3D-Zeitschrift benötigt das Flash 10.1 Plugin von Adobe.Download von adobe.com
Bitte Stellen Sie sicher dass Javascript
in Ihrem Browser aktiviert und erlaubt ist.
in Ihrem Browser aktiviert und erlaubt ist.
Content:
1
QIAGEN Product News 1May 2014 Pick Up ! 注 目 製 品 n QIAxpert n REPLI-g Single Cell シリーズ サンプルテクノロジー アッセイテクノロジー エピジェネティクス 微 生 物 検 出 および 同 定 食 品 試 験 ポートフォリオ 動 物 感 染 症 の 病 原 体 検 出 個 人 識 別 および 法 医 学 サンプル DNA/RNA セレクションガイド Sample & Assay Technologies
2
Pick Up! 注 目 製 品 Get True Insight into Your Sample Quality 次 世 代 サンプルプロファイラー QIAxpert QIAxpert は、DNA、RNA、タンパク 質 の 定 量 やクオリティコントロールを 飛 躍 的 に 加 速 させる 高 速 マイクロフリュー ディックタイプの 紫 外 ・ 可 視 分 光 光 度 計 です。 卓 上 タイプのためサンプル 中 の DNA、RNA とタンパク 質 分 画 や 純 度 を 簡 単 に 測 定 することができます。QIAxpert の 測 定 は 高 速 かつ 簡 便 です。そのパフォーマンスは 2 分 以 内 に 最 大 16 サンプルを 測 定 します。 操 作 は QIAxpert のスライドにサンプルをアプライし、 装 置 にセットしてタッチ スクリーンで 測 定 メニューを 選 択 するだけです。QIAxpert は、サンプル 定 量 に 高 い 精 度 を 求 める 生 命 科 学 の 研 究 室 にとって 理 想 的 なツールとなります。サンプル 溶 液 に 本 当 に 含 まれているものが 見 えてきます。 QIAxpert が 提 供 する 革 新 : ■ ■ 独 自 のスペクトラルプロトコールで DNA、RNA や 他 の 混 入 物 質 を 特 異 的 定 量 ■■ わずか 2 µl の 核 酸 溶 液 で 16 サンプルを 2 分 以 内 に 定 量 測 定 する 迅 速 性 ■■ フルカラータッチスクリーンによる 直 感 的 な 操 作 性 ■■ お 手 持 ちの PC に 解 析 レポートを 持 ち 出 せるポータビリティ 最 少 のサンプル 量 で 最 大 の 情 報 量 QIAxpert は、 貴 重 なサンプルをダウンストリーム 解 析 に 最 大 限 度 提 供 す ることができます。QIAxpert のスライドへのインプット 量 は 解 析 あたり わずか 2 µl、そしてそれらのサンプル 量 を 解 析 するまで、 最 大 で 2 時 間 も 蒸 発 から 守 るキャピラリーチャンネルが 装 置 には 備 わっています。サン プルをロードしてから QIAxpert にセットするまで 急 ぐ 必 要 はありません。 QIAxpert は 実 験 計 画 にゆとりも 提 供 します。 2 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
3
Pick Up! 注 目 製 品 独 自 のアルゴリズムによるサンプルプロファイ リング 独 自 のスペクトラルプロトコールは、いくつもの 紫 外 ・ 可 視 光 に 吸 収 をもつ 化 合 物 を 含 む 複 雑 なサンプルも 定 量 用 色 素 不 要 で 高 精 度 に 定 量 することが 可 能 です。 特 異 的 なスペクトラ ルプロファイリングアプリケーションは、 溶 液 中 の 成 分 を 分 離 することが 難 しいサンプルの 解 析 を 目 的 に 開 発 されました。 独 自 に 開 発 したソフトウェアアルゴリズムにより DNA、RNA と 紫 外 ・ 可 視 スペクトルで 検 出 される 不 純 物 などの 特 定 の 化 合 物 の 寄 与 率 を 見 分 けて 検 出 できるようになりました。 現 在 お 使 いの QIAGEN 精 製 キット * からの 精 製 物 ならそのまま 成 分 分 析 ができます。 * 対 応 するキットに 関 してはお 問 い 合 せください。 Absorbance (10 mm) Absorbance (10 mm) 6.01 –0.601 230250 275 300 325 350 375 400 425 450 Wavelength (nm) タッチスクリーンによる 直 感 的 な 操 作 性 QIAxpert は、 装 置 本 体 にインストールされているソフトウェ アとフルカラータッチスクリーンにより、 簡 便 かつ 直 感 的 な 操 作 を 実 現 しました。 画 面 に 表 示 されるアイコンは、 測 定 の セットアップやデータのエクスポート、 測 定 結 果 といった 作 業 を 視 覚 的 にサポートするため、 操 作 を 学 ぶ 手 間 なく 即 使 用 可 能 です。 多 彩 なエクスポート/レポートオプション QIAxpert の Export タブより 簡 単 にデータを USB ドライブや ネットワークフォルダにエクスポートすることができます。 さらに QR コード ® を 読 み 込 むことでスマートフォンにも データを 保 存 することができます。データは、2 種 類 のデー タフォーマットでエクスポートできますので、その 後 の 解 析 にも 柔 軟 に 対 応 できます。HTML レポートはウェブブラウザ で、CSV ファイルは Microsoft ® Excel ® で 開 くことが 可 能 です。 レポートは 従 来 の 吸 光 度 データ(A 260 、A 260 /A 280 および A 260 / A 230 )が 表 形 式 で 含 まれ、HTML レポートはサンプルごとの スペクトラルプロファイルデータが 含 まれています。 –0.54 230 250 275 300 325 350 375 400 425 450 Wavelength (nm) RNA のスペクトラルプロファイリング 解 析 A :( B ) の RNA サンプルに 人 為 的 に gDNA を 添 加 して 分 子 特 異 的 に 解 析 を 行 なった。 RNA ( 青 )、 DNA ( 赤 ) として 混 入 量 を 定 量 的 に 見 分 けた。 B : 高 純 度 RNA のスペクトラルでは、 有 意 な 混 入 物 はない。 製 品 名 内 容 Cat. no. 価 格 (¥) QIAxpert Instrument QIAxpert 専 用 スライド QIAxpert Slide-40 (25) 装 置 本 体 (1 年 保 証 )、アクセサリー( 電 源 ケーブル、 キャリブレーションスライド 2 枚 )* 25 スライド(25×16 サンプル 用 ;1 スライドあたり 最 大 16 サンプル) 9002340 1,450,000 990700 13,000 * 装 置 のアクセサリーには、 サンプル 測 定 用 の QIAxpert Slide-40 (25) (Cat. no. 990700) は 付 属 しておりませんので、 装 置 と 併 せてご 注 文 頂 くようお 願 い 致 します。 QIAxpert のより 詳 細 な 情 報 は www.qiagen.com/p/QIAxpert をご 覧 ください。 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 3
4
Pick Up! 注 目 製 品 “Compare to our current method.... the high quality results obtained... ” Luting Song, BGI, China ゲノムカバー 率 (%) 94.76% REPLI-g Single Cell Kit (1 cell) REPLI-g Single Cell Kit (1 cell) 97.39% 99.96% REPLI-g Single Cell Kit (1000 cells) gDNA REPLI-g Single Cell Kit (1000 cells) gDNA エラー 率 0.43% 0.22% 0.35% キメラ 0.08% 0.06% 0.11% インデル 率 0.05% 0.02% 0.01% 精 製 ゲノム DNA あるいは REPLI-g Single Cell で 増 幅 した DNA を 用 いた NGS は 同 等 の 結 果 を 実 現 枯 草 菌 ゲ ノ ム の 全 ゲ ノ ム シ ー ク エ ン シ ン グ を Illumina ® MiSeq ® で 行 なった。 解 析 では、 ゲノム DNA およびシン グルセル (3 回 のシングルセル 実 験 を 実 施 ) または 10 3 個 の 細 胞 から REPLI-g Single Cell Kit を 使 用 して 増 幅 した 2 µg の DNA を 300 bp のフラグメントにせん 断 し、 各 1 µg を ライブラリー 作 成 に 使 用 した。 A 同 等 のシークエンスカバ レッジが gDNA および REPLI-g Single Cell で 増 幅 した DNA で 観 察 された *。 B 増 幅 していない DNA と REPLI-g で 増 幅 した DNA の 比 較 では、 エラー 率 が 非 常 に 低 く 類 似 してい た † 。 * Burrows-Wheeler Alignment プログラムを 用 いたアライメ ント (cut-off:10x coverage):bio-bwa.sourceforge.net 非 増 幅 および REPLI-g Single Cell で 増 幅 した DNA の 比 較 はまた、 配 列 が 高 い 割 合 でゲノムにマッピングされたこ とを 明 らかにした (データ 未 提 示 )。 REPLI-g ® Single Cell Kit シングルセルあるいは 限 られたサンプル 量 からの 全 ゲノム 増 幅 (WGA) ■■ シングルセルから 最 大 のゲノムカバレッジでの 全 ゲノム 増 幅 ■■ MDA テクノロジーによりゲノム 遺 伝 子 座 の 偏 りのない 増 幅 ■ ■ 次 世 代 シークエンシングなどの 新 テクノロジーでの 使 用 に 最 適 ■ ■ 最 大 40 µg までの 一 定 した 収 量 ( 増 幅 産 物 長 さの 平 均 は >10 kb) ■■ がん 研 究 やメタゲノミクスなど、 多 くのアプリケーションに 最 適 なツール 革 新 的 テクノロジーを 用 いて DNA 配 列 解 析 やジェノタイピングを 行 なう 場 合 など、 微 量 生 体 サンプルを 用 いた 解 析 には 大 変 困 難 な 場 合 が 数 多 くあ ります。UV 処 理 によりコンタミの 可 能 性 がある DNA を 検 出 限 界 まで 除 去 した 試 薬 を 用 いている REPLI-g Single Cell Kit は、シングルセル(1,000 個 未 満 の 細 胞 から 最 低 1 個 の 細 菌 または 腫 瘍 細 胞 まで)あるいは 精 製 ゲノム DNA から 配 列 の 偏 りがほとんどなく、 最 大 のゲノムカバレッジで 均 一 に ゲノム DNA を 増 幅 することが 可 能 となります。 I have tried the kit and successfully performed single cell whole genome amplification. The DNA obtained allowed me to reliably detect allele-specific point mutations in a colorectal adenocarcinoma cell line. The excellent yield and sequence representation of the amplified DNA really helped me to advance my work in single-cell genomics. Dr. Masafumi Muratani Research Associate, Cancer Therapeutics & Stratified Oncology, Genome Institute of Singapore (GIS) 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) REPLI-g Single Cell Kit (24) 150343 81,500 REPLI-g Single Cell Kit (96) 150345 277,000 シングルセルに 関 する 情 報 は www.qiagen.com/JP/Prod-SingleCell をご 覧 ください。 4 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
5
Pick Up! 注 目 製 品 REPLI-g WTA Single Cell Kit シングルセル 由 来 のトータル RNA や mRNA の 全 トランスクリプ トーム 増 幅 ■■ シングルセルからでも 全 トランスクリプトームをカバー ■■ MDA テクノロジーにより 配 列 の 偏 りのほとんどない 均 一 な WTA ■■ NGS のような 新 テクノロジーでの 使 用 に 最 適 化 ■■ トータル RNA あるいは mRNA– 濃 縮 (poly A + )RNA の 増 幅 ■■ がん、および 幹 細 胞 研 究 のための 革 新 的 なツール REPLI-g WTA Single Cell Kit は、シングルセルのトランスクリプトームレベ ルでの 転 写 制 御 への 影 響 に 関 する 信 頼 できる 研 究 を 可 能 にし、シングル セル(1 ~ 1,000 細 胞 )からの 全 転 写 物 の 均 一 な 増 幅 を 実 現 します。 REPLI-g 法 においては、 混 入 核 酸 の 増 幅 をブロックするため、 専 用 のバッ ファーおよび 試 薬 を 用 いて 独 自 のプロセスで 処 理 することにより、 混 入 核 酸 が 除 去 されます。 革 新 的 な 溶 解 バッファーで 細 胞 RNA を 効 果 的 に 安 定 化 することにより、 増 幅 された RNA は in vivo での 遺 伝 子 発 現 プロファイル を 正 確 に 反 映 します。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) REPLI-g WTA Single Cell Kit (24) 150063 200,000 RPKM (3 cells) 100000 10000 1000 1 10 100 1000 10000 100000 RPKM (average, 10–50 cells) 高 い 再 現 性 をもつ 実 験 Cell 1 rRNA 増 幅 を 抑 えるため、 mRNA (poly A + ) 濃 縮 プロ トコールを 用 いて R 2 = 30.97253 ~ 1000 個 の 様 々な 細 胞 数 で REPLI-g WTA Single Cell 反 応 を 行 な っ た。 増 幅 cDNA を フ ラ グ メ ン1 ト 化 し (Covaris S220)、 GeneRead Library Prep I Kit で NGS 用 ラ イ ブ ラ リ ー を 調 製 し、 MiSeq Instrument 0.1 (Illumina) で 配 列 解 析 し た。 RNA バ イ オ タ イ プ は Bowtie2 を 用 い て シ ン グ ル の 転 写 RNA に マッピングし、 0.01 RPKM (reads per kilobase and million mapped reads) を 計 算 し た。 こ れ ら の 結 果 は、 3 個 の 細 胞 と WTA サンプル (10 ~ 50 細 胞 ) に 由 来 する 0.001 転 写 産 物 の 平 均 RPKM 値 が 同 等 であることを 証 明 している。 0.0001 0.0001 0.001 0.01 Cell 2 REPLI-g Cell WGA & WTA Kit 微 量 サンプルから、 全 ゲノムおよび 全 トランスクリプトームを 同 時 増 幅 ■■ ゲノム DNA および RNA(トータルあるいは mRNA 濃 縮 )の 同 時 増 幅 ■■ ゲノム 状 態 と 転 写 パターンの 関 連 付 けを 容 易 に 実 現 ■■ MDA テクノロジーにより 配 列 の 偏 りは 最 少 限 ■ ■ 細 胞 あるいは 組 織 から gDNA および RNA を 直 接 増 幅 ■■ NGS を 含 む 全 てのダウンストリームアプリケーションに 使 用 可 能 REPLI-g Cell WGA & WTA Kit は 均 一 な 全 ゲノム 増 幅 (WGA)および 全 ト ランスクリプトーム 増 幅 (WTA)を 同 時 に 実 現 し、 微 量 サンプル(25 ~ 1000 個 の 細 胞 )を 用 いてゲノムとトランスクリプトームを 直 接 関 連 づけ ることができます。 専 用 のバッファーおよび 試 薬 は、 混 入 核 酸 の 制 御 され た 除 去 を 行 ない、REPLI-g 法 による 混 入 核 酸 の 増 幅 をブロックします。ゲノ ム DNA およびトータル RNA あるいは mRNA(poly A + )の 増 幅 は REPLI-g SensiPhi DNA Polymerase により PCR ベースの 増 幅 テクノロジーとは 対 照 的 にフィデリティー 率 は 1,000 倍 にまで 増 大 します。 * 使 用 するプライマーにより、 トータル RNA または 濃 縮 miRNA (poly A + ) が 増 幅 される。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) REPLI-g Cell WGA & WTA Kit (12) 150052 138,000 (amplify DNA) Repair Ligation Whole genome amplification Amplified gDNA REPLI-g Cell WGA & WTA Procedure Cell sample (25–1000 cells) Cell lysis Add WGA Ready Mix Add ligation mix Add REPLI-g SensiPhi amplification mix 60 min at 42°C 3 min at 95°C 30 min at 24°C 5 min at 95°C 2 h at 30°C 5 min at 65°C Add Lysis Buffer 5 min at room temperature 3 min at 95°C (amplify RNA) gDNA removal Reverse Transcription Ligation Whole transcriptome amplification Amplified cDNA Add gDNA Wipeout Buffer 10 min at 42°C Add Quantiscript RT mix and primers* Add ligation Add REPLI-g SensiPhi amplification QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 5
6
サンプルテクノロジー Sample Technologies Sample collection Purification Amplification cDNA synthesis Analysis Sample Technologies QIAcube ™ HT System 96 ウェルフォーマットでのミドルからハイスループットの 核 酸 自 動 精 製 装 置 ■■ あらゆる 種 類 のサンプルから DNA、RNA、miRNA を 高 い 信 頼 性 で 抽 出 ■■ ミドルからハイスループットの 核 酸 自 動 精 製 と 専 用 精 製 キットで 経 費 と 時 間 を 節 約 ■■ ユーザーフレンドリーなソフトウェアでデータ 管 理 とドキュメンテーションを 簡 便 化 ■ ■ 安 全 性 に 配 慮 した 設 計 によりクロスコンタミのリスクを 最 小 限 に 抑 制 ■ ■ 操 作 が 簡 便 で 柔 軟 性 が 高 く 使 いやすいコンパクトな 装 置 QIAcube HT は、ミドルからハイスループットのシリカメンブレン 法 を 用 いた 核 酸 自 動 精 製 を 96 ウェルフォーマットで 実 現 します。 動 物 サンプル 中 のバクテリアやウイルスからだけではなく、 細 胞 、 組 織 、 食 品 などあ らゆるサンプル 種 から DNA、RNA、miRNA を 迅 速 かつ 容 易 に 精 製 するこ とができます。 自 動 化 用 プロトコールと 専 用 の QIAcube HT 精 製 キットや プラスチック 製 品 は 信 頼 性 と 利 便 性 を 高 め、 貴 重 な 時 間 を 節 約 できます。 本 システムは、 信 頼 性 の 高 い 他 の QIAGEN 精 製 技 術 と 同 様 に、 高 品 質 な 結 果 を 提 供 します。 原 理 QIAcube HT での 自 動 精 製 は、 高 速 かつ 経 済 的 で、1 ランあたり 24 ~ 96 サンプルから 高 品 質 の 核 酸 が 得 られます。 専 用 の QIAcube HT Kits は、 細 胞 、 組 織 、バクテリア、ウイルス、 食 品 サンプルを 含 む 様 々なスタートサンプ ルからの 核 酸 精 製 を 実 現 します。QIAcube HT は 非 常 に 使 いやすく、 直 感 的 なソフトウェアによりマウスを 数 回 クリックするだけでランを 開 始 する ことができます。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAcube HT system, Priority* † 9001899 4,900,000 ~ * 保 証 期 間 が 3 年 の QIAcube HT system, PrioPLUS (Cat. no. 9001900) もございます。 お 問 い 合 せください。 専 用 のプラスチック 製 品 をご 用 意 しておりますのでお 問 い 合 わせください。 6 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
7
サンプルテクノロジー QIAamp ® 96 DNA QIAcube HT Kit 血 液 、 細 胞 および 組 織 からのハイスループットの トータル DNA 自 動 分 離 QIAcube HT 対 応 M 50 µl 100 µl 150 µl 200 µl ■ ■ 簡 便 で 信 頼 できる 自 動 化 精 製 により 費 用 と 時 間 の 節 約 が 可 能 ■ ■ 様 々なサンプルタイプに 対 応 する 標 準 化 された 手 法 ■ ■ 特 殊 なサンプルからも 高 収 量 で 精 製 ■■ ダウンストリーム 解 析 で 良 好 な 結 果 を 実 現 する 高 品 質 DNA ■ ■ 様 々なスタートサンプルに 至 適 化 済 みのプロトコール QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit は 血 液 、 細 胞 および 組 織 からトータル DNA( 例 ;ゲノム、ミトコンドリアおよび 病 原 体 )の 自 動 化 精 製 を 実 現 し ます。 便 利 な 96 ウェルフォーマットでの、 実 績 のある QIAamp のシリカ メンブレンテクノロジーを 用 いることで、 夾 雑 物 および 阻 害 物 が 除 去 され たダウンストリーム 解 析 に 即 使 用 可 能 な 高 品 質 の 核 酸 が 得 られます。 ゲノム DNA のアガロースゲル 解 析 QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit および QIAcube HT を 用 い て、 50、 100、 150 および 200 µl のヒト 全 血 からゲノム DNA を 精 製 した。 200 µl で 溶 出 した 精 製 DNA から 7 µl を それぞれ 用 いて 0.8%の 1x TBE アガロースゲルで 解 析 した。 M:ラムダ HindIII マーカー。 Sample Technologies 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit (5) 51331 90,000 RNeasy ® 96 QIAcube HT Kit QIAcube HT 対 応 動 物 およびヒトの 細 胞 / 組 織 からのハイスループット RNA 自 動 分 離 ■ ■ 簡 便 で 信 頼 できる 自 動 化 精 製 により 費 用 と 時 間 の 節 約 が 可 能 ■■ トータル RNA または miRNA を 含 むトータル RNA 分 離 のためのフレキ シブルな 操 作 ■ ■ 各 種 スタートサンプルおよび 目 的 のサイズ 分 布 用 プロトコール ■■ ダウンストリームアプリケーションに 即 使 用 可 能 な 高 品 質 RNA ■ ■ 少 量 のスタートサンプルで 一 定 した RNA 収 量 RNeasy 96 QIAcube HT Kit は QIAcube HT システムを 用 いた 動 物 および ヒトの 細 胞 / 組 織 サンプルからのトータル RNA または miRNA を 含 むトー タル RNA の 簡 便 な 自 動 化 精 製 を 実 現 します。 便 利 な 96 ウェルフォーマッ トで、 実 績 のある RNeasy のシリカメンブレンテクノロジーを 用 いること により、 夾 雑 物 および 阻 害 物 が 除 去 されたダウンストリーム 解 析 に 即 使 用 可 能 な 高 品 質 の 病 原 体 核 酸 が 得 られます。 RNA yield (µg) 2.5 5 10 15 Starting material (mg) 20 25 組 織 ライセートからトータル RNA の 直 線 性 のある 回 収 RNAlater ® で 安 定 化 したラット 肺 組 織 からのライセートを、 サンプルが 2.5 ~ 25 mg の 組 織 に 相 当 する 量 を 含 むように 連 続 希 釈 した。 これらのサンプルから、 RNeasy QIAcube HT Kit と RNeasy 96 QIAcube HT total RNA Tissue V1.QSP Protocol を 用 いて QIAcube HT でトータル RNA を 精 製 した。 精 製 RNA は 100 µl の RNase フリー 水 で 溶 出 した。 吸 光 度 測 定 値 は、 RNA 回 収 およびスタートサンプル 量 の 間 に 直 線 関 係 を 示 した。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) RNeasy 96 QIAcube HT Kit (5) 74171 153,000 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 7
8
サンプルテクノロジー The AllPrep procedure AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit QIAcube 対 応 Cells or tissue 細 胞 あるいは 溶 解 困 難 な 組 織 からゲノム DNA および miRNA を Sample Technologies On-column DNase digestion, including miRNA rebinding Wash Total RNA For fatty tissue: chloroform extraction of flow-through Proteinase K digestion in the presence of ethanol ethanol Lyse and homogenize Bind genomic DNA Genomic DNA Wash On-column Proteinase K digestion 含 むトータル RNA を 同 時 に 精 製 ■ ■ 同 一 サンプルから 高 収 量 の DNA、RNA、miRNA 精 製 ■ ■ 溶 解 困 難 なサンプル 用 に 開 発 ( 繊 維 性 あるいは 脂 肪 性 組 織 ) ■■ ダウンストリームですぐに 使 用 可 能 な 高 品 質 核 酸 ■ ■ 様 々なサンプルタイプ 用 に 最 適 化 されたプロトコール ■■ フェノール 不 要 の 簡 便 操 作 AllPrep ® DNA/RNA/miRNA Universal Kit は、 細 胞 および 繊 維 性 、 脂 肪 性 組 織 を 含 む 様 々な 組 織 から、ゲノム DNA および miRNA を 含 むトータル RNA の 同 時 精 製 を 実 現 します。 本 キットを 用 いた 分 離 精 製 法 ではサンプル を 分 割 する 必 要 がないため、DNA および RNA/miRNA を 最 大 収 量 で 精 製 できます。 精 製 した DNA および RNA/miRNA は 別 々に 溶 出 でき、 様 々な ダウンストリームアプリケーションにも 即 使 用 可 能 です。 本 キットには、 組 織 や 分 離 した 血 液 細 胞 など 様 々なサンプルに 至 適 化 されたプロトコール があります。 Wash 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Eluted RNA, including miRNA Elute Bind total RNA Elute AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit (50) 80224 68,000 Eluted DNA Wash Deparaffinization solution FFPE サンプルの 脱 パラフィン Deparaffinization Solution はホルマリン 固 定 パラフィン 包 埋 組 織 切 片 か らの DNA あるいは RNA を 精 製 する 前 に 脱 パラフィンを 行 なうために 至 適 化 されています。Deparaffinization Solution は FFPE サンプルに 添 加 し た 後 もサンプル 上 に 留 まり、Proteinase K による 分 解 が 同 時 に 行 なわれ ます。Deparaffinization Solution の 添 加 後 、FFPE サンプルをペレット 化 する 必 要 はなく、パラフィンを 含 む 上 清 を 除 去 する 必 要 もありません。 Deparaffinization Solution は 無 臭 で、 青 色 のトラッキング 色 素 により 容 易 にトラッキングできます。 本 製 品 は EpiTect Plus Bisulfite Kit の 一 部 であり、 また QIAamp DNA FFPE Tissue Kit、RNeasy FFPE Kit、miRNeasy FFPE Kit、 QIAsymphony RNA Kit、QIAsymphony DNA Mini Kit、 ま た QIAsymphony DSP DNA Mini Kit とも 併 用 できます。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Deparaffinization Solution (16 ml) 19093 23,500 Deparaffinization Solution (50 ml) 939018 36,000 8 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
9
サンプルテクノロジー QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit QIAcube 対 応 予 定 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit 糞 便 サンプルからの gDNA 精 製 ■ ■ 新 規 の InhibitEX ® Buffer により 溶 解 ステップが 大 幅 に 改 善 ■ ■ 有 害 な 有 機 化 合 物 は 不 要 ■■ QIAcube でワークフローを 自 動 化 可 能 ■■ PCR 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 除 去 ■■ ダウンストリームアッセイで 高 い 感 度 Sample QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit は、 新 鮮 あるいは 凍 結 した 糞 便 サンプルか ら 高 品 質 なゲノム DNA(ヒトおよび 細 菌 )を 迅 速 に 精 製 します。 取 り 扱 い にくい 阻 害 物 質 除 去 錠 剤 に 代 わってキットに 付 属 の 液 状 の InhibitEX Buffer は、 糞 便 サンプルに 通 常 存 在 する PCR 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 除 去 し、 手 作 業 時 間 を 大 幅 に 短 縮 します。 Suspend in InhibitEx Buffer Sample Technologies 阻 害 物 質 の 効 率 的 な 除 去 糞 便 サンプルには、 多 糖 類 複 合 体 、 胆 汁 酸 塩 、 脂 質 、および 尿 酸 などの PCR 阻 害 物 質 が 多 く 含 まれています。 最 もうまくいった 場 合 でも、これ らの 阻 害 物 質 によりターゲットを 増 幅 することが 難 しくなります。 最 悪 の 場 合 は、これらの 阻 害 物 質 の 存 在 が PCR 反 応 を 完 全 に 抑 制 されます。 従 っ て、このような 阻 害 物 質 を 完 全 に 除 去 する 方 法 は、どのような 糞 便 サンプ ルの 解 析 にも 非 常 に 重 要 です。QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit に 入 ってい る 新 規 の InhibitEX Buffer は PCR 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 除 去 し、 信 頼 性 の 高 い DNA 検 出 を 実 現 します( 下 図 )。 value Standard column purification QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit Fully automatable on the QIAcube Digest proteins Bind Wash 2x 1 2 3 4 5 6 Sample Elute PCR 阻 害 物 質 の 効 率 的 な 除 去 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit あるいは 他 のスタンダードなカラム 法 により、 糞 便 6 サンプル から DNA を 分 離 した。 C T 値 は 阻 害 物 質 に 対 して 感 受 性 の 高 い PCR システムで 測 定 した。 スタ ンダードな 精 製 法 を 用 いたほとんどのサンプルでは、 PCR 阻 害 物 質 のためターゲットが 増 幅 され なかった。 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit は DNA から 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 分 離 し、 高 感 度 な 増 幅 が 可 能 であった。 DNA ready for downstream applications 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) キャンペーン 価 格 (¥) QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit (50) 51604 33,000 23,100 注 : 上 記 のキャンペーン 価 格 は 2014 年 7 月 31 日 受 注 分 までとなります。 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 9
10
アッセイテクノロジー Assay Technologies Sample collection Purification cDNA synthesis Amplification Analysis Assay Technologies Calculated 70 60 Calculated Experimental 60 50 Experimental 40 50 40 30 30 20 20 10 10 0 0 1– 4 0 Copy number 1– 4 Copy number 1 コピーのターゲットを 高 感 度 かつ 確 実 に 検 出 A QuantiNova Probe PCR Kit を 使 用 して 白 血 球 ゲノム DNA 中 に 存 在 するシングルコピー 遺 伝 子 CFTR を 10 4 コピーから 10 コピーに 相 当 する 30、 3、 0.3、 0.03 ng の gDNA で 検 出 し、 検 量 線 を 作 成 した。 コピー 数 に 対 する C T 値 のプロッ トは 高 い 直 線 性 を 示 した。 60 回 の 反 応 に 充 分 なマスターミッ クスをセットアップし、 理 論 的 にウェルあたり 1 コピーに 相 当 する 3 pg のテンプレート gDNA を 各 反 応 液 に 添 加 した。 60 反 応 でのコピー 数 を 決 定 するために 検 量 線 を 使 用 した。 検 量 線 を 用 いて 測 定 したコピー 数 を 計 算 されたポアソン 分 布 に 対 してマッピングした。 B 検 量 線 を 用 いたシングルコピー 定 量 の 結 果 は、 理 論 的 に 計 算 されたポアソン 分 布 との 一 致 を 示 しており、 高 い 感 度 と 確 実 性 を 証 明 している。 Detection frequency (%) (%) Copy number Copy number 30 ng DNA 3 ng ng DNA DNA 30.3 ng ng DNA DNA 0.3 0.03 ng ng DNA DNA 0.03 3 pg DNA ng DNA 3 pg DNA 1000 1000 10000 10000 100000 100000 QuantiNova Probe PCR Kit プローブを 用 いた、 感 度 と 特 異 性 の 高 い 超 高 速 リアルタイム PCR ■■ わずか 1 コピーのターゲットも 正 確 に 検 出 ■■ 1 反 応 で 複 数 の 結 果 が 得 られる duplex 能 力 ■■ 30℃で 最 長 100 時 間 まで 安 定 しており 様 々なワークフローに 最 適 ■■ バッファーの 色 の 変 化 でサンプルの 入 れ 忘 れを 回 避 ■ ■ 高 い 特 異 性 でより 良 い 結 果 を 実 現 ■ ■ 超 高 速 サイクリングによりスループット 数 を 増 大 QuantiNova Probe PCR Kit は、 低 温 度 でのミスプライミングによる 弊 害 を 回 避 できるリアルタイム PCR 試 薬 です。 抗 体 による 革 新 的 なホットスター トメカニズムをベースにした 本 キットは、プローブベースのリアルタイ ム PCR の 特 異 性 と 効 率 を 向 上 し、 様 々な PCR サイクラーで cDNA または gDNA の 正 確 な singleplex および duplex 解 析 を 実 現 します。また、 室 温 で 最 大 100 時 間 という 卓 越 した 安 定 性 により、 冷 却 の 必 要 がなく、ハイスルー プットおよび 自 動 化 ワークフローに 最 適 です。さらに、 本 キットは 正 確 なピ ペッティングを 視 覚 化 できるシステムにより 安 心 して 実 験 を 実 施 でき、 低 コピーのターゲットも 検 出 可 能 な 高 い 感 度 で 信 頼 できる 結 果 を 提 供 します。 シングルコピー DNA の 正 確 で 確 実 な 検 出 QuantiNova Probe PCR Kit の 高 い 感 度 により、わずか 1 コピーのターゲット でも 正 確 かつ 確 実 に 検 出 できます( 左 図 )。 あらゆるリアルタイムサイクラーで 一 定 した 結 果 QuantiNova Probe PCR Kit は、ほとんどのリアルタイムサイクラーで 使 用 可 能 です。passive reference 色 素 として ROX ™ 色 素 が 必 要 なサイクラー を 使 用 する 場 合 には、 別 チューブで 提 供 される ROX 色 素 を 添 加 できます。 サイクラーによって 高 速 サイクリング 能 力 に 差 があるため、サイクリング・ プロトコールが 異 なりますが、QuantiNova Probe PCR Kit は 異 なるサイク ラーを 用 いた 際 にも 一 定 した 感 度 、 再 現 性 、 効 率 を 実 現 します。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QuantiNova Probe PCR Kit (100) 208252 13,000 QuantiNova Probe PCR Kit (500) 208254 55,500 QuantiNova Probe PCR Kit (2500) 208256 222,000 10 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
11
アッセイテクノロジー QuantiNova SYBR ® Green PCR Kit SYBR Green ベースの qPCR を 用 いて 卓 越 した 結 果 ■ ■ 革 新 的 なホットスタートメカニズムにより 比 類 のない 特 異 性 ■■ バッファーの 色 の 変 化 でサンプルの 入 れ 忘 れを 回 避 ■■ わずか 1 コピーのターゲットも 正 確 かつ 確 実 に 検 出 ■ ■ 超 高 速 サイクリングによりスループット 数 とスピードを 増 大 ■■ QuantiTect ® Primer Assay と 組 み 合 わせて 良 好 な 結 果 特 異 性 、 感 度 、 速 度 、およびプロセスの 安 全 性 が 向 上 された QuantiNova SYBR Green PCR Kit は、SYBR Green をベースにした qPCR において 新 し い 基 準 を 示 しています。 革 新 的 なホットスタートメカニズムは、リアルタ イム PCR の 特 異 性 を 顕 著 に 向 上 し、また 至 適 化 済 みの 試 薬 はほとんどのリ アルタイム PCR サイクラーでわずか 1 コピーのターゲットでも cDNA や gDNA の 正 確 な 定 量 結 果 を 実 現 します。さらに、 正 確 なピペッティングを 視 覚 化 できるシステムが 組 み 込 まれています。 C T value 30 ng 3 ng 0.3 ng 0.03 ng 3 pg 0.1 1 1000 10000 Copy number Detection frequency (%) Calculated Experimental Assay Technologies 1 コピーターゲットを 高 感 度 で 検 出 QuantiNova SYBR Green PCR Kit 試 薬 の 特 殊 な 組 成 により、わずか 1 コピー のターゲットでも 正 確 かつ 確 実 に 検 出 できます( 右 図 )。この 究 極 の 感 度 は 超 高 速 サイクリング 条 件 下 でさえも 達 成 され、 最 高 の 感 度 を 必 要 とする 稀 少 な DNA サンプルを 用 いるような 難 しい 実 験 において QuantiNova SYBR Green PCR Kit は 最 高 の 選 択 肢 となります。 SYBR Green によるリアルタイム PCR で 新 基 準 を 設 定 QuantiNova SYBR Green PCR Kit は、 実 績 のある QIAGEN のバッファー テクノロジーと 革 新 的 な QuantiNova ホットスタートを 組 み 合 わせ、 様 々 なサイクリング 条 件 下 で、 比 類 のない 特 異 性 と 感 度 を 実 現 します。その 結 果 として、QuantiNova ケミストリーはお 客 様 がご 利 用 の 装 置 を 用 いた 既 存 のワークフローに 容 易 に 組 み 込 むことができます。 簡 単 な 反 応 セット アップと 超 高 速 サイクリング 条 件 下 でさえも 確 実 なパフォーマンスを 実 現 する 特 長 に 加 え、QuantiNova SYBR Green PCR Kit は 最 初 の 試 みからリア ルタイム PCR の 成 功 をお 約 束 します。 0 1–4 Copy number 1 コピーターゲットを 高 感 度 かつ 確 実 に 検 出 A QuantiNova SYBR Green PCR Kit を 用 いて 30、3、0.3、 0.03 ng の 白 血 球 ゲノム DNA からシングルコピー 遺 伝 子 IL1R2 を 検 出 し、ターゲットのコピー 数 に 対 し C T 値 をプロッ トし 検 量 線 を 作 製 した。 用 いた 容 量 は 10 ~ 10,000 個 のコピー 数 に 相 当 し、C T との 相 関 関 係 において 高 い 直 線 性 があった。 理 論 的 に 1 コピーになるように、60 回 の 反 応 で 実 際 のターゲッ トのコピー 数 を 決 めるために、 検 量 線 を 使 用 した。 反 応 液 はマ スターミックスから 分 注 したが、 統 計 的 変 動 により、1 コピー 以 上 を 含 むウェル、 何 も 含 まないウェルもいくつか 存 在 した。 B 各 反 応 で 予 想 される 理 論 的 なコピー 数 をポアソン 分 布 を 用 いて 計 算 し、 検 量 線 から 算 出 した 実 際 のコピー 数 と 比 較 した。 低 コピー 数 での 計 算 および 実 験 の 検 出 頻 度 が 非 常 に 良 く 一 致 していたことは、QuantiNova ケミストリーの 高 い 感 度 と 確 実 性 を 証 明 している。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QuantiNova SYBR Green PCR Kit (100) 208052 10,500 QuantiNova SYBR Green PCR Kit (500) 208054 50,000 QuantiNova SYBR Green PCR Kit (2500) 208056 200,000 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 11
12
アッセイテクノロジー Assay Technologies 80 100 120 140 160 180 200 ~200 DNA samples from different populations 信 頼 性 の 高 い 多 コピー 定 量 コントロールアッセイ Type-it CNV Reference Assay は、 異 なるヒト 集 団 間 でコピー 数 が 一 貫 した 多 コピー 因 子 を 基 準 としており、 汎 用 性 のある 定 量 コントロールアッセイとして 最 適 である。Type-it CNV Reference Assay の 多 コピー 因 子 は、192 人 の 健 常 者 のヒト ゲノムを 用 いて 定 量 および 検 証 されており、それらは 性 別 およ びその 他 の 集 団 間 でも 一 貫 した 結 果 を 示 した。 多 コピー 因 子 をリファレンスとして 使 用 した 確 実 な CNV 定 量 qPCR を 用 いた 18 コピーあるいは 単 一 コピー 因 子 をリファレ ンスとする 仮 定 上 の CNV 定 量 実 験 で、 多 コピー 因 子 をリファ レンスとして 使 用 する 優 位 性 を 図 式 化 した。 A グラフおよび B 表 では、CNV リファレンス 遺 伝 子 のコピー 数 変 動 (1 コピー 喪 失 または 獲 得 )がもたらす、C T 値 および 対 象 遺 伝 子 (GOI) のコピー 数 測 定 への 影 響 が 示 されている。GOI のコピー 数 測 定 の 際 に 生 じる 偽 喪 失 と 偽 獲 得 は、 単 一 コピーのリファレン ス 遺 伝 子 が 1 コピー 変 動 することによって 引 き 起 こされる。 これに 対 し、 多 コピー 遺 伝 子 をリファレンスとして 用 いた 場 合 には、リファレンス 遺 伝 子 の 1 コピー 変 動 による GOI の コピー 数 測 定 への 影 響 はなく、 高 い 精 度 でコピー 数 の 測 定 が 可 能 である。( 計 算 の 前 提 :GOI はすべてのテストサンプルに おいてコピー 数 が 変 動 しない 単 一 コピー 遺 伝 子 である。CNV 定 量 のリファレンスには 18 コピーの 因 子 または 一 倍 体 ヒトゲ ノム 上 で 単 一 コピーの 因 子 ( 二 倍 体 ヒトゲノム 上 で 36 または 2 コピー)。 Type-it ™ CNV Probe PCR +qC Kit および Type-it CNV SYBR Green PCR Kit ゲノムコピー 数 変 異 解 析 キット 近 年 の 急 速 なゲノムの 網 羅 的 解 析 の 発 達 により、 CNV (Copy Number Variation) は 患 者 だけではなく 一 般 健 常 者 集 団 にも 広 く 存 在 することが 明 らかになってきました。 臨 床 的 にも、 臨 床 症 状 に 関 与 する CNV と 一 般 健 常 者 集 団 で 観 察 されたものとを 識 別 することが 重 要 です。 また、 CNV は 民 族 集 団 によって 出 現 の 頻 度 が 異 なることが 報 告 されているた め、 ゲノム 解 析 により 検 出 された CNV が 病 態 と 関 わるかどうかを 判 断 す ることが 必 要 とされています。 QIAGEN ではジェノタイピングの 研 究 に 特 化 した 解 析 用 試 薬 、 Type-it シリーズをご 提 供 しています。 その Typeit シリーズから CNV 解 析 用 に Type-it CNV PCR +qC Kits (SYBR Green お よび Probe) をご 用 意 しました。 Calculated GOI copy number CNV reference Type-it CNV Reference Assay Single-copy gene False loss False gain No change +1 copy –1 copy Copy number of CNV quantification reference Copy number, per diploid human genome C T change (reference assay) GOI copy number (real) 18-copy element (Type-it CNV Reference) Single-copy gene; not changed Single-copy gene; copy number +/–1 GOI copy number (calculated) CNV calling for GOI 36 0 2 2.00 NC: Correct 36+1 –0.04 2 1.94 NC: Correct 36–1 +0.04 2 2.06 NC: Correct 2 0 2 2.00 NC: Correct 2+1 –0.58 2 1.33 Loss: False 2–1 +1 2 4.00 Gain: False 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Type-it CNV Probe PCR +qC Kit (100) 206662 25,500 Type-it CNV Probe PCR +qC Kit (400) 206664 90,000 Type-it CNV SYBR Green PCR +qC Kit (100) 206672 22,500 Type-it CNV SYBR Green PCR +qC Kit (400) 206674 79,500 Type-it CNV SYBR Green PCR Core Kit (400) 206624 70,500 12 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
13
アッセイテクノロジー Type-it HRM PCR Kit および Rotor-Gene ™ Type-it HRM Discovery Kit HRM(High Resolution Melt) 解 析 による 遺 伝 子 変 異 および SNP の 迅 速 かつ 正 確 な 検 出 ■■ わずかな 配 列 の 違 いも 正 確 に 検 出 ■ ■ 特 異 性 の 高 い PCR により 増 幅 困 難 な 遺 伝 子 座 を 増 幅 ■ ■ 新 しい EvaGreen 蛍 光 色 素 により 明 確 な 融 解 曲 線 ■ ■ 新 規 の HRM ジェノタイピング 解 析 実 験 系 の 設 定 を 簡 便 化 ■ ■ 簡 便 なマスターミックスフォーマットと 至 適 化 済 みのプロトコール QIAGEN PCR キット キット・プロトコールに 準 拠 時 間 至 適 化 なしで PCR 解 析 成 功 他 社 のキット 実 験 系 の 構 築 時 間 PCR 条 件 の 至 適 化 時 間 煩 雑 な 至 適 化 後 のみ PCR 解 析 が 可 能 Type-it HRM PCR Kit は HRM 解 析 による 迅 速 で 正 確 なジェノタイピングのた めの 信 頼 できる 製 品 です。 本 キットは 増 幅 困 難 なゲノム 遺 伝 子 座 でさえも 良 好 に 解 析 できるように 至 適 化 されています。 本 キットは、 変 異 のスキャ ン 用 に 最 適 であり、 未 知 の 変 異 のスクリーニングに 使 用 できます。 効 率 的 に 新 しい HRM ジェノタイピングアッセイを 確 立 します。 時 間 のかかる PCR 実 験 条 件 の 至 適 化 なしに、 非 特 異 的 な 増 幅 を 抑 え、 特 異 的 な 増 幅 産 物 および 信 頼 できる 結 果 が 一 定 して 得 られます。 本 キットは Rotor-Gene Q、 Rotor-Gene 6000、LightCycler ® 480、Applied Biosystems ® 7500 Fast System のような HRM 解 析 用 に 適 したリアルタイム PCR 装 置 において 使 用 でき ます。 Rotor-Gene Type-it HRM Discovery Kit は Rotor-Gene Q で 正 確 かつ 再 現 性 の ある HRM 解 析 ができるよう 最 適 化 されています。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) 至 適 化 実 験 なしで 良 好 な PCR 実 験 QIAGEN PCR キットは、 簡 単 な 操 作 で 信 頼 性 の 高 い 結 果 を 迅 速 に 実 現 する。 現 在 汎 用 されている 方 法 と 異 なり、QIAGEN PCR キットは PCR パラメーターの 至 適 化 が 不 要 で、アッセイ の 確 立 を 迅 速 かつ 容 易 に 行 なえる。 Normalized fluorescence 78.0 79.0 80.0 81.0 82.0 83.0 84.0 Assay Technologies Type-it HRM PCR Kit (100) 206542 19,000 Type-it HRM PCR Kit (400) 206544 68,000 Type-it HRM PCR Kit (2000) 206546 307,000 Rotor-Gene Type-it HRM Discovery Kit 206541 39,500 A/T Class IV SNP の 正 確 なジェノタイピング Type-it 2. 0HRM PCR Kit を 用 い た ヒ ト GYS1 遺 伝 子 の SNP (rs2270938)タイピングの 結 果 、Type-it HRM PCR Kit を 用 い て 得 られた Normalized melting curve は Class IV SNP の 3 種 類 のジェノタイプ( -2.0 野 生 型 、ヘテロ 接 合 体 、 変 異 体 )を 明 確 に 識 別 できたことを 示 す。 -4.0 Normalized minus wt -6.0 78.0 79.0 80.0 81.0 82.0 83.0 84.0 Rotor-Gene Q 比 類 ない 高 い 感 度 ・ 再 現 性 を 実 現 したリアルタイム 40 PCR システム リアルタイム PCR 装 置 Rotor-Gene Q は、 20画 期 的 な“ 遠 心 エアコントロール 方 式 ” を 採 用 しているため、サンプル 間 の 温 度 のばらつきをブロック 型 装 置 の 約 1/20 の ± 0.02℃まで 抑 えることに 成 功 しました。さらに 77.5 78.5加 熱 79.5 冷 却 装 80.5 置 (ペルチェ 81.5 82.5 素 子 など)の 劣 化 による 実 験 結 果 のばらつきもなく、 高 い 精 度 と 再 現 性 を 実 現 する ことが 可 能 です。Rotor-Gene Q は、 極 めて 高 い 温 度 分 解 能 を 必 要 とする HRM 解 析 や 変 異 解 析 などの 実 験 に 適 しています。 0 -10. 0 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 13 77.0 78.0 79.0 80.0 81.0 82.0 Normalized fluorescence Normalized minus wt -5.0
14
エピジェネティクス Epigenetics Sample collection Purification & bisulfite conversion DNA Amplification Analysis EpiTect ® Fast Bisulfite Conversion Kits ゲノム DNA、FFPE、 血 液 、 細 胞 または 組 織 サンプルからわずか 30 分 で 効 率 的 な Bisulfite 変 換 Epigenetics EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit Whole blood Cultured cells or tissues Bisulfite converted DNA FFPE tissues EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit EpiTect Fast Bisulfite Kit の 相 互 関 係 サンプルタイプに 応 じて DNA の Bisulfite 変 換 は 特 化 された キットとプロトコールが 必 要 。 キットには DNA 抽 出 に 至 適 化 済 みのバッファーと DNA の Bisulfite 変 換 に 必 要 な 全 試 薬 が 含 まれている。 [FU] 1000 2000 4000 EpiTect Fast Supplier Z Supplier E [nt] EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit ■ ■ 至 適 化 済 みの 操 作 で 99% 以 上 の 高 いシトシン 変 換 率 ■■ わずか 30 分 で 効 率 的 な Bisulfite 変 換 ■■ gDNA、 全 血 、 細 胞 、 組 織 、FFPE 切 片 用 に 特 化 されたソリューション ■ ■ 迅 速 で 能 率 的 な 操 作 で DNA の 効 率 的 な 変 換 と 精 製 ■■ DNA 分 解 を 回 避 する 画 期 的 な DNA Protect テクノロジー EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kit は、 様 々なスタートサンプルに 対 応 する 高 い 柔 軟 性 を 提 供 する 一 方 、わずか 30 分 で 非 メチル 化 シトシンをウラシ ルに 高 い 効 率 で 変 換 する 統 合 的 なシステムです。 効 率 の 高 い Bisulfite 変 換 反 応 効 率 がダウンストリーム 解 析 の 信 頼 性 に 非 常 に 大 きな 影 響 を 与 えるこ とから、DNA の Bisulfite 処 理 および 非 メチル 化 シトシンのウラシルへの 変 換 は、メチル 化 解 析 において 最 も 重 要 なステップです。EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kits に 入 っ て い る 革 新 的 な Bisulfite Solution に よ り、2 本 の X 染 色 体 の 1 本 が 高 度 にメチル 化 された 女 性 サンプルに 由 来 する X 染 色 体 のゲノム DNA のような 非 常 に 分 析 困 難 なサンプルでも 超 高 速 で 効 率 良 く Bisulfite 変 換 が 行 なえます。 DNA 断 片 化 を 低 減 完 全 な Bisulfite 変 換 に 必 要 な 過 酷 な 条 件 は、 高 度 な DNA 断 片 化 やサンプ ル 消 失 を 引 き 起 こすため、DNA 収 量 の 低 下 、DNA の 激 しい 断 片 化 、 再 現 性 のない 変 換 効 率 につながります。QIAGEN のユニークな DNA Protect Buffer は DNA 分 解 を 抑 えるため、 他 社 のキットで 変 換 した DNA よりも 大 きいサイズのフラグメントで 完 全 に 変 換 された DNA が 得 られます。 Bisulfite 変 換 後 の DNA フラグメントサイズの 分 析 EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit を 用 いた Bisulfite 変 換 後 、 1 µg のゲノム DNA の 断 片 化 レベルは 最 も 低 く、 フラグメントサ イズの 分 布 は 数 百 bp から 6 kb を 超 える 範 囲 であったが、 他 社 のキットでは 500 bp と 1 kb にそれぞれピークがあった。 サンプルは Agilent ® RNA 6000 Nano Chip で 解 析 した。 14 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
15
エピジェネティクス EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit EpiTect Fast 96 Bisulfite Kit QIAcube 対 応 および EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit には 特 別 に 調 製 されたバッファーと 試 薬 が 入 っており、ゲノム DNA の Bisulfite 変 換 とそれに 続 くクリーンアップを 効 率 的 に 行 ないます。 斬 新 な Bisulfite Solution がわずか 30 分 で 高 効 率 に Bisulfite 変 換 を 可 能 にする 一 方 、DNA Protect テクノロジーと QIAGEN スピンカラムは、 分 解 を 最 小 限 に 抑 えて DNA の 完 全 変 換 を 実 現 します。EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit を 用 いて、20 µl までの 容 量 で 1 ng ~ 2 µg の DNA、あるいは 最 大 容 量 40 µl で 1 ~ 500 ng の DNA が 変 換 可 能 です。 * クリーンアップに 対 応 EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit および EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit ホルマリン 固 定 パラフィン 包 埋 (formalin-fixed、paraffin-embedded;FFPE) 組 織 は EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit で 処 理 されます。 本 キットは、FFPE 組 織 切 片 の 脱 パラフィンと 溶 解 を 効 率 的 に 行 なうため の 特 殊 なバッファーが 入 った EpiTect Fast FFPE Lysis Kit と、 抽 出 した DNA の 迅 速 で 効 率 的 な Bisulfite 変 換 のための EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit で 構 成 されています。 本 プロトコールは Bisulfite 変 換 後 の クリーンアップツールを 含 み、シングルの FFPE 組 織 切 片 ( 厚 さ 10 µm)に 使 用 できます。QIAGEN の 信 頼 できる DNA Protect テクノロジーは 変 換 反 応 中 の 断 片 化 を 最 小 限 に 抑 えるため、Bisulfite 変 換 さ れた DNA を 高 収 量 で 得 られます。 EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit および EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit 全 血 、 培 養 細 胞 、 組 織 サンプルは EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit で 処 理 します。 本 キットは、 特 殊 な 溶 解 バッファーが 入 った EpiTect Fast LyseAll Lysis Kit と、DNA を Bisulfite 変 換 するための EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit で 構 成 されています。 本 プロトコールには、サンプルから DNA を 能 率 的 に 遊 離 す るための 独 自 の 配 合 成 分 を 持 つ 溶 解 バッファーを 用 いて DNA の 結 合 を 促 進 するために 至 適 化 された ステップが 含 まれています。 本 キットで 0.5 ~ 20 µl の 血 液 あるいは 10 ~ 10 5 個 の 細 胞 を 処 理 でき ます( 最 少 60 pg の DNA)。 Epigenetics 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) 精 製 DNA からの Bisulfite 処 理 変 換 およびクリーンアップ 用 EpiTect Fast Bisulfite Kit (10) 59802 12,500 EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit (50) 59824 34,500 EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit (200) 59826 117,000 EpiTect Fast 96 Bisulfite Kit 59720 129,000 FFPE 組 織 切 片 からのサンプル 溶 解 と Bisulfite 処 理 変 換 および クリーンアップ 用 EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit (50) 59844 61,500 EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit (200) 59846 208,000 EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit 59740 229,000 全 血 、 培 養 細 胞 あるいは 組 織 からのサンプル 溶 解 と Bisulfite 処 理 変 換 およびクリーンアップ 用 EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit (50) 59864 39,000 EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit (200) 59866 134,000 EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit 59760 146,000 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 15
16
エピジェネティクス ESR1 解 析 A GeneGlobe の PyroMark CpG Assay ツールは CpG アイラ ンドにある 複 数 のターゲット 情 報 を 提 供 し、ユーザーは 解 析 するべき CpG アイランドの 特 定 領 域 を 選 択 できる。 B パイロ シークエンスのデータは ESR1 遺 伝 子 に 関 連 する CpG アイラ ンドにおける 2 つの 部 位 の 解 析 結 果 を 示 している。 PyroMark ™ CpG Assays パイロシークエンス 解 析 による 遺 伝 子 特 異 的 な DNA メチル 化 定 量 ■ ■ 高 度 なデザインアルゴリズムによりアッセイの 特 異 性 を 最 大 化 ■■ ヒト、マウスおよびラットゲノムの CpG 部 位 を 広 範 に 解 析 可 能 ■ ■ 解 析 設 定 のアッセイファイルを 簡 単 にダウンロード ■■ デザイン 済 みのアッセイが GeneGlobe ® ウェブサイトで 入 手 可 能 ■ ■ 費 用 対 効 果 の 高 い 製 品 で 最 高 のパフォーマンスを 実 現 PyroMark CpG Assay は、パイロシークエンス 解 析 用 のゲノムワイドな デザイン 済 みのメチル 化 アッセイで、 特 異 性 の 高 いアッセイと 高 精 度 な CpG メチル 化 解 析 結 果 を 実 現 するデザインアルゴリズムを 使 用 していま す。 弊 社 のアップグレードされた PyroMark CpG Assay データベースは、 現 在 ヒト、マウスおよびラットゲノムに 対 応 する 84,000 以 上 の 個 別 アッ セイを 提 供 しています。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) PyroMark CpG Assay (200) Varies 18,000 PyroMark CpG Assay 96 well (50) Varies 11,500 Epigenetics PyroMark CpG Assay 96 well (200) Varies 18,000 PyroMark Q24 Advanced Reagents パイロシークエンス 法 によるロングリード 解 析 を 強 力 にサポート する 新 しいテクノロジー ■■ ソフトウェアとケミストリーから 構 成 される Advanced テクノロジー ■■ CpG ターゲットだけは 無 く CpN ターゲットの 解 析 にも 対 応 可 能 ■■ DNA メチル 化 定 量 解 析 および 変 異 ターゲットの 定 量 解 析 の 精 度 の 向 上 PyroMark Q24 Advanced パイロシークエンス 法 による DNA メチル 化 および 遺 伝 子 変 異 定 量 解 析 装 置 PyroMarkQ24 は、パイロシークエンス 法 による 24 ウェルフォーマットのリアルタ イムシークエンス 解 析 システムで、 正 確 な 塩 基 配 列 と 各 配 列 位 置 での 塩 基 の 比 率 定 量 により DNA メチル 化 および 遺 伝 子 変 異 解 析 を 実 現 します。 PyroMark Q24 Advanced Reagents は、 従 来 に 比 較 してロングリードが 可 能 であり、 解 読 配 列 の 後 半 の 解 析 精 度 の 向 上 が 期 待 できる 新 しいテク ノロジーです。 特 に DNA メチル 化 定 量 解 析 や 複 雑 な 変 異 解 析 や 微 生 物 の 同 定 解 析 のようなシークエンス 解 析 に 最 適 です。なお、PyroMark Q24 Advanced Reagents は、PyroMark Q24 Advanced Systems に 特 化 して 最 適 化 された 試 薬 です。また、ロングリード 解 析 に 際 して dNTP が 多 く 必 要 な 場 合 は、PyroMark Q24 Advanced CpG Reagents をご 使 用 ください。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) PyroMark Q24 Advanced Reagents (4 x 24) 970902 27,500 PyroMark Q24 Advanced CpG Reagents (4 x 24) 970922 30,000 16 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
17
微 生 物 検 出 および 同 定 Microbiome Sample collection Sample disruption Purification qPCR and qRT-PCR Analysis Microbial DNA qPCR Arrays リアルタイム PCR ベースでアプリケーションに 特 化 した 微 生 物 の 同 定 またはプロファイリング ■■ アプリケーションに 着 目 した 微 生 物 ターゲットで 関 連 性 の 高 い 解 析 結 果 ■■ ラボ 検 証 済 みのアッセイを 用 いて 確 実 な 検 出 および 定 量 を 実 現 ■■ コントロールアッセイを 含 むことにより 信 頼 できる 結 果 を 提 供 ■ ■ 無 料 のデータ 解 析 ツールで 解 析 を 簡 易 化 Microbial DNA qPCR Array は、 微 生 物 種 、 毒 性 遺 伝 子 、または 抗 生 物 質 耐 性 遺 伝 子 の 同 定 とプロファイリングに 特 化 したアッセイを 搭 載 したアレイ です。 生 物 種 同 定 用 アッセイはバクテリアの 16s rRNA 遺 伝 子 とバクテリ ア DNA をターゲットし、 各 アレイにはホスト DNA、バクテリア DNA の 含 有 、PCR 反 応 を 確 認 するためのコントロールが 含 まれています。また、 アレイキットには Microbial qPCR Mastermix も 含 まれています。 本 アレイ の 簡 便 なフォーマットと 操 作 手 順 は、リアルタイム PCR 装 置 を 使 用 する いかなる 実 験 室 においても、ルーチンでの 信 頼 できる 微 生 物 遺 伝 子 の 同 定 またはプロファイリングを 可 能 にします。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Microbial DNA qPCR Arrays Varies Varies Custom Microbial DNA qPCR Arrays リアルタイム PCR ベースでアプリケーションに 特 化 した 微 生 物 の 同 定 またはプロファイリング Sample 1 G 73 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Host1 Host2 PanA/C PanB1 PanB2 PPC Sample Microbial DNA qPCR Array プレート このアレイプレートフォーマットは、 1 サンプルで 90 種 類 の 微 生 物 アッセイが 行 なえる。 各 ウェルには 独 自 のテストが 1 種 類 含 まれている。 また 宿 主 DNA、 pan-bacterial DNA、 pan-fungal DNA およびポジティブ PCR コントロールが 含 まれ ている。 表 1. Microbial DNA qPCR Arrays の 種 類 * Antibiotic Resistance Genes (1901) Bacterial Vaginosis (1401) Biodefense (1201) Food Testing: Dairy (1402) Food Testing: Meat (1202) Food Testing: Poultry (1101) Food Testing: Seafood (1102) Food Testing: Vegetable (1103) Intestinal Infections (1403) Respiratory Infections (1404) Sepsis (1903) Urinary Tract Infections (1205) Vaginal Flora (1902) Water Analysis (1505) Custom ̶ user-selected assay panels Microbiome ■ ■ 微 生 物 遺 伝 子 または 種 のプロファイリングを 可 能 にするカスタムパネル ■ ■ 高 感 度 で 特 異 的 な Microbial DNA qPCR Assay で 構 成 ■■ お 客 様 のニーズに 対 応 する 様 々なプレートレイアウト Custom Microbial DNA qPCR Array は 微 生 物 種 または 微 生 物 遺 伝 子 を 検 出 するためのユーザーが 設 定 できるアッセイです。 * それぞれのアレイに 含 まれるアッセイの 種 類 は 弊 社 ウェブ サ イ ト www.qiagen.com/JP/Prod-microbial-dna-qpcr-arrays をご 確 認 ください。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Custom Microbial DNA qPCR Array 330161 Inquire QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 17
18
微 生 物 検 出 および 同 定 LLOQ y = –3.2647x + 39.73 R² = 0.9956 2 3 4 5 6 Log target copy number 検 出 限 界 vs 定 量 下 限 グラフは 検 出 限 界 (LOD) と 定 量 下 限 (LLOQ) の 違 い を 示 している。 LOD は 陽 性 サンプルの 95%を 測 定 できる 下 限 濃 度 であり、 一 方 LLOQ は、 標 準 曲 線 の 直 線 上 にのる 下 限 濃 度 である。 LOD はアッセイの 精 度 に 依 存 し、 陽 性 サン プル 量 の 決 定 には 少 なくとも 40 回 の 再 現 性 が 求 められる。 Microbial DNA qPCR Assays においては、 アッセイの 感 度 の 決 定 には LLOQ で 十 分 である。 Microbial DNA qPCR Assays および Microbial DNA qPCR Assay Kits リアルタイム PCR ベースの 微 生 物 検 出 ■ ■ 高 感 度 および 特 異 的 な 実 験 的 に 検 証 済 みのアッセイ ■ ■ 微 生 物 種 、 毒 性 遺 伝 子 、または 抗 生 物 質 耐 性 遺 伝 子 の 検 出 ■■ シンプルな qPCR ワークフロー Microbial DNA qPCR Assay は、 定 量 リアルタイム PCR を 実 現 する 2 種 類 の PCR プライマー( 各 10 µM)および 5'- 加 水 分 解 プローブ(5 µM)の ミックスです。Microbial DNA qPCR Assay は 特 許 取 得 済 みで、 実 験 的 に 検 証 済 みのアルゴリズムを 用 いてデザインされ、 効 果 的 な PCR と 増 幅 条 件 を 提 供 します。 高 い 効 率 を 実 現 するため、ご 使 用 の 際 には Microbial qPCR Mastermixes および Microbial DNA-Free Water と 併 用 してください。 Microbial DNA qPCR Assay Kits は、Microbial DNA Positive Control、Positive PCR Control、Microbial DNA-Free Water および Microbial qPCR Mastermix が 含 まれています。 初 めてのご 使 用 される 方 にお 勧 めします。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Microbiome ΔC T ([metagenomic sample + synthetic template] – synthetic template) -1.0 -2.0 -3.0 -4.0 -5.0 -6.0 Assay 複 雑 なメタゲノム 試 料 中 の 定 量 にも 有 用 な 高 感 度 Micorbial DNA qPCR Assays 数 千 におよぶ 微 生 物 種 が 混 在 する 複 雑 なメタゲノム 試 料 の 定 量 を、 Microbial DNA qPCR Assays が 各 試 料 に 応 じ て 問 題 な く 行 な え る こ と を 確 認 す る た め、 糞 便 、 歯 垢 、 唾 液 を 用 いて 測 定 した。 各 々の 試 料 には 合 成 したテ ンプレートターゲットをスパイクし、 テンプレートター ゲットのみの 場 合 と C T 値 を 比 較 した。 PCR には 次 の 各 サ ンプルを 使 用 :プールされたテンプレートターゲットの み、 糞 便 、 糞 便 に プ ー ル さ れ た テ ン プ レ ー ト タ ー ゲ ッ ト、 歯 垢 、 歯 垢 に プ ー ル さ れ た テ ン プ レ ー ト タ ー ゲ ッ ト、 唾 液 、 唾 液 にプールされたテンプレートターゲット。 糞 便 、 歯 垢 、 あるいは 唾 液 のみの 場 合 で C T 値 が 35 以 下 の ときに ∆C T を 算 出 した ( 例 ; 糞 便 のみの 場 合 の C T 値 – プー ルされたテンプレートターゲットの C T 値 )。 この 計 算 は 全 て のアッセイに 対 して 行 なわれた。 各 アッセイにおいて ∆C T が 3 より 小 さいということは、 Microbial DNA qPCR Assays の 結 果 が、 複 雑 なメタゲノムのバックグラウンドの 影 響 を 受 け ていないことを 示 唆 している。 Microbial DNA qPCR Assays 330025 69,500 Microbial DNA qPCR Assay Kit 330033 28,000 Microbial DNA qPCR Multi-Assay Kits リアルタイム PCR ベースの 微 生 物 検 出 または 同 定 および プロファイリング ■■ qPCR ベースの 微 生 物 検 出 用 アッセイ、コントロールおよび 試 薬 キット ■ ■ 実 験 的 に 検 証 済 みの Microbial DNA qPCR Assay を 含 む ■■ 5' 加 水 分 解 プローブを 用 いた 感 度 および 特 異 性 の 高 い 検 出 Microbial DNA qPCR Multi-Assay Kits は、リアルタイム PCR ベースの 微 生 物 検 出 のための 完 結 したソリューションです。それぞれのキットには、 定 量 リアルタイム PCR を 実 現 する 2 種 類 の PCR プライマー( 各 10 µM)の ミックスおよび 1 種 類 の 5' 加 水 分 解 プローブ(5 µM)の Microbial DNA qPCR Assay が 含 まれています。さらに qPCR を 成 功 させるために 必 要 な Microbial DNA Positive Control、Positive PCR Control、Microbial DNA-Free Water および Microbial qPCR Mastermix も 含 まれています。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Microbial DNA qPCR Multi-Assay Kits Varies Varies 18 www.qiagen.co.jp QIAGEN Issue 1/2014
19
微 生 物 検 出 および 同 定 Supplemental Microbial qPCR Mastermix (Fluorescein) または Supplemental Microbial qPCR Mastermix (ROX) Microbial DNA qPCR Assays 用 マスターミックス Supplemental Microbial qPCR Mastermix は ROX または Fluorescein をリファレンス 色 素 として 用 いる、 5' 加 水 分 解 プローブベースの 検 出 のためのリアルタイム PCR アプリケーションに 使 用 します。この supplemental mastermix は、Microbial DNA qPCR Array および Assay Kit で、 自 動 分 注 システムを 用 いる 場 合 に 必 要 な 追 加 分 のマスターミックスとしても 使 用 できます。Microbial qPCR Mastermix は リアルタイム PCR バッファー、 高 性 能 なホットスタート DNA Taq ポリメラーゼ、ヌクレオチドが 含 まれており、さらにご 使 用 のサイクラーに 合 わせた Fluorescein または ROX 色 素 が 含 まれているキッ トをお 選 びいただきます。 化 学 修 飾 され 厳 密 にコントロールされたホットスタート 酵 素 は、プライ マーダイマーおよびその 他 の 非 特 異 的 な 産 物 の 増 幅 を 防 ぐことで、 比 類 のない 正 確 な 5' 加 水 分 解 プ ローブによる 結 果 を 提 供 します。 また、Microbial DNA qPCR Assays をご 使 用 の 際 は、ご 使 用 のサイクラーに 合 わせて Supplemental Microbial qPCR Mastermix をお 選 びください。 Microbial DNA Positive Control Microbial DNA qPCR Assays でのポジティブコントロール Microbial DNA Positive Control は、 各 Microbial DNA qPCR Assay のターゲットになることで、 各 Microbial DNA qPCR Assay の 機 能 性 を 検 証 する 合 成 DNA のプールです。Microbial DNA Positive Control は、10 倍 濃 縮 で 提 供 されるため、Microbial DNA-Free Water で 希 釈 する 必 要 があります。 Microbial DNA-Free Water Microbial DNA qPCR 製 品 と 使 用 Microbial DNA-Free Water は 分 子 生 物 学 グレードのヌクレアーゼフリー 水 で、ゲノム DNA のコンタ ミを 除 去 するためにフィルター 滅 菌 と UV 処 理 がされています。 品 質 はバクテリアおよび 菌 類 DNA に 反 応 する Microbial DNA qPCR Assay のパネルで PCR により 検 証 済 みです。Microbial DNA-Free Water をテンプレートとして 使 用 した PCR アッセイにおいてポジティブ 反 応 が 無 い 場 合 にロットが 検 査 を 通 過 します。この 厳 密 なプロセスは Microbial DNA qPCR Assay または Array 実 験 の 結 果 を 最 も 正 しいものにさせることができます。 Microbiome 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Supplemental Microbial qPCR Mastermix (Fluorescein) 330540 29,000 Supplemental Microbial qPCR Mastermix (ROX) 330530 29,000 Microbial DNA Positive Control 338134 6,800 Microbial DNA-Free Water 338132 9,700 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 19
20
食 品 試 験 ポートフォリオ Food Safety Testing pre-treatment Sample preparaiton Assay setup Detection mericon ™ Sample Preparation Kits 増 菌 培 養 液 および 生 鮮 / 加 工 食 品 からの 高 品 質 DNA 精 製 ■ ■ 改 良 CTAB 法 により 食 品 検 体 から DNA を 迅 速 に 精 製 ■ ■ 加 工 食 品 中 の 断 片 化 した DNA でも 効 率 的 に 精 製 ■■ グラム 陰 性 菌 および 陽 性 菌 を 迅 速 かつ 効 率 的 に 溶 解 ■ ■ 複 合 食 品 マトリックスから PCR 阻 害 物 質 を 除 去 mericon Sample Preparation Kits は、 病 原 体 の 増 菌 培 養 液 (mericon DNA Bacteria および Bacteria Plus Kits)や 生 鮮 / 加 工 食 品 (DNeasy ® mericon Food Kit)のような 様 々なサンプルから 高 品 質 な 核 酸 を 精 製 するようにデザインされています。 複 合 食 品 マトリックスからの PCR 阻 害 物 質 の 混 入 は 最 小 限 に 抑 えられます。 精 製 された 高 純 度 な DNA は、mericon PCR Assay Kits を 用 いてリアルタイム PCR による 原 材 料 解 析 、 病 原 体 検 出 、GMO 中 の DNA 検 出 や 定 量 のようなアプリケーションに 最 適 です。 微 生 物 増 菌 培 養 mericon DNA Bacteria Kit グラム 陰 性 菌 からの DNA 抽 出 テンプレート DNA DNeasy mericon 96 QIAcube HT Kit 様 々な 食 品 サンプルからの ハイスループット DNA 自 動 精 製 食 品 サンプル mericon DNA Bacteria Plus Kit グラム 陽 性 菌 からの DNA 抽 出 DNeasy mericon Food Kit 様 々な 食 品 タイプからの DNA 精 製 Food Safety Testing mericon PCR Assays リアルタイム PCR による 検 出 食 品 安 全 性 試 験 ワークフローの 2 つの 流 れ 病 原 体 、 遺 伝 子 組 み 換 え 体 、 または 動 植 物 由 来 成 分 を 使 用 するどのような 試 験 であっても、 mericon 食 品 安 全 性 試 験 ポートフォリ オは、 効 率 的 なサンプル 調 製 ワークフローと 完 全 に 標 準 化 された 検 出 プロトコールを 備 えたソリューションを 提 供 。 mericon PCR アッセイ すべての mericon リアルタイム PCR キットは 同 一 のサイクリング 条 件 ですべてのターゲットに 使 用 できるよう 標 準 化 されています。 n 食 品 由 来 の 病 原 体 検 出 n 原 材 料 解 析 n 遺 伝 子 組 み 換 え 作 物 由 来 の DNA 検 出 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) DNeasy mericon Food Kit (50) QIAcube 対 応 69514 23,500 mericon DNA Bacteria Kit (100) 69525 17,000 mericon DNA Bacteria Plus Kit (50) 69534 17,000 DNeasy mericon 96 QIAcube HT Kit (5) QIAcube HT 対 応 69571 147,000 20 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
21
動 物 感 染 症 の 病 原 体 検 出 Animal & veterinary Testing pre-treatment Sample preparaiton Assay setup Detection QIAamp cador ™ Pathogen Mini Kit QIAcube 対 応 様 々な 動 物 サンプル 種 からウイルス RNA/DNA およびバクテリア DNA を 精 製 ■■ ウイルス RNA/DNA、バクテリア DNA 精 製 を 同 じプロトコールで 実 現 ■ ■ 全 血 、 血 清 、 組 織 など 様 々なサンプルに 対 応 ■ ■ 未 希 釈 の 動 物 の 全 血 中 のウイルス RNA 精 製 にも 最 適 ■ ■ 阻 害 物 質 や 不 純 物 を 効 率 的 に 除 去 ■ ■ 分 離 した 核 酸 はリアルタイム PCR/RT-PCR 解 析 に 即 使 用 可 能 QIAamp cador Pathogen Mini Kit は、 希 釈 されていない 全 血 、 血 清 、スワ ブ、 組 織 などの 様 々な 動 物 サンプルからウイルス RNA/DNA やバクテリア DNA の 精 製 を 簡 便 化 します。 簡 単 で 迅 速 なスピンカラム 法 により、コン タミや 阻 害 物 質 を 除 去 し、リアルタイム PCR や RT-PCR のようなアプリケー ションに 即 使 用 できる 病 原 体 由 来 の 核 酸 を 精 製 します。 Bovine blood 1 Bovine blood 2 Ovine blood BVDV QIAamp cador Pathogen Mini Kit cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit Ovine serum Bovine serum Kidney lysate Liver lysate cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit 様 々な 動 物 サンプルからウイルス RNA/DNA および バクテリア DNA のハイスループット 自 動 化 精 製 ■ ■ 簡 便 で 信 頼 できる 自 動 化 精 製 により 費 用 と 時 間 の 節 約 が 可 能 ■■ 1 つの 共 通 機 器 プロトコールでウイルス RNA および DNA、バクテリア DNA の 抽 出 ■ ■ 全 血 、 血 清 、 組 織 など 様 々な 動 物 サンプルに 対 応 ■ ■ 阻 害 物 質 や 不 純 物 を 効 率 的 に 除 去 QIAcube HT ■ ■ 分 離 した 核 酸 はリアルタイム PCR/RT-PCR 解 析 に 即 使 用 可 能 対 応 cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit は、QIAcube HT システムを 用 いた 幅 広 い 動 物 サンプルからのウイルス RNA と DNA、バクテリア DNA の 簡 便 な 自 動 精 製 を 実 現 します。 便 利 な 96 ウェルフォーマットでの、 実 績 のある QIAamp のシリカメンブレンテクノロジーを 用 いることで、 夾 雑 物 および 阻 害 物 が 除 去 されたダウンストリーム 解 析 に 即 使 用 可 能 な 高 品 質 の 病 原 体 核 酸 が 得 られます。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAamp cador Pathogen Mini Kit (50) 54104 25,000 QIAamp cador Pathogen Mini Kit (250) 54106 112,000 cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit (5) 54161 122,000 Bovine blood 1 Bovine blood 2 Ovine blood Salmonella Ovine serum Bovine serum 動 物 感 染 症 の 病 原 体 検 出 用 アッセイ n ウイルス RNA 検 出 用 アッセイ virotype シリーズ n バクテリア DNA 検 出 用 アッセイ cador シリーズ bactotype QIAamp cador Pathogen Mini Kit cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit Kidney lysate Liver lysate ウイルス RNA とバクテリア DNA の 同 時 分 離 BVDV 粒 子 と Salmonella 細 胞 の 一 定 量 を、 様 々な 動 物 サン プルに 同 時 に 添 加 した。サンプルは、QIAcube HT と cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit で、あるいは QIAamp cador Pathogen Mini Kit を 用 いてマニュアルで 並 行 して 処 理 した。 同 時 に 分 離 したウイルス RNA とバクテリア DNA は、 自 社 アッ セイを 用 いて 同 定 した。 A BVDV および B Salmonella での 平 均 C T 値 。エラーバー(3 replicates 抽 出 実 験 の ±1 SD)が 小 さ いことは、 両 方 の 精 製 法 が 高 精 度 であることを 示 す。 Animal & veterinary Testing QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 21
22
個 人 識 別 および 法 医 学 サンプル Human Identity & Forensic Testing pre-treatment Sample preparaiton Assay setup Quantification STR analysis QIAGEN Quality Management System QIAGEN は 一 貫 して 高 品 質 の 製 品 を 提 供 するため、 効 果 的 な 品 質 管 理 システム(Quality Management System;QMS)を 運 用 しています。 当 社 のシステムは 以 下 を 含 む 主 要 な QMS 基 準 で 規 定 される 規 制 要 件 に 従 って 設 計 および 維 持 されています。 ■■ ISO 9001 ■■ ISO 13485、CMDCAS における ISO 13485 ■ ■ 米 国 FDA 21CFR Part 820 ■ ■ 厚 生 労 働 省 令 第 169 号 ■ ■ MPG(BGB1IS.3146)、IVDD 98/79 EC、MDD 93/42/EEC を 含 む 指 令 ■ ■ 台 湾 Technical Cooperation Program(TCP) ■■ その 他 の 国 際 規 制 および 国 際 基 準 Certified Management System EN ISO 9001 EN ISO 13485 高 品 質 な Investigator ソリューション QIAGEN の 各 Investigator Kit は、 優 れた 製 品 品 質 を 保 証 するために 様 々な 専 用 の 基 準 を 満 たしています。 ■■ クリーンルーム 環 境 での 製 造 ■ ■ 自 動 化 生 産 およびエチレンオキサイド(EO) 処 理 ■ ■ 製 造 後 のヒト DNA 非 存 在 確 認 ■ ■ 試 験 成 績 書 (CoA) ■■ コンタミネーション 除 外 データベース ■ ■ 製 品 の 評 価 すべての Investigator Kit は ISO 認 証 を 受 けた 施 設 で 製 造 されています。さらに 一 貫 した 高 品 質 を 維 持 するため、キットの 各 ロットがあらかじめ 定 められた 規 格 に 適 合 しているか 検 査 を 行 なっています。 QIAGEN はお 客 様 にご 満 足 いただけるよう、 自 社 のソリューションやサービスの 質 を 常 に 向 上 させる ことを 目 指 しています。 Human Identity & Forensic Testing QIAGEN forensic grade QIAGEN の 新 しい Forensic Grade ラベルは、 上 記 の 品 質 保 証 手 順 や 個 人 識 別 および 法 医 学 試 験 のため の 厳 格 な 品 質 管 理 基 準 を 満 たしていることを 示 しています。 22 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
23
個 人 識 別 および 法 医 学 サンプル Investigator Lyse&Spin Basket Kit 簡 便 なサンプル 前 処 理 および 高 い 核 酸 回 収 率 ■ ■ 法 医 学 サンプルの 効 率 的 な 前 処 用 製 品 ■■ 56℃で 最 長 16 時 間 の 溶 解 を 漏 れなしに 実 現 ■■ ライセートのろ 過 と 10 µm 以 上 の 固 形 物 質 を 保 持 するバスケット ■ ■ 固 形 物 質 の 保 存 用 コレクションチューブも 同 梱 ■■ エチレンオキサイド 処 理 された 個 別 包 装 製 品 Investigator Lyse&Spin Basket Kit は、EZ1 DNA Investigator Kit、 QIAsymphony ™ DNA Investigator Kit、あるいは QIAamp DNA Investigator Kit のようなマニュアルあるいは 自 動 抽 出 用 キットと 組 み 合 わせて、 法 医 学 サンプルの 前 処 理 に 使 用 できます。 簡 便 な 操 作 でサンプル 溶 解 および 固 形 サンプル 物 質 の 分 離 を 一 つの 工 程 で 行 なえます。 構 成 パーツが 既 に 組 み 合 わされており、サンプルを 移 す 際 の 面 倒 な 操 作 が 不 要 で、その 結 果 操 作 工 程 における 安 全 性 が 増 大 します。この 方 法 は、スワブ、 布 片 や 皮 革 片 、 紙 、 タバコの 吸 殻 、チューインガム、 小 さなテープ、その 他 のサンプル 種 に 使 用 できます。 Sample Spin basket 2ml tube 1 ATL/PK lysis buffer Lysis Lysate separation Lyse&Spin Basket の 操 作 手 順 法 医 学 サンプルの 溶 解 中 、 溶 解 バッファーはバスケット 内 に 保 持 されている。 一 般 的 な 卓 上 遠 心 器 を 用 いて 遠 心 すると、バスケットの 底 の 穴 が 開 き、サンプルライセートがバスケットから 流 出 する。 核 酸 を 含 むライセートは 効 率 的 に 回 収 され、 同 梱 の 2 ml コレクションチューブに 採 集 さ れるが、 固 形 物 質 はバスケット 内 に 留 まる。 固 形 サンプル 物 質 が 残 っている 使 用 済 みのバスケッ トは、 同 梱 の 2 つ 目 のコレクションチューブ 内 で 保 存 することが 可 能 である。 Lysate 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Investigator Lyse&Spin Basket Kit (50) 19597 6,000 2 ml tube 2 QIAamp DNA Investigator Kit 法 医 学 、 個 人 識 別 鑑 定 サンプルからのトータル DNA 精 製 ■ ■ 高 品 質 で 即 使 用 可 能 な DNA の 迅 速 な 精 製 ■ ■ 一 定 した 高 い 収 量 ■ ■ 夾 雑 物 および 阻 害 物 質 の 完 全 除 去 QIAcube 対 応 QIAamp DNA Investigator Kit は、ケースワークや 犯 罪 現 場 のサンプル、 乾 燥 血 液 、 骨 、 性 的 暴 行 サンプル、スワブ、フィルターのような 法 医 学 、 個 人 識 別 鑑 定 サンプルから 高 品 質 なゲノム DNA を 精 製 します。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAamp DNA Investigator Kit (50) 56504 33,500 1200 D3S1358 vWA D16S539 D2S1338 100 150 200 250 300 350 2400 1600 D8S117 D21S11 D18S51 100 150 200 250 300 350 TH01 1200 D19S43 100 150 200 250 300 350 チューインガムから 精 製 した DNA で 良 好 な STR 解 析 チューインガムから QIAamp DNA Investigator Kit を 用 いて トータル DNA を 精 製 した。GeneMapper ® ID Software v3.2.1 (Applied Biosystems)を 用 いて STR 解 析 を 行 なった。 Human Identity & Forensic Testing QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 23
24
DNA セレクションガイド ゲノム DNA サンプル 調 製 テクノロジー(ヒト) QIAamp DNA Blood Kits QIAamp DNA Mini Kit QIAamp DNA Micro Kit QIAamp DNA Stool Mini Kit QIAamp DNA Investigator Kit QIAamp MinElute ® Media Kit QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit QIAamp DNA FFPE Tissue Kit QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit QIAamp UCP Pathogen Mini Kit サンプルタイプ マニュアル 全 血 * n n n n n n n n 血 清 、 血 漿 (ウイルス DNA) n n n 血 清 、 血 漿 n † † † ( 細 胞 外 DNA) 輸 送 ・ 保 存 液 中 の 検 体 尿 n n n CSF(ウイルス DNA) n ‡ n ‡ 唾 液 および 口 腔 洗 浄 液 n n n バフィコート n n 白 血 球 骨 髄 n n 乾 燥 血 斑 n n 組 織 * n n n n § 骨 n n パラフィン 包 埋 組 織 n n § LMD 採 取 した 組 織 糞 便 * n n 寄 生 虫 n n 培 養 細 胞 n n 培 養 液 スワブと 口 腔 細 胞 n n n n n n 法 医 学 および 個 人 識 別 鑑 定 サンプル QIAamp UCP PurePathogen Blood Kit MagAttract ® HMW DNA Kit Gentra ® Puregene ® Blood Kit Gentra Puregene Buccal Cell Kit QIAamp MinElute Virus Kits QIAamp UltraSens Virus Kit PAXgene ® Blood DNA Kit PAXgene Tissue DNA Kit n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット * バクテリアおよびウイルス DNA を 含 む。 循 環 血 液 中 の 遊 離 DNA あるいは RNA を 含 む。 ウイルス RNA も 精 製 可 能 。 PAXgene Tissue Container と 組 み 合 わせて 使 用 。 24 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
25
DNA セレクションガイド ゲノム DNA サンプル 調 製 テクノロジー( 動 物 、 植 物 、 微 生 物 ) DNeasy Blood & Tissue Kit DNeasy Plant Mini and Maxi Kits QIAamp DNA Stool Mini Kit MagAttract HMW DNA Kit QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit QIAamp DNA FFPE Tissue Kit Gentra Puregene Cell Kit Gentra Puregene Buccal Cell Kit Gentra Puregene Tissue Kit Gentra Puregene Yeast/Bact. Kit Gentra Puregene Mouse Tail Kit mericon DNA Bacteria Kit DNeasy mericon Food Kit サンプルタイプ シングルプレップ・フォーマット 動 物 血 液 ( 無 核 赤 血 球 ) n n 動 物 血 液 ( 有 核 赤 血 球 ) n n 動 物 口 腔 スワブ n* n n* 動 物 乾 燥 血 液 斑 n* n* 動 物 の 耳 /ネズミ 尾 n n n 動 物 糞 便 n n mericon DNA Bacteria Plus Kit 96 ウェル プレート 動 物 組 織 n n n バクテリア (グラム 陰 性 / 陽 性 ) n n n n 細 胞 n n n 固 定 組 織 (ホルマリン、パラフィン) n n n 菌 類 n n 毛 髪 n n 昆 虫 n n 植 物 組 織 n n 唾 液 n † n 土 壌 n † 酵 母 n n n 食 品 食 品 由 来 病 原 体 増 菌 培 養 液 (グラム 陰 性 / 陽 性 ) n n § DNeasy 96 Blood & Tissue Kit DNeasy 96 Plant Kit n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット * QIAGEN プロトコールはないが、 弊 社 およびカスタマーのデータは 入 手 可 能 。 ユーザー 開 発 プロトコール。 詳 細 は 弊 社 テクニカルサポートに 問 い 合 わせるか www.qiagen.co.jp を 参 照 。 AllPrep DNA/RNA Kit はゲノム DNA およびトータル RNA の 同 時 精 製 が 可 能 。AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit はさらにタンパク 質 の 同 時 精 製 が 可 能 。 グラム 陰 性 菌 のみ。 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 25
26
RNA セレクションガイド 特 殊 な 組 織 からのRNA 精 製 RNeasy Kits* RNeasy Fibrous Tissue Kits RNeasy Plus Universal Kits † RNeasy Plus Micro Kit RNeasy FFPE Kit ‡ 脂 肪 組 織 n n PAXgene Bone Marrow RNA System 大 動 脈 n n n n 骨 n n 骨 髄 液 n n 脳 n n n 胸 部 組 織 n n n 軟 骨 n n n 眼 組 織 n n n n 腺 組 織 n n n 心 臓 n n n n 腸 n n n n 腎 臓 n n n n 肝 臓 n n n n 肺 n n n n リンパ 節 組 織 n n n 筋 肉 n n n n 神 経 細 胞 n n n 膵 臓 n n n n 皮 膚 ( 豚 /ヒト) n n n 皮 膚 (ラット/マウス) n n n n 脾 臓 n n n n 胃 n n n n 精 巣 組 織 n n n n 胸 腺 n n n n 舌 n n n n 子 宮 n n n n 微 量 の 組 織 サンプル(≤5 mg) n n n FFPE 組 織 切 片 RNAlater RNA Stabilization Reagent Allprotect Tissue Reagent (DNA、RNA、タンパク 質 安 定 化 ) 骨 髄 液 と FFPE 組 織 以 外 の サ ン プ ル は、 TissueRuptor ™ あるいは TissueLyser II で 破 砕 とホモジナイズが 可 能 。 n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット n: 未 検 証 * 以 下 の キットでも 精 製 可 能 :RNeasy Protect Kits、RNeasy Plus Kits、AllPrep K i t s、 E Z1 R N A T is s u e M ini K i t、 QIAsymphony RNA Kit 以 下 のキットでも 精 製 可 能 :RNeasy 96 Universal Tissue Kits、miRNeasy Kits、 PAXgene Tissue RNA Kit、PAXgene Tissue miRNA Kit、EZ1 RNA Universal Tissue Kit miRNA 精 製 には miRNeasy FFPE Kit を ご 使 用 ください。 26 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
27
RNA セレクションガイド RNA 安 定 化 選 択 ガイド アプリ ケーション 採 取 、 安 定 化 、 精 製 RNA、DNA、 タンパク 質 の 安 定 化 RNA の 安 定 化 RNA の 安 定 化 と RNA 精 製 サンプルタイプ ヒト 全 血 (RNA 精 製 ) n* ヒト 骨 髄 (RNA 精 製 ) 動 物 全 血 (RNA、 miRNA 精 製 ) ヒト 組 織 (RNA、 miRNA、DNA 精 製 ) 組 織 RNeasy Protect Cell Mini Kit PAXgene Blood RNA System RNeasy Protect Kits QIAcube 上 で 自 動 化 可 能 RNeasy Protect Bacteria Kits Allprotect Tissue Reagent RNAlater TissueProtect Tubes PAXgene Bone Marrow RNA System PAXgene Tissue System n † マニュアル RNAprotect Bacteria Reagent RNeasy Protect Saliva Mini Kit RNAlater RNA Stabilization Reagent RNAprotect ® Cell Reagent 組 織 n ‡ n 細 胞 n § バクテリア ヒト 唾 液 n § 組 織 細 胞 n § バクテリア RNeasy Protect Animal Blood System 特 殊 な 組 織 を Allprotect Tissue Reagent および RNAlater RNA Stabilization Reagent で 安 定 化 する 際 の 適 応 状 況 は、 裏 面 の 選 択 ガイドを 参 照 してください。 n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット * QIAcube 上 での 自 動 化 には、ユーザー 登 録 が 必 要 です。BioRobot ® Universal System、QIAsymphony SP を 用 いた 自 動 化 精 製 も 可 能 です。 組 織 の 形 態 を 良 好 に 保 存 。 組 織 の 採 取 および 安 定 化 を 実 現 。 DNA も 安 定 化 。 各 製 品 のより 詳 細 な 情 報 は 弊 社 ウェブサイト(www.qiagen.co.jp)でご 検 索 ください。 本 誌 に 記 載 の 価 格 は 希 望 小 売 価 格 です。 本 誌 に 記 載 の QIAGEN 製 品 は 研 究 用 です。 疾 病 の 診 断 、 治 療 または 予 防 の 目 的 には 使 用 することはできません。 最 新 のライセンス 情 報 および 製 品 ごとの 否 認 声 明 に 関 してはウェブサイト www.qiagen.co.jp の“Trademarks and Disclaimers”をご 覧 ください。QIAGEN キットの Handbook および User Manual は www.qiagen.co.jp から 入 手 可 能 です。 Trademarks: QIAGEN ® , QIAcube ™ , QIAamp ® , QIAsymphony ™ , QuantiTect ® , AllPrep ® , BioRobot ® , cador ™ , PDNeasy ® , Gentra ® , GeneGlobe ® , EpiTect ® , MagAttract ® , MinElute ® , mericon ™ , Puregene ® , PyroMark ™ , REPLI-g ® , RNAprotect ® , RNeasy ® , Rotor-Gene ™ , Type-it ™ , InhibitEX ® (QIAGEN Group); Agilent ® (Agilent Technologies, Inc.); Illumina ® , MiSeq ® (Illumina, Inc.); Applied Biosystems ® , ROX ™ , GeneMapper ® , LightCycler ® , SYBR ® (Life Technologies, Inc.); PAXgene ® (PreAnalytiX GmbH); Excel ® , Microsoft ® (Microsoft Corporation). QR コード /QR Code は 株 式 会 社 デンソーウェーブの 登 録 商 標 です。 “RNAlater ® ” is a trademark of AMBION, Inc., Austin, Texas and is covered by various U.S. and foreign patents. 本 文 に 記 載 の 会 社 名 および 商 品 名 は、 各 社 の 商 標 または 登 録 商 標 です。 © 2014 QIAGEN, all rights reserved QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 27
28
製 品 のご 注 文 は 販 売 店 にお 願 い 致 します。 販 売 店 www.qiagen.co.jp 株 式 会 社 キアゲン n 〒 104-0054 n 東 京 都 中 央 区 勝 どき 3-13-1 n Forefront Tower II Tel:03-6890-7300 n Fax:03-5547-0818 n E-mail:techservice-jp@qiagen.com 2302182 05/2014 Sample & Assay Technologies
QIAGEN Product News 1May 2014 Pick Up ! 注 目 製 品 n QIAxpert n REPLI-g Single Cell シリーズ サンプルテクノロジー アッセイテクノロジー エピジェネティクス 微 生 物 検 出 および 同 定 食 品 試 験 ポートフォリオ 動 物 感 染 症 の 病 原 体 検 出 個 人 識 別 および 法 医 学 サンプル DNA/RNA セレクションガイド Sample & Assay Technologies
2
Pick Up! 注 目 製 品 Get True Insight into Your Sample Quality 次 世 代 サンプルプロファイラー QIAxpert QIAxpert は、DNA、RNA、タンパク 質 の 定 量 やクオリティコントロールを 飛 躍 的 に 加 速 させる 高 速 マイクロフリュー ディックタイプの 紫 外 ・ 可 視 分 光 光 度 計 です。 卓 上 タイプのためサンプル 中 の DNA、RNA とタンパク 質 分 画 や 純 度 を 簡 単 に 測 定 することができます。QIAxpert の 測 定 は 高 速 かつ 簡 便 です。そのパフォーマンスは 2 分 以 内 に 最 大 16 サンプルを 測 定 します。 操 作 は QIAxpert のスライドにサンプルをアプライし、 装 置 にセットしてタッチ スクリーンで 測 定 メニューを 選 択 するだけです。QIAxpert は、サンプル 定 量 に 高 い 精 度 を 求 める 生 命 科 学 の 研 究 室 にとって 理 想 的 なツールとなります。サンプル 溶 液 に 本 当 に 含 まれているものが 見 えてきます。 QIAxpert が 提 供 する 革 新 : ■ ■ 独 自 のスペクトラルプロトコールで DNA、RNA や 他 の 混 入 物 質 を 特 異 的 定 量 ■■ わずか 2 µl の 核 酸 溶 液 で 16 サンプルを 2 分 以 内 に 定 量 測 定 する 迅 速 性 ■■ フルカラータッチスクリーンによる 直 感 的 な 操 作 性 ■■ お 手 持 ちの PC に 解 析 レポートを 持 ち 出 せるポータビリティ 最 少 のサンプル 量 で 最 大 の 情 報 量 QIAxpert は、 貴 重 なサンプルをダウンストリーム 解 析 に 最 大 限 度 提 供 す ることができます。QIAxpert のスライドへのインプット 量 は 解 析 あたり わずか 2 µl、そしてそれらのサンプル 量 を 解 析 するまで、 最 大 で 2 時 間 も 蒸 発 から 守 るキャピラリーチャンネルが 装 置 には 備 わっています。サン プルをロードしてから QIAxpert にセットするまで 急 ぐ 必 要 はありません。 QIAxpert は 実 験 計 画 にゆとりも 提 供 します。 2 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
3
Pick Up! 注 目 製 品 独 自 のアルゴリズムによるサンプルプロファイ リング 独 自 のスペクトラルプロトコールは、いくつもの 紫 外 ・ 可 視 光 に 吸 収 をもつ 化 合 物 を 含 む 複 雑 なサンプルも 定 量 用 色 素 不 要 で 高 精 度 に 定 量 することが 可 能 です。 特 異 的 なスペクトラ ルプロファイリングアプリケーションは、 溶 液 中 の 成 分 を 分 離 することが 難 しいサンプルの 解 析 を 目 的 に 開 発 されました。 独 自 に 開 発 したソフトウェアアルゴリズムにより DNA、RNA と 紫 外 ・ 可 視 スペクトルで 検 出 される 不 純 物 などの 特 定 の 化 合 物 の 寄 与 率 を 見 分 けて 検 出 できるようになりました。 現 在 お 使 いの QIAGEN 精 製 キット * からの 精 製 物 ならそのまま 成 分 分 析 ができます。 * 対 応 するキットに 関 してはお 問 い 合 せください。 Absorbance (10 mm) Absorbance (10 mm) 6.01 –0.601 230250 275 300 325 350 375 400 425 450 Wavelength (nm) タッチスクリーンによる 直 感 的 な 操 作 性 QIAxpert は、 装 置 本 体 にインストールされているソフトウェ アとフルカラータッチスクリーンにより、 簡 便 かつ 直 感 的 な 操 作 を 実 現 しました。 画 面 に 表 示 されるアイコンは、 測 定 の セットアップやデータのエクスポート、 測 定 結 果 といった 作 業 を 視 覚 的 にサポートするため、 操 作 を 学 ぶ 手 間 なく 即 使 用 可 能 です。 多 彩 なエクスポート/レポートオプション QIAxpert の Export タブより 簡 単 にデータを USB ドライブや ネットワークフォルダにエクスポートすることができます。 さらに QR コード ® を 読 み 込 むことでスマートフォンにも データを 保 存 することができます。データは、2 種 類 のデー タフォーマットでエクスポートできますので、その 後 の 解 析 にも 柔 軟 に 対 応 できます。HTML レポートはウェブブラウザ で、CSV ファイルは Microsoft ® Excel ® で 開 くことが 可 能 です。 レポートは 従 来 の 吸 光 度 データ(A 260 、A 260 /A 280 および A 260 / A 230 )が 表 形 式 で 含 まれ、HTML レポートはサンプルごとの スペクトラルプロファイルデータが 含 まれています。 –0.54 230 250 275 300 325 350 375 400 425 450 Wavelength (nm) RNA のスペクトラルプロファイリング 解 析 A :( B ) の RNA サンプルに 人 為 的 に gDNA を 添 加 して 分 子 特 異 的 に 解 析 を 行 なった。 RNA ( 青 )、 DNA ( 赤 ) として 混 入 量 を 定 量 的 に 見 分 けた。 B : 高 純 度 RNA のスペクトラルでは、 有 意 な 混 入 物 はない。 製 品 名 内 容 Cat. no. 価 格 (¥) QIAxpert Instrument QIAxpert 専 用 スライド QIAxpert Slide-40 (25) 装 置 本 体 (1 年 保 証 )、アクセサリー( 電 源 ケーブル、 キャリブレーションスライド 2 枚 )* 25 スライド(25×16 サンプル 用 ;1 スライドあたり 最 大 16 サンプル) 9002340 1,450,000 990700 13,000 * 装 置 のアクセサリーには、 サンプル 測 定 用 の QIAxpert Slide-40 (25) (Cat. no. 990700) は 付 属 しておりませんので、 装 置 と 併 せてご 注 文 頂 くようお 願 い 致 します。 QIAxpert のより 詳 細 な 情 報 は www.qiagen.com/p/QIAxpert をご 覧 ください。 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 3
4
Pick Up! 注 目 製 品 “Compare to our current method.... the high quality results obtained... ” Luting Song, BGI, China ゲノムカバー 率 (%) 94.76% REPLI-g Single Cell Kit (1 cell) REPLI-g Single Cell Kit (1 cell) 97.39% 99.96% REPLI-g Single Cell Kit (1000 cells) gDNA REPLI-g Single Cell Kit (1000 cells) gDNA エラー 率 0.43% 0.22% 0.35% キメラ 0.08% 0.06% 0.11% インデル 率 0.05% 0.02% 0.01% 精 製 ゲノム DNA あるいは REPLI-g Single Cell で 増 幅 した DNA を 用 いた NGS は 同 等 の 結 果 を 実 現 枯 草 菌 ゲ ノ ム の 全 ゲ ノ ム シ ー ク エ ン シ ン グ を Illumina ® MiSeq ® で 行 なった。 解 析 では、 ゲノム DNA およびシン グルセル (3 回 のシングルセル 実 験 を 実 施 ) または 10 3 個 の 細 胞 から REPLI-g Single Cell Kit を 使 用 して 増 幅 した 2 µg の DNA を 300 bp のフラグメントにせん 断 し、 各 1 µg を ライブラリー 作 成 に 使 用 した。 A 同 等 のシークエンスカバ レッジが gDNA および REPLI-g Single Cell で 増 幅 した DNA で 観 察 された *。 B 増 幅 していない DNA と REPLI-g で 増 幅 した DNA の 比 較 では、 エラー 率 が 非 常 に 低 く 類 似 してい た † 。 * Burrows-Wheeler Alignment プログラムを 用 いたアライメ ント (cut-off:10x coverage):bio-bwa.sourceforge.net 非 増 幅 および REPLI-g Single Cell で 増 幅 した DNA の 比 較 はまた、 配 列 が 高 い 割 合 でゲノムにマッピングされたこ とを 明 らかにした (データ 未 提 示 )。 REPLI-g ® Single Cell Kit シングルセルあるいは 限 られたサンプル 量 からの 全 ゲノム 増 幅 (WGA) ■■ シングルセルから 最 大 のゲノムカバレッジでの 全 ゲノム 増 幅 ■■ MDA テクノロジーによりゲノム 遺 伝 子 座 の 偏 りのない 増 幅 ■ ■ 次 世 代 シークエンシングなどの 新 テクノロジーでの 使 用 に 最 適 ■ ■ 最 大 40 µg までの 一 定 した 収 量 ( 増 幅 産 物 長 さの 平 均 は >10 kb) ■■ がん 研 究 やメタゲノミクスなど、 多 くのアプリケーションに 最 適 なツール 革 新 的 テクノロジーを 用 いて DNA 配 列 解 析 やジェノタイピングを 行 なう 場 合 など、 微 量 生 体 サンプルを 用 いた 解 析 には 大 変 困 難 な 場 合 が 数 多 くあ ります。UV 処 理 によりコンタミの 可 能 性 がある DNA を 検 出 限 界 まで 除 去 した 試 薬 を 用 いている REPLI-g Single Cell Kit は、シングルセル(1,000 個 未 満 の 細 胞 から 最 低 1 個 の 細 菌 または 腫 瘍 細 胞 まで)あるいは 精 製 ゲノム DNA から 配 列 の 偏 りがほとんどなく、 最 大 のゲノムカバレッジで 均 一 に ゲノム DNA を 増 幅 することが 可 能 となります。 I have tried the kit and successfully performed single cell whole genome amplification. The DNA obtained allowed me to reliably detect allele-specific point mutations in a colorectal adenocarcinoma cell line. The excellent yield and sequence representation of the amplified DNA really helped me to advance my work in single-cell genomics. Dr. Masafumi Muratani Research Associate, Cancer Therapeutics & Stratified Oncology, Genome Institute of Singapore (GIS) 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) REPLI-g Single Cell Kit (24) 150343 81,500 REPLI-g Single Cell Kit (96) 150345 277,000 シングルセルに 関 する 情 報 は www.qiagen.com/JP/Prod-SingleCell をご 覧 ください。 4 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
5
Pick Up! 注 目 製 品 REPLI-g WTA Single Cell Kit シングルセル 由 来 のトータル RNA や mRNA の 全 トランスクリプ トーム 増 幅 ■■ シングルセルからでも 全 トランスクリプトームをカバー ■■ MDA テクノロジーにより 配 列 の 偏 りのほとんどない 均 一 な WTA ■■ NGS のような 新 テクノロジーでの 使 用 に 最 適 化 ■■ トータル RNA あるいは mRNA– 濃 縮 (poly A + )RNA の 増 幅 ■■ がん、および 幹 細 胞 研 究 のための 革 新 的 なツール REPLI-g WTA Single Cell Kit は、シングルセルのトランスクリプトームレベ ルでの 転 写 制 御 への 影 響 に 関 する 信 頼 できる 研 究 を 可 能 にし、シングル セル(1 ~ 1,000 細 胞 )からの 全 転 写 物 の 均 一 な 増 幅 を 実 現 します。 REPLI-g 法 においては、 混 入 核 酸 の 増 幅 をブロックするため、 専 用 のバッ ファーおよび 試 薬 を 用 いて 独 自 のプロセスで 処 理 することにより、 混 入 核 酸 が 除 去 されます。 革 新 的 な 溶 解 バッファーで 細 胞 RNA を 効 果 的 に 安 定 化 することにより、 増 幅 された RNA は in vivo での 遺 伝 子 発 現 プロファイル を 正 確 に 反 映 します。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) REPLI-g WTA Single Cell Kit (24) 150063 200,000 RPKM (3 cells) 100000 10000 1000 1 10 100 1000 10000 100000 RPKM (average, 10–50 cells) 高 い 再 現 性 をもつ 実 験 Cell 1 rRNA 増 幅 を 抑 えるため、 mRNA (poly A + ) 濃 縮 プロ トコールを 用 いて R 2 = 30.97253 ~ 1000 個 の 様 々な 細 胞 数 で REPLI-g WTA Single Cell 反 応 を 行 な っ た。 増 幅 cDNA を フ ラ グ メ ン1 ト 化 し (Covaris S220)、 GeneRead Library Prep I Kit で NGS 用 ラ イ ブ ラ リ ー を 調 製 し、 MiSeq Instrument 0.1 (Illumina) で 配 列 解 析 し た。 RNA バ イ オ タ イ プ は Bowtie2 を 用 い て シ ン グ ル の 転 写 RNA に マッピングし、 0.01 RPKM (reads per kilobase and million mapped reads) を 計 算 し た。 こ れ ら の 結 果 は、 3 個 の 細 胞 と WTA サンプル (10 ~ 50 細 胞 ) に 由 来 する 0.001 転 写 産 物 の 平 均 RPKM 値 が 同 等 であることを 証 明 している。 0.0001 0.0001 0.001 0.01 Cell 2 REPLI-g Cell WGA & WTA Kit 微 量 サンプルから、 全 ゲノムおよび 全 トランスクリプトームを 同 時 増 幅 ■■ ゲノム DNA および RNA(トータルあるいは mRNA 濃 縮 )の 同 時 増 幅 ■■ ゲノム 状 態 と 転 写 パターンの 関 連 付 けを 容 易 に 実 現 ■■ MDA テクノロジーにより 配 列 の 偏 りは 最 少 限 ■ ■ 細 胞 あるいは 組 織 から gDNA および RNA を 直 接 増 幅 ■■ NGS を 含 む 全 てのダウンストリームアプリケーションに 使 用 可 能 REPLI-g Cell WGA & WTA Kit は 均 一 な 全 ゲノム 増 幅 (WGA)および 全 ト ランスクリプトーム 増 幅 (WTA)を 同 時 に 実 現 し、 微 量 サンプル(25 ~ 1000 個 の 細 胞 )を 用 いてゲノムとトランスクリプトームを 直 接 関 連 づけ ることができます。 専 用 のバッファーおよび 試 薬 は、 混 入 核 酸 の 制 御 され た 除 去 を 行 ない、REPLI-g 法 による 混 入 核 酸 の 増 幅 をブロックします。ゲノ ム DNA およびトータル RNA あるいは mRNA(poly A + )の 増 幅 は REPLI-g SensiPhi DNA Polymerase により PCR ベースの 増 幅 テクノロジーとは 対 照 的 にフィデリティー 率 は 1,000 倍 にまで 増 大 します。 * 使 用 するプライマーにより、 トータル RNA または 濃 縮 miRNA (poly A + ) が 増 幅 される。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) REPLI-g Cell WGA & WTA Kit (12) 150052 138,000 (amplify DNA) Repair Ligation Whole genome amplification Amplified gDNA REPLI-g Cell WGA & WTA Procedure Cell sample (25–1000 cells) Cell lysis Add WGA Ready Mix Add ligation mix Add REPLI-g SensiPhi amplification mix 60 min at 42°C 3 min at 95°C 30 min at 24°C 5 min at 95°C 2 h at 30°C 5 min at 65°C Add Lysis Buffer 5 min at room temperature 3 min at 95°C (amplify RNA) gDNA removal Reverse Transcription Ligation Whole transcriptome amplification Amplified cDNA Add gDNA Wipeout Buffer 10 min at 42°C Add Quantiscript RT mix and primers* Add ligation Add REPLI-g SensiPhi amplification QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 5
6
サンプルテクノロジー Sample Technologies Sample collection Purification Amplification cDNA synthesis Analysis Sample Technologies QIAcube ™ HT System 96 ウェルフォーマットでのミドルからハイスループットの 核 酸 自 動 精 製 装 置 ■■ あらゆる 種 類 のサンプルから DNA、RNA、miRNA を 高 い 信 頼 性 で 抽 出 ■■ ミドルからハイスループットの 核 酸 自 動 精 製 と 専 用 精 製 キットで 経 費 と 時 間 を 節 約 ■■ ユーザーフレンドリーなソフトウェアでデータ 管 理 とドキュメンテーションを 簡 便 化 ■ ■ 安 全 性 に 配 慮 した 設 計 によりクロスコンタミのリスクを 最 小 限 に 抑 制 ■ ■ 操 作 が 簡 便 で 柔 軟 性 が 高 く 使 いやすいコンパクトな 装 置 QIAcube HT は、ミドルからハイスループットのシリカメンブレン 法 を 用 いた 核 酸 自 動 精 製 を 96 ウェルフォーマットで 実 現 します。 動 物 サンプル 中 のバクテリアやウイルスからだけではなく、 細 胞 、 組 織 、 食 品 などあ らゆるサンプル 種 から DNA、RNA、miRNA を 迅 速 かつ 容 易 に 精 製 するこ とができます。 自 動 化 用 プロトコールと 専 用 の QIAcube HT 精 製 キットや プラスチック 製 品 は 信 頼 性 と 利 便 性 を 高 め、 貴 重 な 時 間 を 節 約 できます。 本 システムは、 信 頼 性 の 高 い 他 の QIAGEN 精 製 技 術 と 同 様 に、 高 品 質 な 結 果 を 提 供 します。 原 理 QIAcube HT での 自 動 精 製 は、 高 速 かつ 経 済 的 で、1 ランあたり 24 ~ 96 サンプルから 高 品 質 の 核 酸 が 得 られます。 専 用 の QIAcube HT Kits は、 細 胞 、 組 織 、バクテリア、ウイルス、 食 品 サンプルを 含 む 様 々なスタートサンプ ルからの 核 酸 精 製 を 実 現 します。QIAcube HT は 非 常 に 使 いやすく、 直 感 的 なソフトウェアによりマウスを 数 回 クリックするだけでランを 開 始 する ことができます。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAcube HT system, Priority* † 9001899 4,900,000 ~ * 保 証 期 間 が 3 年 の QIAcube HT system, PrioPLUS (Cat. no. 9001900) もございます。 お 問 い 合 せください。 専 用 のプラスチック 製 品 をご 用 意 しておりますのでお 問 い 合 わせください。 6 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
7
サンプルテクノロジー QIAamp ® 96 DNA QIAcube HT Kit 血 液 、 細 胞 および 組 織 からのハイスループットの トータル DNA 自 動 分 離 QIAcube HT 対 応 M 50 µl 100 µl 150 µl 200 µl ■ ■ 簡 便 で 信 頼 できる 自 動 化 精 製 により 費 用 と 時 間 の 節 約 が 可 能 ■ ■ 様 々なサンプルタイプに 対 応 する 標 準 化 された 手 法 ■ ■ 特 殊 なサンプルからも 高 収 量 で 精 製 ■■ ダウンストリーム 解 析 で 良 好 な 結 果 を 実 現 する 高 品 質 DNA ■ ■ 様 々なスタートサンプルに 至 適 化 済 みのプロトコール QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit は 血 液 、 細 胞 および 組 織 からトータル DNA( 例 ;ゲノム、ミトコンドリアおよび 病 原 体 )の 自 動 化 精 製 を 実 現 し ます。 便 利 な 96 ウェルフォーマットでの、 実 績 のある QIAamp のシリカ メンブレンテクノロジーを 用 いることで、 夾 雑 物 および 阻 害 物 が 除 去 され たダウンストリーム 解 析 に 即 使 用 可 能 な 高 品 質 の 核 酸 が 得 られます。 ゲノム DNA のアガロースゲル 解 析 QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit および QIAcube HT を 用 い て、 50、 100、 150 および 200 µl のヒト 全 血 からゲノム DNA を 精 製 した。 200 µl で 溶 出 した 精 製 DNA から 7 µl を それぞれ 用 いて 0.8%の 1x TBE アガロースゲルで 解 析 した。 M:ラムダ HindIII マーカー。 Sample Technologies 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit (5) 51331 90,000 RNeasy ® 96 QIAcube HT Kit QIAcube HT 対 応 動 物 およびヒトの 細 胞 / 組 織 からのハイスループット RNA 自 動 分 離 ■ ■ 簡 便 で 信 頼 できる 自 動 化 精 製 により 費 用 と 時 間 の 節 約 が 可 能 ■■ トータル RNA または miRNA を 含 むトータル RNA 分 離 のためのフレキ シブルな 操 作 ■ ■ 各 種 スタートサンプルおよび 目 的 のサイズ 分 布 用 プロトコール ■■ ダウンストリームアプリケーションに 即 使 用 可 能 な 高 品 質 RNA ■ ■ 少 量 のスタートサンプルで 一 定 した RNA 収 量 RNeasy 96 QIAcube HT Kit は QIAcube HT システムを 用 いた 動 物 および ヒトの 細 胞 / 組 織 サンプルからのトータル RNA または miRNA を 含 むトー タル RNA の 簡 便 な 自 動 化 精 製 を 実 現 します。 便 利 な 96 ウェルフォーマッ トで、 実 績 のある RNeasy のシリカメンブレンテクノロジーを 用 いること により、 夾 雑 物 および 阻 害 物 が 除 去 されたダウンストリーム 解 析 に 即 使 用 可 能 な 高 品 質 の 病 原 体 核 酸 が 得 られます。 RNA yield (µg) 2.5 5 10 15 Starting material (mg) 20 25 組 織 ライセートからトータル RNA の 直 線 性 のある 回 収 RNAlater ® で 安 定 化 したラット 肺 組 織 からのライセートを、 サンプルが 2.5 ~ 25 mg の 組 織 に 相 当 する 量 を 含 むように 連 続 希 釈 した。 これらのサンプルから、 RNeasy QIAcube HT Kit と RNeasy 96 QIAcube HT total RNA Tissue V1.QSP Protocol を 用 いて QIAcube HT でトータル RNA を 精 製 した。 精 製 RNA は 100 µl の RNase フリー 水 で 溶 出 した。 吸 光 度 測 定 値 は、 RNA 回 収 およびスタートサンプル 量 の 間 に 直 線 関 係 を 示 した。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) RNeasy 96 QIAcube HT Kit (5) 74171 153,000 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 7
8
サンプルテクノロジー The AllPrep procedure AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit QIAcube 対 応 Cells or tissue 細 胞 あるいは 溶 解 困 難 な 組 織 からゲノム DNA および miRNA を Sample Technologies On-column DNase digestion, including miRNA rebinding Wash Total RNA For fatty tissue: chloroform extraction of flow-through Proteinase K digestion in the presence of ethanol ethanol Lyse and homogenize Bind genomic DNA Genomic DNA Wash On-column Proteinase K digestion 含 むトータル RNA を 同 時 に 精 製 ■ ■ 同 一 サンプルから 高 収 量 の DNA、RNA、miRNA 精 製 ■ ■ 溶 解 困 難 なサンプル 用 に 開 発 ( 繊 維 性 あるいは 脂 肪 性 組 織 ) ■■ ダウンストリームですぐに 使 用 可 能 な 高 品 質 核 酸 ■ ■ 様 々なサンプルタイプ 用 に 最 適 化 されたプロトコール ■■ フェノール 不 要 の 簡 便 操 作 AllPrep ® DNA/RNA/miRNA Universal Kit は、 細 胞 および 繊 維 性 、 脂 肪 性 組 織 を 含 む 様 々な 組 織 から、ゲノム DNA および miRNA を 含 むトータル RNA の 同 時 精 製 を 実 現 します。 本 キットを 用 いた 分 離 精 製 法 ではサンプル を 分 割 する 必 要 がないため、DNA および RNA/miRNA を 最 大 収 量 で 精 製 できます。 精 製 した DNA および RNA/miRNA は 別 々に 溶 出 でき、 様 々な ダウンストリームアプリケーションにも 即 使 用 可 能 です。 本 キットには、 組 織 や 分 離 した 血 液 細 胞 など 様 々なサンプルに 至 適 化 されたプロトコール があります。 Wash 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Eluted RNA, including miRNA Elute Bind total RNA Elute AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit (50) 80224 68,000 Eluted DNA Wash Deparaffinization solution FFPE サンプルの 脱 パラフィン Deparaffinization Solution はホルマリン 固 定 パラフィン 包 埋 組 織 切 片 か らの DNA あるいは RNA を 精 製 する 前 に 脱 パラフィンを 行 なうために 至 適 化 されています。Deparaffinization Solution は FFPE サンプルに 添 加 し た 後 もサンプル 上 に 留 まり、Proteinase K による 分 解 が 同 時 に 行 なわれ ます。Deparaffinization Solution の 添 加 後 、FFPE サンプルをペレット 化 する 必 要 はなく、パラフィンを 含 む 上 清 を 除 去 する 必 要 もありません。 Deparaffinization Solution は 無 臭 で、 青 色 のトラッキング 色 素 により 容 易 にトラッキングできます。 本 製 品 は EpiTect Plus Bisulfite Kit の 一 部 であり、 また QIAamp DNA FFPE Tissue Kit、RNeasy FFPE Kit、miRNeasy FFPE Kit、 QIAsymphony RNA Kit、QIAsymphony DNA Mini Kit、 ま た QIAsymphony DSP DNA Mini Kit とも 併 用 できます。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Deparaffinization Solution (16 ml) 19093 23,500 Deparaffinization Solution (50 ml) 939018 36,000 8 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
9
サンプルテクノロジー QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit QIAcube 対 応 予 定 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit 糞 便 サンプルからの gDNA 精 製 ■ ■ 新 規 の InhibitEX ® Buffer により 溶 解 ステップが 大 幅 に 改 善 ■ ■ 有 害 な 有 機 化 合 物 は 不 要 ■■ QIAcube でワークフローを 自 動 化 可 能 ■■ PCR 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 除 去 ■■ ダウンストリームアッセイで 高 い 感 度 Sample QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit は、 新 鮮 あるいは 凍 結 した 糞 便 サンプルか ら 高 品 質 なゲノム DNA(ヒトおよび 細 菌 )を 迅 速 に 精 製 します。 取 り 扱 い にくい 阻 害 物 質 除 去 錠 剤 に 代 わってキットに 付 属 の 液 状 の InhibitEX Buffer は、 糞 便 サンプルに 通 常 存 在 する PCR 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 除 去 し、 手 作 業 時 間 を 大 幅 に 短 縮 します。 Suspend in InhibitEx Buffer Sample Technologies 阻 害 物 質 の 効 率 的 な 除 去 糞 便 サンプルには、 多 糖 類 複 合 体 、 胆 汁 酸 塩 、 脂 質 、および 尿 酸 などの PCR 阻 害 物 質 が 多 く 含 まれています。 最 もうまくいった 場 合 でも、これ らの 阻 害 物 質 によりターゲットを 増 幅 することが 難 しくなります。 最 悪 の 場 合 は、これらの 阻 害 物 質 の 存 在 が PCR 反 応 を 完 全 に 抑 制 されます。 従 っ て、このような 阻 害 物 質 を 完 全 に 除 去 する 方 法 は、どのような 糞 便 サンプ ルの 解 析 にも 非 常 に 重 要 です。QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit に 入 ってい る 新 規 の InhibitEX Buffer は PCR 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 除 去 し、 信 頼 性 の 高 い DNA 検 出 を 実 現 します( 下 図 )。 value Standard column purification QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit Fully automatable on the QIAcube Digest proteins Bind Wash 2x 1 2 3 4 5 6 Sample Elute PCR 阻 害 物 質 の 効 率 的 な 除 去 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit あるいは 他 のスタンダードなカラム 法 により、 糞 便 6 サンプル から DNA を 分 離 した。 C T 値 は 阻 害 物 質 に 対 して 感 受 性 の 高 い PCR システムで 測 定 した。 スタ ンダードな 精 製 法 を 用 いたほとんどのサンプルでは、 PCR 阻 害 物 質 のためターゲットが 増 幅 され なかった。 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit は DNA から 阻 害 物 質 を 効 率 的 に 分 離 し、 高 感 度 な 増 幅 が 可 能 であった。 DNA ready for downstream applications 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) キャンペーン 価 格 (¥) QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit (50) 51604 33,000 23,100 注 : 上 記 のキャンペーン 価 格 は 2014 年 7 月 31 日 受 注 分 までとなります。 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 9
10
アッセイテクノロジー Assay Technologies Sample collection Purification cDNA synthesis Amplification Analysis Assay Technologies Calculated 70 60 Calculated Experimental 60 50 Experimental 40 50 40 30 30 20 20 10 10 0 0 1– 4 0 Copy number 1– 4 Copy number 1 コピーのターゲットを 高 感 度 かつ 確 実 に 検 出 A QuantiNova Probe PCR Kit を 使 用 して 白 血 球 ゲノム DNA 中 に 存 在 するシングルコピー 遺 伝 子 CFTR を 10 4 コピーから 10 コピーに 相 当 する 30、 3、 0.3、 0.03 ng の gDNA で 検 出 し、 検 量 線 を 作 成 した。 コピー 数 に 対 する C T 値 のプロッ トは 高 い 直 線 性 を 示 した。 60 回 の 反 応 に 充 分 なマスターミッ クスをセットアップし、 理 論 的 にウェルあたり 1 コピーに 相 当 する 3 pg のテンプレート gDNA を 各 反 応 液 に 添 加 した。 60 反 応 でのコピー 数 を 決 定 するために 検 量 線 を 使 用 した。 検 量 線 を 用 いて 測 定 したコピー 数 を 計 算 されたポアソン 分 布 に 対 してマッピングした。 B 検 量 線 を 用 いたシングルコピー 定 量 の 結 果 は、 理 論 的 に 計 算 されたポアソン 分 布 との 一 致 を 示 しており、 高 い 感 度 と 確 実 性 を 証 明 している。 Detection frequency (%) (%) Copy number Copy number 30 ng DNA 3 ng ng DNA DNA 30.3 ng ng DNA DNA 0.3 0.03 ng ng DNA DNA 0.03 3 pg DNA ng DNA 3 pg DNA 1000 1000 10000 10000 100000 100000 QuantiNova Probe PCR Kit プローブを 用 いた、 感 度 と 特 異 性 の 高 い 超 高 速 リアルタイム PCR ■■ わずか 1 コピーのターゲットも 正 確 に 検 出 ■■ 1 反 応 で 複 数 の 結 果 が 得 られる duplex 能 力 ■■ 30℃で 最 長 100 時 間 まで 安 定 しており 様 々なワークフローに 最 適 ■■ バッファーの 色 の 変 化 でサンプルの 入 れ 忘 れを 回 避 ■ ■ 高 い 特 異 性 でより 良 い 結 果 を 実 現 ■ ■ 超 高 速 サイクリングによりスループット 数 を 増 大 QuantiNova Probe PCR Kit は、 低 温 度 でのミスプライミングによる 弊 害 を 回 避 できるリアルタイム PCR 試 薬 です。 抗 体 による 革 新 的 なホットスター トメカニズムをベースにした 本 キットは、プローブベースのリアルタイ ム PCR の 特 異 性 と 効 率 を 向 上 し、 様 々な PCR サイクラーで cDNA または gDNA の 正 確 な singleplex および duplex 解 析 を 実 現 します。また、 室 温 で 最 大 100 時 間 という 卓 越 した 安 定 性 により、 冷 却 の 必 要 がなく、ハイスルー プットおよび 自 動 化 ワークフローに 最 適 です。さらに、 本 キットは 正 確 なピ ペッティングを 視 覚 化 できるシステムにより 安 心 して 実 験 を 実 施 でき、 低 コピーのターゲットも 検 出 可 能 な 高 い 感 度 で 信 頼 できる 結 果 を 提 供 します。 シングルコピー DNA の 正 確 で 確 実 な 検 出 QuantiNova Probe PCR Kit の 高 い 感 度 により、わずか 1 コピーのターゲット でも 正 確 かつ 確 実 に 検 出 できます( 左 図 )。 あらゆるリアルタイムサイクラーで 一 定 した 結 果 QuantiNova Probe PCR Kit は、ほとんどのリアルタイムサイクラーで 使 用 可 能 です。passive reference 色 素 として ROX ™ 色 素 が 必 要 なサイクラー を 使 用 する 場 合 には、 別 チューブで 提 供 される ROX 色 素 を 添 加 できます。 サイクラーによって 高 速 サイクリング 能 力 に 差 があるため、サイクリング・ プロトコールが 異 なりますが、QuantiNova Probe PCR Kit は 異 なるサイク ラーを 用 いた 際 にも 一 定 した 感 度 、 再 現 性 、 効 率 を 実 現 します。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QuantiNova Probe PCR Kit (100) 208252 13,000 QuantiNova Probe PCR Kit (500) 208254 55,500 QuantiNova Probe PCR Kit (2500) 208256 222,000 10 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
11
アッセイテクノロジー QuantiNova SYBR ® Green PCR Kit SYBR Green ベースの qPCR を 用 いて 卓 越 した 結 果 ■ ■ 革 新 的 なホットスタートメカニズムにより 比 類 のない 特 異 性 ■■ バッファーの 色 の 変 化 でサンプルの 入 れ 忘 れを 回 避 ■■ わずか 1 コピーのターゲットも 正 確 かつ 確 実 に 検 出 ■ ■ 超 高 速 サイクリングによりスループット 数 とスピードを 増 大 ■■ QuantiTect ® Primer Assay と 組 み 合 わせて 良 好 な 結 果 特 異 性 、 感 度 、 速 度 、およびプロセスの 安 全 性 が 向 上 された QuantiNova SYBR Green PCR Kit は、SYBR Green をベースにした qPCR において 新 し い 基 準 を 示 しています。 革 新 的 なホットスタートメカニズムは、リアルタ イム PCR の 特 異 性 を 顕 著 に 向 上 し、また 至 適 化 済 みの 試 薬 はほとんどのリ アルタイム PCR サイクラーでわずか 1 コピーのターゲットでも cDNA や gDNA の 正 確 な 定 量 結 果 を 実 現 します。さらに、 正 確 なピペッティングを 視 覚 化 できるシステムが 組 み 込 まれています。 C T value 30 ng 3 ng 0.3 ng 0.03 ng 3 pg 0.1 1 1000 10000 Copy number Detection frequency (%) Calculated Experimental Assay Technologies 1 コピーターゲットを 高 感 度 で 検 出 QuantiNova SYBR Green PCR Kit 試 薬 の 特 殊 な 組 成 により、わずか 1 コピー のターゲットでも 正 確 かつ 確 実 に 検 出 できます( 右 図 )。この 究 極 の 感 度 は 超 高 速 サイクリング 条 件 下 でさえも 達 成 され、 最 高 の 感 度 を 必 要 とする 稀 少 な DNA サンプルを 用 いるような 難 しい 実 験 において QuantiNova SYBR Green PCR Kit は 最 高 の 選 択 肢 となります。 SYBR Green によるリアルタイム PCR で 新 基 準 を 設 定 QuantiNova SYBR Green PCR Kit は、 実 績 のある QIAGEN のバッファー テクノロジーと 革 新 的 な QuantiNova ホットスタートを 組 み 合 わせ、 様 々 なサイクリング 条 件 下 で、 比 類 のない 特 異 性 と 感 度 を 実 現 します。その 結 果 として、QuantiNova ケミストリーはお 客 様 がご 利 用 の 装 置 を 用 いた 既 存 のワークフローに 容 易 に 組 み 込 むことができます。 簡 単 な 反 応 セット アップと 超 高 速 サイクリング 条 件 下 でさえも 確 実 なパフォーマンスを 実 現 する 特 長 に 加 え、QuantiNova SYBR Green PCR Kit は 最 初 の 試 みからリア ルタイム PCR の 成 功 をお 約 束 します。 0 1–4 Copy number 1 コピーターゲットを 高 感 度 かつ 確 実 に 検 出 A QuantiNova SYBR Green PCR Kit を 用 いて 30、3、0.3、 0.03 ng の 白 血 球 ゲノム DNA からシングルコピー 遺 伝 子 IL1R2 を 検 出 し、ターゲットのコピー 数 に 対 し C T 値 をプロッ トし 検 量 線 を 作 製 した。 用 いた 容 量 は 10 ~ 10,000 個 のコピー 数 に 相 当 し、C T との 相 関 関 係 において 高 い 直 線 性 があった。 理 論 的 に 1 コピーになるように、60 回 の 反 応 で 実 際 のターゲッ トのコピー 数 を 決 めるために、 検 量 線 を 使 用 した。 反 応 液 はマ スターミックスから 分 注 したが、 統 計 的 変 動 により、1 コピー 以 上 を 含 むウェル、 何 も 含 まないウェルもいくつか 存 在 した。 B 各 反 応 で 予 想 される 理 論 的 なコピー 数 をポアソン 分 布 を 用 いて 計 算 し、 検 量 線 から 算 出 した 実 際 のコピー 数 と 比 較 した。 低 コピー 数 での 計 算 および 実 験 の 検 出 頻 度 が 非 常 に 良 く 一 致 していたことは、QuantiNova ケミストリーの 高 い 感 度 と 確 実 性 を 証 明 している。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QuantiNova SYBR Green PCR Kit (100) 208052 10,500 QuantiNova SYBR Green PCR Kit (500) 208054 50,000 QuantiNova SYBR Green PCR Kit (2500) 208056 200,000 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 11
12
アッセイテクノロジー Assay Technologies 80 100 120 140 160 180 200 ~200 DNA samples from different populations 信 頼 性 の 高 い 多 コピー 定 量 コントロールアッセイ Type-it CNV Reference Assay は、 異 なるヒト 集 団 間 でコピー 数 が 一 貫 した 多 コピー 因 子 を 基 準 としており、 汎 用 性 のある 定 量 コントロールアッセイとして 最 適 である。Type-it CNV Reference Assay の 多 コピー 因 子 は、192 人 の 健 常 者 のヒト ゲノムを 用 いて 定 量 および 検 証 されており、それらは 性 別 およ びその 他 の 集 団 間 でも 一 貫 した 結 果 を 示 した。 多 コピー 因 子 をリファレンスとして 使 用 した 確 実 な CNV 定 量 qPCR を 用 いた 18 コピーあるいは 単 一 コピー 因 子 をリファレ ンスとする 仮 定 上 の CNV 定 量 実 験 で、 多 コピー 因 子 をリファ レンスとして 使 用 する 優 位 性 を 図 式 化 した。 A グラフおよび B 表 では、CNV リファレンス 遺 伝 子 のコピー 数 変 動 (1 コピー 喪 失 または 獲 得 )がもたらす、C T 値 および 対 象 遺 伝 子 (GOI) のコピー 数 測 定 への 影 響 が 示 されている。GOI のコピー 数 測 定 の 際 に 生 じる 偽 喪 失 と 偽 獲 得 は、 単 一 コピーのリファレン ス 遺 伝 子 が 1 コピー 変 動 することによって 引 き 起 こされる。 これに 対 し、 多 コピー 遺 伝 子 をリファレンスとして 用 いた 場 合 には、リファレンス 遺 伝 子 の 1 コピー 変 動 による GOI の コピー 数 測 定 への 影 響 はなく、 高 い 精 度 でコピー 数 の 測 定 が 可 能 である。( 計 算 の 前 提 :GOI はすべてのテストサンプルに おいてコピー 数 が 変 動 しない 単 一 コピー 遺 伝 子 である。CNV 定 量 のリファレンスには 18 コピーの 因 子 または 一 倍 体 ヒトゲ ノム 上 で 単 一 コピーの 因 子 ( 二 倍 体 ヒトゲノム 上 で 36 または 2 コピー)。 Type-it ™ CNV Probe PCR +qC Kit および Type-it CNV SYBR Green PCR Kit ゲノムコピー 数 変 異 解 析 キット 近 年 の 急 速 なゲノムの 網 羅 的 解 析 の 発 達 により、 CNV (Copy Number Variation) は 患 者 だけではなく 一 般 健 常 者 集 団 にも 広 く 存 在 することが 明 らかになってきました。 臨 床 的 にも、 臨 床 症 状 に 関 与 する CNV と 一 般 健 常 者 集 団 で 観 察 されたものとを 識 別 することが 重 要 です。 また、 CNV は 民 族 集 団 によって 出 現 の 頻 度 が 異 なることが 報 告 されているた め、 ゲノム 解 析 により 検 出 された CNV が 病 態 と 関 わるかどうかを 判 断 す ることが 必 要 とされています。 QIAGEN ではジェノタイピングの 研 究 に 特 化 した 解 析 用 試 薬 、 Type-it シリーズをご 提 供 しています。 その Typeit シリーズから CNV 解 析 用 に Type-it CNV PCR +qC Kits (SYBR Green お よび Probe) をご 用 意 しました。 Calculated GOI copy number CNV reference Type-it CNV Reference Assay Single-copy gene False loss False gain No change +1 copy –1 copy Copy number of CNV quantification reference Copy number, per diploid human genome C T change (reference assay) GOI copy number (real) 18-copy element (Type-it CNV Reference) Single-copy gene; not changed Single-copy gene; copy number +/–1 GOI copy number (calculated) CNV calling for GOI 36 0 2 2.00 NC: Correct 36+1 –0.04 2 1.94 NC: Correct 36–1 +0.04 2 2.06 NC: Correct 2 0 2 2.00 NC: Correct 2+1 –0.58 2 1.33 Loss: False 2–1 +1 2 4.00 Gain: False 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Type-it CNV Probe PCR +qC Kit (100) 206662 25,500 Type-it CNV Probe PCR +qC Kit (400) 206664 90,000 Type-it CNV SYBR Green PCR +qC Kit (100) 206672 22,500 Type-it CNV SYBR Green PCR +qC Kit (400) 206674 79,500 Type-it CNV SYBR Green PCR Core Kit (400) 206624 70,500 12 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
13
アッセイテクノロジー Type-it HRM PCR Kit および Rotor-Gene ™ Type-it HRM Discovery Kit HRM(High Resolution Melt) 解 析 による 遺 伝 子 変 異 および SNP の 迅 速 かつ 正 確 な 検 出 ■■ わずかな 配 列 の 違 いも 正 確 に 検 出 ■ ■ 特 異 性 の 高 い PCR により 増 幅 困 難 な 遺 伝 子 座 を 増 幅 ■ ■ 新 しい EvaGreen 蛍 光 色 素 により 明 確 な 融 解 曲 線 ■ ■ 新 規 の HRM ジェノタイピング 解 析 実 験 系 の 設 定 を 簡 便 化 ■ ■ 簡 便 なマスターミックスフォーマットと 至 適 化 済 みのプロトコール QIAGEN PCR キット キット・プロトコールに 準 拠 時 間 至 適 化 なしで PCR 解 析 成 功 他 社 のキット 実 験 系 の 構 築 時 間 PCR 条 件 の 至 適 化 時 間 煩 雑 な 至 適 化 後 のみ PCR 解 析 が 可 能 Type-it HRM PCR Kit は HRM 解 析 による 迅 速 で 正 確 なジェノタイピングのた めの 信 頼 できる 製 品 です。 本 キットは 増 幅 困 難 なゲノム 遺 伝 子 座 でさえも 良 好 に 解 析 できるように 至 適 化 されています。 本 キットは、 変 異 のスキャ ン 用 に 最 適 であり、 未 知 の 変 異 のスクリーニングに 使 用 できます。 効 率 的 に 新 しい HRM ジェノタイピングアッセイを 確 立 します。 時 間 のかかる PCR 実 験 条 件 の 至 適 化 なしに、 非 特 異 的 な 増 幅 を 抑 え、 特 異 的 な 増 幅 産 物 および 信 頼 できる 結 果 が 一 定 して 得 られます。 本 キットは Rotor-Gene Q、 Rotor-Gene 6000、LightCycler ® 480、Applied Biosystems ® 7500 Fast System のような HRM 解 析 用 に 適 したリアルタイム PCR 装 置 において 使 用 でき ます。 Rotor-Gene Type-it HRM Discovery Kit は Rotor-Gene Q で 正 確 かつ 再 現 性 の ある HRM 解 析 ができるよう 最 適 化 されています。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) 至 適 化 実 験 なしで 良 好 な PCR 実 験 QIAGEN PCR キットは、 簡 単 な 操 作 で 信 頼 性 の 高 い 結 果 を 迅 速 に 実 現 する。 現 在 汎 用 されている 方 法 と 異 なり、QIAGEN PCR キットは PCR パラメーターの 至 適 化 が 不 要 で、アッセイ の 確 立 を 迅 速 かつ 容 易 に 行 なえる。 Normalized fluorescence 78.0 79.0 80.0 81.0 82.0 83.0 84.0 Assay Technologies Type-it HRM PCR Kit (100) 206542 19,000 Type-it HRM PCR Kit (400) 206544 68,000 Type-it HRM PCR Kit (2000) 206546 307,000 Rotor-Gene Type-it HRM Discovery Kit 206541 39,500 A/T Class IV SNP の 正 確 なジェノタイピング Type-it 2. 0HRM PCR Kit を 用 い た ヒ ト GYS1 遺 伝 子 の SNP (rs2270938)タイピングの 結 果 、Type-it HRM PCR Kit を 用 い て 得 られた Normalized melting curve は Class IV SNP の 3 種 類 のジェノタイプ( -2.0 野 生 型 、ヘテロ 接 合 体 、 変 異 体 )を 明 確 に 識 別 できたことを 示 す。 -4.0 Normalized minus wt -6.0 78.0 79.0 80.0 81.0 82.0 83.0 84.0 Rotor-Gene Q 比 類 ない 高 い 感 度 ・ 再 現 性 を 実 現 したリアルタイム 40 PCR システム リアルタイム PCR 装 置 Rotor-Gene Q は、 20画 期 的 な“ 遠 心 エアコントロール 方 式 ” を 採 用 しているため、サンプル 間 の 温 度 のばらつきをブロック 型 装 置 の 約 1/20 の ± 0.02℃まで 抑 えることに 成 功 しました。さらに 77.5 78.5加 熱 79.5 冷 却 装 80.5 置 (ペルチェ 81.5 82.5 素 子 など)の 劣 化 による 実 験 結 果 のばらつきもなく、 高 い 精 度 と 再 現 性 を 実 現 する ことが 可 能 です。Rotor-Gene Q は、 極 めて 高 い 温 度 分 解 能 を 必 要 とする HRM 解 析 や 変 異 解 析 などの 実 験 に 適 しています。 0 -10. 0 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 13 77.0 78.0 79.0 80.0 81.0 82.0 Normalized fluorescence Normalized minus wt -5.0
14
エピジェネティクス Epigenetics Sample collection Purification & bisulfite conversion DNA Amplification Analysis EpiTect ® Fast Bisulfite Conversion Kits ゲノム DNA、FFPE、 血 液 、 細 胞 または 組 織 サンプルからわずか 30 分 で 効 率 的 な Bisulfite 変 換 Epigenetics EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit Whole blood Cultured cells or tissues Bisulfite converted DNA FFPE tissues EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit EpiTect Fast Bisulfite Kit の 相 互 関 係 サンプルタイプに 応 じて DNA の Bisulfite 変 換 は 特 化 された キットとプロトコールが 必 要 。 キットには DNA 抽 出 に 至 適 化 済 みのバッファーと DNA の Bisulfite 変 換 に 必 要 な 全 試 薬 が 含 まれている。 [FU] 1000 2000 4000 EpiTect Fast Supplier Z Supplier E [nt] EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit ■ ■ 至 適 化 済 みの 操 作 で 99% 以 上 の 高 いシトシン 変 換 率 ■■ わずか 30 分 で 効 率 的 な Bisulfite 変 換 ■■ gDNA、 全 血 、 細 胞 、 組 織 、FFPE 切 片 用 に 特 化 されたソリューション ■ ■ 迅 速 で 能 率 的 な 操 作 で DNA の 効 率 的 な 変 換 と 精 製 ■■ DNA 分 解 を 回 避 する 画 期 的 な DNA Protect テクノロジー EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kit は、 様 々なスタートサンプルに 対 応 する 高 い 柔 軟 性 を 提 供 する 一 方 、わずか 30 分 で 非 メチル 化 シトシンをウラシ ルに 高 い 効 率 で 変 換 する 統 合 的 なシステムです。 効 率 の 高 い Bisulfite 変 換 反 応 効 率 がダウンストリーム 解 析 の 信 頼 性 に 非 常 に 大 きな 影 響 を 与 えるこ とから、DNA の Bisulfite 処 理 および 非 メチル 化 シトシンのウラシルへの 変 換 は、メチル 化 解 析 において 最 も 重 要 なステップです。EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kits に 入 っ て い る 革 新 的 な Bisulfite Solution に よ り、2 本 の X 染 色 体 の 1 本 が 高 度 にメチル 化 された 女 性 サンプルに 由 来 する X 染 色 体 のゲノム DNA のような 非 常 に 分 析 困 難 なサンプルでも 超 高 速 で 効 率 良 く Bisulfite 変 換 が 行 なえます。 DNA 断 片 化 を 低 減 完 全 な Bisulfite 変 換 に 必 要 な 過 酷 な 条 件 は、 高 度 な DNA 断 片 化 やサンプ ル 消 失 を 引 き 起 こすため、DNA 収 量 の 低 下 、DNA の 激 しい 断 片 化 、 再 現 性 のない 変 換 効 率 につながります。QIAGEN のユニークな DNA Protect Buffer は DNA 分 解 を 抑 えるため、 他 社 のキットで 変 換 した DNA よりも 大 きいサイズのフラグメントで 完 全 に 変 換 された DNA が 得 られます。 Bisulfite 変 換 後 の DNA フラグメントサイズの 分 析 EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit を 用 いた Bisulfite 変 換 後 、 1 µg のゲノム DNA の 断 片 化 レベルは 最 も 低 く、 フラグメントサ イズの 分 布 は 数 百 bp から 6 kb を 超 える 範 囲 であったが、 他 社 のキットでは 500 bp と 1 kb にそれぞれピークがあった。 サンプルは Agilent ® RNA 6000 Nano Chip で 解 析 した。 14 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
15
エピジェネティクス EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit EpiTect Fast 96 Bisulfite Kit QIAcube 対 応 および EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit には 特 別 に 調 製 されたバッファーと 試 薬 が 入 っており、ゲノム DNA の Bisulfite 変 換 とそれに 続 くクリーンアップを 効 率 的 に 行 ないます。 斬 新 な Bisulfite Solution がわずか 30 分 で 高 効 率 に Bisulfite 変 換 を 可 能 にする 一 方 、DNA Protect テクノロジーと QIAGEN スピンカラムは、 分 解 を 最 小 限 に 抑 えて DNA の 完 全 変 換 を 実 現 します。EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit を 用 いて、20 µl までの 容 量 で 1 ng ~ 2 µg の DNA、あるいは 最 大 容 量 40 µl で 1 ~ 500 ng の DNA が 変 換 可 能 です。 * クリーンアップに 対 応 EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit および EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit ホルマリン 固 定 パラフィン 包 埋 (formalin-fixed、paraffin-embedded;FFPE) 組 織 は EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit で 処 理 されます。 本 キットは、FFPE 組 織 切 片 の 脱 パラフィンと 溶 解 を 効 率 的 に 行 なうため の 特 殊 なバッファーが 入 った EpiTect Fast FFPE Lysis Kit と、 抽 出 した DNA の 迅 速 で 効 率 的 な Bisulfite 変 換 のための EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit で 構 成 されています。 本 プロトコールは Bisulfite 変 換 後 の クリーンアップツールを 含 み、シングルの FFPE 組 織 切 片 ( 厚 さ 10 µm)に 使 用 できます。QIAGEN の 信 頼 できる DNA Protect テクノロジーは 変 換 反 応 中 の 断 片 化 を 最 小 限 に 抑 えるため、Bisulfite 変 換 さ れた DNA を 高 収 量 で 得 られます。 EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit および EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit 全 血 、 培 養 細 胞 、 組 織 サンプルは EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit で 処 理 します。 本 キットは、 特 殊 な 溶 解 バッファーが 入 った EpiTect Fast LyseAll Lysis Kit と、DNA を Bisulfite 変 換 するための EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit で 構 成 されています。 本 プロトコールには、サンプルから DNA を 能 率 的 に 遊 離 す るための 独 自 の 配 合 成 分 を 持 つ 溶 解 バッファーを 用 いて DNA の 結 合 を 促 進 するために 至 適 化 された ステップが 含 まれています。 本 キットで 0.5 ~ 20 µl の 血 液 あるいは 10 ~ 10 5 個 の 細 胞 を 処 理 でき ます( 最 少 60 pg の DNA)。 Epigenetics 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) 精 製 DNA からの Bisulfite 処 理 変 換 およびクリーンアップ 用 EpiTect Fast Bisulfite Kit (10) 59802 12,500 EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit (50) 59824 34,500 EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit (200) 59826 117,000 EpiTect Fast 96 Bisulfite Kit 59720 129,000 FFPE 組 織 切 片 からのサンプル 溶 解 と Bisulfite 処 理 変 換 および クリーンアップ 用 EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit (50) 59844 61,500 EpiTect Fast FFPE Bisulfite Kit (200) 59846 208,000 EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit 59740 229,000 全 血 、 培 養 細 胞 あるいは 組 織 からのサンプル 溶 解 と Bisulfite 処 理 変 換 およびクリーンアップ 用 EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit (50) 59864 39,000 EpiTect Fast LyseAll Bisulfite Kit (200) 59866 134,000 EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit 59760 146,000 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 15
16
エピジェネティクス ESR1 解 析 A GeneGlobe の PyroMark CpG Assay ツールは CpG アイラ ンドにある 複 数 のターゲット 情 報 を 提 供 し、ユーザーは 解 析 するべき CpG アイランドの 特 定 領 域 を 選 択 できる。 B パイロ シークエンスのデータは ESR1 遺 伝 子 に 関 連 する CpG アイラ ンドにおける 2 つの 部 位 の 解 析 結 果 を 示 している。 PyroMark ™ CpG Assays パイロシークエンス 解 析 による 遺 伝 子 特 異 的 な DNA メチル 化 定 量 ■ ■ 高 度 なデザインアルゴリズムによりアッセイの 特 異 性 を 最 大 化 ■■ ヒト、マウスおよびラットゲノムの CpG 部 位 を 広 範 に 解 析 可 能 ■ ■ 解 析 設 定 のアッセイファイルを 簡 単 にダウンロード ■■ デザイン 済 みのアッセイが GeneGlobe ® ウェブサイトで 入 手 可 能 ■ ■ 費 用 対 効 果 の 高 い 製 品 で 最 高 のパフォーマンスを 実 現 PyroMark CpG Assay は、パイロシークエンス 解 析 用 のゲノムワイドな デザイン 済 みのメチル 化 アッセイで、 特 異 性 の 高 いアッセイと 高 精 度 な CpG メチル 化 解 析 結 果 を 実 現 するデザインアルゴリズムを 使 用 していま す。 弊 社 のアップグレードされた PyroMark CpG Assay データベースは、 現 在 ヒト、マウスおよびラットゲノムに 対 応 する 84,000 以 上 の 個 別 アッ セイを 提 供 しています。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) PyroMark CpG Assay (200) Varies 18,000 PyroMark CpG Assay 96 well (50) Varies 11,500 Epigenetics PyroMark CpG Assay 96 well (200) Varies 18,000 PyroMark Q24 Advanced Reagents パイロシークエンス 法 によるロングリード 解 析 を 強 力 にサポート する 新 しいテクノロジー ■■ ソフトウェアとケミストリーから 構 成 される Advanced テクノロジー ■■ CpG ターゲットだけは 無 く CpN ターゲットの 解 析 にも 対 応 可 能 ■■ DNA メチル 化 定 量 解 析 および 変 異 ターゲットの 定 量 解 析 の 精 度 の 向 上 PyroMark Q24 Advanced パイロシークエンス 法 による DNA メチル 化 および 遺 伝 子 変 異 定 量 解 析 装 置 PyroMarkQ24 は、パイロシークエンス 法 による 24 ウェルフォーマットのリアルタ イムシークエンス 解 析 システムで、 正 確 な 塩 基 配 列 と 各 配 列 位 置 での 塩 基 の 比 率 定 量 により DNA メチル 化 および 遺 伝 子 変 異 解 析 を 実 現 します。 PyroMark Q24 Advanced Reagents は、 従 来 に 比 較 してロングリードが 可 能 であり、 解 読 配 列 の 後 半 の 解 析 精 度 の 向 上 が 期 待 できる 新 しいテク ノロジーです。 特 に DNA メチル 化 定 量 解 析 や 複 雑 な 変 異 解 析 や 微 生 物 の 同 定 解 析 のようなシークエンス 解 析 に 最 適 です。なお、PyroMark Q24 Advanced Reagents は、PyroMark Q24 Advanced Systems に 特 化 して 最 適 化 された 試 薬 です。また、ロングリード 解 析 に 際 して dNTP が 多 く 必 要 な 場 合 は、PyroMark Q24 Advanced CpG Reagents をご 使 用 ください。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) PyroMark Q24 Advanced Reagents (4 x 24) 970902 27,500 PyroMark Q24 Advanced CpG Reagents (4 x 24) 970922 30,000 16 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
17
微 生 物 検 出 および 同 定 Microbiome Sample collection Sample disruption Purification qPCR and qRT-PCR Analysis Microbial DNA qPCR Arrays リアルタイム PCR ベースでアプリケーションに 特 化 した 微 生 物 の 同 定 またはプロファイリング ■■ アプリケーションに 着 目 した 微 生 物 ターゲットで 関 連 性 の 高 い 解 析 結 果 ■■ ラボ 検 証 済 みのアッセイを 用 いて 確 実 な 検 出 および 定 量 を 実 現 ■■ コントロールアッセイを 含 むことにより 信 頼 できる 結 果 を 提 供 ■ ■ 無 料 のデータ 解 析 ツールで 解 析 を 簡 易 化 Microbial DNA qPCR Array は、 微 生 物 種 、 毒 性 遺 伝 子 、または 抗 生 物 質 耐 性 遺 伝 子 の 同 定 とプロファイリングに 特 化 したアッセイを 搭 載 したアレイ です。 生 物 種 同 定 用 アッセイはバクテリアの 16s rRNA 遺 伝 子 とバクテリ ア DNA をターゲットし、 各 アレイにはホスト DNA、バクテリア DNA の 含 有 、PCR 反 応 を 確 認 するためのコントロールが 含 まれています。また、 アレイキットには Microbial qPCR Mastermix も 含 まれています。 本 アレイ の 簡 便 なフォーマットと 操 作 手 順 は、リアルタイム PCR 装 置 を 使 用 する いかなる 実 験 室 においても、ルーチンでの 信 頼 できる 微 生 物 遺 伝 子 の 同 定 またはプロファイリングを 可 能 にします。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Microbial DNA qPCR Arrays Varies Varies Custom Microbial DNA qPCR Arrays リアルタイム PCR ベースでアプリケーションに 特 化 した 微 生 物 の 同 定 またはプロファイリング Sample 1 G 73 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Host1 Host2 PanA/C PanB1 PanB2 PPC Sample Microbial DNA qPCR Array プレート このアレイプレートフォーマットは、 1 サンプルで 90 種 類 の 微 生 物 アッセイが 行 なえる。 各 ウェルには 独 自 のテストが 1 種 類 含 まれている。 また 宿 主 DNA、 pan-bacterial DNA、 pan-fungal DNA およびポジティブ PCR コントロールが 含 まれ ている。 表 1. Microbial DNA qPCR Arrays の 種 類 * Antibiotic Resistance Genes (1901) Bacterial Vaginosis (1401) Biodefense (1201) Food Testing: Dairy (1402) Food Testing: Meat (1202) Food Testing: Poultry (1101) Food Testing: Seafood (1102) Food Testing: Vegetable (1103) Intestinal Infections (1403) Respiratory Infections (1404) Sepsis (1903) Urinary Tract Infections (1205) Vaginal Flora (1902) Water Analysis (1505) Custom ̶ user-selected assay panels Microbiome ■ ■ 微 生 物 遺 伝 子 または 種 のプロファイリングを 可 能 にするカスタムパネル ■ ■ 高 感 度 で 特 異 的 な Microbial DNA qPCR Assay で 構 成 ■■ お 客 様 のニーズに 対 応 する 様 々なプレートレイアウト Custom Microbial DNA qPCR Array は 微 生 物 種 または 微 生 物 遺 伝 子 を 検 出 するためのユーザーが 設 定 できるアッセイです。 * それぞれのアレイに 含 まれるアッセイの 種 類 は 弊 社 ウェブ サ イ ト www.qiagen.com/JP/Prod-microbial-dna-qpcr-arrays をご 確 認 ください。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Custom Microbial DNA qPCR Array 330161 Inquire QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 17
18
微 生 物 検 出 および 同 定 LLOQ y = –3.2647x + 39.73 R² = 0.9956 2 3 4 5 6 Log target copy number 検 出 限 界 vs 定 量 下 限 グラフは 検 出 限 界 (LOD) と 定 量 下 限 (LLOQ) の 違 い を 示 している。 LOD は 陽 性 サンプルの 95%を 測 定 できる 下 限 濃 度 であり、 一 方 LLOQ は、 標 準 曲 線 の 直 線 上 にのる 下 限 濃 度 である。 LOD はアッセイの 精 度 に 依 存 し、 陽 性 サン プル 量 の 決 定 には 少 なくとも 40 回 の 再 現 性 が 求 められる。 Microbial DNA qPCR Assays においては、 アッセイの 感 度 の 決 定 には LLOQ で 十 分 である。 Microbial DNA qPCR Assays および Microbial DNA qPCR Assay Kits リアルタイム PCR ベースの 微 生 物 検 出 ■ ■ 高 感 度 および 特 異 的 な 実 験 的 に 検 証 済 みのアッセイ ■ ■ 微 生 物 種 、 毒 性 遺 伝 子 、または 抗 生 物 質 耐 性 遺 伝 子 の 検 出 ■■ シンプルな qPCR ワークフロー Microbial DNA qPCR Assay は、 定 量 リアルタイム PCR を 実 現 する 2 種 類 の PCR プライマー( 各 10 µM)および 5'- 加 水 分 解 プローブ(5 µM)の ミックスです。Microbial DNA qPCR Assay は 特 許 取 得 済 みで、 実 験 的 に 検 証 済 みのアルゴリズムを 用 いてデザインされ、 効 果 的 な PCR と 増 幅 条 件 を 提 供 します。 高 い 効 率 を 実 現 するため、ご 使 用 の 際 には Microbial qPCR Mastermixes および Microbial DNA-Free Water と 併 用 してください。 Microbial DNA qPCR Assay Kits は、Microbial DNA Positive Control、Positive PCR Control、Microbial DNA-Free Water および Microbial qPCR Mastermix が 含 まれています。 初 めてのご 使 用 される 方 にお 勧 めします。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Microbiome ΔC T ([metagenomic sample + synthetic template] – synthetic template) -1.0 -2.0 -3.0 -4.0 -5.0 -6.0 Assay 複 雑 なメタゲノム 試 料 中 の 定 量 にも 有 用 な 高 感 度 Micorbial DNA qPCR Assays 数 千 におよぶ 微 生 物 種 が 混 在 する 複 雑 なメタゲノム 試 料 の 定 量 を、 Microbial DNA qPCR Assays が 各 試 料 に 応 じ て 問 題 な く 行 な え る こ と を 確 認 す る た め、 糞 便 、 歯 垢 、 唾 液 を 用 いて 測 定 した。 各 々の 試 料 には 合 成 したテ ンプレートターゲットをスパイクし、 テンプレートター ゲットのみの 場 合 と C T 値 を 比 較 した。 PCR には 次 の 各 サ ンプルを 使 用 :プールされたテンプレートターゲットの み、 糞 便 、 糞 便 に プ ー ル さ れ た テ ン プ レ ー ト タ ー ゲ ッ ト、 歯 垢 、 歯 垢 に プ ー ル さ れ た テ ン プ レ ー ト タ ー ゲ ッ ト、 唾 液 、 唾 液 にプールされたテンプレートターゲット。 糞 便 、 歯 垢 、 あるいは 唾 液 のみの 場 合 で C T 値 が 35 以 下 の ときに ∆C T を 算 出 した ( 例 ; 糞 便 のみの 場 合 の C T 値 – プー ルされたテンプレートターゲットの C T 値 )。 この 計 算 は 全 て のアッセイに 対 して 行 なわれた。 各 アッセイにおいて ∆C T が 3 より 小 さいということは、 Microbial DNA qPCR Assays の 結 果 が、 複 雑 なメタゲノムのバックグラウンドの 影 響 を 受 け ていないことを 示 唆 している。 Microbial DNA qPCR Assays 330025 69,500 Microbial DNA qPCR Assay Kit 330033 28,000 Microbial DNA qPCR Multi-Assay Kits リアルタイム PCR ベースの 微 生 物 検 出 または 同 定 および プロファイリング ■■ qPCR ベースの 微 生 物 検 出 用 アッセイ、コントロールおよび 試 薬 キット ■ ■ 実 験 的 に 検 証 済 みの Microbial DNA qPCR Assay を 含 む ■■ 5' 加 水 分 解 プローブを 用 いた 感 度 および 特 異 性 の 高 い 検 出 Microbial DNA qPCR Multi-Assay Kits は、リアルタイム PCR ベースの 微 生 物 検 出 のための 完 結 したソリューションです。それぞれのキットには、 定 量 リアルタイム PCR を 実 現 する 2 種 類 の PCR プライマー( 各 10 µM)の ミックスおよび 1 種 類 の 5' 加 水 分 解 プローブ(5 µM)の Microbial DNA qPCR Assay が 含 まれています。さらに qPCR を 成 功 させるために 必 要 な Microbial DNA Positive Control、Positive PCR Control、Microbial DNA-Free Water および Microbial qPCR Mastermix も 含 まれています。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Microbial DNA qPCR Multi-Assay Kits Varies Varies 18 www.qiagen.co.jp QIAGEN Issue 1/2014
19
微 生 物 検 出 および 同 定 Supplemental Microbial qPCR Mastermix (Fluorescein) または Supplemental Microbial qPCR Mastermix (ROX) Microbial DNA qPCR Assays 用 マスターミックス Supplemental Microbial qPCR Mastermix は ROX または Fluorescein をリファレンス 色 素 として 用 いる、 5' 加 水 分 解 プローブベースの 検 出 のためのリアルタイム PCR アプリケーションに 使 用 します。この supplemental mastermix は、Microbial DNA qPCR Array および Assay Kit で、 自 動 分 注 システムを 用 いる 場 合 に 必 要 な 追 加 分 のマスターミックスとしても 使 用 できます。Microbial qPCR Mastermix は リアルタイム PCR バッファー、 高 性 能 なホットスタート DNA Taq ポリメラーゼ、ヌクレオチドが 含 まれており、さらにご 使 用 のサイクラーに 合 わせた Fluorescein または ROX 色 素 が 含 まれているキッ トをお 選 びいただきます。 化 学 修 飾 され 厳 密 にコントロールされたホットスタート 酵 素 は、プライ マーダイマーおよびその 他 の 非 特 異 的 な 産 物 の 増 幅 を 防 ぐことで、 比 類 のない 正 確 な 5' 加 水 分 解 プ ローブによる 結 果 を 提 供 します。 また、Microbial DNA qPCR Assays をご 使 用 の 際 は、ご 使 用 のサイクラーに 合 わせて Supplemental Microbial qPCR Mastermix をお 選 びください。 Microbial DNA Positive Control Microbial DNA qPCR Assays でのポジティブコントロール Microbial DNA Positive Control は、 各 Microbial DNA qPCR Assay のターゲットになることで、 各 Microbial DNA qPCR Assay の 機 能 性 を 検 証 する 合 成 DNA のプールです。Microbial DNA Positive Control は、10 倍 濃 縮 で 提 供 されるため、Microbial DNA-Free Water で 希 釈 する 必 要 があります。 Microbial DNA-Free Water Microbial DNA qPCR 製 品 と 使 用 Microbial DNA-Free Water は 分 子 生 物 学 グレードのヌクレアーゼフリー 水 で、ゲノム DNA のコンタ ミを 除 去 するためにフィルター 滅 菌 と UV 処 理 がされています。 品 質 はバクテリアおよび 菌 類 DNA に 反 応 する Microbial DNA qPCR Assay のパネルで PCR により 検 証 済 みです。Microbial DNA-Free Water をテンプレートとして 使 用 した PCR アッセイにおいてポジティブ 反 応 が 無 い 場 合 にロットが 検 査 を 通 過 します。この 厳 密 なプロセスは Microbial DNA qPCR Assay または Array 実 験 の 結 果 を 最 も 正 しいものにさせることができます。 Microbiome 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Supplemental Microbial qPCR Mastermix (Fluorescein) 330540 29,000 Supplemental Microbial qPCR Mastermix (ROX) 330530 29,000 Microbial DNA Positive Control 338134 6,800 Microbial DNA-Free Water 338132 9,700 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 19
20
食 品 試 験 ポートフォリオ Food Safety Testing pre-treatment Sample preparaiton Assay setup Detection mericon ™ Sample Preparation Kits 増 菌 培 養 液 および 生 鮮 / 加 工 食 品 からの 高 品 質 DNA 精 製 ■ ■ 改 良 CTAB 法 により 食 品 検 体 から DNA を 迅 速 に 精 製 ■ ■ 加 工 食 品 中 の 断 片 化 した DNA でも 効 率 的 に 精 製 ■■ グラム 陰 性 菌 および 陽 性 菌 を 迅 速 かつ 効 率 的 に 溶 解 ■ ■ 複 合 食 品 マトリックスから PCR 阻 害 物 質 を 除 去 mericon Sample Preparation Kits は、 病 原 体 の 増 菌 培 養 液 (mericon DNA Bacteria および Bacteria Plus Kits)や 生 鮮 / 加 工 食 品 (DNeasy ® mericon Food Kit)のような 様 々なサンプルから 高 品 質 な 核 酸 を 精 製 するようにデザインされています。 複 合 食 品 マトリックスからの PCR 阻 害 物 質 の 混 入 は 最 小 限 に 抑 えられます。 精 製 された 高 純 度 な DNA は、mericon PCR Assay Kits を 用 いてリアルタイム PCR による 原 材 料 解 析 、 病 原 体 検 出 、GMO 中 の DNA 検 出 や 定 量 のようなアプリケーションに 最 適 です。 微 生 物 増 菌 培 養 mericon DNA Bacteria Kit グラム 陰 性 菌 からの DNA 抽 出 テンプレート DNA DNeasy mericon 96 QIAcube HT Kit 様 々な 食 品 サンプルからの ハイスループット DNA 自 動 精 製 食 品 サンプル mericon DNA Bacteria Plus Kit グラム 陽 性 菌 からの DNA 抽 出 DNeasy mericon Food Kit 様 々な 食 品 タイプからの DNA 精 製 Food Safety Testing mericon PCR Assays リアルタイム PCR による 検 出 食 品 安 全 性 試 験 ワークフローの 2 つの 流 れ 病 原 体 、 遺 伝 子 組 み 換 え 体 、 または 動 植 物 由 来 成 分 を 使 用 するどのような 試 験 であっても、 mericon 食 品 安 全 性 試 験 ポートフォリ オは、 効 率 的 なサンプル 調 製 ワークフローと 完 全 に 標 準 化 された 検 出 プロトコールを 備 えたソリューションを 提 供 。 mericon PCR アッセイ すべての mericon リアルタイム PCR キットは 同 一 のサイクリング 条 件 ですべてのターゲットに 使 用 できるよう 標 準 化 されています。 n 食 品 由 来 の 病 原 体 検 出 n 原 材 料 解 析 n 遺 伝 子 組 み 換 え 作 物 由 来 の DNA 検 出 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) DNeasy mericon Food Kit (50) QIAcube 対 応 69514 23,500 mericon DNA Bacteria Kit (100) 69525 17,000 mericon DNA Bacteria Plus Kit (50) 69534 17,000 DNeasy mericon 96 QIAcube HT Kit (5) QIAcube HT 対 応 69571 147,000 20 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
21
動 物 感 染 症 の 病 原 体 検 出 Animal & veterinary Testing pre-treatment Sample preparaiton Assay setup Detection QIAamp cador ™ Pathogen Mini Kit QIAcube 対 応 様 々な 動 物 サンプル 種 からウイルス RNA/DNA およびバクテリア DNA を 精 製 ■■ ウイルス RNA/DNA、バクテリア DNA 精 製 を 同 じプロトコールで 実 現 ■ ■ 全 血 、 血 清 、 組 織 など 様 々なサンプルに 対 応 ■ ■ 未 希 釈 の 動 物 の 全 血 中 のウイルス RNA 精 製 にも 最 適 ■ ■ 阻 害 物 質 や 不 純 物 を 効 率 的 に 除 去 ■ ■ 分 離 した 核 酸 はリアルタイム PCR/RT-PCR 解 析 に 即 使 用 可 能 QIAamp cador Pathogen Mini Kit は、 希 釈 されていない 全 血 、 血 清 、スワ ブ、 組 織 などの 様 々な 動 物 サンプルからウイルス RNA/DNA やバクテリア DNA の 精 製 を 簡 便 化 します。 簡 単 で 迅 速 なスピンカラム 法 により、コン タミや 阻 害 物 質 を 除 去 し、リアルタイム PCR や RT-PCR のようなアプリケー ションに 即 使 用 できる 病 原 体 由 来 の 核 酸 を 精 製 します。 Bovine blood 1 Bovine blood 2 Ovine blood BVDV QIAamp cador Pathogen Mini Kit cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit Ovine serum Bovine serum Kidney lysate Liver lysate cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit 様 々な 動 物 サンプルからウイルス RNA/DNA および バクテリア DNA のハイスループット 自 動 化 精 製 ■ ■ 簡 便 で 信 頼 できる 自 動 化 精 製 により 費 用 と 時 間 の 節 約 が 可 能 ■■ 1 つの 共 通 機 器 プロトコールでウイルス RNA および DNA、バクテリア DNA の 抽 出 ■ ■ 全 血 、 血 清 、 組 織 など 様 々な 動 物 サンプルに 対 応 ■ ■ 阻 害 物 質 や 不 純 物 を 効 率 的 に 除 去 QIAcube HT ■ ■ 分 離 した 核 酸 はリアルタイム PCR/RT-PCR 解 析 に 即 使 用 可 能 対 応 cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit は、QIAcube HT システムを 用 いた 幅 広 い 動 物 サンプルからのウイルス RNA と DNA、バクテリア DNA の 簡 便 な 自 動 精 製 を 実 現 します。 便 利 な 96 ウェルフォーマットでの、 実 績 のある QIAamp のシリカメンブレンテクノロジーを 用 いることで、 夾 雑 物 および 阻 害 物 が 除 去 されたダウンストリーム 解 析 に 即 使 用 可 能 な 高 品 質 の 病 原 体 核 酸 が 得 られます。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAamp cador Pathogen Mini Kit (50) 54104 25,000 QIAamp cador Pathogen Mini Kit (250) 54106 112,000 cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit (5) 54161 122,000 Bovine blood 1 Bovine blood 2 Ovine blood Salmonella Ovine serum Bovine serum 動 物 感 染 症 の 病 原 体 検 出 用 アッセイ n ウイルス RNA 検 出 用 アッセイ virotype シリーズ n バクテリア DNA 検 出 用 アッセイ cador シリーズ bactotype QIAamp cador Pathogen Mini Kit cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit Kidney lysate Liver lysate ウイルス RNA とバクテリア DNA の 同 時 分 離 BVDV 粒 子 と Salmonella 細 胞 の 一 定 量 を、 様 々な 動 物 サン プルに 同 時 に 添 加 した。サンプルは、QIAcube HT と cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit で、あるいは QIAamp cador Pathogen Mini Kit を 用 いてマニュアルで 並 行 して 処 理 した。 同 時 に 分 離 したウイルス RNA とバクテリア DNA は、 自 社 アッ セイを 用 いて 同 定 した。 A BVDV および B Salmonella での 平 均 C T 値 。エラーバー(3 replicates 抽 出 実 験 の ±1 SD)が 小 さ いことは、 両 方 の 精 製 法 が 高 精 度 であることを 示 す。 Animal & veterinary Testing QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 21
22
個 人 識 別 および 法 医 学 サンプル Human Identity & Forensic Testing pre-treatment Sample preparaiton Assay setup Quantification STR analysis QIAGEN Quality Management System QIAGEN は 一 貫 して 高 品 質 の 製 品 を 提 供 するため、 効 果 的 な 品 質 管 理 システム(Quality Management System;QMS)を 運 用 しています。 当 社 のシステムは 以 下 を 含 む 主 要 な QMS 基 準 で 規 定 される 規 制 要 件 に 従 って 設 計 および 維 持 されています。 ■■ ISO 9001 ■■ ISO 13485、CMDCAS における ISO 13485 ■ ■ 米 国 FDA 21CFR Part 820 ■ ■ 厚 生 労 働 省 令 第 169 号 ■ ■ MPG(BGB1IS.3146)、IVDD 98/79 EC、MDD 93/42/EEC を 含 む 指 令 ■ ■ 台 湾 Technical Cooperation Program(TCP) ■■ その 他 の 国 際 規 制 および 国 際 基 準 Certified Management System EN ISO 9001 EN ISO 13485 高 品 質 な Investigator ソリューション QIAGEN の 各 Investigator Kit は、 優 れた 製 品 品 質 を 保 証 するために 様 々な 専 用 の 基 準 を 満 たしています。 ■■ クリーンルーム 環 境 での 製 造 ■ ■ 自 動 化 生 産 およびエチレンオキサイド(EO) 処 理 ■ ■ 製 造 後 のヒト DNA 非 存 在 確 認 ■ ■ 試 験 成 績 書 (CoA) ■■ コンタミネーション 除 外 データベース ■ ■ 製 品 の 評 価 すべての Investigator Kit は ISO 認 証 を 受 けた 施 設 で 製 造 されています。さらに 一 貫 した 高 品 質 を 維 持 するため、キットの 各 ロットがあらかじめ 定 められた 規 格 に 適 合 しているか 検 査 を 行 なっています。 QIAGEN はお 客 様 にご 満 足 いただけるよう、 自 社 のソリューションやサービスの 質 を 常 に 向 上 させる ことを 目 指 しています。 Human Identity & Forensic Testing QIAGEN forensic grade QIAGEN の 新 しい Forensic Grade ラベルは、 上 記 の 品 質 保 証 手 順 や 個 人 識 別 および 法 医 学 試 験 のため の 厳 格 な 品 質 管 理 基 準 を 満 たしていることを 示 しています。 22 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
23
個 人 識 別 および 法 医 学 サンプル Investigator Lyse&Spin Basket Kit 簡 便 なサンプル 前 処 理 および 高 い 核 酸 回 収 率 ■ ■ 法 医 学 サンプルの 効 率 的 な 前 処 用 製 品 ■■ 56℃で 最 長 16 時 間 の 溶 解 を 漏 れなしに 実 現 ■■ ライセートのろ 過 と 10 µm 以 上 の 固 形 物 質 を 保 持 するバスケット ■ ■ 固 形 物 質 の 保 存 用 コレクションチューブも 同 梱 ■■ エチレンオキサイド 処 理 された 個 別 包 装 製 品 Investigator Lyse&Spin Basket Kit は、EZ1 DNA Investigator Kit、 QIAsymphony ™ DNA Investigator Kit、あるいは QIAamp DNA Investigator Kit のようなマニュアルあるいは 自 動 抽 出 用 キットと 組 み 合 わせて、 法 医 学 サンプルの 前 処 理 に 使 用 できます。 簡 便 な 操 作 でサンプル 溶 解 および 固 形 サンプル 物 質 の 分 離 を 一 つの 工 程 で 行 なえます。 構 成 パーツが 既 に 組 み 合 わされており、サンプルを 移 す 際 の 面 倒 な 操 作 が 不 要 で、その 結 果 操 作 工 程 における 安 全 性 が 増 大 します。この 方 法 は、スワブ、 布 片 や 皮 革 片 、 紙 、 タバコの 吸 殻 、チューインガム、 小 さなテープ、その 他 のサンプル 種 に 使 用 できます。 Sample Spin basket 2ml tube 1 ATL/PK lysis buffer Lysis Lysate separation Lyse&Spin Basket の 操 作 手 順 法 医 学 サンプルの 溶 解 中 、 溶 解 バッファーはバスケット 内 に 保 持 されている。 一 般 的 な 卓 上 遠 心 器 を 用 いて 遠 心 すると、バスケットの 底 の 穴 が 開 き、サンプルライセートがバスケットから 流 出 する。 核 酸 を 含 むライセートは 効 率 的 に 回 収 され、 同 梱 の 2 ml コレクションチューブに 採 集 さ れるが、 固 形 物 質 はバスケット 内 に 留 まる。 固 形 サンプル 物 質 が 残 っている 使 用 済 みのバスケッ トは、 同 梱 の 2 つ 目 のコレクションチューブ 内 で 保 存 することが 可 能 である。 Lysate 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) Investigator Lyse&Spin Basket Kit (50) 19597 6,000 2 ml tube 2 QIAamp DNA Investigator Kit 法 医 学 、 個 人 識 別 鑑 定 サンプルからのトータル DNA 精 製 ■ ■ 高 品 質 で 即 使 用 可 能 な DNA の 迅 速 な 精 製 ■ ■ 一 定 した 高 い 収 量 ■ ■ 夾 雑 物 および 阻 害 物 質 の 完 全 除 去 QIAcube 対 応 QIAamp DNA Investigator Kit は、ケースワークや 犯 罪 現 場 のサンプル、 乾 燥 血 液 、 骨 、 性 的 暴 行 サンプル、スワブ、フィルターのような 法 医 学 、 個 人 識 別 鑑 定 サンプルから 高 品 質 なゲノム DNA を 精 製 します。 製 品 名 Cat. no. 価 格 (¥) QIAamp DNA Investigator Kit (50) 56504 33,500 1200 D3S1358 vWA D16S539 D2S1338 100 150 200 250 300 350 2400 1600 D8S117 D21S11 D18S51 100 150 200 250 300 350 TH01 1200 D19S43 100 150 200 250 300 350 チューインガムから 精 製 した DNA で 良 好 な STR 解 析 チューインガムから QIAamp DNA Investigator Kit を 用 いて トータル DNA を 精 製 した。GeneMapper ® ID Software v3.2.1 (Applied Biosystems)を 用 いて STR 解 析 を 行 なった。 Human Identity & Forensic Testing QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 23
24
DNA セレクションガイド ゲノム DNA サンプル 調 製 テクノロジー(ヒト) QIAamp DNA Blood Kits QIAamp DNA Mini Kit QIAamp DNA Micro Kit QIAamp DNA Stool Mini Kit QIAamp DNA Investigator Kit QIAamp MinElute ® Media Kit QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit QIAamp DNA FFPE Tissue Kit QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit QIAamp UCP Pathogen Mini Kit サンプルタイプ マニュアル 全 血 * n n n n n n n n 血 清 、 血 漿 (ウイルス DNA) n n n 血 清 、 血 漿 n † † † ( 細 胞 外 DNA) 輸 送 ・ 保 存 液 中 の 検 体 尿 n n n CSF(ウイルス DNA) n ‡ n ‡ 唾 液 および 口 腔 洗 浄 液 n n n バフィコート n n 白 血 球 骨 髄 n n 乾 燥 血 斑 n n 組 織 * n n n n § 骨 n n パラフィン 包 埋 組 織 n n § LMD 採 取 した 組 織 糞 便 * n n 寄 生 虫 n n 培 養 細 胞 n n 培 養 液 スワブと 口 腔 細 胞 n n n n n n 法 医 学 および 個 人 識 別 鑑 定 サンプル QIAamp UCP PurePathogen Blood Kit MagAttract ® HMW DNA Kit Gentra ® Puregene ® Blood Kit Gentra Puregene Buccal Cell Kit QIAamp MinElute Virus Kits QIAamp UltraSens Virus Kit PAXgene ® Blood DNA Kit PAXgene Tissue DNA Kit n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット * バクテリアおよびウイルス DNA を 含 む。 循 環 血 液 中 の 遊 離 DNA あるいは RNA を 含 む。 ウイルス RNA も 精 製 可 能 。 PAXgene Tissue Container と 組 み 合 わせて 使 用 。 24 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
25
DNA セレクションガイド ゲノム DNA サンプル 調 製 テクノロジー( 動 物 、 植 物 、 微 生 物 ) DNeasy Blood & Tissue Kit DNeasy Plant Mini and Maxi Kits QIAamp DNA Stool Mini Kit MagAttract HMW DNA Kit QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit QIAamp DNA FFPE Tissue Kit Gentra Puregene Cell Kit Gentra Puregene Buccal Cell Kit Gentra Puregene Tissue Kit Gentra Puregene Yeast/Bact. Kit Gentra Puregene Mouse Tail Kit mericon DNA Bacteria Kit DNeasy mericon Food Kit サンプルタイプ シングルプレップ・フォーマット 動 物 血 液 ( 無 核 赤 血 球 ) n n 動 物 血 液 ( 有 核 赤 血 球 ) n n 動 物 口 腔 スワブ n* n n* 動 物 乾 燥 血 液 斑 n* n* 動 物 の 耳 /ネズミ 尾 n n n 動 物 糞 便 n n mericon DNA Bacteria Plus Kit 96 ウェル プレート 動 物 組 織 n n n バクテリア (グラム 陰 性 / 陽 性 ) n n n n 細 胞 n n n 固 定 組 織 (ホルマリン、パラフィン) n n n 菌 類 n n 毛 髪 n n 昆 虫 n n 植 物 組 織 n n 唾 液 n † n 土 壌 n † 酵 母 n n n 食 品 食 品 由 来 病 原 体 増 菌 培 養 液 (グラム 陰 性 / 陽 性 ) n n § DNeasy 96 Blood & Tissue Kit DNeasy 96 Plant Kit n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット * QIAGEN プロトコールはないが、 弊 社 およびカスタマーのデータは 入 手 可 能 。 ユーザー 開 発 プロトコール。 詳 細 は 弊 社 テクニカルサポートに 問 い 合 わせるか www.qiagen.co.jp を 参 照 。 AllPrep DNA/RNA Kit はゲノム DNA およびトータル RNA の 同 時 精 製 が 可 能 。AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit はさらにタンパク 質 の 同 時 精 製 が 可 能 。 グラム 陰 性 菌 のみ。 QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 25
26
RNA セレクションガイド 特 殊 な 組 織 からのRNA 精 製 RNeasy Kits* RNeasy Fibrous Tissue Kits RNeasy Plus Universal Kits † RNeasy Plus Micro Kit RNeasy FFPE Kit ‡ 脂 肪 組 織 n n PAXgene Bone Marrow RNA System 大 動 脈 n n n n 骨 n n 骨 髄 液 n n 脳 n n n 胸 部 組 織 n n n 軟 骨 n n n 眼 組 織 n n n n 腺 組 織 n n n 心 臓 n n n n 腸 n n n n 腎 臓 n n n n 肝 臓 n n n n 肺 n n n n リンパ 節 組 織 n n n 筋 肉 n n n n 神 経 細 胞 n n n 膵 臓 n n n n 皮 膚 ( 豚 /ヒト) n n n 皮 膚 (ラット/マウス) n n n n 脾 臓 n n n n 胃 n n n n 精 巣 組 織 n n n n 胸 腺 n n n n 舌 n n n n 子 宮 n n n n 微 量 の 組 織 サンプル(≤5 mg) n n n FFPE 組 織 切 片 RNAlater RNA Stabilization Reagent Allprotect Tissue Reagent (DNA、RNA、タンパク 質 安 定 化 ) 骨 髄 液 と FFPE 組 織 以 外 の サ ン プ ル は、 TissueRuptor ™ あるいは TissueLyser II で 破 砕 とホモジナイズが 可 能 。 n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット n: 未 検 証 * 以 下 の キットでも 精 製 可 能 :RNeasy Protect Kits、RNeasy Plus Kits、AllPrep K i t s、 E Z1 R N A T is s u e M ini K i t、 QIAsymphony RNA Kit 以 下 のキットでも 精 製 可 能 :RNeasy 96 Universal Tissue Kits、miRNeasy Kits、 PAXgene Tissue RNA Kit、PAXgene Tissue miRNA Kit、EZ1 RNA Universal Tissue Kit miRNA 精 製 には miRNeasy FFPE Kit を ご 使 用 ください。 26 www.qiagen.co.jp QIAGEN Product News Issue 1/2014
27
RNA セレクションガイド RNA 安 定 化 選 択 ガイド アプリ ケーション 採 取 、 安 定 化 、 精 製 RNA、DNA、 タンパク 質 の 安 定 化 RNA の 安 定 化 RNA の 安 定 化 と RNA 精 製 サンプルタイプ ヒト 全 血 (RNA 精 製 ) n* ヒト 骨 髄 (RNA 精 製 ) 動 物 全 血 (RNA、 miRNA 精 製 ) ヒト 組 織 (RNA、 miRNA、DNA 精 製 ) 組 織 RNeasy Protect Cell Mini Kit PAXgene Blood RNA System RNeasy Protect Kits QIAcube 上 で 自 動 化 可 能 RNeasy Protect Bacteria Kits Allprotect Tissue Reagent RNAlater TissueProtect Tubes PAXgene Bone Marrow RNA System PAXgene Tissue System n † マニュアル RNAprotect Bacteria Reagent RNeasy Protect Saliva Mini Kit RNAlater RNA Stabilization Reagent RNAprotect ® Cell Reagent 組 織 n ‡ n 細 胞 n § バクテリア ヒト 唾 液 n § 組 織 細 胞 n § バクテリア RNeasy Protect Animal Blood System 特 殊 な 組 織 を Allprotect Tissue Reagent および RNAlater RNA Stabilization Reagent で 安 定 化 する 際 の 適 応 状 況 は、 裏 面 の 選 択 ガイドを 参 照 してください。 n: 推 奨 するキット : 適 応 するキット * QIAcube 上 での 自 動 化 には、ユーザー 登 録 が 必 要 です。BioRobot ® Universal System、QIAsymphony SP を 用 いた 自 動 化 精 製 も 可 能 です。 組 織 の 形 態 を 良 好 に 保 存 。 組 織 の 採 取 および 安 定 化 を 実 現 。 DNA も 安 定 化 。 各 製 品 のより 詳 細 な 情 報 は 弊 社 ウェブサイト(www.qiagen.co.jp)でご 検 索 ください。 本 誌 に 記 載 の 価 格 は 希 望 小 売 価 格 です。 本 誌 に 記 載 の QIAGEN 製 品 は 研 究 用 です。 疾 病 の 診 断 、 治 療 または 予 防 の 目 的 には 使 用 することはできません。 最 新 のライセンス 情 報 および 製 品 ごとの 否 認 声 明 に 関 してはウェブサイト www.qiagen.co.jp の“Trademarks and Disclaimers”をご 覧 ください。QIAGEN キットの Handbook および User Manual は www.qiagen.co.jp から 入 手 可 能 です。 Trademarks: QIAGEN ® , QIAcube ™ , QIAamp ® , QIAsymphony ™ , QuantiTect ® , AllPrep ® , BioRobot ® , cador ™ , PDNeasy ® , Gentra ® , GeneGlobe ® , EpiTect ® , MagAttract ® , MinElute ® , mericon ™ , Puregene ® , PyroMark ™ , REPLI-g ® , RNAprotect ® , RNeasy ® , Rotor-Gene ™ , Type-it ™ , InhibitEX ® (QIAGEN Group); Agilent ® (Agilent Technologies, Inc.); Illumina ® , MiSeq ® (Illumina, Inc.); Applied Biosystems ® , ROX ™ , GeneMapper ® , LightCycler ® , SYBR ® (Life Technologies, Inc.); PAXgene ® (PreAnalytiX GmbH); Excel ® , Microsoft ® (Microsoft Corporation). QR コード /QR Code は 株 式 会 社 デンソーウェーブの 登 録 商 標 です。 “RNAlater ® ” is a trademark of AMBION, Inc., Austin, Texas and is covered by various U.S. and foreign patents. 本 文 に 記 載 の 会 社 名 および 商 品 名 は、 各 社 の 商 標 または 登 録 商 標 です。 © 2014 QIAGEN, all rights reserved QIAGEN Product News Issue 1/2014 Sample & Assay Technologies 27
28
製 品 のご 注 文 は 販 売 店 にお 願 い 致 します。 販 売 店 www.qiagen.co.jp 株 式 会 社 キアゲン n 〒 104-0054 n 東 京 都 中 央 区 勝 どき 3-13-1 n Forefront Tower II Tel:03-6890-7300 n Fax:03-5547-0818 n E-mail:techservice-jp@qiagen.com 2302182 05/2014 Sample & Assay Technologies