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EpiTect Methyl II PCR Array Service

使用MethylScreen技术,分析用于通路或疾病研究的某一位点的DNA甲基化状态

  • 完整的流程,从样本制备到数据分析
  • 每个样本可分析24或96个基因,无需亚硫酸氢盐转化
  • 经优化的限制性酶切条件
  • 详尽的项目审查,全面的质量控制
EpiTect Methyl II PCR Array Service利用EpiTect Methyl II PCR Array system,提供DNA甲基化谱分析服务。利用该项创新技术可以快速且准确地实现单个基因以及疾病或通路相关的基因检测板中CpG岛DNA甲基化谱分析的检测。EpiTect Methyl II PCR Array Service采用了MethylScreen技术,该技术已获得了Orion Genomics, LLC许可。
Cat No./ID: EpiTectArray
EpiTect Methyl II PCR Array Service
Epigenetic analysis performed on your samples using EpiTect Methyl II PCR Arrays

EpiTect Methyl II PCR Array Service适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或治疗。


Principle
EpiTect Methyl II PCR Array利用2种不同的限制性内切酶对目标序列进行差异性剪切,这2种酶的活性依赖于各自识别序列中甲基化的胞嘧啶的存在。利用real-time PCR检测每种酶切后的相对DNA残留量,可以可靠且轻松地计算出单个基因的甲基化状态以及整个基因检测板的甲基化谱。利用酶切和PCR扩增获得高产量DNA,可实现更小、异质性更高的样本的分析。

EpiTect Methyl II PCR Array中的基因是根据大量实验中报道的超甲基化状态精心挑选的。利用这些芯片对您的生物DNA样本进行谱分析,可以将CpG岛的甲基化状态与生物学表型或疾病预后相关联,其结果可供我们深入了解疾病发展过程中关键的分子机制和生物学通路。

EpiTect Methyl II PCR Array有96和384孔板可供选择,可实现24或96个通路或疾病特异性基因检测板的同时分析。标志检测板包含24种基因,分布于96孔或384孔板内,可分别实现1种或4种不同DNA样本的全部4种酶切鉴定。全套检测板包含96种基因,分布于96孔或384孔板内,可分别在4块反应板或同一块反应板上实现一个DNA样本的全部4种酶切鉴定。
Procedure

对一个DNA样本进行四种不同的酶切:甲基化敏感性酶、甲基化依赖性酶、利用这两种酶进行双酶切、空酶切。随后,对目的基因进行定量real-time PCR,检测各反应中DNA残留量。利用上述数据计算甲基化状态——甲基化、超甲基化或非甲基化。

请发送电子邮件至support@sabiosciences.com,联系技术支持代表,订购或者探讨您的特定需要。

芯片选择

从下列预设计的癌症或通路相关的芯片(参见下表)中选择,或者选择EpiTect Methyl II Custom PCR Array并自定义基因列表。专利算法能够可靠地预测启动子CpG岛,并选择最佳的目标启动子区域进行分析。严格的qPCR引物确认和质量控制生产流程确保了可靠的分析性能。

表1.预制芯片
癌症研究芯片 通路研究芯片
乳腺癌
凋亡
癌症miRNA
细胞周期
结肠癌
细胞因子生成
上皮–间质转化(EMT)
DNA修复
胃癌
同源框基因
白血病和淋巴瘤
炎症反应
肝癌
精神病症
肺癌
Notch信号通路
黑色素瘤
Polycomb(PcG)基因
前列腺癌
干细胞转录因子
肿瘤抑制基因
压力和毒性
T细胞活化
辅助T细胞分化
肿瘤抑制基因
Toll样受体信号通路
TGF-β/BMP信号通路
Wnt信号通路
样本

如需了解有关样本提交和运输方面的说明,请联系QIAGEN技术服务。我们接受的样本是细胞或组织或总DNA。对于细胞和组织,我们可提供DNA分离服务。

各种样本

请注意起始材料最低需要量(参见下文,了解各种样本类型的要求)。如果您未达到最低量或以前分离的样本未采用我们推荐的方法保存,请联系QIAGEN技术服务后再提交样本。

运输前:

  • 从QIAGEN技术服务获取样本提交表。
  • 填写表格并与样本一同提交。
  • 包括材料量及其保存条件。
  • 签名并填写填表日期。
  • 参照您的样本类型说明运输。
  • 细胞

    每种样本提供至少50万个细胞,在提交表上注明细胞数量。将细胞沉淀快速冻存于液氮中,置于–80°C冷冻保存样本,干冰运输。

    组织 

    每种样本提供至少50 mg组织,在提交表上注明组织重量。将组织快速冻存于液氮中,置于–80°C冷冻保存样本,干冰运输。

    纯化的基因组DNA

    纯化的基因组DNA需要进行甲基化分析。我们目前还提供基因组DNA分离服务,敬请垂询。

    采用可与甲基化谱分析兼容的标准的基因组DNA分离试剂盒(如DNeasy Blood & Tissue Kit)分离基因组DNA。我们建议使用2 µg DNA/样本(采用不含DNA酶的水或TE缓冲液溶解),浓度≥30 ng/µl。要求A260/A280比≥1.7,A260/A230比≥1.7。客户应采用琼脂糖凝胶电泳检查样本的完整性,然后在将样本寄送至QIAGEN。提交样本时应附带样本凝胶图(如可用)。

    还应附上样本提交表。样本提交时首选Excel格式,电子表格应包含下列信息:样本ID、浓度、A260/A280A260/A230、总体积、DNA总量。

    样本处理
  • 基因组DNA分离服务(可选)
  • 利用EpiTect Methyl II PCR Array进行样本制备和real-time PCR检测
  • 同时分析24或96个基因的DNA甲基化状态
  • 数据分析 

    从安全的FTP网站下载或者通过电子邮件提交电子表格数据。完整的数据和实验报告包括:

    原始CT
    ΔCT校准品和样本相比内源性对照 
    Excel表
    Applications
    EpiTect Methyl II PCR Array Service尤其适用于通路或疾病相关的基因检测板的甲基化谱分析,以及与干细胞增殖和分化、肿瘤及其他人类疾病相关的主要生物标记物的研究和开发。