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Qproteome FFPE Tissue Kit

从福尔马林固定、石蜡包埋组织中高效抽提全长蛋白

  • 标准化、大量的从福尔马林固定、石蜡包埋组织中进行抽提
  • 获得全长蛋白质
  • 样本量要求低

Qproteome FFPE Tissue Kit采用创新的专有试剂,逆转福尔马林固定导致的交联,并提供全长蛋白用于后续分析。

Cat No./ID: 37623
Qproteome FFPE Tissue Kit (20)
For 20 protein preparations from formalin-fixed, paraffin-embedded tissue samples: Extraction Buffer, Collection Tubes, Collection Tube Sealing Clips

Qproteome FFPE Tissue Kit适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或治疗。


0
在蛋白水平对比不同的FFPE样本。
通过蛋白抽提可以实现蛋白水平上的组织学样本比较。采用免疫组织化学法检测两个乳腺癌组织活检样本,其受体酪氨酸激酶HER2的评分均为2+,使用Qproteome FFPE Tissue Kit对其进行处理并通过蛋白裂解物芯片和Western印迹进行分析。在样本B中,采用FISH确认HER2基因的扩增(数据未显示)。以管家基因β-actin为对照进行分析。数据由德国慕尼黑工业大学的Karl-Friedrich Becker和Christina Schott提供。
1
产量与冷冻材料相当。
使用Qproteome Kit从FFPE组织中获得的蛋白产量与从冷冻材料中获得的产量相当。同时处理冷冻组织和FFPE组织,采用SDS-PAGE分离并进行Western印迹,比较两种组织的蛋白产量。以SW480结肠癌细胞 (结肠)、Huh7人肝癌细胞 (肝脏)、SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞 (大鼠脑部) 的裂解物为对照。
2
组织特异性生物标记物的确定。
某些类型淋巴瘤的特异性生物标记物的确定。从FFPE淋巴瘤制备物中抽提蛋白进行Western印迹后,检测转录因子E2A。在B细胞淋巴瘤样本中检测到E2A,但T细胞淋巴瘤制备物中无E2A。以管家基因β-actin为对照进行分析。(数据由德国法兰克福大学医学院病理学研究所的Susan Eckerle提供。)
3
标准化、可重复的蛋白抽提。
使用Qproteome Kit可从FFPE组织切片中进行标准化且可重复的蛋白抽提。同时对6个FFPE结肠组织样本进行处理。采用SDS-PAGE分离等体积的抽提蛋白。在Western印迹后,使用β-actin和Erk2抗体检测蛋白。
4
从FFPE组织中高效抽提蛋白。
从FFPE组织中高效抽提蛋白。使用直径1 mm的打孔器从福尔马林固定、石蜡包埋的肝脏制备物中获取样本,使用Qproteome FFPE Tissue Kit抽提蛋白。处理不同大小的样本各4个。使用BCA分析测定最终的上清液中的蛋白浓度。数据由德国雷根斯堡大学病理学/分子病理学研究所的Anja Bosserhoff教授提供。
Performance
Qproteome FFPE Tissue Kit通过标准化的实验方案,可从福尔马林固定、石蜡包埋组织样本中高效纯化蛋白质 。标准化的实验方案确保可重复的蛋白质产量(参见"Standardized and reproducible protein extraction")。使用Qproteome FFPE Tissue Kit得到的蛋白质产量与冷冻样本的产量相媲美。可用于比较不同组织样本,检测疾病特异性标志物(参见"tissue-specific biomarker identification")。
Principle

作为组织学样本制备的标准方法,每年都有几百万的福尔马林固定、石蜡包埋样品被分类并存档。以前,受到组织化学技术的限制,对其研究有限。Qproteome FFPE Tissue Kit打破了这一瓶颈,可高效提取适用于Western印迹、蛋白芯片和质谱分析的全长蛋白,为蛋白质组研究和蛋白表达分析提供了珍贵的资源。第一次,研究人员可在存档福尔马林固定、石蜡包埋组织中研究蛋白和表达路径。可同时应用Probing blots或包含多个抗体的芯片研究蛋白,获得多个蛋白表达谱的详细信息,如信号传导通路。

福尔马林固定会产生化学交联,稳定用于组织研究的样本,但会使后续的蛋白分离(如:通过SDS-PAGE)无法进行。Qproteome FFPE Tissue Kit应用创新的专有化学试剂反转交联过程,确保全长蛋白可应用western印迹或蛋白芯片以及后续的免疫学检测进行分析(参见"Compare FFPE Tissue Samples at the Protein Level")。

Procedure

将切片脱蜡并在Extraction Buffer孵育中,离心后收集上清获得蛋白质。回收所得的蛋白质和常规蛋白质一样,可直接与样本缓冲液混合,并上样到SDS-PAGE胶上。无需其他昂贵的仪器或处理过程。

Applications

Qproteome FFPE Tissue Kit提供了特殊的分析方法,以分析病理学状态已确定的样本,但对其精确的蛋白修饰还未完全了解。这些从一系列处理和不同研究组先代那里传下来的样品,为比较蛋白质组学和生物标记研究提供了丰富的资源。

Features
Specifications
应用 SDS-PAGE, Western-Blot, mass spectrometry
结合能力/产量 20–80 µg
分离组分 One fraction
样本大小 2–3 x 100 mm2 per prep
起始材料 Formalin-fixed tissues

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产品介绍与指南 (1)
Critical factors for molecular analysis of FFPE samples
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