QIAamp Fast DNA Tissue Kit

Le génotypage et autres analyses ADN utilisant la PCR ou le séquençage à haut débit (NGS) demandent une quantité adaptée d’ADN génomique de haute qualité comme matériel de départ. L’obstacle le plus courant dans l’obtention d’ADN de haute qualité est la lyse des tissus. Les tissus fibreux ou autres tissus difficiles à lyser demandent des protocoles longs et fastidieux qui produisent souvent un faible rendement d’ADN de basse qualité. Le QIAamp Fast DNA Tissue Kit, qui repose sur les technologies éprouvées de QIAGEN, surmonte cet obstacle en proposant des tubes de désagrégation innovants qui améliorent significativement le rendement et réduisent le temps total nécessaire à l’obtention des résultats. La procédure peut être entièrement automatisée sur le QIAcube Connect.

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Le QIAamp Fast DNA Tissue Kit utilise une combinaison novatrice de lyses mécanique, chimique et enzymatique. Chaque kit est accompagné de tubes de désagrégation contenant une bille spéciale de forme unique en acier inoxydable qui permet une désagrégation plus complète des tissus que d’autres méthodes. Tout d’abord, l’échantillon de tissu et le mélange réactif sont ajoutés dans les tubes et homogénéisés à l’aide d’un vortexeur de paillasse courant (avec les adaptateurs appropriés) ou d’un broyeur à billes, comme le TissueLyser II ou LT, suivi d’une courte lyse dans le même tube. L’ADN est ensuite extrait du lysat à l’aide de la technologie éprouvée QIAamp. Le prétraitement ramène le temps nécessaire pour une extraction d’ADN total de plusieurs heures à seulement 30 minutes.
En plus d’accélérer le temps total que prend l’extraction de l’ADN, l’étape de désagrégation mécanique et le protocole de lyse complète augmentent le rendement d’ADN. Les améliorations du rendement à partir de différents types de tissus ont été évaluées à l’aide du QIAxpert et d’un dosage fluorimétrique. Les résultats montrent que le QIAamp Fast DNA Tissue Kit est capable d’extraire jusqu’à dix fois plus d’ADN en comparaison aux méthodes standard en plus de fournir un des protocoles les plus rapides.
La plupart des applications NGS demandent un ADN de poids moléculaire élevé (> 10 kb) pour permettre à de plus grandes plages d’être séquencées et assemblées avec les outils bio-informatiques. Certaines méthodes de désagrégation peuvent fragmenter l’ADN par cisaillement, ce qui peut affecter l’analyse en aval. Comparé aux autres kits qui montrent une haute fragmentation jusqu’à quelques kb, le QIAamp Fast DNA Tissue Kit vous permet d’obtenir un ADN entre 25 et 50 kb et est par conséquent parfaitement adapté à toute application PCR ou NGS.

Les techniques moléculaires, telles que la PCR et le NGS révèlent des détails jusqu’alors inconnus à partir d’échantillons expérimentaux complexes. Afin d’obtenir des résultats fiables à l’aide de ces techniques, il est essentiel d’obtenir des quantités suffisantes d’ADN de haute qualité. Cela peut être un véritable défi lorsque l’on travaille avec des tissus fibreux ou durs, car ils sont difficiles à lyser, ce qui a une incidence directe sur la quantité d’ADN libérée. Afin de résoudre ce problème, notre nouveau QIAamp Fast DNA Tissue Kit combine la lyse mécanique, chimique et enzymatique des tissus, résultant en des rendements d’ADN 5 à 10 fois supérieurs aux méthodes standard. Le prétraitement ramène le temps nécessaire pour une extraction d’ADN total de plusieurs heures à seulement 30 minutes, cela signifie qu’en plus d’obtenir un ADN de haute intégrité adapté pour des applications PCR et NGS, vous gagnez également un temps non négligeable.

Le QIAamp Fast DNA Tissue Kit utilise une combinaison de lyses mécanique, chimique et enzymatique pour homogénéiser les échantillons. Les tubes de désagrégation de tissus fournis contiennent des billes de forme spéciale pour désagréger les tissus lors de l’agitation. 5 minutes dans un vortexeur de paillasse ou 30 secondes dans un broyeur à billes puissant suffisent pour homogénéiser les tissus. Une chimie optimisée permet une homogénéisation des tissus en même temps qu’une stabilisation de l’ADN des tissus désagrégés. Le mélange du tampon de digestion contient également de la protéinase K, qui lyse complètement le matériel de l’échantillon en une courte durée d’incubation et n’est pas affectée par l’homogénéisation mécanique. L’ADN génomique est ensuite purifié à l’aide de la technologie éprouvée QIAamp, offrant un ADN pur pour toute application en aval, comme la PCR ou le séquençage. De plus, le QIAamp Fast DNA Tissue Kit peut être utilisé avec le QIAcube pour une automatisation de la préparation d’échantillons.

Le QIAamp Fast DNA Tissue Kit offre de hauts rendements d’ADN pur à partir de n’importe quel type de tissu et est adapté pour les applications de type PCR et NGS.