PyroMark CpG Assays

パイロシークエンス解析による遺伝子特異的なDNAメチル化の定量

  • 高度なデザインアルゴリズムによりアッセイの特異性を最大化
  • ヒトおよびマウスゲノムのCpG部位を広範に解析可能
  • 解析設定のアッセイファイルを簡単にダウンロード
  • デザイン済みのアッセイがGeneGlobeウェブサイトで入手可能
  • 費用対効果の高い製品で最高のパフォーマンスを実現
PyroMark CpG Assayは、パイロシークエンス解析用のゲノムワイドなデザイン済みのメチル化アッセイで、特異性の高いアッセイと高精度なCpGメチル化解析結果を実現するデザインアルゴリズムを使用しています。弊社のアップグレードされたPyroMark CpG Assayデータベースは、現在ヒトやマウスゲノムに対応する60,000以上の個別アッセイを提供しています。
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  • Cat. no. (e.g., SI00299551, QT01342509)
  • Sanger ID or Accession (e.g., hsa-let-7b, MI0000063)
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PyroMark CpG Assay (200)
PCR and sequencing primers for Pyrosequencing analysis of gene-specific CpG methylation after DNA bisulfite conversion (200 reactions; tube format)
Varies
87,60 €
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PyroMark CpG Assay 96 plate (50)
PCR and sequencing primers for Pyrosequencing analysis of gene-specific CpG methylation after DNA bisulfite conversion (50 reactions; plate format); minimum order of 24 assays per plate
Varies
58,50 €
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PyroMark CpG Assay 96 plate (200)
PCR and sequencing primers for Pyrosequencing analysis of gene-specific CpG methylation after DNA bisulfite conversion (200 reactions; plate format); minimum order of 24 assays per plate
Varies
87,60 €
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PyroMark CpG Assays are intended for molecular biology applications. These products are not intended for the diagnosis, prevention, or treatment of a disease.


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Analysis of ESR1.|High PCR success rate, even with bisulfite converted DNA.|High Pyrosequencing success rate of predesigned PyroMark CpG Assays.|Ready-to-use methylation assays.|
[A] The GeneGlobe interface for PyroMark CpG Assays affords access to multiple targets in CpG islands, which allows the user to pick and choose the particular regions in a CpG island to analyze. [B] Pyrosequencing data show the analysis of two different positions within the CpG island associated with the gene ESR1.|The PCR performance of PyroMark CpG Assays for 310 randomly selected genes was evaluated. A total of 305 assays (98%) resulted in the predicted PCR amplicon, usable as template for subsequent Pyrosequencing.|The Pyrosequencing performance of PyroMark CpG Assays for 310 randomly selected genes was evaluated. A total of 305 assays (98%) resulted in the predicted PCR amplicon, usable as template for subsequent Pyrosequencing. From these assays, 281 resulted in successful Pyrosequencing results. Of these successful assays, 229 (75.1%) required no further review by the user, and 52 (17%) were successful after user review. Only 24 (7.9%) evaluated assays failed.|The GeneGlobe interface for searching and ordering PyroMark CpG Assays provides access to multiple targets in CpG islands, allowing users to pick and choose the exact regions in a CpG island for analysis. By combining different assays, users can quantify methylation of as many target sites as needed, whether these are consecutive or not.|
Performance
デザイン済みのPyroMark CpG Assaysは、ヒトやマウスゲノムのほとんどのCpG部位におけるCpGメチル化レベルを正確に測定するために最適なアッセイです(図“ESR1の解析”)。
Principle

PyroMark CpG Assay はゲノム上に存在する特定ターゲットのメチル化解析を実現します。パイロシークエンス解析用にデザイン済みのメチル化アッセイは、bisulfite変換後のゲノムDNA情報をベースに、最適なアッセイデザインを実現するアルゴリズムを使用しています。このようなアッセイを迅速かつ簡単に注文できるのでアッセイの至適化に必要な時間を最小限に抑え、解析成功率の最大化を実現します。最適化されたPyroMark専用の製品群であるPCR試薬や シークエンシング試薬と組み合わせて使用することにより、 PyroMark CpG Assayは、能率的なパイロシークエンス解析のワークフローを拡大し、ヒトあるいはマウスゲノム上の様々なCpGアイランドのメチル化解析が可能です。

至適化済みのプライマー

PyroMark CpG Assay のPCR 用プライマーおよびシークエンシング用プライマーは、ともに高度なアルゴリズムによりデザインされています。それらのプライマーは全ヒトおよびマウスゲノムに対してチェック済みで、PCR特異性を高めるために最適な濃度でお届けしています。PyroMark PCR Kitの至適化済み試薬と組み合わせた最適な条件により、この至適化はシークエンシングテンプレートの収量と品質、さらにアッセイの信頼性も増大します。

GeneGlobeの特長

QIAGENの GeneGlobeポータルサイトは遺伝子あるいはパスウェイに関連する様々なアッセイテクノロジー情報を得ることができるオンラインインターフェースです。GeneGlobe は最先端の検索およびデザイン用アルゴリズム、最新の配列データ、画期的なテクノロジーを提供し、皆様の研究を促進します。GeneGlobeで目的の遺伝子あるいはパスウェイに関する検索項目を入力するだけで、エピジェネティクスあるいは他の分野におけるお客様の研究を支援する情報をお届けします(図“即使用可能なメチル化アッセイ”)。

Procedure
パイロシークエンス法を実施する前に、bisulfite変換済みのDNAからビオチン標識されたPCR産物が産生されます。ビオチン標識されたPCR 産物はストレプトアビジンでコーティングしたセファロースビーズに結合します。これらのビーズはその後PyroMark Vacuum Workstation上のVacuum Prep Tool により捕集され、十分に洗浄された後、シークエンシング用に最適な一本鎖DNA が調製されます。PyroMark CpG Assaysはパイロシークエンス解析用にデザイン済みのDNAメチル化アッセイです。ヒト、マウスゲノムに対応する60,000以上の個別アッセイは、ウェブポータルサイト、GeneGlobeでクリックするだけでアクセスできます。各アッセイにはビオチン標識PCR産物の作製に必要なプライマーおよびパイロシークエンス解析用のプライマーが含まれています。
Applications

PyroMark CpG Assaysは、エピジェネティクス研究でマウスやヒトのCpG部位の正確で定量的なメチル化解析を実現します。

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FAQs
23
FAQ ID -2007
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Ready-to-use methylation assays at GeneGlobe 2.0
Analysis of ESR1.
[A] The GeneGlobe interface for PyroMark CpG Assays affords access to multiple targets in CpG islands, which allows the user to pick and choose the particular regions in a CpG island to analyze. [B] Pyrosequencing data show the analysis of two different positions within the CpG island associated with the gene ESR1.
High PCR success rate, even with bisulfite-converted DNA.
High PCR success rate, even with bisulfite converted DNA.
The PCR performance of PyroMark CpG Assays for 310 randomly selected genes was evaluated. A total of 305 assays (98%) resulted in the predicted PCR amplicon, usable as template for subsequent Pyrosequencing.
High Pyrosequencing success rate of predesigned PyroMark CpG Assays
High Pyrosequencing success rate of predesigned PyroMark CpG Assays.
The Pyrosequencing performance of PyroMark CpG Assays for 310 randomly selected genes was evaluated. A total of 305 assays (98%) resulted in the predicted PCR amplicon, usable as template for subsequent Pyrosequencing. From these assays, 281 resulted in successful Pyrosequencing results. Of these successful assays, 229 (75.1%) required no further review by the user, and 52 (17%) were successful after user review. Only 24 (7.9%) evaluated assays failed.
All the information needed to select the best assay
Ready-to-use methylation assays.

The GeneGlobe interface for searching and ordering PyroMark CpG Assays provides access to multiple targets in CpG islands, allowing users to pick and choose the exact regions in a CpG island for analysis. By combining different assays, users can quantify methylation of as many target sites as needed, whether these are consecutive or not.