qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays

体細胞DNA変異の状態を迅速かつ正確にプロファイリングできる遺伝子パネル

パスウェイあるいは疾病に特異的な遺伝子体細胞変異状態のプロファイリング
簡単なリアルタイムPCR操作
高い感度と幅広いダイナミックレンジ
ほとんどのリアルタイムPCR装置でルーチン使用が可能
マスターミックス付属

qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayは翻訳研究ツールで、生物学的パスウェイあるいは疾病に関連する重要な遺伝子の体細胞変異状態のプロファイリングを迅速かつ正確に行ないます。変異は、臨床または機能的関連性および出現頻度に基づいて、広範な体細胞突然変異のデータベース（例；COSMIC）と査読済み科学文献から選択されています。

オーダーインフォメーション
製品の詳細
関連資料

Available Products

製品名	Product no.	Cat. no.	List price:
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for EGFR Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-001AA	varies	configure
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for ErbB2 Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-002AA	varies	configure
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for FLT3 Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-003AA	varies	configure
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for PDGFR Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-004AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human FGFR Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-005AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human KIT Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-006AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human c-MET Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-007AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Receptor Tyrosine Kinase (RTK) Pathways (Panel I) PCR plate and master mix show details	337021	SMH-008AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Receptor Tyrosine Kinase (RTK) Pathways (Panel Il) PCR plate and master mix show details	337021	SMH-009AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human APC/CTNNB1 (beta-catenin) Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-010AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human p53/Rb Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-011AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human RAS-RAF Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-013AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human PI3K-AKT Signaling Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-014AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Breast Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-020AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Colon Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-021AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Hematopoietic Neoplasms PCR plate and master mix show details	337021	SMH-022AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Lung Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-023AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Skin Cancers PCR plate and master mix show details	337021	SMH-024AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Brain Cancers PCR plate and master mix show details	337021	SMH-025AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Lymphoid Neoplasms PCR plate and master mix show details	337021	SMH-026AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Soft Tissue Tumors PCR plate and master mix show details	337021	SMH-027AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Thyroid Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-028AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Melanoma PCR plate and master mix show details	337021	SMH-029AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Bladder Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-030AA	varies	configure
qBiomarker™qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Endometrial Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-032AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Endometrial Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-032BA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Kidney Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-033BA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Kidney Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-033CA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Liver Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-034AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Pancreatic Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-035AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Prostate Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-036BA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Head & Neck Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-037AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Esophageal Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-038AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Ovarian Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-039AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Gastric Cancer PCR plate and master mix show details	337021	SMH-041AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Acute Myeloid Leukemia PCR plate and master mix show details	337021	SMH-045AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Myelodysplastic Syndromes PCR plate and master mix show details	337021	SMH-046AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Oncogene Panel (384-well format) PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3002AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Oncogene and Tumor Suppressor Panel (384-well format) PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3003AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Tumor Suppressor Panel (384-well format) PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3004AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Tyrosine Kinases and Cell Signaling Pathways (384-well format) PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3005AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Lung and Colon Cancers (Expanded Panel) PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3006AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Cancer Comprehensive 384HC PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3007AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Tumor Suppressor Genes 384HC PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3008AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human Receptor Tyrosine Kinase Signaling 384HC PCR plate and master mix show details	337021	SMH-3009AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human APC Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-801AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human BRAF Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-802AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human CTNNB1 Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-803AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human EGFR Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-804AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human KIT Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-805AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human KRAS Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-806AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human PDGFR Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-807AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human PIK3CA Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-808AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human PTEN Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-809AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human RUNX1 Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-810AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human STK11 Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-811AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human TP53 Gene PCR plate and master mix show details	337021	SMH-812AA	varies	configure
qBiomarker™ Somatic Mutation PCR Array Human DNA QC Pathway PCR plate and master mix show details	337021	SMH-999AA	varies	configure

qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays は分子生物学実験用です。疾病の診断、治療または予防の目的には使用することはできません。

Main Image Navi

野生型あるいはがん細胞株からのゲノムDNA 200 ngを、Human EGFR Pathway qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayにより 85種類の突然変異（x軸）でプロファイルした。検出された変異はそれぞれピークで示されている。これらの細胞株で既に同定されているEGFRパスウェイの変異をすべて正しく確認できた。|Human EGFR Pathway qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayを用いて、4種類の細胞株のFFPEサンプル、1種類の野生型胎盤FFPEサンプル（コントロール）、および9種類の肺腺がんのFFPE組織サンプル（このうち8サンプルはコーカソイド由来、性別混合、喫煙者）で85種類の変異（x軸）に対してプロファイルした（サンプルをy軸）。FFPE MDAMB- 231細胞株でBRAFとKRAS変異を検出した（ピークで示す）。これらはQIAGEN KRAS PCR Kit とパイロシークエンス法により個別に同定した。また、KRAS体細胞変異1つと EGFR体細胞変異1つが2種類の肺腺がんのFFPE組織サンプルで検出された。||A375細胞（BRAF V600E positive）由来のゲノムDNAと野生型ゲノムDNAのミックスの希釈系列を作製し、全ゲノム増幅（WGA）を行なった場合と行なわない場合でBRAF V600Eを調べた。その結果、このアッセイ感度は1～2 ％の変異であった。||

パフォーマンス

qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayはホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織でも高い感度を示します（図 “高い感度” および “FFPEサンプルを用いた場合のqBiomarker Somatic Mutation PCR Array感度”）。

qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayは、毒性研究、創薬、がん研究において重要となる、細胞株または研究サンプル中の変異検出に有用です（図 “一般的ながん細胞株の体細胞突然変異状態のプロファイリング”）。

原理

リアルタイムPCRはDNA変異検出において感度と信頼性が最も高い方法です。対立遺伝子特異的増幅と加水分解プローブ検出を組み合わせたqBiomarker Somatic Mutation real-time PCR assayは、野生型ゲノムDNAのバックグランドからわずか1％の体細胞突然変異を検出することが可能です。アレルの特異的な増幅は、PCRプライマーの3'末端でのマッチとミスマッチをTaq ポリメラーゼにより判別するAmplification Refractory Mutation System（ARMS）テクノロジーをベースにしています（図“ARMSテクノロジーの原理”）。

操作手順

DNAテンプレートと即使用可能なPCRマスターミックスを、同一プレートの各ウェルに等量分注し、リアルタイムPCRサイクリングプリグラムを起動します。 qBiomarker Somatic Mutation PCR ArrayはABI、Bio-Rad、Eppendorf、Roche、Stratagene社の装置で使用可能です。

96ウェルおよび384ウェルプレートでの入手が可能なqBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayは、疾病状態やパスウェイに関連する変異検出に加えて、標準化のための遺伝子コピー数コントロール用に使用します。各qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayにはまた、一般的なPCRパフォーマンスをチェックするためのコントロールが含まれています。

使いやすいデータ解析

エクセルベースのデータ解析テンプレートを用いてデータ解析を行なえます。データ解析は∆∆C_T 法あるいは平均 ∆C_T 法をベースにしています。

アレイは様々なフォーマットでお届けし、すべてマスターミックスが入っています。

qBiomarker Somatic Mutation PCR Array Format A:Fluoroscein, 96-well; for Bio-Rad iCycler, iQ5, MyiQ, and MyiQ2 instruments

qBiomarker Somatic Mutation PCR Array Format A:ROX, 96-well; for ABI Standard 96-well Blocks (5700, 7000, 7300, 7500, 7900HT, ViiA 7); Bio-Rad Chromo 4 (MJ Research); Stratagene Mx3005p, Mx3000p; Eppendorf ep realplex 2/2S, and 4/4S instruments

qBiomarker Somatic Mutation PCR Array Format C:ROX, 96-well; for ABI 7500 FAST 96-well Block, 7900HT FAST 96-Well Block, StepOnePlus, and ViiA 7 FAST 96-well Block instruments

qBiomarker Somatic Mutation PCR Array Format D:ROX, 96-well; for Bio-Rad CFX96, Opticon and Opticon 2 (MJ Research); Stratagene Mx4000 instruments

qBiomarker Somatic Mutation PCR Array Format E:ROX, 384-well; for ABI 7900HT 384-well Block, ViiA 7 384-well Block; Bio-Rad CFX384 instruments

qBiomarker Somatic Mutation PCR Array Format F:ROX, 96-well; for Roche LightCycler 480 96-well Block instruments

qBiomarker Somatic Mutation PCR Array Format G:ROX, 384-well; for Roche LightCycler 480 96-well Block instruments

アプリケーション

qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrayは、パスウェイあるいは疾病に特異的な遺伝子セットおよびダウンストリームでシグナル伝達に関与する遺伝子の変異を迅速かつ正確にプロファイリングできます。

Application Notes

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	High-quality genomic DNA isolation and sensitive mutation analysis	詳細を表示

FAQ

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	How many different genes and gene mutations are on a Somatic Mutation PCR Array? FAQ ID -2427	表示
	How are the different mutations for a single gene normalized on the qBiomarker Somatic Mutation PCR array? FAQ ID -2428	表示
	Where are the somatic mutations published? FAQ ID -2429	表示
	How can I check DNA sample quality before using the Somatic Mutation PCR Arrays & Assays? FAQ ID -2430	表示
	How much DNA starting sample is needed for analysis with a Somatic Mutations PCR Array? And Assay? FAQ ID -2431	表示
	What is the sensitivity of the assays contained on the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays? FAQ ID -2910	表示
	How many mutations can I profile per sample on the qBiomarker Somatic Mutation PCR Array? FAQ ID -2911	表示
	Were all assays on the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays bench-validated? FAQ ID -2912	表示
	How do you decide on the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays to include on the pathway arrays and disease arrays? FAQ ID -2913	表示
	What are the control features on the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays? FAQ ID -2914	表示
	What is the data analysis method, and where can I find it for the qBiomarker Somatic Mutatation PCR arrays? FAQ ID -2915	表示
	What is the principle for qBiomarker Somatic Mutation PCR Array data analysis? FAQ ID -2916	表示
	What PCR machine do I need to use to run such a qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays? FAQ ID -2917	表示
	What effects can be predicted with poor sample quality? How robust is the platform with questionable sample quality (such as FFPE samples)? FAQ ID -2918	表示
	What sample types can I test on the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays? FAQ ID -2919	表示
	What method(s) do you recommend as an alternative way to validate the mutations identified on the somatic mutation PCR arrays? FAQ ID -2920	表示
	What are the advantages of RT-PCR based somatic mutation PCR arrays and assays compared to other platforms? FAQ ID -2921	表示
	What pathways and diseases are currently covered for the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays? FAQ ID -2922	表示
	How do I use the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays? FAQ ID -2923	表示
	What are the technological principles behind somatic mutation PCR arrays and assays? FAQ ID -2924	表示

技術情報

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	(EN) Somatic mutations and copy number changes in cancer: finding the right targetsresponse	表示

ホワイトペーパー

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	(EN) - Rapid and accurate cancer somatic mutation profiling with the qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示

機器テクニカル資料

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	(EN) - qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays For screening disease-focused mutation panels by PCR	詳細を表示
	QIAGEN Service Core - (EN) For gene expression and genomic analysis	詳細を表示

キットハンドブック

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	(EN) - qBiomarker Somatic Mutation PCR Handbook For real-time PCR-based, pathway- or disease-focused, somatic mutation profiling	詳細を表示

Supplementary Protocols

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	Applied Biosystems 7500 (Fast block) real-time PCR run setup instructions for qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示
	Applied Biosystems 7900HT real-time PCR run setup instructions for qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示
	Bio-Rad iCycler and iQ real-time PCR run setup instructions for qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示
	Rotor-Gene Q real-time PCR setup instructions for qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示
	Roche LightCycler 480 real-time PCR run setup instructions for qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示
	Stratagene Mx3000P QPCR System real-time PCR run setup instructions for qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示
	Applied Biosystems ViiA7 real-time PCR run setup instructions for qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays	詳細を表示

安全データシート

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	MSDS qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays

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