QIAGEN Genomic-tips for Genomic DNA Extraction

Pour un isolement jusqu’à 20 µg, 100 µg ou 500 µg d’ADN de poids moléculaire élevé à partir d’une grande variété d’échantillons

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QIAGEN Genomic-tip 20/G

N° de réf. / ID.   10223

25 colonnes
Type de colonne
20/G
100/G
500/G
Les QIAGEN Genomic-tips sont destinés aux applications de biologie moléculaire. Ces produits ne sont pas conçus pour le diagnostic, la prévention ou le traitement des maladies.

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Caractéristiques

  • Un cisaillement mécanique minimal permet un isolement d’ADN de poids moléculaire élevé d’une taille pouvant atteindre 150 kb
  • Pas d’extraction au phénol ou au chloroforme
  • Traitement pratique en parallèle de plusieurs échantillons

Détails produit

Les QIAGEN Genomic-tips sont des embouts échangeurs d’anions qui fournissent un écoulement par gravité pour une purification efficace de l’ADN génomique pour une large gamme d’échantillons biologiques. La taille de l’ADN purifié peut monter jusqu’à 150 kb, avec une taille moyenne de 50 à 100 kb

Performances

La procédure QIAGEN Genomic-tip est très délicate, et le cisaillement de l’ADN qui en résulte est négligeable. La taille de l’ADN purifié avec les QIAGEN Genomic-tips peut monter jusqu’à 150 kb avec une longueur moyenne de 50 à 100 kb (voir la figure « ADN génomique jusqu’à 150 kb »). L’ADN ne présente aucun contaminant tel que de l’ARN, des protéines ou des métabolites, et possède des ratios A260/A280 entre 1,7 et 1,9.

Les QIAGEN Genomic-tips sont disponibles en différentes tailles afin de remplir les exigences spécifiques de toute préparation et sont accompagnés d’un manuel complet contenant les protocoles détaillés de la préparation d’ADN génomique à partir de chaque type d’échantillon. Des tampons de lyse spécifiques pour le sang, les tissus, les cellules de culture, les levures et les bactéries ainsi que tous les autres tampons nécessaires sont fournis dans le Genomic DNA Buffer Set vendu séparément.

L’ADN purifié a été utilisé dans le séquençage direct de génome bactérien (voir la figure «  Séquençage direct d’ADN génomique bactérien »).

Caractéristiques du QIAGEN Genomic-tip

Source d’échantillon Quantité Rendement (µg)
  Genomic-tip 20/G Genomic-tip 100/G Genomic-tip 500/G Genomic-tip 20/G Genomic-tip 100/G Genomic-tip 500/G
Sang total (humain) 1 ml 5 ml 20 ml 15 à 20 80 à 100 350 à 400
Cellules de culture (HeLa) 5 x 106 2 x 107 1 x 108 15 à 20 80 à 100 350 à 450
Tissus (foie) 15 mg 80 mg 350 mg 15 à 20 80 à 100 350 à 450
Levures (S. cerevisiae) 1 ml 5 ml 20 ml 18 à 20 85 à 95 350 à 450
Bactérie à Gram négatif (E. coli) 0,6 à 1,2 ml 3 à 6 ml 15 à 30 ml 16 à 20 85 à 95 300 à 400
Bactérie à Gram positif (B. subtilis) 1,2 à 1,8 ml 6 à 9 ml 30 à 45 ml 16 à 20 85 à 95 300 à 400

Principe

Les QIAGEN Genomic-tips utilisent la technologie unique d’échange d’anions de QIAGEN pour isoler l’ADN de poids moléculaire élevé à partir d’une grande variété d’échantillons biologiques sans nécessiter de phénol ou de chloroforme. Les tampons de lyse sont optimisés pour différents types d’échantillons et assurent une dénaturation immédiate des protéines, telles que les nucléases, les histones et les protéines de liaison à l’ADN ainsi que des particules virales potentiellement infectieuses. Grâce au pH et aux conditions de faible salinité garantis par le tampon, l’ADN se lie à la résine QIAGEN dans la colonne. Dans le même temps, d’autres composants cellulaires, tels que les protéines, les glucides et les métabolites s’écoulent. L’ADN purifié est élué dans un tampon à haute salinité. Les Genomic-tips fonctionnent par écoulement par gravité et peuvent donc être laissés sans surveillance sans qu’ils ne s’assèchent. Cela réduit au minimum la durée de manipulation et rend la procédure idéale pour un traitement simultané de plusieurs échantillons.

Procédure

Les échantillons sont d’abord lysés (les échantillons de tissus sont mécaniquement désagrégés) et les protéines simultanément dénaturées dans le tampon de lyse approprié (voir le schéma « Procédure QIAGEN Genomic-tip »). La QIAGEN Protease ou Proteinase K est ensuite ajoutée et, après un temps d’incubation approprié, les lysats sont chargés sur le QIAGEN Genomic-tip. L’ADN se lie à la colonne pendant que les autres composants cellulaires s’écoulent. À la suite d’une étape de lavage pour éliminer tout contaminant résiduel, l’ADN pur de poids moléculaire élevé est élué et précipité avec de l’isopropanol. La durée complète de manipulation pour la procédure est de seulement 20 minutes pour les bactéries, 30 minutes pour le sang et les cellules de culture, et 40 minutes pour les tissus et les levures.

Applications

L’ADN purifié à l’aide des QIAGEN Genomic-tips est adapté pour les applications suivantes :

  • Séquençage à haut débit et séquençage à lecture longue
  • Analyse par RFLP
  • Analyse de ciblage de gène
  • Criblage d’animaux transgéniques
  • Études de profilage génétique
  • Transfert de Southern

Données et illustrations utiles

Ressources

Protocoles élaborés par l’utilisateur (7)
Protocoles complémentaires (1)
This protocol is designed for isolation of up to 200 μg RNA from 150 mg plant tissue or up to 1 mg RNA from 600 mg plant tissue and is for use with QIAGEN-tip 100 or QIAGEN-tip 500, respectively.
Documents techniques sur les instruments (1)
Manuels de kit (1)
Fiches de données de sécurité (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)

Publications

Similarity and differences in the Lactobacillus acidophilus group identified by polyphasic analysis and comparative genomics.
Berger B; Pridmore RD; Barretto C; Delmas-Julien F; Schreiber K; Arigoni F; Brüssow H;
J Bacteriol; 2006; 189 (4):1311-21 2006 Dec 1 PMID:17142402
A genome-wide map of diversity in Plasmodium falciparum.
Volkman SK; Sabeti PC; DeCaprio D; Neafsey DE; Schaffner SF; Milner DA Jr; Daily JP; Sarr O; Ndiaye D; Ndir O; Mboup S; Duraisingh MT; Lukens A; Derr A; Stange-Thomann N; Waggoner S; Onofrio R; Ziaugra L; Mauceli E; Gnerre S; Jaffe DB; Zainoun J; Wiegand RC; Birren BW; Hartl DL; Galagan JE; Lander ES; Wirth DF;
Nat Genet; 2006; 39 (1):113-9 2006 Dec 10 PMID:17159979
Development and evaluation of a loop-mediated isothermal amplification method for rapid diagnosis of Bordetella pertussis infection.
Kamachi K; Toyoizumi-Ajisaka H; Toda K; Soeung SC; Sarath S; Nareth Y; Horiuchi Y; Kojima K; Takahashi M; Arakawa Y;
J Clin Microbiol; 2006; 44 (5):1899-902 2006 May PMID:16672435
Arsenic detoxification and evolution of trimethylarsine gas by a microbial arsenite S-adenosylmethionine methyltransferase.
Qin J; Rosen BP; Zhang Y; Wang G; Franke S; Rensing C;
Proc Natl Acad Sci U S A; 2006; 103 (7):2075-80 2006 Feb 1 PMID:16452170
Validation of a 21-locus autosomal SNP multiplex for forensic identification purposes.
Dixon LA; Murray CM; Archer EJ; Dobbins AE; Koumi P; Gill P;
Forensic Sci Int; 2005; 154 (1):62-77 2005 Jan 20 PMID:16182950

FAQ

What is the size of genomic DNA that is obtained with QIAGEN Genomic-tips?
Genomic DNA purified using QIAGEN Genomic-tips ranges in size from 20–150 kb, with an average length of 50–100 kb. Vortexing the lysate for about 20 seconds may reduce the size of the genomic DNA slightly to 20–130 kb, but can help to improve flow rates.
FAQ-142
Do you have a protocol for the purification of DNA from fruit flies?

Using Gentra Puregene Cell kit:

 

• Purification of archive-quality DNA from up to 30 Drosophila melanogaster using the Gentra Puregene Cell Kit (PG20)

• Purification of archive-quality DNA from 100 Drosophila melanogaster using the Gentra Puregene Cell Kit (PG21)

• Purification of archive-quality DNA from 300–700 Drosophila melanogaster using the Gentra Puregene Cell Kit (PG22)

 

Using the QIAGEN Genomic tips:

• Isolation of genomic DNA from flies using the QIAGEN Genomic-tip 100/G (QG05)

FAQ-1970
What do you recommend for the cleanup of genomic DNA (gDNA)?

Using QIAGEN Genomic-tips

Protocol for DNA cleanup using Genomic-tips can be found in the 'Special Applications' section of the QIAGEN Genomic DNA Handbook.

 

Using QIAamp DNA Micro kit

Up to 10ug of gDNA can be cleaned using the cleanup protocol in the QIAamp DNA Micro Handbook.

 

Using Gentra Puregene Reagents

Gentra Puregene Handbook has protocols for removal of proteins and RNA from purified gDNA in Appendix C and Appendix D respectively.

FAQ-618
Do you have a protocol for the isolation of genomic DNA from frozen clotted blood?

Yes, we have the following protocols:

  • Isolation of genomic DNA from frozen clotted whole blood using the QIAGEN Genomic-tip 100/G (QG02). TEST

You will need to prepare the required buffers according to the recipes in Appendix A of the QIAGEN Genomic DNA Handbook, or you can purchase the Genomic DNA Buffer Set containing pre-made solutions. Alternatively, the QIAGEN Blood & Cell Culture Midi Kit, containing Genomic-tips 100/G and buffers, can be used.

  • Purification of archive-quality DNA from clotted whole blood using Clotspin Baskets and the Gentra Puregene Blood Kit (PG03).
  • Purification of archive-quality DNA from clotted whole blood using the Gentra Puregene Tissue Kit or Gentra Puregene Mouse Tail Kit (PG04).
  • Purification of DNA from clotted blood using the FlexiGene DNA Kit (FG01).
FAQ-900
Do you have a protocol for isolation of genomic and viral DNA from lymphocytes using QIAGEN Genomic-tips?

Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic and viral DNA from lymphocytes using the QIAGEN Genomic-tip' (QG03). The protocol is for use with the QIAGEN Genomic-tip 20/G.

FAQ-901
Do you have a protocol for isolation of genomic and plasmid DNA from cell cultures using QIAGEN Genomic-tips?

Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic and plasmid DNA from cell cultures using the QIAGEN Genomic-tip' (QG04).

FAQ-902
Do you have a protocol for isolation of genomic DNA from flies using QIAGEN Genomic-tips?

Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic DNA from flies using the QIAGEN Genomic-tip 100/G' (QG05).

FAQ-903
Do you have a protocol for isolation of genomic DNA from insects?

Yes, we have the following protocols:

  • Isolation of genomic DNA from mosquitoes or other insects using the QIAGEN Genomic tip (QG06).
  • Purification of total DNA from insects using the DNeasy Blood & Tissue Kit (DY14).
FAQ-904
Do you have a protocol for isolation of genomic DNA from plants and filamentous fungi using QIAGEN Genomic-tips?

 Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic DNA from plants and filamentous fungi using the QIAGEN Genomic-tip' (QG08).

FAQ-905
Do you have protocols for the isolation of genomic DNA from tissue using QIAGEN-tips 2500 (Mega) and 10000 (Giga)?
Do you have a protocol for the isolation of genomic DNA from fungi?

Yes, we have the following protocols:

  • Isolation of genomic DNA from fungi (culture and blood) using the QIAamp DNA Mini Kit (QA09).
  • Isolation of genomic DNA from plants and filamentous fungi using the QIAGEN Genomic-tip (QG08).
FAQ-911