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Enzimas para biología molecular

Limpieza de la reacción y mejora del rendimiento

Elegir la enzima adecuada para obtener muestras más limpias y un procesamiento más rápido

Los reactivos y reactantes que se quedan atrás pueden obstaculizar los procesos posteriores. Utilice la preparación enzimática adecuada para limpiar sus muestras antes de comenzar el siguiente paso. Acelere y mejore la amplificación y la transcripción con algunos aditivos no tan secretos. 

La limpieza enzimática de muestras de ADN con Exonuclease I, DNase I, RNase A, Proteinase K y otras nucleasas y proteasas elimina los cebadores, nucleótidos y enzimas residuales antes del análisis de SNP, secuenciación de nueva generación, la secuenciación Sanger del ADN, bioprocesamiento u otros procedimientos posteriores.

La Proteinase K es una endopeptidasa de amplio espectro que se utiliza mayormente para la digestión de proteínas, incluidas DNasas y RNasas. Normalmente se aplica un paso de digestión con la enzima durante la preparación de los ácidos nucleicos sin que ello afecte a la integridad del ADN o el ARN aislado. La Proteinase K es activa en una amplia gama de condiciones de reacción, incluidas las temperaturas elevadas y la presencia de SDS.

Proteinase K NGS Grade está disponible para las aplicaciones más exigentes, incluida la preparación de ácidos nucleicos para la secuenciación de nueva generación. La purificación exhaustiva da lugar a un producto enzimático de gran calidad con una mayor actividad específica, una solubilidad significativamente mayor (2,5 veces) y una pureza notable con un contenido de ADN ≤0,1 pg/mg. Proteinase K NGS Grade no contiene exonucleasas, endonucleasas ni ribonucleasas.

La enzima TAGZyma DAPasa y el sistema TAGZyma se utilizan para la eliminación de la etiqueta His de proteínas que contienen un punto de parada intrínseco DAPasa (expresado utilizando el vector TAGZyma pQE-2) o de proteínas que contienen un punto modificado de parada de glutamina.

Se dispone de una amplia gama de enzimas constitutivas para la escisión y limpieza de reactivos residuales.

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El uso de proteínas que contrarresten los inhibidores de la PCR y la adición para amplificación y reacciones de secuenciación de proteínas de unión al ADN especializadas puede mejorar el rendimiento y la calidad de la PCR . La proteína de unión al ADN, proteína del gen 32 del bacteriófago T4 (T4gp32), aumenta la eficacia de la amplificación por PCR con una serie de moldes diversos. Además, el uso de la proteína de unión al ADN monocatenario (single-stranded DNA-binding, SSB) de E. coli en las reacciones de secuenciación del ADN aumenta la resolución de las series de secuenciación.

El tratamiento con pirofosfatasa inorgánica, componente esencial de las reacciones de preparación del ARN, permite aumentar la tasa de transcripción in vitro. Esta enzima escinde el pirofosfato en dos moléculas de fosfato e impide que el pirofosfato precipite con el magnesio.

* Esta reacción altamente exergónica puede acoplarse a transformaciones bioquímicas desfavorables para impulsar estas transformaciones hasta su finalización.

†Dirige el equilibrio químico hacia la síntesis de ADN eliminando el pirofosfato de la reacción. Esta enzima no se puede desactivar por calor y conserva toda su actividad tras incubarla a 100 °C durante horas.

La escisión de hebras mediada por UDG (Uracil ADN glicosilasa en inglés) es una herramienta importante en biotecnología molecular, que permite la escisión controlada y de localización específica de ADN monocatenario o bicatenario sintetizado química o enzimáticamente con incorporaciones únicas o múltiples de desoxiuridina. 

Los tratamientos con UDG pueden reducir los artefactos de secuencia, eliminar el arrastre de PCR y generar huecos específicos en el ADN.

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Preguntas frecuentes sobre la reducción de artefactos y la limpieza de reacciones

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