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Custom qBiomarker Array PreAMP Mix

在real-time PCR前进行位点特异性预扩增,以确保下游癌症突变检测的灵敏性
  • 巢式PCR预扩增能够提高下游监测的灵敏度,减少假阳性结果
  • 基于PCR技术的实验方案广泛适用于各实验室
  • 附带的免费数据分析功能极大简化了突变检测
在使用Custom qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays进行分析前,可使用Custom qBiomarker Array PreAMP Mix对少量不完整或降解的DNA进行预扩增。该试剂盒中的位点特异性引物混合液可与qBiomarker PreAMP PCR Mastermix配合使用,通过多重PCR预扩增位点特异性DNA模板。扩增产物可用qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays或Assays进行分析。
Cat No./ID: 337040
Custom qBiomarker Array PreAMP Mix
1000 µl PreAMP mix for a user-defined set of loci — enough for 250 reactions
Principle
有效的体细胞突变检测方法在对待检测样本进行分析时,需要将可能存在的突变位点从大量存在的野生型序列中检测区分出来。因此,影响此类实验的两大关键因素为:样本中固有的突变DNA比例,以及检测方法的灵敏度。而在癌症研究中,作为肿瘤异质性的典型特征之一,肿瘤样本中的某一突变的频率可能十分之低。此外,不同样本类型和来源中突变频率及可分析的DNA量也存在着不同。而实验方法的灵敏度则直接影响了样本DNA中可被检出的突变DNA量。

癌症研究中的常见样本类型包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本、血清样本、穿刺活检样本和分选细胞样本,这些类型的样本中通常只含有少量的可扩增DNA。比方说,FFPE样本中的基因组DNA已经片段化,而血清样本中的DNA则浓度非常低。穿刺活检样本或分选细胞样本中的细胞含量少,因此所含的基因组DNA量也较少。扩增基因组DNA为更加准确的检测这些类型样本中的DNA突变提供了可能。

qBiomarker PreAMP系列产品采用巢式PCR预扩增技术,改善了检测特异性,并减少假阳性结果。在12个循环的PCR反应中,待测位点扩增后,可直接用于下游配套的qBiomarker Somatic Mutation PCR Assays和Arrays产品分析。Custom qBiomarker Array PreAMP Mix提供用户自选位点的对应引物。该混合液与qBiomarker PreAMP Synthesis Kit配合使用,可以预扩增特异性位点,用于后续Custom qBiomarker Somatic Mutation PCR Array突变检测。
Procedure
首先使用相应的QIAamp或DNeasy试剂盒,从FFPE样本、血清或其他类型的少量样本中分离DNA。之后使用qBiomarker PreAMP Synthesis Kit和含有位点特异性引物的Custom qBiomarker PreAMP Mix预扩增DNA。使用Custom qBiomarker Somatic Mutation Array检测突变,将CT值上传至GeneGlobe Data Analysis数据分析工具进行突变数据分析。
Applications
qBiomarker Array PreAMP Mix特别适合在使用Custom qBiomarker Somatic Mutation PCR Arrays前对于少量可扩增的DNA进行预扩增。推荐样本类型包括:
  • FFPE样本
  • 血浆、血清、尿液及其他无细胞体液样本
  • 激光捕获显微切割样本
  • 穿刺活检样本
  • 流式细胞仪分选细胞样本

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仪器技术参数 (1)
For screening disease-focused mutation panels by PCR
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试剂盒操作手册 (1)
For real-time PCR-based, pathway- or disease-focused, somatic mutation profiling
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fragment fix placeholder