Investigación sobre el cáncer

Saque el máximo partido de las muestras FFPE

Serie: FFPE en el punto de mira

Los científicos de QIAGEN comparten sus conocimientos

Los archivos de secciones de tejido fijado en formalina e impregnado en parafina (Formalin-Fixed, Paraffin Embedded, FFPE) almacenados en todas partes del mundo representan una amplia y valiosa fuente de información para la investigación biomédica. El tejido FFPE es un tipo de muestra muy valioso aunque complejo, ya que requiere una metodología que pueda lidiar con la naturaleza de las muestras de FFPE con resultados eficientes en cuanto a la purificación de los analitos y el análisis molecular posterior. Inicie sesión para acceder a nuestra serie de recomendaciones y consejos, y benefíciese de los conocimientos de los científicos de QIAGEN.

Seminarios web, vídeos y más

Preparación de los ácidos nucleicos

Factores que deben tenerse en cuenta antes del análisis

Martin Schlumpberger: Nociones básicas sobre las muestras de FFPE

Martin comienza la serie de seminarios web destacando algunos de los distintos factores que influyen en el análisis molecular a partir de muestras de FFPE y las dificultades y factores que se deben tener en cuenta cuando se trabaja con este tipo de muestra, valiosa a la vez que compleja.

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Daniel Groelz: Factores que deben tenerse en cuenta antes del análisis: estándares e implementación en el laboratorio

Daniel comenta algunos de los factores preanalíticos que influyen en los análisis de ácido nucleico a partir de muestras de FFPE, iniciativas internacionales y requisitos para estandarizar los flujos de trabajo preanalíticos y las formas de implementar estos estándares en su laboratorio.

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Martin Schlumpberger: Preparación del ácido nucleico: ADN, ARN y obtención de ambos de una única muestra de FFPE

Martin habla sobre algunas de las consideraciones clave para alcanzar y garantizar altos rendimientos, y buena calidad en el ADN y ARN que se obtiene de las muestras de FFPE, como eficientes desparafinación, eliminación de enlaces cruzados y artefactos, control de la integridad del ADN y el ARN y su efecto en los análisis posteriores.

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Metilación de ADN

Ioanna Andreou: Detección de marcadores de metilación de NGS a partir de muestras FFPE

Ioanna habla sobre los análisis de metilación del ADN a partir de muestras FFPE mediante secuenciación dirigida de la metilación. También comenta el flujo de trabajo de un solo día hasta el secuenciador, a través de índices moleculares únicos (unique molecular index, UMI) y las tecnologías de extensión de cebador único (single primer extension, SPE).

Norbert Hochstein: Análisis de metilación mediante pirosecuenciación: efecto de la longitud del amplicón y cantidad de entrada de ADN

Norbert da una descripción general del flujo de trabajo de la pirosecuenciación para el análisis de metilación, seguido de algunos descubrimientos clave en su estudio de pirosecuenciación con muestras de FFPE y el impacto de la longitud del amplicón y la cantidad de entrada de ADN en los resultados.

Expresión de miARN

Francesca Di Pasquale: Análisis de miARN mediante PCR

Francesca expone los retos más comunes que surgen a la hora de trabajar con miARN extraído de muestras de FFPE y las consideraciones clave para el diseño de los cebadores, los controles de calidad y la normalización de los datos para análisis de expresión de miARN mediante qPCR.

Marie-Louise Lunn: miARN FFPE ISH en el desarrollo de biomarcadores del cáncer

Marie-Louise explica la hibridación in situ de miARN optimizado para los estudios de localización que emplean ácidos nucleicos bloqueados (LNA). También expondrá un protocolo de un día optimizado y no tóxico, además de los controles necesarios para la optimización de los protocolos de ISH.

Secuenciación de ARN y NGS multimodal

Jonathan Shaffer: NGS de transcriptoma completo de muestras de FFPE

Jon presenta una tecnología nueva que permite eliminar el rARN de las muestras de FFPE de manera eficiente durante el proceso de secuenciación de ARN de transcriptoma completo que aumenta drásticamente las lecturas mapeadas a los genes y los genes detectados, lo que da lugar a un análisis de expresión diferencial más fiable.

Jonathan Shaffer: Análisis de NGS multimodal a partir de muestras de FFPE

Jon nos presenta un nuevo flujo de trabajo (el NGS multimodal) de caracterización simultánea de las variantes de ADN y las fusiones de ARN. Describirá, con ejemplos, cómo posibilita esta solución posibilita la preparación consolidada de genotecas dirigidas de ADN y ARN a partir de muestras de FFPE.

Leif Schauser: Análisis de datos de NGS mediante QIAGEN CLC Genomics Workbench

Leif explica el funcionamiento de QIAGEN CLC Genomics Workbench para el análisis de datos de NGS y las funciones principales que son relevantes para FFPE. A través de una demostración en vivo, veremos los pasos principales de los flujos de trabajo del análisis de datos de la secuenciación de ARN y ADN.

Directrices técnicas

Caracterización precisa de biomarcadores a partir de muestras FFPE

Las secciones de tejido FFPE conforman un tipo de muestra muy valioso aunque complejo, ya que requiere una metodología eficiente para la purificación de los analitos y el análisis molecular posterior.
Obtenga información acerca de los métodos más novedosos y las consideraciones más importantes para la preparación de las muestras FFPE y los pasos del flujo de trabajo preanalítico para los análisis moleculares.

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Productos

Descubra el verdadero potencial de las muestras FFPE

Descubra las soluciones Sample to Insight de QIAGEN para obtener resultados óptimos en los análisis moleculares a partir de muestras FFPE; desde la preparación de las muestras hasta la evaluación de datos para el análisis molecular mediante NGS, PCR digital, PCR o qPCR.

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Producto en el punto de mira:

QIAamp DNA FFPE Advanced Kit

Este kit de última generación para aislar el ADN de las muestras de tejido FFPE le permitirá aumentar el rendimiento de su ADN amplificable. El protocolo de doble lisis, de desparafinación sin lavado y libre de xileno, también puede automatizarse.

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