QIAGEN Genomic-tips for Genomic DNA Extraction

Für die Isolierung von bis zu 20 µg, 100 µg oder 500 µg hochmolekularer DNA aus einer Vielzahl von Proben

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QIAGEN Genomic-tip 20/G

Kat.-Nr. / ID.   10223

25 Säulen
Säulentyp
20/G
100/G
500/G
QIAGEN Genomic-tips sind für molekularbiologische Anwendungen vorgesehen. Diese Produkte sind nicht zur Diagnose, Prävention oder Behandlung einer Erkrankung vorgesehen.

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Eigenschaften

  • Minimale mechanische Scherung ermöglicht die Isolierung von hochmolekularer DNA mit einer Größe von bis zu 150 kb
  • Keine Phenol- oder Chloroformextraktion
  • Bequeme, parallele Verarbeitung von mehreren Proben

Angaben zum Produkt

QIAGEN Genomic-tips sind Schwerkraftfluss-Anionenaustauscherspitzen, die eine effiziente Aufreinigung genomischer DNA aus einer Vielzahl biologischer Proben ermöglichen. Die aufgereinigte DNA hat eine Größe von bis zu 150 kb mit einer durchschnittlichen Größe von 50–100 kb

Leistung

Das Verfahren mit QIAGEN Genomic-tips ist sehr schonend und führt zu einer vernachlässigbaren DNA-Scherung. Die mit QIAGEN Genomic-tips aufgereinigte DNA hat eine Größe von bis zu 150 kb mit einer durchschnittlichen Länge von 50–100 kb (siehe Abbildung „Genomische DNA von bis zu 150 kb“). Die DNA ist frei von allen Verunreinigungen wie RNA, Proteinen und Metaboliten und hat ein A260 / A280-Verhältnis zwischen 1,7 und 1,9.

QIAGEN Genomic-tips sind in verschiedenen Größen erhältlich, um allen Präparationsanforderungen gerecht zu werden, und werden mit einem umfassenden Handbuch geliefert, das detaillierte Protokolle für die Präparation genomischer DNA aus jedem Probentyp enthält. Spezifische Lysepuffer für Blut, Gewebe, Zellkulturen, Hefe und Bakterien sowie alle anderen erforderlichen Puffer sind im Genomic DNA Buffer Set enthalten, das separat erworben werden kann.

Gereinigte DNA wurde für die direkte Sequenzierung bakterieller Genome verwendet (siehe Abbildung „ Direkte Sequenzierung bakterieller genomischer DNA“).

QIAGEN Genomic-tip – Spezifikationen

Probenquelle Menge Ausbeute (µg)
  Genomic-tip 20/G Genomic-tip 100/G Genomic-tip 500/G Genomic-tip 20/G Genomic-tip 100/G Genomic-tip 500/G
Vollblut (human) 1 ml 5 ml 20 ml 15–20 80–100 350–400
Zellkulturen (HeLa) 5 x 106 2 x 107 1 x 108 15–20 80–100 350–450
Gewebe (Leber) 15 mg 80 mg 350 mg 15–20 80–100 350–450
Hefe (S. cerevisiae) 1 ml 5 ml 20 ml 18–20 85–95 350–450
Gramnegative Bakterien (E. coli) 0,6–1,2 ml 3–6 ml 15–30 ml 16–20 85–95 300–400
Grampositive Bakterien (B. subtilis) 1,2–1,8 ml 6–9 ml 30–45 ml 16–20 85–95 300–400

Prinzip

QIAGEN Genomic-tips nutzen die einzigartige QIAGEN-Anionenaustauschertechnologie für die Isolierung hochmolekularer DNA aus einer Vielzahl biologischer Proben ohne Phenol oder Chloroform. Die Lysepuffer sind für verschiedene Probentypen optimiert und bieten eine sofortige Denaturierung von Proteinen wie Nukleasen, Histonen und DNA-bindenden Proteinen sowie von potenziell infektiösen Viruspartikeln. Unter dem pH-Wert und den Niedrigsalz-Bedingungen des Puffers bindet die DNA an das QIAGEN-Harz in der Säule. Gleichzeitig fließen andere Zellbestandteile wie Proteine, Kohlenhydrate und Stoffwechselprodukte hindurch. Die aufgereinigte DNA wird in einem Hochsalzpuffer eluiert. Genomic-tips arbeiten nach dem Schwerkraftprinzip und können unbeaufsichtigt gelassen werden, ohne auszutrocknen. Dies reduziert den manuellen Zeitaufwand auf ein Minimum und macht das Verfahren ideal für die gleichzeitige Verarbeitung mehrerer Proben.

Verfahren

Die Proben werden zunächst lysiert (Gewebeproben werden mechanisch zerkleinert) und die Proteine gleichzeitig in dem entsprechenden Lysepuffer denaturiert (siehe Ablaufdiagramm „Verfahren mit QIAGEN Genomic-tips“). Anschließend wird QIAGEN Protease oder Proteinase K zugegeben und nach einer geeigneten Inkubationszeit werden die Lysate auf die QIAGEN Genomic-tip geladen. Die DNA bindet an die Säule, während andere Zellbestandteile durchlaufen. Nach einem Waschschritt zur Entfernung etwaiger Verunreinigungen wird reine, hochmolekulare DNA eluiert und mit Isopropanol ausgefällt. Die Bearbeitungszeit für das gesamte Verfahren beträgt nur 20 Minuten für Bakterien, 30 Minuten für Blut und Zellkulturen und 40 Minuten für Gewebe und Hefen.

Anwendungen

Mit QIAGEN Genomic-tips aufgereinigte DNA eignet sich hervorragend für die folgenden Anwendungen:

  • Next-generation sequencing und Long-Read sequencing
  • RFLP-Analyse
  • Analyse des Gen-Targeting
  • Screening von transgenen Tieren
  • DNA-Fingerprinting-Studien
  • Southern Blotting

Ergänzende Daten und Abbildungen

Ressourcen

Anwenderentwickelte Protokolle (7)
Ergänzende Protokolle (1)
This protocol is designed for isolation of up to 200 μg RNA from 150 mg plant tissue or up to 1 mg RNA from 600 mg plant tissue and is for use with QIAGEN-tip 100 or QIAGEN-tip 500, respectively.
Kit-Handbücher (1)
Sicherheitsdatenblätter (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
Safety Data Sheets (1)
Certificates of Analysis (1)

Publikationen

Similarity and differences in the Lactobacillus acidophilus group identified by polyphasic analysis and comparative genomics.
Berger B; Pridmore RD; Barretto C; Delmas-Julien F; Schreiber K; Arigoni F; Brüssow H;
J Bacteriol; 2006; 189 (4):1311-21 2006 Dec 1 PMID:17142402
A genome-wide map of diversity in Plasmodium falciparum.
Volkman SK; Sabeti PC; DeCaprio D; Neafsey DE; Schaffner SF; Milner DA Jr; Daily JP; Sarr O; Ndiaye D; Ndir O; Mboup S; Duraisingh MT; Lukens A; Derr A; Stange-Thomann N; Waggoner S; Onofrio R; Ziaugra L; Mauceli E; Gnerre S; Jaffe DB; Zainoun J; Wiegand RC; Birren BW; Hartl DL; Galagan JE; Lander ES; Wirth DF;
Nat Genet; 2006; 39 (1):113-9 2006 Dec 10 PMID:17159979
Development and evaluation of a loop-mediated isothermal amplification method for rapid diagnosis of Bordetella pertussis infection.
Kamachi K; Toyoizumi-Ajisaka H; Toda K; Soeung SC; Sarath S; Nareth Y; Horiuchi Y; Kojima K; Takahashi M; Arakawa Y;
J Clin Microbiol; 2006; 44 (5):1899-902 2006 May PMID:16672435
Arsenic detoxification and evolution of trimethylarsine gas by a microbial arsenite S-adenosylmethionine methyltransferase.
Qin J; Rosen BP; Zhang Y; Wang G; Franke S; Rensing C;
Proc Natl Acad Sci U S A; 2006; 103 (7):2075-80 2006 Feb 1 PMID:16452170
Validation of a 21-locus autosomal SNP multiplex for forensic identification purposes.
Dixon LA; Murray CM; Archer EJ; Dobbins AE; Koumi P; Gill P;
Forensic Sci Int; 2005; 154 (1):62-77 2005 Jan 20 PMID:16182950

FAQ

What is the size of genomic DNA that is obtained with QIAGEN Genomic-tips?
Genomic DNA purified using QIAGEN Genomic-tips ranges in size from 20–150 kb, with an average length of 50–100 kb. Vortexing the lysate for about 20 seconds may reduce the size of the genomic DNA slightly to 20–130 kb, but can help to improve flow rates.
FAQ-142
Do you have a protocol for the purification of DNA from fruit flies?

Using Gentra Puregene Cell kit:

 

• Purification of archive-quality DNA from up to 30 Drosophila melanogaster using the Gentra Puregene Cell Kit (PG20)

• Purification of archive-quality DNA from 100 Drosophila melanogaster using the Gentra Puregene Cell Kit (PG21)

• Purification of archive-quality DNA from 300–700 Drosophila melanogaster using the Gentra Puregene Cell Kit (PG22)

 

Using the QIAGEN Genomic tips:

• Isolation of genomic DNA from flies using the QIAGEN Genomic-tip 100/G (QG05)

FAQ-1970
What do you recommend for the cleanup of genomic DNA (gDNA)?

Using QIAGEN Genomic-tips

Protocol for DNA cleanup using Genomic-tips can be found in the 'Special Applications' section of the QIAGEN Genomic DNA Handbook.

 

Using QIAamp DNA Micro kit

Up to 10ug of gDNA can be cleaned using the cleanup protocol in the QIAamp DNA Micro Handbook.

 

Using Gentra Puregene Reagents

Gentra Puregene Handbook has protocols for removal of proteins and RNA from purified gDNA in Appendix C and Appendix D respectively.

FAQ-618
Do you have a protocol for the isolation of genomic DNA from frozen clotted blood?

Yes, we have the following protocols:

  • Isolation of genomic DNA from frozen clotted whole blood using the QIAGEN Genomic-tip 100/G (QG02). TEST

You will need to prepare the required buffers according to the recipes in Appendix A of the QIAGEN Genomic DNA Handbook, or you can purchase the Genomic DNA Buffer Set containing pre-made solutions. Alternatively, the QIAGEN Blood & Cell Culture Midi Kit, containing Genomic-tips 100/G and buffers, can be used.

  • Purification of archive-quality DNA from clotted whole blood using Clotspin Baskets and the Gentra Puregene Blood Kit (PG03).
  • Purification of archive-quality DNA from clotted whole blood using the Gentra Puregene Tissue Kit or Gentra Puregene Mouse Tail Kit (PG04).
  • Purification of DNA from clotted blood using the FlexiGene DNA Kit (FG01).
FAQ-900
Do you have a protocol for isolation of genomic and viral DNA from lymphocytes using QIAGEN Genomic-tips?

Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic and viral DNA from lymphocytes using the QIAGEN Genomic-tip' (QG03). The protocol is for use with the QIAGEN Genomic-tip 20/G.

FAQ-901
Do you have a protocol for isolation of genomic and plasmid DNA from cell cultures using QIAGEN Genomic-tips?

Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic and plasmid DNA from cell cultures using the QIAGEN Genomic-tip' (QG04).

FAQ-902
Do you have a protocol for isolation of genomic DNA from flies using QIAGEN Genomic-tips?

Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic DNA from flies using the QIAGEN Genomic-tip 100/G' (QG05).

FAQ-903
Do you have a protocol for isolation of genomic DNA from insects?

Yes, we have the following protocols:

  • Isolation of genomic DNA from mosquitoes or other insects using the QIAGEN Genomic tip (QG06).
  • Purification of total DNA from insects using the DNeasy Blood & Tissue Kit (DY14).
FAQ-904
Do you have a protocol for isolation of genomic DNA from plants and filamentous fungi using QIAGEN Genomic-tips?

 Yes, please follow the User-Developed Protocol 'Isolation of genomic DNA from plants and filamentous fungi using the QIAGEN Genomic-tip' (QG08).

FAQ-905
Do you have protocols for the isolation of genomic DNA from tissue using QIAGEN-tips 2500 (Mega) and 10000 (Giga)?
Do you have a protocol for the isolation of genomic DNA from fungi?

Yes, we have the following protocols:

  • Isolation of genomic DNA from fungi (culture and blood) using the QIAamp DNA Mini Kit (QA09).
  • Isolation of genomic DNA from plants and filamentous fungi using the QIAGEN Genomic-tip (QG08).
FAQ-911