MinElute Reaction Cleanup Kit

Para la limpieza de hasta 5 µg de ADN (entre 70 bp y 4 kb) a partir de reacciones enzimáticas

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MinElute Reaction Cleanup Kit (50)

Cat. No. / ID:  28204

50 MinElute Spin Columns, tampones, Collection Tubes (2 ml)
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Preparations
50
250
El MinElute Reaction Cleanup Kit está concebido para su uso en aplicaciones de biología molecular. Este producto no está concebido para el diagnóstico, la prevención ni el tratamiento de enfermedades.

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Features

  • Volúmenes de elución muy bajos
  • Procedimiento rápido y manejo sencillo
  • Recuperaciones altas y reproducibles
  • Colorante de carga de gel para el análisis práctico de muestras

Product Details

El MinElute Reaction Cleanup Kit incluye columnas de centrifugación, tampones y tubos de recogida para la purificación basada en membrana de gel de sílice de ADN de 70 bp–4 kb en tamaño a partir de reacciones enzimáticas. Las columnas de centrifugación se han diseñado para permitir la elución en volúmenes muy pequeños (tan solo 10 µl), lo que genera ADN altamente concentrado en altos rendimientos. El indicador de pH integrado permite la fácil determinación del pH óptimo para la unión del ADN en la columna de centrifugación. El procedimiento se puede automatizar por completo en el instrumento QIAcube Connect. Los fragmentos de ADN purificados con el sistema MinElute están listos para su uso directo en todas las aplicaciones, incluyendo la secuenciación, el análisis de micromatrices, la ligación y transformación, la digestión de restricción, el marcado, la microinyección, la PCR y la transcripción in vitro.

Para obtener resultados óptimos, se recomienda utilizar este producto junto con QIAvac 24 Plus.

Performance

El MinElute Reaction Cleanup Kit garantiza la limpieza de hasta 5 µg de ADN (entre 70 bp y 4 kb) a partir de reacciones enzimáticas, lo que genera altos rendimientos de ADN adecuados para una variedad de aplicaciones. El kit incluye columnas de centrifugación para la limpieza de reacciones enzimáticas. Con el uso de una microcentrifugadora o un colector de vacío, se alcanza rápidamente una alta concentración del fragmento de ADN (70 bp–4 kb). (Los fragmentos de ADN superiores a 4 kb se deben purificar con el sistema QIAquick.)

Ejemplos de enzimas que se han eliminado completamente con el MinElute Reaction Cleanup Kit
Proteína Peso molecular por subunidad de enzima (kDa)
ADN polimerasa I 109
Fragmento de Klenow 62
Fosfatasa alcalina intestinal de ternero 69
Ligasa de ADN T4 55
Polinucleótido cinasa T4 35
Transferasa terminal 32
DNase I 31
Enzimas de restricción Varía

Principle

Los kits MinElute contienen un ensamblaje de membrana de síllice para la unión de ADN en tampón de alta salinidad y elución con tampón de baja salinidad o agua. El procedimiento de purificación elimina cebadores, nucleótidos, enzimas, aceites minerales, sales, agarosa, bromuro de etidio y otras impurezas de las muestras de ADN. La tecnología de membrana de sílice elimina los problemas e inconvenientes relacionados con las resinas sueltas y los residuos pastosos. Los tampones de unión especializados están optimizados para aplicaciones específicas y promover la adsorción selectiva de moléculas de ADN dentro de rangos de tamaño específicos.

Colorante de carga de gel

Para que el procesamiento y el análisis de las muestras sean más rápidos y prácticos, se proporciona el colorante de carga de gel. El GelPilot Loading Dye contiene tres colorantes de seguimiento (xileno cianol, azul de bromofenol y naranja G) para facilitar la optimización del tiempo de la serie del gel de agarosa y evitar que los fragmentos más pequeños de ADN migren demasiado lejos (consulte la figura « GelPilot Loading Dye »).

See figures

Procedure

El sistema MinElute utiliza un sencillo procedimiento de unión, lavado y elución (consulte el diagrama de flujo « Procedimiento de MinElute»). El tampón de unión se añade directamente a la reacción enzimática y la mezcla se aplica a la MinElute Spin Column. El tampón de unión contiene un indicador de pH, lo que permite determinar con facilidad el pH óptimo para la unión del ADN (consulte la figura  «Colorante indicador de pH»). Los ácidos nucleicos se adsorben a la membrana de sílice en las condiciones de alta salinidad generadas por el tampón. Las impurezas se lavan y el ADN puro se eluye con un volumen pequeño de tampón suministrado de baja salinidad o agua, listo para usarse en aplicaciones posteriores.

Manejo

Las MinElute Spin Columns se han diseñado con dos prácticas opciones de manejo (consulte el diagrama de flujo «Procedimiento de MinElute»). Las columnas de centrifugación se adaptan a una microcentrifugadora de mesa convencional o a cualquier colector de vacío con conectores Luer, como QIAvac 24 Plus o QIAvac 6S con QIAvac Luer Adapters. El MinElute Reaction Cleanup Kit, junto con otros kits basados en columnas de centrifugación de QIAGEN, se puede automatizar por completo en el instrumento QIAcube Connect, lo que permite incrementar la productividad y la normalización de los resultados (consulte las figuras «Opciones de manejo de la columna de centrifugación  A,  B,  C,  D y  E» y « QIAcube Connect»).

See figures

Applications

Los fragmentos de ADN purificados con el sistema MinElute están listos para su uso directo en todas las aplicaciones, incluyendo las indicadas a continuación:

  • Secuenciación
  • Análisis de micromatrices
  • Ligación y transformación
  • Digestión de restricción
  • Marcado

Supporting data and figures

Specifications

FeaturesSpecifications
Binding capacity5 µg
Fragment size70 bp–4 kb
ProcessingManual
Elution volume10 µl
Recovery: oligonucleotides dsDNARecuperación: oligonucleótidos, ADNbc
Removal <10mers 17–40mers dye terminator proteinsEliminación, <40 mers
FormatTubo
Sample type: applicationsADN, oligonucleótidos: Reacciones enzimáticas
TechnologyTecnología de sílice

Publications

Oncocytic change in pleomorphic adenoma: molecular evidence in support of an origin in neoplastic cells.
Di Palma S; Lambros MB; Savage K; Jones C; Mackay A; Dexter T; Iravani M; Fenwick K; Ashworth A; Reis-Filho JS;
J Clin Pathol; 2006; 60 (5):492-9 2006 Feb 7 PMID:16467165
Similarity and differences in the Lactobacillus acidophilus group identified by polyphasic analysis and comparative genomics.
Berger B; Pridmore RD; Barretto C; Delmas-Julien F; Schreiber K; Arigoni F; Brüssow H;
J Bacteriol; 2006; 189 (4):1311-21 2006 Dec 1 PMID:17142402
Chromosome Conformation Capture Carbon Copy (5C): a massively parallel solution for mapping interactions between genomic elements.
Dostie J; Richmond TA; Arnaout RA; Selzer RR; Lee WL; Honan TA; Rubio ED; Krumm A; Lamb J; Nusbaum C; Green RD; Dekker J;
Genome Res; 2006; 16 (10):1299-309 2006 Sep 5 PMID:16954542
Quantitative proteomics of the archaeon Methanococcus maripaludis validated by microarray analysis and real time PCR.
Xia Q; Hendrickson EL; Zhang Y; Wang T; Taub F; Moore BC; Porat I; Whitman WB; Hackett M; Leigh JA;
Mol Cell Proteomics; 2006; 5 (5):868-81 2006 Feb 17 PMID:16489187
RAISE: a simple and novel method of generating random insertion and deletion mutations.
Fujii R; Kitaoka M; Hayashi K;
Nucleic Acids Res; 2006; 34 (4):e30 2006 Feb 21 PMID:16493137

FAQ

Are Buffer PB of the QIAquick PCR Purification Kit and Buffer QG of the QIAquick Gel Extraction Kit interchangeable?

Buffer PB of the QIAquick PCR Purification Kit cannot be used to extract DNA from agarose gels. However, Buffer QG of the QIAquick Gel Extraction Kit can be used to remove salt and proteins from enzymatic reactions by adding 3 volumes of Buffer QG and 1 volume of isopropanol to the reaction and proceeding with step 6 of the Gel Extraction Spin Protocol in the QIAquick Spin Handbook. See the QIAquick Spin Handbook for a list of reactions which can be cleaned up with the various QIAquick kits.

FAQ ID -786
I received a kit containing the MinElute columns; however, they were left out for a while and not stored at 2–8°C upon receipt. Can I still use them?

The MinElute spin columns included in the following kits should be stored at 2–8°C upon arrival: AllPrep DNA/RNA Micro, EpiTect Fast DNA Bisulfite, EpiTect Fast FFPE Bisulfite, EpiTect Fast LyseAll Bisulfite, EpiTect Plus DNA Bisulfite, EpiTect Plus FFPE Bisulfite, EpiTect Plus LyseAll Bisulfite, exoRNeasy Serum/plasma Maxi, exoRNeasy Serum/Plasma Midi, GeneRead DNA FFPE, GeneRead rRNA Depletion, GeneRead Size Selection, MinElute Gel Extraction, MinElute PCR Purification, MinElute Reaction Cleanup, miRNeasy FFPE, miRNeasy Micro, miRNeasy Serum/Plasma, QIAamp DNA FFPE, QIAamp DNA Investigator, QIAamp DNA Micro, QIAamp MinElute Media, QIAamp MinElute Virus Spin, QIAamp MinElute Virus Vacuum, RNeasy FFPE, RNeasy Micro, RNeasy Plus Micro.

Short-term storage (up to 4 weeks) at room temperature (15–25°C) does not affect the performance. However, for optimal performance and quality, storage temperature should not exceed 25°C.

FAQ ID - 3560
Are the columns of the MinElute Reaction Cleanup-, Gel Extraction-, and PCR Purification Kit identical?
Yes, and therefore they are interchangeable.
FAQ ID -581
Why does my DNA sample float out of the slot when loading it onto an agarose gel?

DNA fragments purified with the QIAGEN DNA Cleanup Systems, i.e., the QIAquick PCR Purification Kit, the MinElute Reaction Cleanup Kit, the QIAEX II Gel Extraction Kit etc. may float out of the loading wells of agarose gels due to residual ethanol carried over from the wash step with Buffer PE (despite the addtition of glycerol-containing loading buffer).

Use either of the following options to remove residual ethanol from the eluate:

  • re-purify the sample using a QIAquick-, or MinElute column, or QIAEX II resin
  • incubate the eluate at 56°C for 10 min to evaporate the ethanol
  • dry down the sample in a vacuum centrifuge, and resuspend the pellet in a small volume of sterile water
FAQ ID -205
Do you have information about the cleanup of single-stranded DNA (ssDNA) with QIAquick columns?

As a rule of thumb, single-stranded DNA binds to silica with approximately half the affinity of a double-stranded DNA fragment of the same length under the buffer conditions used in the QIAquick and MinElute Kits. Even though no systematic experimental data exists, we expect that recovery of ssDNA fragments of approximately 200 nucleotides and below will not be very efficient after cleanup using the QIAquick PCR Purification Kit or MinElute PCR Purification Kit. By comparison, it should be possible to purify fragments longer than 140 nucleotides using the QIAquick Gel Extraction Kit.

Note that recovery of single strand DNA is influenced to some degree also by factors such as base composition and secondary structure. It has to be determined empirically by the researcher if cleanup of single-stranded DNA with QIAquick columns yields satisfactory results.

FAQ ID -759
What is the composition of Buffer EB?

The composition of Buffer EB is:

  • 10 mM Tris-Cl, pH 8.5

Buffer EB is the elution buffer used in the QIAquick PCR, Gel Extraction, Nucleotide Removal Kits, and MinElute Kits for DNA cleanup, and the QIAprep Miniprep Kits for small-scale plasmid purification. The purified DNA can also be eluted in TE (10 mM Tris-Cl, 1 mM EDTA, pH 8.0), but the EDTA may inhibit subsequent enzymatic reactions.

FAQ ID -199
What is the small band below my fragment of interest on an agarose gel after DNA cleanup using QIAquick?

Occasionally, DNA fragments eluted from the silica matrix of QIAquick, MinElute or QIAEX II Kits will contain denatured single-stranded DNA (ssDNA), appearing as a smaller band on an analytical gel. Under certain conditions, chaotropic agents (present in all silica-based DNA purification methods) can denature DNA fragments. This is a rare event that may be influenced by sequence characteristics such as the presence of inverted repeats or A–T-rich stretches.

Because salt and buffering agents promote renaturation of DNA strands, the following tips are recommended:

  • use the eluted DNA to prepare your downstream enzymatic reaction, but omit the enzyme. Incubate the reaction mix at 95°C for 2 minutes to reanneal the ssDNA, and allow the tube to cool slowly to room temperature before adding the enzyme and proceeding
  • alternatively, the DNA can be eluted from the silica-gel membrane or resin in 10 mM Tris buffer containing 10 mM NaCl. However, the salt concentration of the eluate must then be taken into consideration in downstream applications.
FAQ ID -148
Can I buy QIAquick and MinElute columns separately?

The QIAquick Spin Columns (100) (cat. no. 28115) in the QIAquick PCR Purification, Gel Extraction, Nucleotide Removal and PCR & Gel Cleanup kits are also sold separately from the kits.

The MinElute columns in the MinElute PCR Purification, Gel Extraction and Reaction Cleanup kits are not sold separately.

We always provide extra buffers in our kits so you can scale up reactions, add extra washes or allow for spillage.

FAQ ID -2460