Digital PCR
디지털 PCR

PCR의 새로운 절댓값 – 디지털 PCR

알아보기 – 디지털 PCR(dPCR)

디지털 PCR의 힘 – 건초 더미에서 바늘 찾기

디지털 PCR(Digital PCR, dPCR)은 샘플을 여러 개의 개별 반응으로 분획하여 각 반응에 0개 또는 하나 이상의 표적 분자가 존재하도록 하는 기술입니다. 이 접근 방식을 사용하면 네거티브 백그라운드에서 하나의 포지티브를 놀라울 정도로 쉽게 찾아낼 수 있습니다. 건초 더미에서 바늘 찾기처럼 말이죠. 이는 낮은 검출 한계로 인해 표준 real-time 정량 PCR(Quantitative PCR, qPCR)을 실행하지 못했던 경우 한 가지 방법이 될 수 있습니다.

디지털 PCR의 가장 큰 특징은 핵산의 절대 정량화입니다. 분획 후, 각 반응은 엔드포인트 PCR 사이클링을 거치고 각 분획에서 형광 신호의 존재(양성 반응) 또는 부재(음성 반응)를 분석합니다. 이 정보를 바탕으로 샘플에 존재하는 분자의 절대적인 수를 계산할 수 있습니다. qPCR과 달리 dPCR은 표준 곡선에 의존하지 않습니다. 덕분에 dPCR은 qPCR보다 검출 한계가 낮고 정밀도가 높습니다.

연구자들은 복제수 변이 분석, 유전자 발현 정량화, 희귀 표적 검출과 같은 민감한 응용 분야에 점점 디지털 PCR을 더 많이 사용하고 있습니다. 이 방법은 세포 및 유전자 치료 연구, 암 연구, 전염병 조사, 식품 검사 등 다양한 분야 발전에 도움을 주었습니다.

탐색 시작
DNA, binary code
당사의 사명은 디지털 PCR 과정에서 겪는 어려움을 극복하는 데 필요한 지식과 도구를 제공하는 것입니다. 어쩌면 건초 더미에서 바늘 찾기도 말처럼 어려운 일은 아닐지 모릅니다.
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PCR 경험의 혁신

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COVID-19 이전에 녹화된 동영상
미래가 디지털이라면, PCR의 미래도 마찬가지 아니겠어요? qPCR의 친숙성과 용이성은 유지하면서 과학적 통찰을 얻는 데 걸리는 시간을 연장하지 않고 디지털 PCR의 높은 민감도와 정밀도를 얻는다고 생각해 보세요. QIAGEN에서 제공하는 완전히 통합된 나노플레이트 기반 디지털 PCR 시스템인 QIAcuity는 연구의 요구 사항과 현재 제공되는 방법의 한계를 염두에 두고 설계되었습니다. 이제는 qPCR에서 전환하는 작업을 단순화하고 디지털 PCR의 변화하는 환경에 맞는 중요한 연구 애플리케이션을 준비해야 할 때입니다.

미세방울(droplet) 디지털 PCR 기술 대비 장점

나노플레이트 기반 기술은 디지털 미세방울 PCR (Digital Droplet PCR, ddPCR)에 비해 상당한 이점을 제공합니다. 이는 다음과 같습니다.

• 고정된 분획물로 사이즈 변이 및 병합이 방지됩니다
• 밀봉된 나노플레이트로 웰간 오염이 방지됩니다
• 샘플의 모든 분획물의 동시 측정으로 보다 신속한 판독이 가능합니다
• 사용자 친화적, 친숙한 플레이트 방식은 qPCR과 마찬가지로 피펫팅하기가 용이합니다
• 플레이트는 frond-end 자동화가 가능합니다

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COVID-19 이전에 녹화된 동영상
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참고 문헌

Huggett JF et al. (2013). The digital MIQE guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments. Clin Chem. 59(6):892-902.

dMIQE Group, Huggett JF. (2020). The Digital MIQE Guidelines Update: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments for 2020. Clin Chem. 66(8):1012-1029.

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