Contar con biomarcadores adecuados es fundamental para mejorar la detección, el diagnóstico y la supervisión del cáncer. ¿Qué biomarcador será el mejor?
La detección de biomarcadores del ARN y su desarrollo para el uso clínico es un tema complejo. Tenemos que ser capaces de superar estas dificultades, ya que lo que verdaderamente importa son los objetivos finales de mejora en la detección, pronóstico y apoyo para aquellas personas que contraen cáncer. Trabajando juntos, podemos facilitar su camino hacia la identificación de biomarcadores del cáncer y la obtención de resultados relevantes.
Contamos con un amplio catálogo de flujos de trabajo Sample to Insight para miARN de cáncer, expresión genética del cáncer, transcriptoma o estudios de funcionalidad. Aquí incluimos información útil sobre cada uno de los pasos de los flujos de trabajo más comunes y facilitamos la búsqueda de la información y los productos que necesita. Proporcionamos soluciones probadas que aumentan la eficiencia y aceleran la investigación sobre biomarcadores del ARN, desde muestras fijadas con formalina e impregnadas en parafina (FFPE) y biopsia líquida hasta la secuenciación de ARN y el descubrimiento de nuevas vías de señalización del cáncer. Compartimos un objetivo común. Trabajemos para vencer al cáncer. Hagámoslo juntos.
Preparación de las muestras
Estabilización y aislamiento de ARN
Si aísla ARN de muestras de biopsia líquida o FFPE, sabrá que es un proceso que plantea numerosos retos. Las condiciones de almacenamiento, el pretratamiento y la propia fragilidad del ARN nos obligan a planificar y prepararnos a fin de obtener los mejores resultados posibles. Hemos reunido una serie de recursos útiles para que pueda comenzar o profundizar en los detalles que marcan la diferencia en la preparación de las muestras al trabajar con biomarcadores de ARN.
Guías y pósteres
Control de calidad
Guías y pósteres
Secuenciación de última generación
Secuenciación de ARN y miARN
La secuenciación de última generación (Next-generation sequencing, NGS) es una técnica potente para el descubrimiento y la caracterización de biomarcadores de ARN que, sin embargo, puede resultar compleja de instalar en su laboratorio. Si cuenta con un alto rendimiento de muestras, podemos ayudarle. Nuestro objetivo es facilitar al máximo la NGS, hacer que su nivel de dificultad sea comparable a una PCR. Para ello, democratizamos la NGS y apoyamos a laboratorios pequeños de investigación sobre el cáncer para que den sus primeros pasos con resultados garantizados. Tanto si analiza la expresión genética como genes de fusión, aceleramos, con cualquier número de muestras, el descubrimiento de biomarcadores de ARN con nuestras soluciones de NGS.
Análisis de datos de secuenciación de ARN
Ahora que ya ha caracterizado exitosamente la expresión genética con NGS como parte de su proyecto de descubrimiento de biomarcadores, ¿cuál es la mejor manera de analizar los datos brutos y avanzar así en el proceso? Una manera es utilizar una herramienta de análisis de datos en línea
PCR digital
Caracterización de miARN
Los microARN (miARN) están ampliamente vinculados con la progresión y la supresión del cáncer mediante la regulación de miles de genes relacionados con el cáncer; asimismo, los miARN circulantes libres de células han abierto recientemente nuevas puertas a las pruebas no invasivas de detección precoz de esta enfermedad.
Sin embargo, la cuantificación de miARN en suero o plasma sigue pecando de falta de coherencia y estandarización. Si desea superar las dificultades analíticas de la cuantificación de miARN, recurra a la PCR digital. La PCR digital (dPCR) ofrece cuantificación absoluta sin necesidad de curvas estándar, y aporta un mayor grado de precisión en comparación con la qPCR. Este aspecto es especialmente importante a la hora de detectar miARN poco abundantes en comparación con la qPCR. Al medir con precisión los niveles de miARN circulante, la dPCR constituye una herramienta de gran valor en su trayectoria hacia el descubrimiento de biomarcadores y, en última instancia, la detección del cáncer.
Análisis de expresión genética
Los cambios en la expresión genética son un indicador tremendamente valioso que ha permitido ampliar los conocimientos que teníamos en relación con numerosas funciones biológicas. La dPCR le permite llevar este método a un nivel superior y superar las limitaciones del pasado. Por ejemplo, ¿qué importancia tienen las dianas poco abundantes o las diferencias mínimas de expresión de 2 o inferiores? Ahora podrá descubrirlo con la dPCR.
El método de dPCR proporciona datos más precisos y reproducibles que la qPCR, debido a la medición de punto final y a la cuantificación absoluta que no requiere curvas estándar. Las implicaciones de este método son importantes, en especial al cuantificar dianas muy poco abundantes que han quedado diluidas a causa del elevado contenido de inhibidores y contaminantes de la muestra o que poseen niveles muy reducidos de expresión.
Análisis de datos
QIAGEN Digital Insights cuenta con eficaces herramientas de bioinformática que le permiten comprender el significado biológico que ocultan los datos de expresión genética. Con QIAGEN OmicSoft, podrá comparar patrones de expresión genética y detectar visualmente los genes regulados a la baja o al alza, a fin de identificar posibles biomarcadores. Utilice el Land Explorer basado en web de QIAGEN OmicSoft para acceder a cientos de miles de grupos de datos seleccionados a fin de examinar el estado de expresión o mutación de una diana frente a cientos de categorías de enfermedades.
Con QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA), podrá comprender la causa y el efecto de los cambios en la expresión genética e identificar las posibles dianas que necesiten una exploración más a fondo. Prediga qué reguladores previos (upstream) serán los responsables y si están activados o inhibidos. Visualice los efectos posteriores (downstream) para identificar qué genes es más probable que provoquen un aumento o una reducción de los procesos biológicos posteriores (downstream).
