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GeneRead DNA QuantiMIZE Kits

用于在NGS前,定量、定性检测可扩增DNA
  • 在Array或单独的反应管中实施定性或定量类PCR分析
  • 对PCR扩增后的DNA进行定性和定量
  • 指导靶向富集条件的优化
  • 无需进行梯度稀释
GeneRead DNA QuantiMIZE System是基于qPCR方法的检测系统,适于在NGS分析之前对即将进行靶向富集扩增的DNA进行定量与定性分析。本系统专为探索型、转化型和临床型等不同类型的研究人员而研发。这一类人员往往面对的是分离自包括FFPE等不同生物样本的DNA,需要更为经济、高效的检测手段来确定靶向富集DNA的最优条件。不同于其他技术手段,此系统不仅能够对可扩增的DNA进行定量,还能同时优化靶向富集条件,从而提升NGS检测的成功率。
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2
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2 arrays in Formats A, C, D, or F; or 2 discs in Format R; or 1 array in Format E or G; QuantiMIZE Control gDNA (50 μl; GeneRead qPCR SYBR Green Mastermix (2 x 1.35 ml)
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333404 DNQA-002 varies
Assay 100 and Assay 200 for 400 x 25 μl reactions (400 μl) each; QuantiMIZE Control gDNA (50 μl); RNase- and DNase-free water (1 ml x 4); GeneRead qPCR SYBR Green Mastermix (1.35 ml x 4)
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333414 DNQC-100Y varies
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GeneRead DNA QuantiMIZE Kits适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或治疗。


Performance
通过GeneRead DNA QuantiMIZE System对可扩增的DNA进行定量和定性操作,能够成功从低质量的FFPE样本中获得有效样本进入后续的NGS分析。使用GeneRead DNA QuantiMIZE System可获得高质量的文库,进而在MiSeq设备上成功实施测序(参见Successful quantification and qualification of DNA by the GeneRead DNA QuantiMIZE system)。
Principle
GeneRead DNA QuantiMIZE System应用了两类qPCR分析,能够对20个基因组位点进行查询以确定生物样本中可扩增DNA的数量。这两类分析——即Assay 100和Assay 200——能够分别生成100和200 bp的扩增子。QuantiMIZE Kit使用Assay 100和Assay 200分析中获得的CT值来同时为对照(Control)样本和检测(Case)样本的DNA进行定量和定性(参见Principle of the GeneRead DNA QuantiMIZE System)。
Procedure
将生物样本中抽提出的基因组DNA与所提供的预混液进行混合。如果使用了芯片试剂盒,则将混合之后的样品平均加样至芯片当中;如果使用了分析试剂盒,则在加样至芯片之前将其与Assay 100和Assay 200进行混合。执行PCR反应并将原始的CT值导出至网络数据分析模块当中,后者将对DNA进行定量和定性,并提供所需的DNA数量和PCR循环数方面的指导意见,以帮助优化靶向富集条件。
Applications
GeneRead DNA QuantiMIZE Kit适合于针对任何种类DNA样本进行定量和定性操作。其尤为适于FFPE等低质量DNA样本。不仅如此,为了成功地实施靶向富集操作,此试剂盒还能够针对任何种类的DNA样本中的基因组区域,进行条件优化方面的必要工作;其所兼容的DNA样本囊括了FFPE等低质量DNA样本和细针吸取液等低含量DNA样本。

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试剂盒操作手册 (2)
New version – For advanced qualification and quantification of amplifiable genomic DNA for targeted enrichment prior to next-generation sequencing (array format)

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New version – For advanced qualification and quantification of amplifiable genomic DNA for targeted enrichment prior to next-generation sequencing (assay format)

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分析软件 (4)
Excel-based data analysis template for use with QuantiMIZE assay kits for 72-well plates
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Excel-based data analysis template for use with QuantiMIZE array and assay kits for 96-well plates
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Excel-based data analysis template for use with QuantiMIZE array and assay kits for Rotor-Disc 100 rings
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Excel-based data analysis template for use with QuantiMIZE array and assay kits for 384-well plates
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