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Type-it Fast SNP Probe PCR Kit

应用TaqMan或TaqMan MGB探针进行准确可靠的SNP基因分型

  • 经TaqMan SNP Genotyping Assays验证
  • 自动等位基因分型,致密的荧光光束
  • 适用于难以分型的SNP位点和少量模板
  • 快速循环可节约多达40%的时间
Type-it Fast SNP Probe PCR Kit基于高度特异性的HotStarTaq Plus DNA Polymerase和新研发的缓冲液体系,可获得可靠、清晰的等位基因分型。预混液中所有组分的配合可提高探针结合的准确性和特异性。Type-it Fast SNP Probe PCR Kit经TaqMan SNP Genotyping Assays验证,能获得可重复的SNP基因分型结果,也可用于难处理的SNP位点(如富含GC)或起始量低的模板。
Cat No./ID: 206042
Type-it Fast SNP Probe PCR Kit (100)
For 100 x 25 μl reactions: 2x Type-it Fast SNP Probe PCR Master Mix, 5x Q-Solution, RNase-Free Water
Cat No./ID: 206045
Type-it Fast SNP Probe PCR Kit (800)
For 800 x 25 μl reactions: 6 x 1.7 ml of 2x Type-it Fast SNP Probe PCR Master Mix, 5x Q-Solution, RNase-Free Water
Cat No./ID: 206047
Type-it Fast SNP Probe PCR Kit (4000)
For 4000 x 25 μl reactions: 2 x 25 ml of 2x Type-it Fast SNP Probe PCR Master Mix, 5x Q-Solution, RNase-Free Water

Type-it Fast SNP Probe PCR Kit适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或治疗。


0
成功的自动化等位基因信号分析。
使用6个不同的TaqMan MGB-based SNP基因分型实验和来自60个样本的1 ng基因组DNA对一组不同的DNA进行平均自动化等位基因信号率分析。在384孔板中以5 μl反应体系对指定产物进行PCR。在Applied Biosystems 7900HT仪器上进行等位基因区分读板。Type-it Fast SNP Probe PCR Kit可持续获得最高的信号率和最低的错误率。
1
高度特异性的探针结合。
由于错配探针的非特异性结合,来自其他供应商的用于SNP基因分型的缓冲液经常不能很好分离等位基因簇。Type-it Fast SNP Probe Buffer System通过缩小熔化温度范围,可提高分辨率,减少错配探针的非特异性结合。可对等位基因簇进行广泛的和明确的分离。
2
基因分型工作流程。
Type-it Fast SNP Probe PCR Master Mix含有高度特异性的HotStarTaq Plus Polymerase,可在室温下快速、简单地构建反应体系,即使模板量很少也能确保高度特异的扩增。
3
使用少量模板进行可靠的SNP基因分型。
使用[A] Type-it Fast SNP Probe PCR Kit或[B]来自供应商A的基因分型预混液对80个不同基因组DNA(每5 μl反应有10 ng或1 ng)进行等位基因区分。即使使用少量模板,Type-it Fast SNP Probe PCR Master Mix的表现都优于来自供应商A的预混液,获得紧密的等位基因和可靠的结果。使用TaqMan SNP基因分型实验对rs 951134(aryl-hydrocarbon receptor repressor gene)和2个无模板对照(NTCs)进行PCR,在Applied Biosystems 7900HT仪器上进行分析。黑色:NTCs;蓝色:T等位基因纯合子(FAM荧光);绿色:杂合子样本;红色:A等位基因纯合子(VIC荧光)。数据以98%信度进行分析。
Performance

Type-it Fast SNP Probe PCR Kit确保持续获得高度准确的SNP基因分型。

等位基因特异性的探针可进行高度严谨和特异的结合  

Type-it Fast SNP Genotyping PCR Master Mix基于高度特异性的HotStarTaq Plus DNA Polymerase和新研发的SNP基因分型PCR缓冲液体系,可进行高度特异性的探针结合和持续强的荧光信号。与其他商业化SNP基因分型预混液相比,可获得更广泛、更清晰的等位基因群分离(参见"Highly specific probe binding")。

低模板量也能获得高信号率

对于有挑战性的靶点或难处理的SNP位点,Type-it Fast SNP Probe PCR Kit提供可靠的SNP基因分型,可完全分开等位基因并使相同的等位基因紧密成群,产生较高的信号率(参见"Successful automated allele calling")。Type-it Fast SNP Probe PCR Kit优于其他供应商的试剂盒,保证等位基因紧密成群,即使1 ng的DNA模板(参见 "Reliable SNP genotyping with small amounts of template")。

Principle

Type-it Fast SNP Probe PCR Kit采用方便的预混液规格,含有高度特异性的HotStarTaq Plus Polymerase和独特的SNP基因分型缓冲液体系,可快速、高效的扩增。独特的试剂盒组分可使等位基因紧密成群,完全分开确保高信号率,获得可重复的、准确的结果(见表)。

高特异性和灵敏度

预混液中提供的HotStarTaq Plus DNA Polymerase确保高特异性扩增,即使处理低模板量。HotStarTaq Plus DNA Polymerase处于非活化状态,在环境温度下没有聚合酶活性。这避免了在低温下引物错搭产物和引物二聚体的形成。

独特的缓冲液体系

预混液中含有的Type-it Fast SNP PCR Buffer专用于通过序列特异性5'核酸酶探针进行快速循环的SNP基因分型。Type-it Fast SNP PCR Buffer的独特组分确保非常严格和特异性的等位基因特异性探针的结合。改变探针的熔解行为可形成更窄的探针熔解温度窗口。基于原始的QIAGEN PCR Buffer,这种创新的缓冲液使每个PCR循环的退火步骤都有较高比率的特异性引物结合。KCl和(NH4)2SO4独特比例结合,使PCR缓冲液与常规PCR缓冲液相比,可在更宽范围的退火温度和Mg2+浓度下提供严格的引物退火条件。极大减少通过改变退火温度或Mg2+浓度的PCR优化过程,有时甚至不需要。

Type-it Fast SNP PCR缓冲液中的添加剂,如Q-Solution,可提供反应条件,用于难处理基因组区域和SNP位点的扩增。创新的Q-Bond技术(用于快速循环),可更快获得SNP基因分型结果(参见"Mechanism of fast cycling during annealing")。预混液中含有的ROX染料,其浓度使其能在Applied Biosystems的多种仪器上进行SNP基因分型。而且,ROX染料也能在不需要ROX作为阴性参照染料的仪器上使用(见表)。

试剂盒的特征
试剂盒组分 特征
2x Master Mix format* 用于配合TaqMan MGB探针进行SNP基因分型。能与多种循环仪配合使用,用于SNP基因分型
HotStarTaq Plus DNA Polymerase 室温下进行快速、简单的反应体系构建。即使使用少量模板,也能高度特异性扩增   
Type-it Fast SNP Probe PCR Buffer 广泛分离基因群。紧密的等位基因群,高等位基因信号率。探针结合具有更高特异性。使用Q-Bond Molecule,快速循环   
Q-Solution 对于高GC含量的SNP位点,在散点图分析中具有更紧密的集群和更强信号。可进一步提高不理想的等位基因信号
* 包括ROX参照染料、dNTPs和MgCl2。
Procedure

Type-it Fast SNP Probe PCR Kit使用商业化的SNP基因分型检测进行了功能验证,能与TaqMan MGB Probes配合使用,也可配合用户自行设计的探针法检测,可使用TaqMan MGB、TaqMan或其他双标记探针。此试剂盒包括简化的、预优化的操作流程,用于快速、可靠的分析。

快速循环步骤,可直接获得结果

Type-it Fast SNP Probe PCR Master Mix提供的反应条件,配合序列特异性探针进行快速PCR循环。缓冲液包含专有化的Q-Bond Molecule,可在标准循环仪或具有快速升温速率的快速循环仪上缩短循环时间。快速循环步骤可减少至多40%的PCR运行时间,提高通量(参见"Genotyping workflow")。

方便的试剂盒规格

该试剂盒采用即用型、预优化预混液形式,具有更大便利性。使用预混液可节约时间,简化反应体系构建的手工操作,通过消除移液误差和污染的可能来源,提高可重复性,尽量减少移液步骤,无需繁琐的计算。预混液中含有的HotStarTaq Plus DNA Polymerase 95°C,5分钟被激活,可在热循环程序中简单设置。使用预混液进行室温下的反应体系构建快速、简单。

适合的仪器

Type-it Fast SNP Probe PCR Kit经优化,可在多种合适的标准和快速升温的循环仪上进行SNP PCR分析,光学PCR孔板配合real-time PCR仪可用于荧光板阅读分析(见表)。

Suitable instruments
循环仪 模式
Real-time PCR cyclers QIAGEN: Rotor-Gene Q
ABI PRISM 7900 (all series)
Applied Biosystems 7500 (all series)
Applied Biosystems 7300
ABI PRISM 7700
ABI PRISM 7000
ABI StepOne and StepOnePlus
Bio-Rad: iCycler iQ
Roche: LightCycler 480
Stratagene: Mx3000P and Mx3005P
Standard cyclers 采用标准升温模式的所有循环仪(如GeneAmp 9700)
采用快速升温模式的所有循环仪(如GeneAmp 9800)

 

Applications

Type-it Fast SNP Probe PCR Kit应用TaqMan MGB探针检测SNPs,可用于多个研究领域,包括:

  • 疾病基因位点的分型
  • 生物标记物的发现
Features
Specifications
应用 Probe-based SNP Genotyping
酶活 5'-> 3' Exonuclease activity
预混液 Yes
产品使用 Functionally validated and developed for reliable SNP Genotyping
反应类型 PCR amplification
real-time或终点法PCR Both
样本/目标类型 Genomic DNA
序列特异性探针 TaqMan® Genotyping Assays, TaqMan® or TaqMan MGB® probes
有/无ROX ROX included in Master Mix
有/无热启动酶 With