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EpiTect Methyl II PCR Arrays

使用MethylScreen技术,进行以应用为主的DNA的甲基化分析

  • 经实验验证的real-time PCR引物
  • 专用于DNA甲基化分析
  • 同时进行22或94个基因的甲基化分析
  • 无需亚硫酸氢盐转化
  • 适用于人体、小鼠和大鼠样本

EpiTect Methyl II PCR Arrays可在96或384规格的real-time PCR孔板上同时进行24或96个基因启动子的DNA甲基化分析。基因是通过各种实验报告的高甲基化而精心筛选的。这些芯片可进行与生物表型或疾病相关的CpG位点的甲基化状态分析。EpiTect Methyl II Signature PCR Arrays和EpiTect Methyl II Complete PCR Arrays适用于人类或小鼠研究,提供96或384孔板两种规格。EpiTect Methyl II PCR Arrays使用的MethylScreen技术是经Orion Genomics, LLC认证的。

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  • Sanger ID or Accession (e.g., hsa-let-7b, MI0000063)
  • CpG loci identification numbers (CG#) (e.g., CG17753661)

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产品 Product no. 货号 目录价:
EpiTect Methyl II PCR Assay
Laboratory-verified forward and reverse primers for 200 reactions
335002 Varies Enter your targets in search box above.

EpiTect Methyl II PCR Arrays适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或治疗。


Performance
EpiTect Methyl II PCR Assays具有高灵敏度(参见"EpiTect Methyl II PCR Assay detects methylation in heterogeneous samples")。结果与使用亚硫酸氢盐测序的甲基化结果具有可比性(参见"Comparison with bisulfite Sanger sequencing"),非常适合基因组范围的甲基化分析研究验证(参见"EpiTect Methyl II PCR Arrays generate data comparable to that from BeadChip platforms")。
Principle

基因表达过程中,DNA甲基化至关重要,以独有的CpG二核苷酸形式存在,即甲基残留与胞嘧啶残留共价结合。CpG岛是一个GC含量丰富和CpG二核苷酸高频出现的区域,与人类基因60–70%的启动子区域重叠。基因启动子CpG岛的超甲基化多数与基因沉默有关。

EpiTect Methyl II PCR Array体系,配合MethylScreen技术,使用2个不同的限制性内切酶剪切靶序列,这些酶的活性要求在各自的识别序列中存在或不存在甲基化胞嘧啶。Real-time PCR确定限制性酶切后残留的DNA的量(参见"EpiTect Methyl II PCR Array procedure"),同时简单可靠计算单个基因的甲基化状态和对多个基因进行甲基化分析(参见"Pictorial explanation of results")。同时使用限制性酶切和PCR扩增,能够分析更少量、更多异源性的样本。

EpiTect Methyl II PCR System是一种新型技术,可快速、准确检测单个基因和用于疾病或通路研究的基因DNA的甲基化状态,无需亚硫酸氢盐转化。得到结果使用PyroMark CpG Assays验证。配合RT2 SYBR® Green qPCR Mastermix,EpiTect Methyl II PCR Arrays性能具有可靠性。

芯片布局和规格
布局

PCR Arrays同时提供96孔板和384孔板两种规格,用于分析22或94个基因的甲基化状态,这些基因通常与疾病如特定类型癌症、或相关特定细胞或组织通路有关。标记板包含22个基因,以96孔板或384孔板形式提供,用于分别表征1或4个不同DNA样本的4个限制性酶切。完整板包含94个基因,以96孔板或384孔板形式提供,用于分别表征来自4个不同孔板或同一孔板的一个DNA样本的4个限制性酶切。除了22或94个基因外,每个芯片还含有2个对照,用于监测酶消化效率。

芯片规格
EpiTect Methyl II PCR Array Format A:96孔板包含干燥qPCR引物,Optical Thin-Wall 8-Cap Strips
EpiTect Methyl II PCR Array Format C:96孔板包含干燥qPCR引物,Optical Adhesive Film
EpiTect Methyl II PCR Array Format D:96孔板包含干燥qPCR引物,Optical Thin-Wall 8-Cap Strips
EpiTect Methyl II PCR Array Format E (Signature Panels):384孔板包含干燥qPCR引物,Optical Adhesive Film,384EZLoad Covers
EpiTect Methyl II PCR Array Format E (Complete Panels) :384孔板包含干燥qPCR引物,Optical Adhesive Film
EpiTect Methyl II PCR Array Format F:96孔板包含干燥qPCR引物,Optical Adhesive Film 
EpiTect Methyl II PCR Array Format G (Signature Panels):384孔板包含干燥qPCR引物,Optical Adhesive Film,384EZLoad Covers
EpiTect Methyl II PCR Array Format G (Complete Panels):384孔板包含干燥qPCR引物,Optical Adhesive Film,Optical Adhesive Film
用于研究癌症的芯片
乳腺癌
癌症miRNA
结肠癌
上皮向间质转型(EMT)
胃癌
白血病和淋巴瘤
肝癌
肺癌
黑色素瘤
前列腺癌
抑癌基因
用于通路研究的芯片
细胞凋亡
细胞周期
细胞因子产生
DNA修复
同源(HOX)基因
炎症反应
精神失常
Notch信号通路
Polycomb(PcG)基因
干细胞转录因子
压力和毒性
T细胞活性
辅助性T细胞分化
抑癌基因
Toll样受体信号
TGF-β/BMP信号
WNT信号

Procedure

首先,加入等量的基因组DNA样本到EpiTect Methyl II DNA Restriction Kit,构建四种不同的限制性酶切:模拟(Mo)、甲基敏感(Ms)、甲基依赖(Md)和双甲基敏感(Msd)。酶切和热灭活后,使用RT2 SYBR Green qPCR Mastermix混合酶切产物,等分至EpiTect Methyl II PCR Array的相应孔中,在real-time PCR仪上运行推荐的循环程序即可。

使用仪器上的软件确定CT值,用于表征每个基因特异性分析的酶切产物。然后,将得到的值粘贴到符合芯片规格的Excel数据表格,计算超甲基化DNA百分比。

Applications

EpiTect Methyl II PCR系列产品是创新的多功能研究工具,用于:

甲基化模式分析
验证基因组内甲基化分析结果
发现癌症和干细胞生物标记物
毒理学和流行病学筛查
表征基因表达调控
表观遗传学DNA甲基化分析

您无权限查看此资源

试剂盒操作手册 (1)
For regional DNA methylation analysis using MethylScreen technology
显示更多
仪器技术参数 (1)
For pathway- or disease-focused profiling of regional DNA methylation, without bisulfite conversion, using MethylScreenTM technology
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