Importancia de la eliminación de rARN en la optimización de secuenciación de ARN

QIAseq FastSelect permite una secuenciación de ARN de gran calidad a partir de muestras combinadas de humano y bacteria

La Dra. Marie Adams, Genomics Core Director en Van Andel Institute, explica cómo la tecnología QIAseq FastSelect le ayudó a superar los retos que supone la generación de datos de secuenciación de ARN en estudios de coexpresión de humanos y bacterias a partir de una única muestra de ARN.

QIAseq FastSelect ayuda a facilitar la investigación de tratamientos contra el cáncer con mayor tasa de éxito

“QIAseq FastSelect ha sido extremadamente útil con la secuenciación de ARN de mi proyecto. El ARN estaba muy degradado y prácticamente no podía usarse. Sin embargo, con QIAseq FastSelect conseguimos eliminar totalmente el ARN ribosómico de estas muestras de tan poca calidad, por lo que hemos mejorado nuestras genotecas de secuenciación”.

Brandon Mistrella, Departamento de Biología y Bioquímica, Universidad de Houston

El equipo de investigadores del cáncer de la Universidad de Houston se topaba día a día con contratiempos relacionados con la degradación del ARN a la hora de trabajar con muestras de FFPE. La presencia de especies de ARN no deseadas, como el ARN ribosómico y el mARN de globina en muestras de ARN de bajo rendimiento aún complicaban más el proceso de secuenciación del ARN. Descubra cómo, gracias a QIAseq FastSelect, transformaron su investigación y consiguieron obtener datos de secuenciación de ARN útiles a partir del ARN de FFPE.

QIAseq FastSelect permite la construcción de genotecas de secuenciación de ARN a partir de ARN de FFPE de baja calidad

“El flujo de trabajo es muy sencillo y rápido. La verdad es que, debido a que trabajábamos con muestras de mala calidad y con cantidades limitadas, no esperaba los resultados que obtuvimos.”

Dr. Fabienne Desmots-Loyer, Hematology Researcher, CHU – Hospital Pontchaillou, Rennes, Francia

Trabajar con ARN de muestras de FFPE puede resultar todo un reto debido a sus altos niveles de degradación y a su bajo rendimiento. Lea la historia del Dr. Fabienne Desmots-Loyer, Hospital de Rennes y descubra cómo QIAseq FastSelect le permitió ofrecer genotecas de alta calidad de muestras de cáncer fijadas en formalina e impregnadas en parafina (FFPE) que anteriormente habían sido rechazadas por dos laboratorios comerciales debido a sus altos niveles de degradación de ARN y a su bajo rendimiento.

Descargar la nota de aplicación

Eliminación de rARN mucho más rápida y sencilla

Mientras que otros métodos de eliminación de rARN pueden llevar varias horas, requieren numerosos pasos, funcionan solo con ARN no fragmentado o, simplemente, no eliminan la cantidad suficiente de rARN, con el método FastSelect conseguirá un flujo de trabajo mucho más rápido y cómodo, así como resultados excepcionales, incluso con muestras de ARN fragmentadas o de FFPE.

Confíe en QIAGEN Genomic Services para sus necesidades de investigación

Aprovéchese de las ventajas de QIAGEN Genomic Services para acelerar su labor de investigación. Nuestro equipo de expertos utiliza la tecnología NGS de QIAseq y el software QIAGEN Digital Insights para proporcionar resultados de alta calidad y totalmente fiables, desde la preparación de genotecas y los procesos de secuenciación hasta el análisis y la interpretación de datos.