnétiques haute performance garantissent un rendement et une pureté importants de l’ADN isolé.

Procedure

Le protocole MagAttract adapté permet des résultats reproductibles en seulement 70 minutes.


Protocole rapide et optimisé
Des tampons et enzymes optimisés lysent délicatement les échantillons tout en limitant la fragmentation de l’ADN génomique. La procédure comprend 4 étapes simples : lyse, liaison, lavage et élution. Après la lyse de l’échantillon, l’ADN se lie à la surface des billes magnétiques. Au cours des étapes de lavage, les contaminants et inhibiteurs de PCR sont efficacement éliminés puis un ADN pur de poids moléculaire élevé est élué dans du Buffer AE (voir l’illustration  Procédure du MagAttract HMW DNA Kit).

See figures

Applications

L’ADN génomique de poids moléculaire élevé obtenu avec le MagAttract HMW DNA Kit est prêt à être utilisé dans des expériences de NGS. Il peut être utilisé pour générer des banques contenant des inserts petits et grands, il est donc parfaitement adapté à toutes les applications de séquençage.

Supporting data and figures

Specifications

FeaturesSpecifications
Sample amount200 μl de sang ; jusqu’à 25 mg de tissus ; 2 × cellules bactériennes 10e9
Process time~ 70 minutes pour 12 échantillons
Elution volume100 à 200 µl

Resources

Brochures & Guides (1)
Introducing QIAseq
PDF (450KB)
Accelerate your NGS performance through Sample to Insight solutions
Kit Handbooks (1)
For isolation of high-molecular-weight DNA from blood, tissue, and bacteria for next-generation sequencing applications
Quick-Start Protocols (1)
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Can I scale up reagents if I want to use more sample with the MagAttract HMW DNA Kit (cat. no. 67563)?

Technically yes, however you would need to use different containers like 15 ml tubes and suitable magnets. You cannot use 2 ml tubes as the protocol states as higher amounts of beads also require more buffer for the protocol to work.

FAQ ID - 3448