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QIAGEN Genomic-tips는 중력류, 음이온 교환 팁으로, 광범위한 생물학적 샘플에서 유전체 DNA를 효율적으로 정제할 수 있습니다. 정제된 DNA의 크기는 최대 150kb이며 평균 크기는 50~100kb입니다
QIAGEN Genomic-tip 절차는 매우 섬세하여 DNA 단편화가 거의 발생하지 않습니다. QIAGEN Genomic-tips로 정제된 DNA는 크기가 최대 150kb이며, 평균 길이는 50~100kb입니다(그림 '최대 150kb의 유전체 DNA' 참조). 이 DNA에는 RNA, 단백질, 대사산물 등 오염 물질이 전혀 없으며 A260 / A280 비율은 1.7~1.9입니다.
QIAGEN Genomic-tips는 그 어떤 준비 요구에도 맞게 다양한 크기로 제공되며 샘플 유형별 유전체 DNA 준비에 대한 상세한 프로토콜이 포함된 포괄적인 핸드북과 함께 제공됩니다. 혈액, 조직, 배양 세포, 효모 및 박테리아에 대한 특정 용해 완충액과 기타 모든 필수 완충액은 유전체 DNA 완충액 세트(별도 구매 가능)로 제공됩니다.
정제된 DNA가 직접 박테리아 유전체 염기서열 분석에 사용되었습니다(그림 ' 박테리아 유전체 DNA의 직접 염기서열 분석' 참조).
QIAGEN Genomic-tip 사양
| 샘플 출처 | 양 | 수율(µg) | ||||
| Genomic-tip 20/G | Genomic-tip 100/G | Genomic-tip 500/G | Genomic-tip 20/G | Genomic-tip 100/G | Genomic-tip 500/G | |
| 전혈(인간) | 1ml | 5ml | 20ml | 15~20 | 80~100 | 350~400 |
| 배양 세포(HeLa) | 5 x 106 | 2 x 107 | 1 x 108 | 15~20 | 80~100 | 350~450 |
| 조직(간) | 15mg | 80mg | 350mg | 15~20 | 80~100 | 350~450 |
| 효모(S. cerevisiae) | 1ml | 5ml | 20ml | 18~20 | 85~95 | 350~450 |
| 그람음성 세균(E. coli) | 0.6~1.2ml | 3~6ml | 15~30ml | 16~20 | 85~95 | 300~400 |
| 그람양성 세균(B. subtilis) | 1.2~1.8ml | 6~9ml | 30~45ml | 16~20 | 85~95 | 300~400 |
QIAGEN Genomic-tips는 페놀이나 클로로포름을 사용하지 않고도 다양한 생물학적 샘플에서 고분자량 DNA를 분리하기 위해 독자적인 QIAGEN 음이온 교환 기술을 사용합니다. 용해 완충액은 다양한 샘플 유형에 맞게 최적화되어 있으며, 핵산 분해 효소, 히스톤, DNA 결합 단백질과 같은 단백질은 물론, 감염성이 있는 바이러스 입자도 즉각 변성시킵니다. 완충액의 pH 및 저염 조건 하에서 DNA는 칼럼 내 QIAGEN 레진에 결합하게 됩니다. 동시에 단백질, 탄수화물, 대사산물 등 다른 세포 구성 요소도 통과해 흐릅니다. 정제 DNA는 고염도 완충액에서 용출됩니다. Genomic-tips는 중력류로 작동하며, 방치해도 마르지 않습니다. 따라서 실제 작업에 필요한 시간이 최소화되고 여러 샘플을 동시에 처리하는 데 이상적인 절차입니다.
우선 샘플을 용해하고(조직 샘플을 기계적으로 파쇄) 적절한 용해 완충액에서 단백질을 동시에 변성시킵니다(흐름도 'QIAGEN Genomic-tip 절차' 참조). 그런 후 QIAGEN Protease 또는 Proteinase K를 첨가하고 적절한 배양 기간이 경과한 후 용해물을 QIAGEN Genomic-tip에 로드합니다. DNA는 컬럼에 결합하지만 다른 세포 성분은 컬럼을 통과합니다. 잔류 오염 물질을 제거하기 위한 세척 단계 후에 분자량이 큰 순수 DNA가 용출되어 이소프로판올로 침전됩니다. 전체 절차에 걸리는 수작업 시간은 세균의 경우 20분, 혈액과 배양 세포의 경우 30분, 조직과 효모의 경우 40분입니다.
QIAGEN Genomic-tips으로 정제된 DNA는 다음과 같은 용도에 사용하기에 적합합니다.
